功能基因組學(xué)

功能基因組學(xué)

最新進(jìn)展1AmericanJournalofHumanGenetics,2008.09.011,TerryVrijenhoek,RoelA.Ophoff,JorisA.VeltmanRecurrentCNVsDisruptThreeCandidateGenesinSchizophreniaPatients加州大學(xué)洛杉磯分校發(fā)現(xiàn)了可能導(dǎo)致精神分裂癥的3個(gè)新候選基因3種基因的拷貝數(shù)突變CNVs（copy-numbervariants）與腦部功能有關(guān),增加患有精神分裂癥的幾率MYT1L,CTNND2,ASTN2精神分裂癥的新候選基因

2NatureGenetics,2008.11,JamesDMcKay,PaulBrennanLungcancersusceptibilitylocusat5p15.3318個(gè)國家科學(xué)家參與,6000名肺癌患者和9000名非肺癌患者第五條染色體上的兩種基因TERT和CRR9的變異可能使患肺癌的幾率增加高達(dá)60%基因變異可能增加患肺癌幾率

3PLoSGenetics,2008.10,SoniaDavila,MarkSeielstadGeneticAssociationandExpressionStudiesIndicateaRoleofToll-LikeReceptor8inPulmonaryTuberculosis與結(jié)核病易感性有關(guān)的基因,男性比女性更易感染結(jié)核病全球約有1/3的人感染了結(jié)核分支桿菌,但僅5%~10%的人得結(jié)核病。推測(cè)可能是與宿主免疫應(yīng)答相關(guān)的免疫基因發(fā)生了變異。結(jié)核病易感基因

4印尼的375個(gè)肺結(jié)核病人和387個(gè)對(duì)照組的18個(gè)基因之間的差別。發(fā)現(xiàn)男性易感結(jié)核病與TLR8基因的突變有關(guān)。俄國的1837個(gè)肺結(jié)核病人和1779個(gè)對(duì)照組的TLR8基因的變化,結(jié)果與上述一致。TLR8基因位于X染色體上,男性只有一條X染色體。TLR8基因的遺傳變異與肺結(jié)核易感性相關(guān)。男性僅僅攜帶一條X染色體,因此感染概率更大；此前TLR8基因被認(rèn)為只與病毒有聯(lián)系,該研究首次發(fā)現(xiàn)它與病菌感染相關(guān)識(shí)別TLR8在結(jié)核病易感性中的作用,為科學(xué)家和臨床醫(yī)學(xué)家提供了一個(gè)干預(yù)治療的新靶點(diǎn)由于印度人與中國人的基因變異相似,因此這個(gè)發(fā)現(xiàn)也同樣適用中國這個(gè)世界上第二大結(jié)核病國5NatureGenetics,doi:10.1038/ng.240,KayaBilguvar,MuratGünelSusceptibilitylociforintracranialaneurysminEuropeanandJapanesepopulations耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院、日本、荷蘭等國科學(xué)家掃描了2000個(gè)患有顱內(nèi)動(dòng)脈瘤和8000個(gè)健康個(gè)體的基因組發(fā)現(xiàn)了3個(gè)特殊的染色體片段2q,8qand9p,其上的遺傳突變顯著增加腦動(dòng)脈瘤的風(fēng)險(xiǎn),從而導(dǎo)致中風(fēng)。危險(xiǎn)基因突變數(shù)的增加會(huì)加大患腦動(dòng)脈瘤的風(fēng)險(xiǎn),攜帶較多危險(xiǎn)基因突變的個(gè)體患病風(fēng)險(xiǎn)是常人的3倍。提供了基礎(chǔ)性的認(rèn)識(shí),有助于了解一些遺傳和生化變化導(dǎo)致了腦動(dòng)脈瘤,可能在血管破裂發(fā)生前進(jìn)行預(yù)防性的治療。特殊基因突變?cè)黾幽X動(dòng)脈瘤風(fēng)險(xiǎn)6PNAS,2008（11）,AinhoaBilbao,JanRodriguezParkitna,德國曼海姆精神衛(wèi)生研究中心LossoftheCa2+/calmodulin-dependentproteinkinasetypeIVindopaminoceptiveneuronsenhancesbehavioraleffectsofcocaineCaMKIV、CREB(cAMP-responsiveelementbindingprotein)CaMKIV基因變異體,asinglenucleotidepolymorphismintheCaMKIVpromoter攜帶這種基因變異的人比一般人更容易對(duì)香煙和毒品上隱,可卡因上癮者中,25％的人攜帶有這種基因目前主要是采取勸導(dǎo)或保護(hù)的手段,使攜帶者抵制對(duì)可卡因的誘惑。希望藉此防止想嘗試毒品的行為以及研發(fā)相關(guān)的手段。正在研制一種疫苗,攜帶者注射后可降低對(duì)毒品的興奮度一種蛋白激酶基因變異易導(dǎo)致毒品上癮

