生物信息學(xué)智慧樹知到期末考試答案章節(jié)答案2024年華東理工大學(xué)

生物信息學(xué)智慧樹知到期末考試答案+章節(jié)答案2024年華東理工大學(xué)LINUX不支持多個(gè)程序同時(shí)并獨(dú)立的運(yùn)行。

答案:錯(cuò)兩個(gè)蛋白質(zhì)序列相似性超過30%就是同源蛋白。

答案:錯(cuò)在代謝組學(xué)分析中，PLS-DA（偏最小二乘判別分析分析）是一種有監(jiān)督方法，需要事先確定樣品所屬的類別。

答案:對(duì)同源性是指一種很直接的數(shù)量關(guān)系，需實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

答案:錯(cuò)流平衡分析生成的代謝矩陣S中，反應(yīng)物的系數(shù)表示為正值，產(chǎn)物的系數(shù)表示為負(fù)值。

答案:錯(cuò)代謝網(wǎng)絡(luò)模型分為（）模型、（）模型和（）模型等三個(gè)層次。

答案:動(dòng)力學(xué)模型###計(jì)量模型###調(diào)控模型在全基因組代謝網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建時(shí)，一個(gè)代謝反應(yīng)只能由一種酶催化。

答案:錯(cuò)下面各種相互作用中，哪些屬于大分子間相互作用？

答案:蛋白-蛋白相互作用###基因-蛋白相互作用利用實(shí)驗(yàn)手段獲得蛋白質(zhì)等生物大分子三維結(jié)構(gòu)的方法有哪些？

答案:X射線衍射###核磁共振###冷凍電鏡美國政府于1990年10月啟動(dòng)被稱為生命科學(xué)“登月計(jì)劃”的人類基因組計(jì)劃,預(yù)期到2005年完成人類基因組大約（）億個(gè)堿基的全序列測定。

答案:30下面哪些代謝物組分析方法不需要有樣品的類別信息？

答案:主成分分析###層次聚類法13C代謝通量分析中，如果測量谷氨酸同位素豐度，最多能測量出幾種同位素異構(gòu)體的信息？

答案:32人類基因組計(jì)劃中，中國參與了（）%的測序工作？

答案:1生物信息學(xué)產(chǎn)生的背景源于美國政府于1990年10月啟動(dòng)的（）計(jì)劃。

答案:人類基因組計(jì)劃在蛋白質(zhì)功能預(yù)測中，通過比對(duì)數(shù)據(jù)庫相似性序列確定功能的原則是：超過（）個(gè)氨基酸的區(qū)段至少有25%相同為顯著匹配。

答案:80除了人工審核注釋的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫，以下哪個(gè)數(shù)據(jù)庫中收錄了由計(jì)算機(jī)翻譯或模擬獲得的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)？

答案:TrEMBL分子動(dòng)力學(xué)模擬通過求解（）來模擬分子體系的運(yùn)動(dòng)，獲得體系內(nèi)原子的運(yùn)動(dòng)軌跡。

答案:牛頓力學(xué)方程綜合考慮準(zhǔn)確性和計(jì)算速度，目前常用于對(duì)未知序列進(jìn)行數(shù)據(jù)庫相似性搜索的算法屬于以下哪種？

答案:Fasta或Blast利用X射線衍射、核磁共振、冷凍電鏡等技術(shù)獲得的生物大分子結(jié)構(gòu)，存儲(chǔ)于下列哪個(gè)生物大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫？

答案:PDBDavidBaker是研究蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)解析的領(lǐng)軍人物。

答案:錯(cuò)生物信息學(xué)就是“干”的實(shí)驗(yàn)科學(xué)，所有的研究結(jié)論從計(jì)算和預(yù)測中來，于“濕”實(shí)驗(yàn)中得到驗(yàn)證。

答案:對(duì)在全基因組代謝網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建時(shí)，一種酶只能催化一個(gè)代謝反應(yīng)。

