(高清版)GB∕T 39367.1-2020 體外診斷檢驗系統(tǒng) 病原微生物檢測和鑒定用核酸定性體外檢驗程序 第1部分：通 用要求、術(shù)語和定義

體外診斷檢驗系統(tǒng)病原微生物檢測和鑒定用核酸定性體外檢驗程序國家市場監(jiān)督管理總局國家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會IGT/T39367《體外診斷檢驗系統(tǒng)病原微生物檢測和鑒定用核酸定性體外檢驗程序》計劃由以下本部分為GB/T39367的第1部分。本部分使用翻譯法等同采用ISO/TS17822-1:2014《體外診斷檢驗系統(tǒng)病原微生物檢測和鑒定——YY/T0287—2017醫(yī)療器械質(zhì)量管理體系用于法規(guī)的要求(ISO13485:2016,IDT)。ⅡGB/T39367.1—2020/ISO/TS1ISO/TS17822-1對用于人體樣本中微生物病原體檢測和鑒定的體外診斷核酸定性檢驗程序的相證。即以客觀證據(jù)證明，驗證過的檢驗程序已成功地從實驗室或IVD制造商移植到醫(yī)學(xué)實驗室終端。1GB19781—2005醫(yī)學(xué)實驗室安全要求(ISO15190:2003,IDT)GB/T22576.1—2018醫(yī)學(xué)實驗室質(zhì)量和能力的要求第1部分：通用要求(ISO15189:2012,GB/T29791.1—2013體外診斷醫(yī)療器械制造商提供的信息(標(biāo)示)第1部分：術(shù)語、定義和GB/T29791.2—2013體外診斷醫(yī)療器械制造商提供的信息(標(biāo)示)第2部分：專業(yè)GB/T29791.3—2013體外診斷醫(yī)療器械制造商提供的信息(標(biāo)示)第3部分：專業(yè)用體外診YY/T0316—2016醫(yī)療器械風(fēng)險管理對醫(yī)療器械的應(yīng)用(ISO14971:2007,IDT)YY/T1579—2018體外診斷醫(yī)療器械體外診斷試劑穩(wěn)定性評價(ISO23640:2011,IDT)ISO13485:2003醫(yī)療器械質(zhì)量管理體系用于法規(guī)的要求(Medicaldevices—Qualityman-2GB/T39367.1—2020/ISO/TS1臨床準(zhǔn)確度3GB/T39367.1—202《檢驗醫(yī)學(xué)>體外診斷檢驗程序產(chǎn)生的特定臨床條件或生理狀態(tài)相關(guān)的結(jié)果與目標(biāo)人群和預(yù)定用戶一致的能力。[來源：GHTF/SG5/N6:2012,4.4.2,臨床靈敏度clinicalsensitivity診斷靈敏度diagnosticsensitivity《檢驗醫(yī)學(xué)>體外診斷檢驗程序可以識別與特定疾病或狀態(tài)相關(guān)的目標(biāo)標(biāo)志物存在的能力。臨床特異性clinicalspecificity《檢驗醫(yī)學(xué)>體外診斷檢驗程序可以識別特定疾病或狀態(tài)相關(guān)的目標(biāo)標(biāo)志物不存在的能力?！稒z驗醫(yī)學(xué))體外診斷檢驗結(jié)果的效用以及對患者和(或)廣泛人群的價值。在逆轉(zhuǎn)錄酶存在下合成的與給定的RNA互補的單鏈DNA,作為合成DNA拷貝的模板。污染物contamination引入的非預(yù)期的材料或物質(zhì)。<檢驗醫(yī)學(xué)>用于鑒別樣品，作為判斷特定疾病、狀態(tài)或被測量存在或不存在的界限的量值。4GB/T39367.1—2020/IS變性denaturation破壞或改變分析物的結(jié)構(gòu)、功能、酶或抗原特性的物理和/或(生物)化學(xué)處理。脫氧核糖核苷三磷酸deoxyribonucleosidetriphosphate;dNTP含有脫氧腺苷三磷酸(dATP)、脫氧胞苷三磷酸(dCTP)、脫氧鳥苷三磷酸(dGTP)、脫氧胸苷三磷酸(dTTP)和/或脫氧尿苷三磷酸(dUTP)的溶液。檢出限detectionlimit;limitofdetection由給定測量程序測得的量值，對于此值，錯誤地聲稱被測物質(zhì)中存在該成分的概率為α,錯誤地聲稱不存在該成分的概率為β。[來源：BIPMJCGM脫氧核糖核酸deoxyribonucleicacid;DNA以雙鏈(dsDNA)或單鏈(ssDNA)形式存在的脫氧核糖核苷酸聚合物。