7Science，322(5906)1395-1399，2008,AtulR.Chopra，BertW.O'MalleyAbsenceoftheSRC-2CoactivatorResultsinaGlycogenopathyResemblingVonGierke'sDisease葡萄糖-6-磷酸酶Glucose-6-phosphatase(G6Pase)：作用于肝臟中磷酸化葡萄糖，使之進(jìn)入血液，血流中90%的葡萄糖來自于此類固醇受體2--SRC-2，coactivator，masterregulatorgene，影響G6PaseSRC-2缺乏，磷酸化葡萄糖不能離開肝臟，就會(huì)以肝糖glycogen的形式留在肝臟，積累會(huì)使肝臟病變SRC-2過多？糖尿病主宰基因在血糖水平調(diào)控中起關(guān)鍵作用

8PLoSGenet2008，ChristianGieger,LudwigGeistlingerGeneticsMeetsMetabolomics:AGenome-WideAssociationStudyofMetaboliteProfilesinHumanSerumGermany，InstituteofEpidemiology共掃描了284個(gè)人的基因，發(fā)現(xiàn)4個(gè)基因FADS1、LIPC.SCAD和MCAD決定人體的新陳代謝速度新陳代謝情況的不同會(huì)導(dǎo)致一些人更易患上糖尿病之類的疾病飲食、鍛煉、藥物對(duì)不同病人產(chǎn)生的結(jié)果各不相同的原因個(gè)性化護(hù)理和營養(yǎng)4個(gè)基因決定人體新陳代謝速度

9EnvironmentalandExperimentalBotany，2008.12，YupingQiu，DiqiuYuOver-expressionofthestress-inducedOsWRKY45enhancesdiseaseresistanceanddroughttoleranceinArabidopsisWRKY45:水稻逆境誘導(dǎo)的cDNA文庫中克隆獲得，有效調(diào)控植物抗干旱和鹽堿能力的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)基因通常，能有效提高轉(zhuǎn)基因植株對(duì)抗逆水平的基因，會(huì)降低轉(zhuǎn)基因植物的生物量，導(dǎo)致產(chǎn)量降低WRKY45在水稻和擬南芥中高表達(dá)，有效地提高轉(zhuǎn)基因植株抗干旱能力，且未引起任何轉(zhuǎn)基因植物在其形態(tài)發(fā)生、花器官發(fā)育、授粉特征、結(jié)實(shí)率及最終產(chǎn)量等指標(biāo)沒有任何降低，相反還有一定程度的改善一個(gè)重要的水稻抗干旱功能基因10有助心臟免受高脂飲食傷害的基因突變

Science2008.12ANullMutationinHumanAPOC3ConfersaFavorablePlasmaLipidProfileandApparentCardioprotectionAPOC3,NullMutation,表達(dá)正常數(shù)量一半的apoC-III甘油三酸酯的水平低higherlevelsofHDL-cholesterol高密度脂蛋白lowerlevelsofLDL-cholesterol不容易發(fā)生心血管性疾病研發(fā)以apoc-III或編碼apoc-III的基因?yàn)闃?biāo)靶的藥物,用于治療心臟病11愛吃"垃圾食品"可能是基因變異作怪

NEJM:359:2558-2566December11,2008

AnObesity-AssociatedFTOGeneVariantandIncreasedEnergyIntakeinChildrenFTO基因發(fā)生變異這類肥胖與新陳代謝率、運(yùn)動(dòng)量、攝食量無關(guān)傾向于選擇更不健康、更易致胖食物健康飲食經(jīng)常運(yùn)動(dòng)12發(fā)現(xiàn)心房顫動(dòng)和猝死致病新基因