答案:錯(cuò)在代謝組學(xué)分析中，PCA（主成分分析）是一種有監(jiān)督方法，需要事先明確樣品所屬類別。

答案:錯(cuò)生物信息學(xué)研究任務(wù)之一包括SNP的發(fā)現(xiàn)和鑒定，對(duì)于疾病機(jī)理和藥物開發(fā)靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)具有重要意義。

答案:對(duì)同源序列（Homolog）根據(jù)在同種屬和不同種屬可再分為直向同源序列（Ortholog）和旁系同源序列（Paralog）。

答案:對(duì)局部比對(duì)用于比較相似性程度較高的兩個(gè)序列的比對(duì)，找出兩個(gè)序列全長的最優(yōu)比對(duì)結(jié)果。

答案:錯(cuò)利用分子對(duì)接方法可以預(yù)測獲得蛋白質(zhì)和小分子的復(fù)合物結(jié)構(gòu)。

答案:對(duì)代謝組學(xué)能夠更準(zhǔn)確地反映生物體系的狀態(tài)，基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)告訴你什么可能會(huì)發(fā)生，而代謝組學(xué)則告訴你什么確實(shí)發(fā)生了。

答案:對(duì)網(wǎng)絡(luò)可以分為有向網(wǎng)絡(luò)和無向網(wǎng)絡(luò)，生物網(wǎng)絡(luò)都是無向網(wǎng)絡(luò)。

答案:錯(cuò)分子動(dòng)力學(xué)模擬是解析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能關(guān)系的重要手段之一，其主要理論基礎(chǔ)是求解牛頓力學(xué)方程。

答案:對(duì)國際核酸數(shù)據(jù)庫由EMBL，DDBJ和GenBank組成，它們?cè)?988年形成國際核酸數(shù)據(jù)庫聯(lián)合中心，對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行

答案:數(shù)據(jù)同步更新###數(shù)據(jù)格式相同###三方共享下面哪類生物分子屬于小分子物質(zhì)？

答案:氨基酸###抗生素全基因組代謝網(wǎng)絡(luò)模型可用于哪些方面研究？

答案:預(yù)測基因操作靶點(diǎn)###估算代謝通量分布###分析基因?qū)ιL的重要性分子動(dòng)力學(xué)模擬通過求解牛頓力學(xué)方程模擬分子體系的運(yùn)動(dòng)，獲得體系內(nèi)原子的運(yùn)動(dòng)軌跡。

答案:對(duì)代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)具有什么特點(diǎn)？

答案:相互作用關(guān)系復(fù)雜###高噪聲###高變異性###高維、小樣本隨著生物信息學(xué)的誕生及應(yīng)用，今后生物學(xué)研究項(xiàng)目的起點(diǎn)將是理論的，一位科學(xué)家將從理論推測開始，然后才轉(zhuǎn)向?qū)嶒?yàn)去追蹤或檢驗(yàn)該假設(shè)。

答案:對(duì)全基因組代謝網(wǎng)絡(luò)模型可整合基因組、蛋白組、代謝物組和代謝通量組等多組學(xué)數(shù)據(jù)，為全面了解細(xì)胞功能提供了便利條件。

答案:對(duì)分子對(duì)接的兩個(gè)理論基礎(chǔ)模型是（）模型和（）模型。

答案:誘導(dǎo)契合模型###鎖鑰模型分子鐘是用高度保守的核酸或蛋白質(zhì)分子變異程度來度量時(shí)間的一個(gè)尺度。

答案:對(duì)IluminaSolexa測序技術(shù)的技術(shù)缺點(diǎn)是不能測定很長的序列，其根本原因在于

答案:難以做到所有反應(yīng)隨著時(shí)間和測序長度的平齊性：###DNA聚合酶隨著反應(yīng)時(shí)間效率的衰減對(duì)生物體系代謝產(chǎn)物的分析可分為哪幾個(gè)層次。

答案:代謝指紋分析###代謝靶標(biāo)分析###代謝輪廓分析###代謝組分析序列比對(duì)根據(jù)比對(duì)的計(jì)算方法可以分為（）比對(duì)和（）比對(duì)。

