第十章微生物分類學(xué)知識課件

第九章

微生物的分類分類目的：①建立各種生物的信息存取系統(tǒng)，以便人們查考、認(rèn)識和利用各種生物。②探討生物的系統(tǒng)發(fā)育，建立反映生物進(jìn)化關(guān)系的自然分類系統(tǒng)，以揭示生物的本質(zhì)特征及它們的內(nèi)在聯(lián)系和區(qū)別。第一節(jié) 微生物的分類單位與命名一、分類單位1、正式的分類等級：主要的、次級界Kingdom門Phylum（或Division）——亞門綱Class——亞綱 ——超目 目Order——亞目 科Family——亞科 ——族 ——亞族 屬Genus 種Species

2、非正式的分類等級：變種、型、菌株、型、群

種：指一群在形態(tài)和生理方面非常相似或差別微小的個體。變種——基本特征與典型菌株基本相符，而個別較次要的特征不相符合但又穩(wěn)定的變異株。亞種——種的進(jìn)一步細(xì)分單元，實驗室獲得的穩(wěn)定變異株。是變種的同義詞。二、微生物的學(xué)名命名原則：學(xué)名=屬名+種名+（首次定名人）+現(xiàn)名定名人+定名年份學(xué)名=屬名+種名+（Subsp.或var.)+亞種（或變種）名規(guī)定與常識：屬名首字母大寫，種名全小寫；屬名、種名、亞種名用斜體字，其余用正體字且可省略。命名舉例Bacillussubtilis枯草芽孢桿菌Bacillusthuriuggiensys蘇云金芽孢桿菌Staphylococcusaureus金黃色葡萄球菌第二節(jié)微生物的分類方法一、傳統(tǒng)分類法1、形態(tài)特征個體形態(tài)特征群體形態(tài)特征：固體培養(yǎng)基上；液體培養(yǎng)基中

2、生理生化特征

營養(yǎng)類型；利用營養(yǎng)物質(zhì)的能力：能否利用，利用能力大小，通常檢測微生物對碳源和氮源的利用能力；代謝產(chǎn)物:如糖發(fā)酵產(chǎn)酸產(chǎn)氣情況;產(chǎn)氨試驗檢測NH3產(chǎn)生情況;硝酸鹽還原試驗檢測亞硝酸的存在;吲哚試驗檢測吲哚的存在以判斷色氨酸酶的存在;硫化氫試驗檢測H2S的產(chǎn)生情況;明膠液化測蛋白酶的產(chǎn)生某些生長條件：生長溫度范圍最低、適、高，嗜冷、熱、溫;需氧情況好氧厭氧兼性；生長酸堿度范圍

3、生態(tài)學(xué)特征主要利用微生物在自然界中的分布情況，與其它生物之間的相互關(guān)系（共生、寄生），它的致病性，它的對噬菌體的敏感性。

4、血清學(xué)反應(yīng)常采用免疫血清（含Ab）與抗原在體外進(jìn)行可見反應(yīng)而進(jìn)行鑒別，特異性高，靈敏度高，微生物間的細(xì)小差別均能區(qū)別，用于在形態(tài)和生理特征上難以區(qū)別的微生物。二、數(shù)值分類法

定義：用數(shù)值的方法來評價有機(jī)體分類單元之間的相似性，并根據(jù)相似性的數(shù)值將分類單位歸為更高等級的分類單元的一種分類方法。方法：選擇盡可能多的分類特征并進(jìn)行特征的測定和收集，將各項特征輸入計算機(jī)，即根據(jù)程序計算出相似性，根據(jù)相似性的百分?jǐn)?shù)分群歸類。對分類特征的處理遵循“等重要原則”。三、化學(xué)分類法

主要是通過分析細(xì)胞的化學(xué)組成，所含的類脂、蛋白質(zhì)、糖及代謝產(chǎn)物等判斷細(xì)胞間的親緣關(guān)系。四、遺傳分類法1、NDA堿基G+C含量分析同種微生物DNA組成穩(wěn)定，親緣關(guān)系越近，堿基的組成越近。2、核酸雜交DNA—DNA雜交，DNA—RNA雜交，親緣關(guān)系相近的微生物，其核酸的堿基組成，排列順序越相近，雜交率越高。第三節(jié) 微生物分類系統(tǒng)一、生物分類系統(tǒng)定義：指按親緣關(guān)系分群歸類編排成的系統(tǒng)生物界中的分類系統(tǒng)，因不同的人采用的分類方法、分類依據(jù)不同，因而形成的生物分類系統(tǒng)不同，有將生物界分成：二界：植物界、動物界三界：植物界、動物界、原生生物界四界、五界、六界的。六界系統(tǒng)是我國學(xué)者提出的：病毒界、原核生物界、真核原生生物界、真菌界、植物界、動物界。在這六界系統(tǒng)中，微生物屬于病毒界、原核生物界、真核原生生物界和真菌界。

二、微生物分類系統(tǒng)（二）細(xì)菌分類系統(tǒng)1、“伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊”第八版開始放棄了從界

種的完整的分類體系，將細(xì)菌歸屬于原核生物界，下分藍(lán)細(xì)菌和細(xì)菌。將細(xì)菌進(jìn)一步分成19部分，對藍(lán)細(xì)菌未作進(jìn)一步分類。第九版（新版）內(nèi)容有較大變動，全書共分四卷，細(xì)菌歸屬于原核生物界的四個門中：薄壁、厚壁、柔膜、疵壁菌門。2、“細(xì)菌和放線菌的鑒定”前蘇聯(lián)克拉西里尼科夫3、“細(xì)菌分類學(xué)”法國普雷沃（二）放線菌分類系統(tǒng)1、美國瓦克斯曼分類系統(tǒng)2、蘇聯(lián)克拉西里尼科夫（三）酵母菌分類系統(tǒng)荷蘭羅德（Lodder）分類系統(tǒng)（四）霉菌分類系統(tǒng)尚未形成較好的分類系統(tǒng)對于真菌分類，目前有AinsworthAlexopoulosSmith等分類系統(tǒng)，把酵母、霉菌歸屬于真菌門下，分五個亞門，酵母、霉菌分屬于各個亞門中：鞭毛菌亞門，接合菌亞門，子囊菌亞門，擔(dān)子菌亞門，半知菌亞門。第四節(jié) 微生物的鑒定主要步驟：純化、測定一系列必要的指標(biāo)、查找權(quán)威性鑒定手冊鑒定技術(shù)的不同水平：細(xì)胞的形態(tài)和習(xí)性：形態(tài)特征、運(yùn)動、酶反應(yīng)、營養(yǎng)要求及生長條件等細(xì)胞組分水平：細(xì)胞壁成分、氨基酸庫、脂類、醌類、光合色素等的分析蛋白質(zhì)水平：氨基酸序列分析、凝膠電泳和血清學(xué)反應(yīng)等基因或DNA水平：核酸分子雜交、（G+C）mol%、轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)導(dǎo)、16SrRNA寡核苷酸族分分析、DNA或RNA核苷酸序列分析等思考題