DB32T3762.13-2021新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范 第13部分:疊氮溴化丙錠-熒光PCR檢測程序_第1頁
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文檔簡介

ICS11.020

C62

DB32

江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)

DB32/T3762.13—2021

新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范

第13部分:疊氮溴化丙錠-熒光PCR

檢測程序

TechnicalspecificationsforSARS-CoV-2detection

Part13:PMA-qRT-PCRtestprocedure

2021-12-09發(fā)布2022-01-09實(shí)施

江蘇省市場監(jiān)督管理局發(fā)布

DB32/T3762.13—2021

前??言

DB32/T3762《新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范》目前分為以下部分:

——第1部分:生物樣本采集、運(yùn)輸和保存;

——第2部分:病毒分離與鑒定;

——第3部分:核酸熒光PCR檢測程序;

——第4部分:重組酶介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增程序;

——第5部分:血清IgM和IgG抗體酶聯(lián)免疫吸附檢測程序;

——第6部分:血清IgM和IgG抗體膠體金免疫層析檢測程序;

——第7部分:空氣樣本檢測與評估;

——第8部分:物體表面檢測與評估;

——第9部分:醫(yī)務(wù)人員職業(yè)暴露檢測與評估;

——第10部分:微量血清中和試驗(yàn);

——第11部分:全基因組高通量測序;

——第12部分:藥物體外抗病毒效果測定;

——第13部分:疊氮溴化丙錠-熒光PCR檢測程序;

——第14部分:N亞基因組熒光PCR檢測程序;

——第15部分:血清/血漿IgM和IgG抗體磁微?;瘜W(xué)發(fā)光法檢測程序;

——第16部分:核酸數(shù)字PCR法;

——第17部分:核酸檢測用假病毒陽性質(zhì)控品;

——第18部分:規(guī)模化核酸檢測程序。

本文件為DB32/T3762的第13部分。

本文件按照GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起

草。

本文件由江蘇省衛(wèi)生健康委員會提出。

本文件由江蘇省衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會歸口。

本文件主要起草單位:江蘇省疾病預(yù)防控制中心、揚(yáng)州市疾病預(yù)防控制中心、南京市疾病預(yù)防控制

中心、宿遷市疾病預(yù)防控制中心。

本文件主要起草人:葛以躍、崔侖標(biāo)、劉丹丹、朱寶立、遲瑩、吳濤、朱小娟、吳斌、趙康辰、喬

喬、徐勤、杜雪飛、戚曉飛。

II

DB32/T3762.13—2021

新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第13部分:疊氮溴化丙錠-熒光PCR檢測程序

1范圍

本文件規(guī)定了新型冠狀病毒疊氮溴化丙錠-熒光PCR(PMA-qRT-PCR)檢測環(huán)境與設(shè)施、設(shè)備與耗

材、試劑與材料、樣本處理與核酸提取、擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增和結(jié)果判斷。

本文件適用于新型冠狀病毒PMA-qRT-PCR檢測,為判斷樣本中的新型冠狀病毒是否具有感染性提

供輔助手段。

2規(guī)范性引用文件

下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,

僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改版)適用于本

文件。

DB32/T3762.3新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第3部分:核酸熒光PCR檢測程序

新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南中華人民共和國國家衛(wèi)生健康委員會

新型冠狀病毒肺炎實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)指南中華人民共和國國家衛(wèi)生健康委員會

醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法原中華人民共和國衛(wèi)生部辦公廳

醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作導(dǎo)則原中華人民共和國衛(wèi)生部檢驗(yàn)中心

3術(shù)語和定義

3.1

疊氮溴化丙錠propidiummonoazide;PMA

一種具有高親和力的光敏反應(yīng)DNA結(jié)合染料,光解后,染料上的光敏疊氮基轉(zhuǎn)變?yōu)楦叻磻?yīng)性的氮

烯自由基,極容易與結(jié)合部位核酸的碳?xì)浠衔镄纬衫喂蘎NA或DNA修飾,修飾后的核酸不能用作PCR

反應(yīng)模板被擴(kuò)增。由于PMA不能透過活細(xì)胞膜,因此將PMA與PCR聯(lián)合使用可用于區(qū)分死活細(xì)胞、細(xì)

菌和病毒等。

4環(huán)境與設(shè)施

同DB32/T3762.3第4章。

5設(shè)備與耗材

BLU-V曝光系統(tǒng)或鹵素?zé)簦?50W),余同DB32/T3762.3第5章。

6試劑與材料

6.1試劑

1

DB32/T3762.13—2021

6.1.1病毒核酸提取試劑盒。

6.1.2qRT-PCR擴(kuò)增試劑盒。

6.1.3二甲基亞砜(DMSO)。

6.1.4磷酸鹽緩沖液(PBS,PH=7.4)。

6.1.5疊氮溴化丙錠(PMA)。

6.2材料

6.2.1新型冠狀病毒核酸檢測質(zhì)控品。

6.2.2消毒劑:75%乙醇、有效氯5500mg/L的消毒液(需每天新鮮配制)。

7試驗(yàn)技術(shù)要點(diǎn)