答案:全局序列比對(duì)###局部序列比對(duì)生物學(xué)工作者向Genbank數(shù)據(jù)庫提交大量序列或較復(fù)雜序列的獨(dú)立程序是（）。

答案:Sequin在蛋白質(zhì)功能預(yù)測中，通過比對(duì)數(shù)據(jù)庫相似性序列確定功能的原則是：超過80個(gè)氨基酸的區(qū)段至少有（）相同為顯著匹配。

答案:25%二代測序技術(shù)平臺(tái)因?yàn)椴捎么笠?guī)模平行測序思路，可以用于統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，因此有很多應(yīng)用領(lǐng)域

答案:ChIP-seq###sRNA-seq###RNA-seq###Tnseq哪種組學(xué)數(shù)據(jù)不能通過儀器直接測量出來，只可通過計(jì)算得到？

答案:代謝通量組如果要構(gòu)建進(jìn)化樹，首先需要對(duì)序列進(jìn)行。

答案:多序列比對(duì)IluminaSolexa測序技術(shù)的核心步驟是邊測序邊合成(SBS)，其中每一步加入一種熒光標(biāo)記以及修飾過的堿基，其目的在于（）：

答案:阻斷擴(kuò)增反應(yīng)二代測序技術(shù)技術(shù)總體特征不包括的是：

答案:熒光拍照生物信息學(xué)的研究目標(biāo)：以（）和（）等生物大分子數(shù)據(jù)為主要對(duì)象。

答案:核酸###蛋白（）是NCBI提供的集成檢索工具，通過一次檢索可查詢NCBI多個(gè)子數(shù)據(jù)庫中的相關(guān)信息。

答案:Entrez在核酸數(shù)據(jù)庫中比對(duì)核酸序列，需要選擇一下那種blast模式？

答案:blastn當(dāng)目標(biāo)蛋白質(zhì)和模板蛋白的序列比對(duì)完成后，同源建模方法如何對(duì)目標(biāo)蛋白的主鏈結(jié)構(gòu)進(jìn)行建模？

答案:根據(jù)結(jié)構(gòu)保守區(qū)將模板結(jié)構(gòu)的坐標(biāo)直接拷貝到目標(biāo)蛋白中生物信息學(xué)方法識(shí)別基因主要的兩個(gè)途徑：基因組外顯子識(shí)別和EST策略，其中人類基因組（）序列均可用前者預(yù)測，但基因的完整預(yù)測準(zhǔn)確性僅20%。

答案:90%生物序列數(shù)據(jù)庫包括核酸序列數(shù)據(jù)庫和蛋白序列數(shù)據(jù)庫，以下哪個(gè)不屬于蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫？

答案:OMIM截止到2019年5月，我國運(yùn)算速度最快的超算是以下哪個(gè)？

答案:神威太湖之光能統(tǒng)籌兼顧準(zhǔn)確性和計(jì)算量的分子對(duì)接算法是一下哪種？

答案:半柔性對(duì)接一般情況下，序列一致性需高于多少，同源建模預(yù)測得到的三維結(jié)構(gòu)被認(rèn)為是可靠的？

答案:30%在各種代謝物組學(xué)分析方法中，哪種方法不需要識(shí)別出化合物？

答案:代謝指紋分析生物序列常使用的序列文件格式為（），是最簡單的格式，第一行以“>”表示一個(gè)序列的開始。

答案:FASTA合成生物學(xué)的研究內(nèi)容包括：合成代謝網(wǎng)絡(luò)、遺傳/基因線路的設(shè)計(jì)與構(gòu)建、細(xì)胞群體系統(tǒng)及多細(xì)胞系統(tǒng)研究、數(shù)學(xué)模擬和功能預(yù)測。

答案:對(duì)R語言中，需要安裝軟件包時(shí)需要調(diào)用的命令是（）？

答案:install.packages()在代謝網(wǎng)絡(luò)中，每一個(gè)節(jié)點(diǎn)代表一個(gè)（）？

答案:代謝物L(fēng)inux是一款免費(fèi)的操作系統(tǒng)，用戶可以通過網(wǎng)絡(luò)或其他途徑免費(fèi)獲得，并可以任意修改其源代碼。

