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第六節(jié)代謝能對(duì)微生物生

長(zhǎng)和維持的支撐2024/9/261張星元:發(fā)酵原理涉及微生物細(xì)胞的生長(zhǎng)和繁殖的每一個(gè)“動(dòng)作”,包括細(xì)胞內(nèi)有機(jī)化合物降解的啟動(dòng)、生物合成的啟動(dòng)和繼續(xù)、主動(dòng)輸送、細(xì)胞內(nèi)pH自動(dòng)動(dòng)態(tài)平衡等都需要代謝能的支撐,同樣維持細(xì)胞的生命也需要代謝能的支撐。2024/9/262張星元:發(fā)酵原理

沒有生命活動(dòng)就沒有代謝能。沒有代謝能就沒有生命,沒有代謝能就沒有微生物的生命活動(dòng),就沒有工業(yè)發(fā)酵。2024/9/263張星元:發(fā)酵原理2.6.1微生物細(xì)胞的生長(zhǎng)能學(xué)

2.6.2用于維持的ATP消耗

2.6.3微生物能量的儲(chǔ)存2024/9/264張星元:發(fā)酵原理2.6.1.1前體代謝物的代謝成本

2.6.1.2分子模塊等的代謝成本

2.6.1.3生物大分子的代謝成本

2.6.1.4整個(gè)細(xì)胞的代謝成本

2024/9/266張星元:發(fā)酵原理2.6.1.1前體代謝物的代謝成本

依據(jù)運(yùn)輸、生物合成和聚合的代謝成本的估計(jì)值,有可能計(jì)算出細(xì)胞合成所需的ATP總量和NADPH的總量。這種計(jì)算是以碳源(通常是葡萄糖)為基礎(chǔ)的,首先計(jì)算12種前體代謝物(將在第三章講述)。這12種前體代謝物是微生物通過能量供應(yīng)反應(yīng)從碳源生成的。2024/9/267張星元:發(fā)酵原理2.6.1.2模塊分子等的代謝成本

研究細(xì)胞經(jīng)濟(jì)運(yùn)行,當(dāng)然要研究代謝的成本,包括多肽和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)單元氨基酸生物合成的代謝成本,核酸的結(jié)構(gòu)單元核苷酸生物合成的代謝成本,以及脂類和糖類結(jié)構(gòu)單元的生物合成的代謝成本。這些分子模塊都是從前體代謝物出發(fā)合成的。2024/9/268張星元:發(fā)酵原理2.6.1.3生物大分子的代謝成本

在細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)運(yùn)行中,既要討論全局的通用代謝物的作用,也要討論細(xì)胞物質(zhì)合成的成本。這里將討論合成生物大分子的代謝成本。2024/9/269張星元:發(fā)酵原理組成細(xì)胞的生物大分子可分成以下幾類:①RNA;②DNA;③蛋白質(zhì);④碳水化合物(糖類);⑤氨基碳水化合物(氨基糖類);⑥脂類。生物大分子的組成隨生物種類的不同而不同,對(duì)于一個(gè)給定的生物物種,其大分子組成隨比生長(zhǎng)速率和環(huán)境條件的改變而改變。2024/9/2610張星元:發(fā)酵原理⑴蛋白質(zhì)合成的成本

在延伸的肽鏈上添加1個(gè)氨基酸需要利用4個(gè)高能磷酸鍵,相當(dāng)于4個(gè)ATP。此外,在從mRNA合成與校對(duì)等過程中還需要一些自由能,總計(jì)每結(jié)合1個(gè)氨基酸約需0.3個(gè)ATP。因此在多肽生成過程中,在延伸的肽鏈上每添加1個(gè)氨基酸一共要消耗4.3個(gè)ATP。2024/9/2611張星元:發(fā)酵原理⑵核糖核酸(RNA)合成的成本

收編1個(gè)核苷酸(以單磷酸核苷酸計(jì))的代謝能成本為2.4個(gè)ATP。

⑶脫氧核糖核酸(DNA)合成的成本

結(jié)合1個(gè)脫氧核糖核苷酸(以單磷酸核苷酸計(jì))的總能耗為3.4個(gè)ATP。

⑷磷脂等的生物合成成本(略)

