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文檔簡介
DNA損傷與修復
DNADamageandRepair第十五章第15章DNA損傷與修復各種體內外因素所導致的DNA組成與結構的變化稱為DNA損傷(DNAdamage)其一,DNA的結構發(fā)生永久性改變,即突變
其二,導致DNA失去作為復制和/或轉錄的模板的功能DNA損傷的后果:第15章DNA損傷與修復生物多樣性依賴于:DNA突變DNA修復平衡第15章DNA損傷與修復DNA損傷DNADamage第一節(jié)第15章DNA損傷與修復一、多種因素通過不同機制導致DNA損傷(一)體內因素DNA復制錯誤
DNA自身的不穩(wěn)定性機體代謝過程中產生的活性氧第15章DNA損傷與修復DNA復制錯誤:在DNA復制過程中,堿基的異構互變、4種dNTP之間濃度的不平衡等均可能引起堿基的錯配DNA復制的錯配率約1/1010復制錯誤還表現為片段的缺失或插入。特別是DNA上的短片段重復序列,在真核細胞染色體上廣泛分布,導致DNA復制系統(tǒng)工作時可能出現“打滑”現象,使得新生成的DNA上的重復序列拷貝數發(fā)生變化。
第15章DNA損傷與修復DNA自身的不穩(wěn)定性
:DNA結構自身的不穩(wěn)定性是DNA自發(fā)性損傷中最頻繁和最重要的因素。當DNA受熱或所處環(huán)境的pH值發(fā)生改變時,DNA分子上連接堿基和核糖之間的糖苷鍵可自發(fā)發(fā)生水解,導致堿基的丟失或脫落,其中以脫嘌呤最為普遍。含有氨基的堿基還可能自發(fā)脫氨基反應,轉變?yōu)榱硪环N堿基,即堿基的轉變,如C轉變?yōu)閁,A轉變?yōu)镮(次黃嘌呤)等。第15章DNA損傷與修復(二)體外因素物理因素化學因素生物因素第15章DNA損傷與修復物理因素:電離輻射、紫外線(ultraviolet,UV)第15章DNA損傷與修復化學因素:自由基導致的DNA損傷堿基類似物導致的DNA損傷堿基修飾劑、烷化劑導致的DNA損傷嵌入性染料導致的DNA損傷第15章DNA損傷與修復物理和化學因素對DNA的損傷第15章DNA損傷與修復二、DNA損傷有多種類型
堿基脫落堿基結構破壞嘧啶二聚體形成DNA單鏈或雙鏈斷裂DNA交聯(lián)第15章DNA損傷與修復堿基損傷與糖基破壞:化學毒物可通過對堿基的某些基團進行修飾而改變堿基的性質。由于堿基損傷或糖基破壞,在DNA鏈上可能形成一些不穩(wěn)定點,最終可導致DNA鏈的斷裂。第15章DNA損傷與修復堿基之間發(fā)生錯配
:堿基類似物的摻入、堿基修飾劑的作用可改變堿基的性質,導致DNA序列中的錯誤配對。在正常的DNA復制過程中,存在著一定比例的自發(fā)堿基錯配。最常見的是組成RNA的尿嘧啶替代胸腺嘧啶摻入到DNA分子中。第15章DNA損傷與修復DNA鏈發(fā)生斷裂:電離輻射、化學毒劑、磷酸二酯鍵的斷裂、脫氧戊糖的破壞、堿基的損傷和脫落都是引起DNA斷裂的原因。堿基損傷或糖基破壞可引起DNA雙螺旋局部變性,形成酶敏感性位點,特異的核酸內切酶能識別并切割這樣的部位,造成鏈斷裂。DNA鏈上被損傷的堿基也可以被另一種特異的DNA-糖基化酶除去,形成無嘌呤嘧啶位點(apurinic-apyrimidinicsite,APsite),或稱無堿基位點(abasicsite),這些位點在內切酶等的作用下可形成鏈斷裂。第15章DNA損傷與修復DNA
的共價交聯(lián):DNA雙螺旋鏈中的一條鏈上的堿基與另一條鏈上的堿基以共價鍵結合,稱為DNA鏈間交聯(lián)(DNAinterstrandcross-linking)。DNA分子中同一條鏈中的兩個堿基以共價鍵結合,稱為DNA鏈內交聯(lián)(DNAintrastrandcross-linking)。DNA分子還可與蛋白質以共價鍵結合,稱為DNA-蛋白質交聯(lián)(DNAproteincross-linking)。第15章DNA損傷與修復DNA損傷可導致堿基置換缺失插入鏈的斷裂
轉換顛換第15章DNA損傷與修復DNA損傷的修復TherepairofDNAdamage第二節(jié)第15章DNA損傷與修復DNA修復(DNArepair)是指糾正DNA兩條單鏈間錯配的堿基、清除DNA鏈上受損的堿基或糖基、恢復DNA的正常結構的過程。DNA修復是機體維持DNA結構的完整性與穩(wěn)定性,保證生命延續(xù)和物種穩(wěn)定的重要環(huán)節(jié)。
第15章DNA損傷與修復常見的DNA損傷修復途徑修復途徑修復對象參與修復的酶或蛋白
光復活修復嘧啶二聚體光復活酶
堿基切除修復受損的堿基DNA糖基化酶、無嘌呤嘧啶核酸內切酶
核苷酸切除修復嘧啶二聚體、DNA螺旋結構的改變大腸桿菌中UvrA、UvrB、UvrC和UvrD,人XP系列蛋白XPA、XPB、XPC……XPG等
錯配修復復制或重組中的堿基配對錯誤大腸桿菌中的MutH、MutL、MutS,人的MLH1、MSH2、MSH3、MSH6等