答案:對(duì)Linux系統(tǒng)非常獨(dú)立，不能在Windows下運(yùn)行Linux環(huán)境。

答案:錯(cuò)利用R可以繪制并分析基因芯片數(shù)據(jù)的火山圖來顯示差異基因及p-value。

答案:對(duì)R是生物信息分析中非常重要的工具，可以實(shí)現(xiàn)以下哪些功能？

答案:測序數(shù)據(jù)分析###生態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)分析###進(jìn)化樹分析###聚類分析在生物信息學(xué)研究中使用Linux系統(tǒng)的優(yōu)勢在于？

答案:Linux系統(tǒng)支持集群計(jì)算機(jī)的使用###Linux系統(tǒng)支持多種平臺(tái)，并且不斷更新###Linux系統(tǒng)是科學(xué)研究的通用平臺(tái)###Linux系統(tǒng)是免費(fèi)的以下哪些屬于生物網(wǎng)絡(luò)？

答案:蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)###基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)###代謝網(wǎng)絡(luò)###信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)生物學(xué)是在系統(tǒng)層面上研究生命現(xiàn)象的一門學(xué)科，最基本的模型是網(wǎng)絡(luò)模型。

答案:對(duì)全基因組代謝網(wǎng)絡(luò)模型是基于基因-蛋白-代謝反應(yīng)三者之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系建立起來的？

答案:對(duì)代謝物組分析可在代謝靶標(biāo)分析、代謝物譜分析和代謝指紋分析三個(gè)層次上開展。

答案:對(duì)在主成分分析中，兩個(gè)樣品在得分圖上的距離越近，它們屬于同一類別的可能性就越大。

答案:對(duì)流平衡分析不但考慮了代謝反應(yīng)的化學(xué)計(jì)量信息，也包含了代謝反應(yīng)的調(diào)控信息。

答案:錯(cuò)下面哪些方法可用在代謝物組學(xué)分析中應(yīng)用？

答案:質(zhì)譜法###核磁共振法###光譜法下面哪些測量值可作為流平衡分析的約束條件？

答案:產(chǎn)物生成速率###同位素豐度代謝網(wǎng)絡(luò)研究所建立的模型可分為計(jì)量模型、調(diào)控模型和動(dòng)力學(xué)模型三種。

答案:對(duì)常用的代謝物分離方法包括哪些？

答案:液相色譜法###氣相色譜法###毛細(xì)管電泳法代謝物組研究的對(duì)象是什么？

答案:內(nèi)源性化合物13C代謝通量分析中，測量丙氨酸同位素豐度時(shí)，最多能測量出幾種同位素異構(gòu)體的信息？

答案:8PDB數(shù)據(jù)庫中同時(shí)包含了利用實(shí)驗(yàn)解析和計(jì)算模擬的生物大分子的三維結(jié)構(gòu)信息。

答案:錯(cuò)分子對(duì)接可以分為哪幾種類型？

答案:半柔性對(duì)接###剛性對(duì)接###柔性對(duì)接以下哪項(xiàng)參數(shù)無法通過一級(jí)序列的理化性質(zhì)計(jì)算獲得？

答案:進(jìn)化關(guān)系分子動(dòng)力學(xué)模擬可以獲得蛋白質(zhì)在溶液中一段時(shí)間內(nèi)的運(yùn)動(dòng)情況，但是消耗計(jì)算資源。

答案:對(duì)以下分子力場中，不屬于非鍵作用的是（）？

答案:鍵的伸縮蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測的方法包括哪些？

答案:同源建模###折疊識(shí)別###從頭預(yù)測以下關(guān)于同源建模的說法中，表述錯(cuò)誤的是（）？

答案:同源建模時(shí)只能選擇一個(gè)結(jié)構(gòu)作為模板來建模疏水作用力是蛋白質(zhì)折疊的主要驅(qū)動(dòng)力，氨基酸親疏水性等分析為高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測提供參。