2024/9/2612張星元:發(fā)酵原理2.6.1.4整個(gè)細(xì)胞的代謝成本

如果用于形成前體代謝物、模塊分子和生物大分子的代謝成本已知,那么就可以計(jì)算出合成整個(gè)細(xì)胞所需的ATP。2024/9/2613張星元:發(fā)酵原理2.6.2用于維持的ATP消耗

2024/9/2614張星元:發(fā)酵原理許多細(xì)胞反應(yīng)需要消耗ATP,但這些反應(yīng)對(duì)菌體的凈合成并沒有貢獻(xiàn),通常把這些反應(yīng)稱為維持反應(yīng)或維持過程。其中有一些維持反應(yīng)與生長(zhǎng)有關(guān),例如用于維持細(xì)胞質(zhì)膜的跨膜的電化學(xué)梯度的反應(yīng),而其他維持反應(yīng)(如生物大分子的周轉(zhuǎn)和更新)與細(xì)胞的比生長(zhǎng)速率是無關(guān)的。2024/9/2615張星元:發(fā)酵原理2.6.2.1濃度梯度和電位梯度的

維持

2.6.2.2無效循環(huán)

2.6.2.3大分子的周轉(zhuǎn)和更新

2024/9/2616張星元:發(fā)酵原理2.6.2.1濃度梯度和電位梯度的維持

為確保適當(dāng)?shù)墓δ?,?xì)胞要維持各種跨膜的濃度梯度和電化學(xué)梯度,包括跨質(zhì)膜的濃度梯度和電化學(xué)梯度,跨真核細(xì)胞線粒體膜的濃度梯度和電化學(xué)梯度。這些過程需要代謝能,但不會(huì)導(dǎo)致新菌體量的合成,因此是維持過程的典型例子。2024/9/2617張星元:發(fā)酵原理

這些過程中有一部分是與生長(zhǎng)相關(guān)的,例如細(xì)胞膨脹變大時(shí),增大的面積(或體積)上的電位梯度要得到維持;但也有一部分是與生長(zhǎng)無關(guān)的,即當(dāng)細(xì)胞不生長(zhǎng)時(shí)梯度也需要維持。維持梯度的ATP消耗估計(jì)可達(dá)生成ATP總量的的50%。2024/9/2618張星元:發(fā)酵原理2.6.2.2無效循環(huán)

細(xì)胞內(nèi)有些反應(yīng)序列,其凈結(jié)果是ATP的水解。例如6-磷酸果糖在磷酸果糖激酶的作用下生成1,6-二磷酸果糖,1,6-二磷酸果糖在二磷酸果糖磷酸酯酶的作用下,又被降解成6-磷酸果糖。這兩步反應(yīng)導(dǎo)致ATP的凈消耗。2024/9/2619張星元:發(fā)酵原理這類循環(huán)最初被當(dāng)作是代謝控制的一個(gè)缺陷(因此被稱為無效循環(huán)),但目前這種循環(huán)被認(rèn)為是一種重要的代謝控制機(jī)制。當(dāng)兩種酶都存在時(shí),這種循環(huán)能使細(xì)胞迅速地進(jìn)行自我調(diào)整以適應(yīng)新環(huán)境條件。2024/9/2620張星元:發(fā)酵原理2.6.2.3大分子的周轉(zhuǎn)和更新

細(xì)胞需要不斷降解和合成許多分子,以維持其對(duì)代謝功能的控制能力。因此mRNA的半衰期只有的幾分鐘。大分子的這種連續(xù)的降解和再聚合,導(dǎo)致了ATP的凈消耗,而沒有新生物量的產(chǎn)生,因此,也被認(rèn)為是一種維持過程。2024/9/2621張星元:發(fā)酵原理2.6.3微生物能量的貯存