PCR用DNA聚合酶DNApolymeraseforPCR反復(fù)催化DNA合成的耐熱酶。DNA測序DNAsequencing設(shè)備確認(rèn)equipmentqualification通過檢查、測試和文件確認(rèn)正確的設(shè)備已按照事先確定的要求正確安裝和運行。外擴(kuò)增對照externalamplificationcontrol以確定量或拷貝數(shù)添加到一份分裝的提取核酸中的對照DNA,作為獨立反應(yīng)的擴(kuò)增對照。正向工作流單向工作流《檢驗醫(yī)學(xué)>物料/樣品處理的原則，用于確保原始樣品與處理過的樣品(包括擴(kuò)增后的DNA)在整5將確定量或拷貝數(shù)的已知DNA添加到每個PCR反應(yīng)體系中的對照DNA,作為擴(kuò)增反應(yīng)的內(nèi)部多重PCRmultiplexP使用多對引物進(jìn)行的PCR反應(yīng)。6存在DNA聚合酶和三磷酸脫氧核糖核苷酸時，與互補DNA序列雜交，作為DNA合成起始點的在引物序列的3'端加入單個脫氧核糖核苷酸形成新DNA鏈的酶促反應(yīng)過程。使DNA和/或RNA更為純凈的過程。陽性PCR對照positivePCR含一定量或拷貝數(shù)目標(biāo)核酸的PCR反應(yīng)。7由RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA和PCR擴(kuò)增8GB/T39367.1—2020/ISO/TS1用作擴(kuò)增的DNA序列。運行PCR反應(yīng)溫度轉(zhuǎn)換程序的自動裝置。a)定義預(yù)期醫(yī)療用途；ISO13485:2003中4.2.3的要求適用于與制定檢驗程序有關(guān)的文件和記錄的控制。應(yīng)按照GB/T29791.1—2013、GB/T29791.2—2013和GB/T29791.3—2013的要求編寫使用說9GB/T39367.1—202GB/T22576.1—2018中4.3和4.13的要求適用于文件和記錄的控制。實施未經(jīng)修改且經(jīng)確認(rèn)的基于核酸的體外診斷檢驗程序的醫(yī)學(xué)實驗室，應(yīng)在其投入常規(guī)使用前對其性能進(jìn)行驗證。適用于GB/T22576.1—2018中的要求。對經(jīng)確認(rèn)的檢驗過程的后續(xù)修改應(yīng)得到驗證。適用于GB/T22576.1—2018中的要求。標(biāo)本的收集、運輸和儲存要求應(yīng)在使用說明中規(guī)定。適用于GB/T29791.2—2013的要求。應(yīng)特別注意標(biāo)本采集、運輸和儲存對標(biāo)本的核酸提取所需步驟的潛在影響。醫(yī)療實驗室應(yīng)將標(biāo)本采集、運輸和儲存的要求作為說明納入樣品采集手冊的相應(yīng)章節(jié)。4.3目標(biāo)核酸序列的選擇選擇目標(biāo)核酸序列的標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)在使用說明中規(guī)定。目標(biāo)序列應(yīng)根據(jù)目標(biāo)微生物病原體的核酸進(jìn)行鑒定。應(yīng)酌情使用公開的核酸序列數(shù)據(jù)庫，評估目標(biāo)序列與其他生物之間的同源程度。實驗室應(yīng)定期檢查序列數(shù)據(jù)庫以了解更新情況，以確定是否需要修改實驗室的技術(shù)程序。如果之前的證據(jù)不足以表明目標(biāo)序列普遍存在于目標(biāo)病原微生物中，應(yīng)檢驗足夠數(shù)量的菌株以提供其普遍存在于目標(biāo)病原體的統(tǒng)計學(xué)確認(rèn)證據(jù)。4.4引物(或引物序列)的選擇選擇引物序列的程序應(yīng)被設(shè)計用于檢測目標(biāo)微生物病原體。選擇引物的過程應(yīng)遵循適當(dāng)?shù)脑O(shè)計標(biāo)準(zhǔn)，例如，長度、鳥嘌呤和胞嘧啶含量、熔形成和非同源性互補配對，以便于檢測目標(biāo)病原微生物。應(yīng)評價多對引物以達(dá)到預(yù)期性能。4.5核酸制備和穩(wěn)定性應(yīng)在使用說明中定義、確認(rèn)并記錄確保核酸充足制備與提取后核酸穩(wěn)定的條件。從樣本中提取的核酸的純度、完整性和產(chǎn)量應(yīng)足以滿足預(yù)期用途。如果樣品中沒有足夠的核酸，則應(yīng)使用同一樣品重復(fù)提取，或收集另一樣品進(jìn)行提取。