答案:對(duì)UniProt數(shù)據(jù)庫整合了哪三大數(shù)據(jù)庫資源？

答案:PIR-PSD###Swiss-Prot###TrEMBL利用計(jì)算手段預(yù)測的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)能達(dá)到很高的準(zhǔn)確性，不需要再進(jìn)行優(yōu)化了。

答案:錯(cuò)IluminaSolexa測序技術(shù)的技術(shù)缺點(diǎn)是不能測定很長的序列，其根本原因在于PCR擴(kuò)增摻入堿基時(shí)，難以做到所有反應(yīng)隨著時(shí)間和測序長度的平齊性。

答案:對(duì)二代測序技術(shù)技術(shù)總體思路是統(tǒng)計(jì)學(xué)（大量重復(fù)）、分子生物學(xué)（如PCR和連接反應(yīng)）和微液滴/微流控化學(xué)反應(yīng)

答案:對(duì)二代測序技術(shù)平臺(tái)包括

答案:IlluminaSolexa###454平臺(tái)IluminaSolexa對(duì)測序?qū)ο筮M(jìn)行測序時(shí)需要采用P5和P7引物進(jìn)行擴(kuò)增，其目的是與芯片中植入的寡核苷酸進(jìn)行配對(duì)，從而固定到芯片上，為后續(xù)邊測序邊合成打下良好基礎(chǔ)。

答案:對(duì)與IlluminaSolexa相比，454測序技術(shù)平臺(tái)的缺點(diǎn)是熒光試劑成本高，而且會(huì)產(chǎn)生相同堿基的連續(xù)摻入。

答案:對(duì)基因結(jié)構(gòu)的預(yù)測是基因組測序后的最重要一個(gè)步驟，真核生物和原核生物因?yàn)槊艽a子表的不同，方法會(huì)有所不同。各種預(yù)測方法得到的結(jié)果也有所不同

答案:對(duì)隨著鏈特異性轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)等的大量應(yīng)用，為基因的鑒定提供了一個(gè)更為直接的工具和數(shù)據(jù)庫

答案:對(duì)CodonW是密碼子偏好性分析軟件，以下哪些功能可以用該軟件分析

答案:密碼子適應(yīng)指數(shù)###最優(yōu)密碼子使用頻率###有效密碼子數(shù)###密碼子偏性指數(shù)基因的預(yù)測軟件主要有

答案:CpGPlot###GENOMESCAN###GENSCANCpG島指的是一段（）bp長度的DNA序列，G+C含量達(dá)到（）以上，與基因的存在相關(guān)性達(dá)到60-80%以上

答案:200，50全局序列比對(duì)用于整體相似性程度較低、在較小區(qū)域內(nèi)有局部相似性的兩個(gè)序列比對(duì)。

答案:錯(cuò)在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中比對(duì)蛋白質(zhì)序列，需要選擇一下那種blast模式？

答案:blastp傳統(tǒng)的基于動(dòng)態(tài)規(guī)劃的局部性比對(duì)性算法采用的是精確的序列比對(duì)，雖然有著較好的比較結(jié)果，但是算法的時(shí)間復(fù)雜度較高。

答案:對(duì)多序列比對(duì)就是兩條以上的序列進(jìn)行比對(duì)，可以用于進(jìn)化樹分析、尋找保守區(qū)域等。

答案:對(duì)以下哪些屬于蛋白質(zhì)打分矩陣？

答案:遺傳密碼矩陣###PAM矩陣###BLOSUM矩陣###疏水矩陣BLAST是基于局部比對(duì)算法，采用漸進(jìn)式比對(duì)方法，對(duì)數(shù)據(jù)分成字段等思路進(jìn)行的成對(duì)比對(duì)方法

答案:對(duì)生物信息學(xué)的研究對(duì)象中包括各種數(shù)據(jù)庫，比如

答案:PDB###GenBank###Uniprot###KEGGGenBank對(duì)于核酸數(shù)據(jù)的顯示方式有以下幾種

答案:Graph###ASN.1###FASTA###GBKUniprotKB對(duì)于生物數(shù)據(jù)在不同數(shù)據(jù)