重組修復雙鏈斷裂RecA蛋白、Ku蛋白、DNA-PKcs、XRCC4
損傷跨越修復大范圍的損傷或復制中來不及修復的損傷RecA蛋白、LexA蛋白、其他類型DNA聚合酶
第15章DNA損傷與修復一、有些DNA損傷可以直接修復
嘧啶二聚體的直接修復
烷基化堿基的直接修復
無嘌呤位點的直接修復
單鏈斷裂的直接修復
第15章DNA損傷與修復嘧啶二聚體的直接修復第15章DNA損傷與修復烷基化堿基的直接修復第15章DNA損傷與修復無嘌呤位點的直接修復
DNA嘌呤插入酶能催化游離嘌呤堿基或脫氧核苷與DNA嘌呤缺如部位重新生成糖苷共價鍵,導致嘌呤堿基的直接插入。具有很強的專一性。單鏈斷裂的直接修復
DNA連接酶能夠催化DNA雙螺旋結構中一條鏈上缺口處的5
-磷酸基團與相鄰片段的3
-羥基之間形成磷酸二酯鍵,從而直接參與部分DNA單鏈斷裂的修復,如電離輻射所造成的切口。第15章DNA損傷與修復二、切除修復是最普遍的DNA損傷修復方式
堿基切除修復
核苷酸切除修復
第15章DNA損傷與修復堿基切除修復(baseexcisionrepair)
①識別水解:DNA糖基化酶特異性識別DNA鏈中已受損的堿基并將其水解去除,產生一個無堿基位點;②切除:在此位點的5
端,無堿基位點核酸內切酶將DNA鏈的磷酸二酯鍵切開,去除剩余的磷酸核糖部分;③合成:DNA聚合酶在缺口處以另一條鏈為模板修補合成互補序列;④連接:由DNA連接酶將切口重新連接,使DNA恢復正常結構
第15章DNA損傷與修復第15章DNA損傷與修復核苷酸切除修復(nucleotideexcisionrepair)
①首先,由一個酶系統(tǒng)識別DNA損傷部位;②其次,在損傷兩側切開DNA鏈,去除兩個切口之間的一段受損的寡核苷酸;③再次,在DNA聚合酶作用下,以另一條鏈為模板,合成一段新的DNA,填補缺損區(qū);④最后由連接酶連接,完成損傷修復。第15章DNA損傷與修復E.coli的NER主要由4種蛋白質組成:UvrAUvrBUvrCUvrD
第15章DNA損傷與修復人類的DNA損傷核苷酸切除修復①首先由損傷部位識別蛋白XPC和XPA等,再加上DNA復制所需的SSB,結合在損傷DNA的部位;②XPB、XPD發(fā)揮解旋酶的活性,與上述物質共同作用在受損DNA周圍形成一個凸起;③XPG與XPF發(fā)生構象改變,分別在凸起的3′-端和5′-端發(fā)揮核酸內切酶活性,在增殖細胞核抗原(PCNA)的幫助下,切除并釋放受損的寡核苷酸;④遺留的缺損區(qū)由聚合酶δ或ε進行修補合成;⑤最后,由連接酶完成連接。
第15章DNA損傷與修復NER不僅能夠修復整個基因組中的損傷,而且能拯救因轉錄模板鏈損傷而暫停轉錄的RNA聚合酶,即參與轉錄偶聯(lián)修復(transcription-coupledrepair)。作用方式:NER蛋白質被募集于暫停的RNA聚合酶。轉錄偶聯(lián)修復的意義:將修復酶集中于正在轉錄DNA,使該區(qū)域的損傷盡快得以修復。第15章DNA損傷與修復堿基錯配修復(mismatchrepair)錯配是指非Watson-Crick堿基配對。堿基錯配修復也可被看作是堿基切除修復的一種特殊形式,主要負責糾正:①復制與重組中出現的堿基配對錯誤;②因堿基損傷所致的堿基配對錯誤;③堿基插入;④堿基缺失。第15章DNA損傷與修復E.coli錯配修復系統(tǒng)修復復制差錯第15章DNA損傷與修復Dam甲基化酶(methylase)使E.coli處于暫時的半甲基化狀態(tài),標記母鏈和新合成的DNA鏈,幫助新合成的DNA鏈被錯配修復系統(tǒng)識別并修復。第15章DNA損傷與修復模板鏈的GATC序列甲基化MutH僅切割新合成的DNA鏈第15章DNA損傷與修復MutH的切口位于錯配核苷酸的5
側,使用外切酶Ⅶ或RecJ,按5
3
方向降解DNA;切口位于錯配的3’側,則使用外切酶Ⅰ,按3
5
方向降解DNA。DNA聚合酶Ⅲ填補所產生單鏈DNA缺口。第15章DNA損傷與修復MSH(MutShomologs)蛋白與MutL同源的MLH和PMS蛋白真核細胞錯配修復系統(tǒng)無MutH,也無半甲基化標記母鏈。錯配修復系統(tǒng)利用岡崎片段連接前的DNA缺口辨別錯配堿基所在的DNA鏈。真核細胞核苷酸修復錯配系統(tǒng):第15章DNA損傷與修復三、DNA嚴重損傷時需要重組修復
同源重組修復
非同源末端連接的重組修復
第15章DNA損傷與修復同源重組修復第15章DNA損傷與修復四、某些修復發(fā)生在跨越損傷DNA的復制事件之后
重組跨越損傷修復
合成跨越損傷修復
第15章DNA損傷與修復SOS修復中LexA-RecA操縱子的作用機制第15章DNA損傷與修復DNA損傷和修復的意義ThesignificanceofDNAdamageandrepair第三節(jié)第15章DNA損傷與修復
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