實驗室應(yīng)按照使用說明制備和儲存核酸提取物，以確保純度、完整性和穩(wěn)定性足以進(jìn)行檢驗。GB/T39367.1—2020/ISO/TS1中，目標(biāo)序列的體外擴(kuò)增通過DNA聚合酶的催化應(yīng)規(guī)定和確認(rèn)試劑的穩(wěn)定性和儲存條件，并在使用說明中說明。適用于YY/T1579—2018和GB/T29791.2—2013的要求。2013中7.13的要求適用。與預(yù)期用途有關(guān)的性能特征，在檢驗程序投入常規(guī)使用前，應(yīng)由醫(yī)學(xué)實驗室進(jìn)行驗證。適用于GB/T39367.1—2020/ISO/TSGB/T22576.1—2018中的要求。測量不確定度應(yīng)足以滿足預(yù)期用途。實驗室應(yīng)制定質(zhì)量保證程序，并考慮使用說明中的建議。應(yīng)記錄選擇控制物質(zhì)和控制程序的理由。在任何影響檢驗的程序更改后，應(yīng)重新評估相關(guān)的性能特征，并定期進(jìn)行審查。重新評估的頻率應(yīng)基于與錯誤結(jié)果相關(guān)的風(fēng)險。檢測和鑒定目標(biāo)微生物病原體的分析臨界值應(yīng)根據(jù)預(yù)期用途的要求確立。檢驗程序最初投入使用時，應(yīng)驗證臨界值，并應(yīng)在批次變更、儀器維護(hù)和適用于預(yù)期用途的周期內(nèi)進(jìn)行驗證。應(yīng)確定95%置信度的樣品中可檢測到的目標(biāo)DNA序列的最小量。檢出限應(yīng)在檢驗程序最初投入使用時進(jìn)行驗證，并應(yīng)在批次變更(如新的主混合料)、儀器維護(hù)以及適用于預(yù)期用途的周期內(nèi)進(jìn)行驗證。應(yīng)在整個檢驗過程中確定目標(biāo)微生物病原體的分析特異性。交叉反應(yīng)性應(yīng)由一組相關(guān)生物體進(jìn)行檢查。干擾應(yīng)由一組相關(guān)內(nèi)源和外源物質(zhì)進(jìn)行檢查。假陽性率應(yīng)以足夠數(shù)量的無靶序列的樣品(陰性標(biāo)本)確定。應(yīng)評價樣本處理程序從核酸提取步驟到微生物病原體的檢測和鑒定步驟中對檢驗程序的干擾。在適當(dāng)情況下，應(yīng)確定測量結(jié)果的相關(guān)精密度特征。測量精密度應(yīng)在檢驗程序最初投入使用時進(jìn)行驗證，并應(yīng)持續(xù)監(jiān)測。合適的控制物質(zhì)可用于監(jiān)測測量精密度。監(jiān)測間隔應(yīng)適合預(yù)期用途。GB/T39367.1—2020/ISO/TS1b)人員流動和單項工作流程從樣品制備區(qū)到樣品分析區(qū)。文件化實驗室程序(見5.3.3),以減少f)PCR擴(kuò)增子的后續(xù)操作(如凝膠電泳或DNA測序),在打開PCR反應(yīng)管蓋之前短暫離心。h)不允許將在含有樣品核酸或擴(kuò)增子的區(qū)域(污染區(qū)域)打印的凝膠電泳照片移至不含有樣品核括進(jìn)行分析所需的軟件。適用于GB/T22576.1—2018中5.3的要求。適用于GB/T22576.1—2018中5.10的要求。2018中5.1的要求。應(yīng)執(zhí)行適當(dāng)?shù)馁|(zhì)量保證程序確保核酸檢驗結(jié)果的質(zhì)量。適用于GB/T22576.1—2018中5.6的應(yīng)實施適當(dāng)?shù)某绦蛞源_保及時報告結(jié)果。適用于GB/T22576.1—2018中5.8的要求。b)采樣日期和檢驗日期；GB/T39367.1—2020/ISO/TS1醫(yī)療實驗室應(yīng)確保實驗室工作人員和服務(wù)人員的安全和防護(hù)。適用于GB19781—2005的要求。