用于新型冠狀病毒核酸PMA-qRT-PCR檢測的樣本應(yīng)采用非滅活型病毒采樣管進(jìn)行采集。

8樣本前處理

8.1在BSL-2實(shí)驗(yàn)室生物安全柜內(nèi)打開樣本第二層包裝,取出待檢樣本,核對送檢單,若管壁外有不

明液體,應(yīng)用消毒劑擦拭。

8.2將樣本混勻后分裝于2mL帶螺旋蓋內(nèi)有墊圈凍存管。在凍存管上標(biāo)記,注明姓名、樣本類型、

日期等。吸取部分樣本進(jìn)行樣本PMA預(yù)處理與核酸提取。所有凍存管旋緊管蓋后需用封口膜密封。

9樣本PMA預(yù)處理與核酸提取

9.1樣本PMA預(yù)處理

9.1.1以20%二甲基亞砜(DMSO)將PMA配置成2mM濃度。

9.1.2將PMA加入到病毒樣品中使其達(dá)到200μM終濃度,同時(shí)取等量PBS加入到病毒樣本中作為

樣品對照組,并做好標(biāo)記。以同樣的方法對新型冠狀病毒核酸檢測質(zhì)控品(稀釋到500拷貝/mL)進(jìn)行

處理。

9.1.3將所有樣品管混合均勻,室溫孵育10min。

9.1.4孵育完成后使用BLU-V曝光系統(tǒng)或鹵素?zé)簦?50W,樣品置于冰上,距離燈源20cm)曝光15

min。

注:以上步驟均在避光條件下進(jìn)行。

9.2核酸提取

同DB32/T3762.3的7.2條。

10擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增

10.1將qRT-PCR擴(kuò)增引物和探針(Forward:5′-CCCTGTGGGTTTTACACTTAA-3′;Reverse:

5′-ACGATTGTGCATCAGCTGA-3′;Probe:5′-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG

-BHQ1-3′)配置為10μM濃度。

2

DB32/T3762.13—2021

10.2采用qRT-PCR擴(kuò)增試劑盒,根據(jù)試劑盒說明書配置qRT-PCR擴(kuò)增體系,反應(yīng)體系中每一條引物

的終濃度為0.2μM,每個(gè)樣品及新型冠狀病毒核酸檢測質(zhì)控品均做3個(gè)重復(fù),同時(shí)設(shè)立陰性對照。

10.3在生物安全柜內(nèi)加核酸模板,然后根據(jù)試劑盒說明書設(shè)定反應(yīng)條件進(jìn)行qRT-PCR擴(kuò)增,共擴(kuò)增

40個(gè)循環(huán)。

10.4在實(shí)驗(yàn)記錄本記錄加樣位置和樣本編號。

10.5未用完核酸樣本轉(zhuǎn)入病毒樣本專用專人保管冰箱。

11閾值設(shè)定

閾值設(shè)定原則以閾值線剛好超過陰性對照擴(kuò)增曲線的最高點(diǎn),結(jié)果顯示陰性為準(zhǔn)。

12質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)

陰性對照結(jié)果為陰性。新型冠狀病毒核酸檢測質(zhì)控品PBS處理組出現(xiàn)典型S型擴(kuò)增曲線,Ct值小

于40,且質(zhì)控品PBS處理組Ct值和PMA預(yù)處理組Ct值之間存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(陰性結(jié)果Ct值記為40);若

以上對照不成立,此次實(shí)驗(yàn)視為無效。

13結(jié)果判斷

記錄各組樣品Ct值,陰性結(jié)果Ct值記為40。如果樣品PMA預(yù)處理組Ct值和PBS處理對照組Ct值之間

無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,則提示樣品中的病毒具有感染性的可能性較大;如果PMA預(yù)處理組Ct值和PBS處理對照

組Ct值之間存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,則提示樣品中的病毒無感染性或者感染性較低。具體判定需結(jié)合樣品實(shí)際

情況進(jìn)行綜合分析。

________________________________

3

DB32/T3762.13—2021

目??次

前??言.............................................................................................................................................................II

1范圍.................................................................................................................................................................1

2規(guī)范性引用文件.............................................................................................................................................1

3術(shù)語和定義.....................................................................................................................................................1

4環(huán)境與設(shè)施.....................................................................................................................................................1

5設(shè)備與耗材.....................................................................................................................................................1

6試劑與材料.....................................................................................................................................................1

7試驗(yàn)技術(shù)要點(diǎn).................................................................................................................................................2

8樣本前處理.....................................................................................................................................................2

