遺傳學第三章 第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計課件

遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計遺傳學數(shù)據(jù)的統(tǒng)計處理遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)的統(tǒng)計處理

ApplicationofStatisticsinGenetics(問題的提出)一、概率原理與應用二、二項式展開與應用三、Χ2測驗(Chi平方測驗)與應用3遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計為什么要應用統(tǒng)計方法分析數(shù)據(jù)？孟德爾對數(shù)據(jù)的處理：歸類統(tǒng)計(歸類記載)與描述統(tǒng)計。實際結果與理論比例波動的解釋：孟德爾雜交試驗結果與理論比例的差異；試驗誤差的來源：隨機誤差：N(0,σ2)；系統(tǒng)誤差。本節(jié)中概率定理及二項式公式是用于推算理論比例，而Χ2測驗則是用于測定試驗結果是否符合理論比例。4遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計一、概率原理與應用(一)、概率(probability):概率(機率/幾率/或然率)：指一定事件總體中某一事件發(fā)生的可能性(幾率)。例：雜種F1產(chǎn)生的配子中，帶有顯性基因和隱性基因的概率均為50％。在遺傳研究時，可以采用概率及概率原理對各個世代尤其是分離世代(如F2)的表現(xiàn)型或基因型種類和比率(各種類型出現(xiàn)的概率)進行算，從而分析、判斷該比率的真實性與可靠性；并進而研究其遺傳規(guī)律。5遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(二)概率基本定理(乘法定理與加法定理)1.乘法定理：

兩個獨立事件同時發(fā)生的概率等于各個事件發(fā)生的概率的乘積。例：雙雜合體(YyRr)中，Yy的分離與Rr的分離是相互獨立的，在F1的配子中:具有Y的概率是1/2，y的概率也1/2；具有R的概率是1/2，r的概率是1/2。而同時具有Y和R的概率是兩個獨立事件(具有Y和R)概率的乘積：1/2×1/2=1/4。6遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計

兩個互斥事件的和事件發(fā)生的概率是各個事件各自發(fā)生的概率之和?；コ馐录谝淮卧囼炛?，某一件出現(xiàn)，另一事件即被排斥；也就是互相排斥的事件。

如：拋硬幣。

又如：雜種F1(Cc)自交F2基因型為CC與Cc是互斥事件，兩者的概率分別為1/4和2/4，因此F2表現(xiàn)為顯性性狀(開紅花)的概率為兩者概率之和3/4——基因型為CC或Cc。2.加法定理：7遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(三)、概率定理的應用示例1.用乘法定理推算F2表現(xiàn)型種類與比例.如前所述，根據(jù)分離規(guī)律，F(xiàn)1(YyRr)自交得到的F2代中：子葉色呈黃色的概率為3/4，綠色的概率為1/4；種子形態(tài)圓粒的概率為3/4，皺粒的概率為1/4。因此根據(jù)乘法定理：8遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(三)、概率定理的應用示例2.用乘法定理推算F2基因型種類與比例.F1雌雄配子均有四種，且每種的概率為1/4；并且各種雌雄配子結合的機會是均等的。根據(jù)乘法定理，F(xiàn)2產(chǎn)生的16種組合方式；再根據(jù)加法定理。其中基因型YYRr出現(xiàn)的概率是1/16+1/16。9遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計二、二項式展開式與應用(一)、二項式公式與通式(二)、雜種自交后代群體的基因型結構(三)、測交后代群體的表現(xiàn)型結構(四)、雜種自交后代群體表現(xiàn)型結構(五)、雜種自交后代某種表現(xiàn)型出現(xiàn)的概率11遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計2個子代：(p+q)2=1p2+2pq+1q2(Aa+aa)2=1Aa2+2Aa*aa+1aa2

=(1/2+1/2)2=1/4+2/4+1/43個子代：(p+q)3=1p3+3p2q+3pq2+1q3(Aa+aa)3=1Aa3+3Aa2*aa+3Aa*aa2+1aa3