2024/9/2622張星元:發(fā)酵原理當(dāng)有多余營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)存在時(shí),微生物常常改變它們的某些代謝方向,合成一些化合物,作為能量貯存。當(dāng)?shù)椿蚱渌匦桦x子限量而碳和能量物質(zhì)仍然可以被利用時(shí),也生成大量的貯備化合物。饑餓時(shí)可以降解這些化合物,以釋放能量,維持生存。一般情況下,不到細(xì)胞內(nèi)氨基酸和核苷酸庫(kù)不能再維持下去的時(shí)候,這些貯藏物是不動(dòng)用的。這些化合物大致可以分成以下幾類。2024/9/2623張星元:發(fā)酵原理2.6.3.1碳水化合物的貯藏

2.6.3.2脂類的貯藏

2.6.3.3多聚偏磷酸

2024/9/2624張星元:發(fā)酵原理2.6.3.1碳水化合物的貯藏

在真菌及細(xì)菌中,包括某些藍(lán)細(xì)菌中,發(fā)現(xiàn)的貯存化合物是海藻糖(trehalose),一種非還原性的雙糖。

在酵母及黏菌(slimemoulds)中碳水化合物則以糖原的方式存在。糖原在營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段堆積起來,到生長(zhǎng)發(fā)育階段,導(dǎo)致孢子形成時(shí),這些儲(chǔ)備物就用來提供能量。2024/9/2625張星元:發(fā)酵原理在許多微生物中發(fā)現(xiàn)糖原存在,特別是在能量豐富營(yíng)養(yǎng)不平衡的時(shí)候,就有相當(dāng)大量的糖原堆積。糖原合成的機(jī)制在原核生物和真核生物中是不同的。在原核細(xì)胞中,葡糖基(glycosyl)的供體是ADP-葡萄糖,而不是UDP-葡萄糖(原核細(xì)胞中UDP-葡萄糖用來合成細(xì)胞壁)。2024/9/2626張星元:發(fā)酵原理2.6.3.2脂類的貯藏

在原核細(xì)胞中,多聚-β-羥基丁酸(poly-β-hydroxybutyrate,PHB)是最普通的脂類貯存化合物,在光合細(xì)菌、藍(lán)細(xì)菌和許多其他原核細(xì)胞中都有大量堆積。

在有較大的芽孢的芽孢桿菌中,包括蠟狀芽孢桿菌(B.cereus)及巨大芽孢桿菌(B.megaterium),PHB是生孢子的主要貯存化合物。2024/9/2627張星元:發(fā)酵原理PHB是一種線形多聚體(可達(dá)菌體干重的60%),它的降解需要蛋白水解酶使PHB顆?;罨?,隨后被PHB解聚酶(depolymerase)水解成二聚體,最后切成單體。

真核細(xì)胞中沒有發(fā)現(xiàn)PHB,卻有中性脂類的堆積。2024/9/2628張星元:發(fā)酵原理2.6.3.3多聚偏磷酸

在許多微生物中,包括真核及原核生物,在異染粒(volutin)顆粒中發(fā)現(xiàn)有多聚偏磷酸(polymetaphosphate),這種多聚體同時(shí)起磷酸貯存及能量貯存的作用,因?yàn)榱姿狒I水解時(shí)具有很高的自由能。2024/9/2629張星元:發(fā)酵原理

代謝能的持續(xù)供應(yīng)是微生物生命活動(dòng)的前提,代謝能支撐是工業(yè)發(fā)酵運(yùn)行的立足點(diǎn)。

代謝能支撐假說揭示了化能異養(yǎng)型微生物細(xì)胞的能量代謝的氧化還原本質(zhì),確定了工業(yè)發(fā)酵的生物學(xué)屬性。確立了微生物活細(xì)胞在發(fā)酵生產(chǎn)中的核心地位。2024/9/2630張星元:發(fā)酵原理復(fù)習(xí)題

1.試述代謝能支撐假說的要點(diǎn)。

2.試比較真核細(xì)胞與原核細(xì)胞細(xì)胞內(nèi)部的空間分隔,討論真核細(xì)胞的跨膜輸送的復(fù)雜性。

3.試比較微生物細(xì)胞進(jìn)行有氧呼吸與發(fā)酵時(shí),還原劑分子釋放的電子轉(zhuǎn)移到最終電子受體的過程。

4.為什么說“無氧發(fā)酵”的說法是不準(zhǔn)確的?5.為什么脫氫酶的輔酶必須被再

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