9樣本PMA預(yù)處理與核酸提取......................................................................................................................2

10擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增......................................................................................................................................2

11閾值設(shè)定..........................................................................................................................................................3

12樣本前處理......................................................................................................................................................3

13結(jié)果判斷..........................................................................................................................................................3

I

DB32/T3762.13—2021

新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第13部分:疊氮溴化丙錠-熒光PCR檢測程序

1范圍

本文件規(guī)定了新型冠狀病毒疊氮溴化丙錠-熒光PCR(PMA-qRT-PCR)檢測環(huán)境與設(shè)施、設(shè)備與耗

材、試劑與材料、樣本處理與核酸提取、擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增和結(jié)果判斷。

本文件適用于新型冠狀病毒PMA-qRT-PCR檢測,為判斷樣本中的新型冠狀病毒是否具有感染性提

供輔助手段。

2規(guī)范性引用文件

下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,

僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改版)適用于本

文件。

DB32/T3762.3新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第3部分:核酸熒光PCR檢測程序

新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南中華人民共和國國家衛(wèi)生健康委員會

新型冠狀病毒肺炎實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)指南中華人民共和國國家衛(wèi)生健康委員會

醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法原中華人民共和國衛(wèi)生部辦公廳

醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作導(dǎo)則原中華人民共和國衛(wèi)生部檢驗(yàn)中心

3術(shù)語和定義

3.1

疊氮溴化丙錠propidiummonoazide;PMA

一種具有高親和力的光敏反應(yīng)DNA結(jié)合染料,光解后,染料上的光敏疊氮基轉(zhuǎn)變?yōu)楦叻磻?yīng)性的氮

烯自由基,極容易與結(jié)合部位核酸的碳?xì)浠衔镄纬衫喂蘎NA或DNA修飾,修飾后的核酸不能用作PCR

反應(yīng)模板被擴(kuò)增。由于PMA不能透過活細(xì)胞膜,因此將PMA與PCR聯(lián)合使用可用于區(qū)分死活細(xì)胞、細(xì)

菌和病毒等。

4環(huán)境與設(shè)施

同DB32/T3762.3第4章。

5設(shè)備與耗材

BLU-V曝光系統(tǒng)或鹵素?zé)簦?50W),余同DB32/T3762.3第5章。

6試劑與材料

6.1試劑

1

DB32/T3762.13—2021

6.1.1病毒核酸提取試劑盒。

6.1.2qRT-PCR擴(kuò)增試劑盒。

6.1.3二甲基亞砜(DMSO)。

6.1.4磷酸鹽緩沖液(PBS,PH=7.4)。

6.1.5疊氮溴化丙錠(PMA)。

6.2材料

6.2.1新型冠狀病毒核酸檢測質(zhì)控品。

6.2.2消毒劑:75%乙醇、有效氯5500mg/L的消毒液(需每天新鮮配制)。

7試驗(yàn)技術(shù)要點(diǎn)

用于新型冠狀病毒核酸PMA-qRT-PCR檢測的樣本應(yīng)采用非滅活型病毒采樣管進(jìn)行采集。

8樣本前處理

8.1在BSL-2實(shí)驗(yàn)室生物安全柜內(nèi)打開樣本第二層包裝,取出待檢樣本,核對送檢單,若管壁外有不

明液體,應(yīng)用消毒劑擦拭。

8.2將樣本混勻后分裝于2mL帶螺旋蓋內(nèi)有墊圈凍存管。在凍存管上標(biāo)記,注明姓名、樣本類型、

日期等。吸取部分樣本進(jìn)行樣本PMA預(yù)處理與核酸提取。所有凍存管旋緊管蓋后需用封口膜密封。

9樣本PMA預(yù)處理與核酸提取

9.1樣本PMA預(yù)處理

9.1.1以20%二甲基亞砜(DMSO)將PMA配置成2mM濃度。

9.1.2將PMA加入到病毒樣品中使其達(dá)到200μM終濃度,同時(shí)取等量PBS加入到病毒樣本中作為

樣品對照組,并做好標(biāo)記。以同樣的方法對新型冠狀病毒核酸檢測質(zhì)控品(稀釋到500拷貝/mL)進(jìn)行

處理。

9.1.3將所有樣品管混合均勻,室溫孵育10min。

9.1.4孵育完成后使用BLU-V曝光系統(tǒng)或鹵素?zé)簦?50W,樣品置于冰上,距離燈源20cm)曝光15

min。

注:以上步驟均在避光條件下進(jìn)行。

9.2核酸提取

同DB32/T3762.3的7.2條。

10擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增

10.1將qRT-PCR擴(kuò)增引物和探針(Forward:5′-CCCTGTGGGTTTTACACTTAA-3′;Reverse:

5′-ACGATTGTGCATCAGCTGA-3′;Probe:5′-

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