＝1/8+3/8+3/8+1/812遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(一)、二項式公式與通式用于分析兩對立事件(非此即彼)在多次試驗中每種事件組合發(fā)生的概率。設A、B為對立事件，P(A)=p,P(B)=q，n為估測其事件出現(xiàn)概率的事件數(shù)（幾個子代？）。顯然P(A+B)=p+q=1。r：在n次事件中A事件出現(xiàn)的次數(shù)；n-r：在n次事件中B事件出現(xiàn)的次數(shù)；13遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計例：AaXaa,如產(chǎn)生4個子代，問子代中Aa的機會有多少？因AaXaa產(chǎn)生配子時分離，子代中出現(xiàn)Aa和aa的概率各為1/2,即:p＝?，q＝1/2,s=1,n=4求出概率為1/1614遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(二)、雜種自交后代群體的基因型結構以兩對基因雜合體(YyRr)自交為例，分析其自交后代群體基因型結構時：A事件為一個F2中出現(xiàn)顯性基因(Y或R)，P(A)=p=1/2；B事件為一個F2中出現(xiàn)隱性基因(y或r)，P(B)=q=1/2。n=4為(雜合)基因個數(shù)，有p+q=1.代入二項公式，得到F2個體中，具有：4個顯性基因的概率為1/16(一種基因型)；3個顯性、1個隱性基因的概率為4/16(多種基因型)；2個顯性、2個隱性基因的概率為6/16(多種基因型)；1個顯性、3個隱性基因的概率為4/16(多種基因型)；4個隱性基因的概率為1/16(一種基因型)。15遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(三)、測交后代群體的表現(xiàn)型結構以兩對基因雜合體(YyRr)測交為例，分析其自交后代群體表現(xiàn)型結構時：A事件：Ft表現(xiàn)為顯性(黃子葉或圓粒)，P(A)=p=1/2；B事件：Ft表現(xiàn)為隱性(綠子葉或皺粒)，P(B)=q=1/2。n=2為相對性狀(雜合基因)對數(shù)，有p+q=1.代入二項公式，得到Ft中，表現(xiàn)：2個顯性性狀的概率為1/4(黃圓)；1個顯性、1個隱性性狀的概率為2/4(黃皺、綠圓)；2個隱性基因的概率為1/4(綠皺)。16遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(四)、雜種自交后代群體表現(xiàn)型結構以兩對基因雜合體(YyRr)自交為例，分析其自交后代群體表現(xiàn)型結構時：A事件：F2表現(xiàn)為顯性(黃子葉或圓粒)，P(A)=p=3/4；B事件：F2表現(xiàn)為隱性(綠子葉或皺粒)，P(B)=q=1/4。n=2為相對性狀(雜合基因)對數(shù)，有p+q=1.代入二項公式，得到F2中，表現(xiàn)：2個顯性性狀的概率為9/16(黃圓)；1個顯性、1個隱性性狀的概率為6/16(黃皺、綠圓)；2個隱性基因的概率為1/16(綠皺)。17遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(四)、雜種自交后代群體表現(xiàn)型結構當有三對基因雜合體(YyRrCc)自交時，其自交后代群體表現(xiàn)型結構分析時：A事件：F2表現(xiàn)為顯性(黃子葉、圓?；蚣t花)，P(A)=p=3/4；B事件：F2表現(xiàn)為隱性(綠子葉、皺粒或白花)，P(B)=q=1/4。n=3為相對性狀(雜合基因)對數(shù)，有p+q=1.同樣代入二項式公式，得到27:27:9:1的表現(xiàn)型結構。遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(五)、雜種自交后代某種表現(xiàn)型出現(xiàn)的概率關鍵在于首先根據(jù)給定條件確定p、q、n以及要求推算項的r值。遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計三、Х2平方測驗及應用Χ2測驗是一種統(tǒng)計假設測驗：先作統(tǒng)計假設(一個無效假設和一個備擇假設)，然后根據(jù)估計的參數(shù)(Χ2)來判斷應該接受其中哪一個。20遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(一)、Χ2測驗的兩種應用1.樣本方差的同質性檢驗；2.次數(shù)分布資料的適合性測驗。在檢驗雜交試驗得到的k種表現(xiàn)型的數(shù)目(次數(shù)分布資料)是否符合一個預期的理論比例時，采用下述公式計算統(tǒng)計參數(shù)Χ2值，該參數(shù)符合以k-1為自由度的一個Χ2理論分布。21遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計(二)、Χ2測驗應用方法統(tǒng)計假設：無效假設H0：試驗結果與理論比例相符合；備擇假設HA：試驗結果與理論比例不相符。參數(shù)估計與檢驗：1.按公式計算Χ2值;2.用統(tǒng)計參數(shù)Χ2與查表得到的Χ2α,k-1比較；α為臨界概率值，為0.05或0.01，通常用0.05；當Χ2<Χ20.05,k-1時接受無效假設，反之接受備擇假設?；颍簭谋碇兄苯訌谋碇胁榈忙?對應用概率值P(Χ2)，當P(Χ2)>0.05時，接受無效假設(差異不顯著)。22遺傳學第三章第四節(jié)遺傳學數(shù)據(jù)統(tǒng)計X2檢驗應用實例k=4，df=k-1=3；Χ20.05,3=7.815；Χ2=0.47，P(Χ2)~(0.90-0.95)結論：YyRr個體自交后代四種表現(xiàn)型的比例與9:3:3:1的理論比例間差異不顯著。23遺傳學第三章第四節(jié)