[1]ISO21569:2005Foodstuffs—Methodsofanalysisforthedeteorganismsandderivedprodu[2]ISO21571:2005Foodstuffs—Methodsofanalysisforthedete[3]ISO21572:2013Foodstuffs—Molecularbiomar[4]ISO21748:2010Guidancefortheuseofrepeatability,reproducibilityandtr[6]ISO24276:2006Foodstuffs—Methodsofanalysisforthedete[7]ISO5725-1:1994Accuracy(truenessandprecision)ofmeasurem[8]ISO5725-2:1994Accuracy(truenessandprecision)ofmeasurem[9]ISO5725-3:1994Accuracy(truenessandprecision)ofmeasurement[10]ISO/TR22971:2005Accuracy(truenessandprecision)ofmeasuresults—Practicalguidanalysinginterlaboratoryrepea[11]ISO/TS22367:2008Medicallaboratories—Reductionoferrorthroughriskmanagement[12]BIPMJCGM100:2008Evaluationofmeasurementdata—GuidetotheexpressionofucertaintyinmeasureApprovedGuideline,S[15]CLSIEP12-A2UserProtocolforEvaluationofQualitativeTestGuideline,SecondEdition,2008[16]CLSIEP17-A2ProtocolsforDeterminationofLimitsofDetectionandtation.ApprovedGuideline,[17]CLSIEP23-ALaboratoryQualityControlBasedonRiskMa[18]CLSIEP24-A2AssessmentoftheDiagnosticAccuracyofLaboratoryTestsUsingRe-ceiverOperatingCharacter[19]CLSIEP29-AExpressionofMeasurementUncertaintyinLaboratoryMedicine.Approved[21]CLSIMM03-A2:2006Guidelinesforapprop[22]CLSIMM13-A2:2005Collection,Transports,Prep[23]GHTF/SG3/N15R8:2007Implementationofriskmanage[26]GHTF/SG5/N7:2012ClinicalEvidenceforIVDMedicalDevices—Scien[27]EUROLABTechnicalreportNo.1/2006Guidetotheevaluationofmeasurementuncer-taintyforquantitativetestsresults()[28]JCCLSMM5-A1Guidelineforaqualitymanagementofspecimensformol[29]WHO.Laboratoryqualitymanagementsystem;handbook(2011).Availa/publications/2011/9789241548274_eng.pdf[30]EuropeanMolecularBiologyLaboratory(EMBL)NucleotideArchive.www.ebi.ac.uk/em-bl/[31]Japan:DNADataBankofJapan(DDBJ),(www.ddbj.nig.ac.jp/)[32]USNationalInstitutesofHealth(NIH).NatNationalLibraryofMedicineGenBankDatabase(/genbank/)[33]BossuytP.M.,ReitsmaJ.B.,BrunsD.E.,GatsonisC.A.,GlasziouP.P.,IrwigL.McompleteandaccuratereportingofstudiesofdiagReportingofDiagnosticAccuracy.Clin.Chem.2003,49(1)pp.1-6[34]BurdE.M.ValidationofLaboratory-DevelopedMolecularAssaysforInfectiousDiseases.Clin.Microbiol.Rev.2010Jul,23(3)pp.550-576[35]KeerJ.T.,&.BirchL.eds.EssentialsofNucleicAcidAnalysis:ARobuSocietyofChemistry,FirstEdition,[36]HuggettJ.,&