Cell,135,2008.XianqinZhang,ShenghanChenMutationinNuclearPoreComponentNUP155LeadstoAtrialFibrillationandEarlySuddenCardiacDeath五代成員的大型房顫疾病家系進(jìn)行遺傳分析，七個(gè)心臟病患者，其中五人不到兩歲發(fā)生猝死，患者體內(nèi)NUP155基因存在突變基因NUP155的突變會(huì)導(dǎo)致房顫和猝死NUP155編碼核孔復(fù)合物組分主要功能:控制遺傳物質(zhì)mRNA由細(xì)胞核到細(xì)胞質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)控制一些重要蛋白質(zhì)由細(xì)胞質(zhì)到細(xì)胞核的轉(zhuǎn)運(yùn)。NUP155--處于上游的位置調(diào)控基因、新的導(dǎo)致房顫和猝死的分子靶點(diǎn)、一個(gè)全新的分子通路對(duì)房顫和猝死進(jìn)行分子診斷，創(chuàng)立基因診斷試劑盒，預(yù)防房顫和猝死為開發(fā)治療房顫和猝死等心臟病提供了新的策略和靶點(diǎn)13睡眠基因突變?cè)黾犹悄虿★L(fēng)險(xiǎn)

NatureGenetics,2008.12,ValeriyaLyssenko,LeifGroopCommonvariantinMTNR1Bassociatedwithincreasedriskoftype2diabetesandimpairedearlyinsulinsecretion退黑激素幫助調(diào)節(jié)睡眠模式睡眠較少的人容易罹患糖尿病和肥胖癥生理節(jié)奏紊亂的實(shí)驗(yàn)室小鼠則更容易體重增加編碼人體退黑激素受體的基因MTNR1B變異14確定一種新抑癌基因

PNAS,2008,Zao-zhongSu,PaulB.FisherCloningandcharacterizationofSARI(suppressorofAP-1,regulatedbyIFN)SARI遞送到癌癥細(xì)胞,癌細(xì)胞停止分裂并死亡SARIexpressionwasinduced2hafterIFN-βOverexpressionofSARIinhibitedgrowthandinducedapoptosisincancercells,butnotinnormalcells.SARIinteractedwithc-Junviaitsleucinezipper,resultingininhibitionofDNAbindingofactivatorprotein(AP-1)complexandconsequentlyAP-1-dependentgeneexpression.15Science:2008年十大科學(xué)進(jìn)展

PNAS:確定一種新抑癌基因Cell:應(yīng)用RNAi技術(shù)檢測(cè)抑癌基因Nature:美科學(xué)家首次測(cè)序癌癥患者基因組Nature

Genetics:特殊基因突變?cè)黾幽X動(dòng)脈瘤風(fēng)險(xiǎn)Nature

Genetics:基因變異可能增加患肺癌幾率Nature:發(fā)現(xiàn)促使肺癌發(fā)生的26個(gè)基因Nature

Genetics:兩種與皮膚基細(xì)胞癌相關(guān)新變異JAMA:基因變異與結(jié)腸直腸癌風(fēng)險(xiǎn)降低有關(guān)聯(lián)CCR:漢族女性乳腺癌基因易感性研究新進(jìn)展JAMA:候選基因多態(tài)性與腫瘤遺傳易感性的分析BJC:科學(xué)家鑒別出兒童腦癌基因Nature:與兒童神經(jīng)母細(xì)胞瘤相關(guān)的變異16Nature

Genetics:普通基因變異增加乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因差異致男性更易患肝癌Science:發(fā)現(xiàn)易患結(jié)直腸癌的遺傳因子Cancer

Cell:兩種基因活躍會(huì)幫助癌細(xì)胞擴(kuò)散AJHG:乳腺癌易感性的遺傳學(xué)新發(fā)現(xiàn)Nature

Genetics:膚色基因與癌癥易感性有關(guān)Cell:尋找癌癥相關(guān)基因的新方法Cancer

Research:發(fā)現(xiàn)乳腺癌致病基因Nature

Genetics

:可誘發(fā)乳腺癌的變異基因臺(tái)灣研究團(tuán)隊(duì)找到肝癌關(guān)鍵基因nature:基因影響肺癌的迄今最有力證據(jù)Genomics:NPM1變異可作為臨床癌癥診斷指示Nature

Genetics:首個(gè)種族特異性結(jié)腸癌基因變異確定AJHG:研究發(fā)現(xiàn)新的結(jié)直腸癌易感基因Science:基因組大規(guī)模篩選新技術(shù)助力癌癥研究17查明中國人肺癌易感基因

Cancer2008Geneticsusceptibilityoflungcancerassociatedwithcommonvariantsinthe3untranslatedregionsoftheadenosinetriphosphate-bindingcassetteB1(ABCB1)andABCC1candidatetransportergenesforcarcinogenexport復(fù)旦大學(xué)遺傳工程實(shí)驗(yàn)室盧大儒教授聯(lián)合美國研究人員中國東南部500名肺癌患者和517名未患肺癌者31%患者ABCB1基因發(fā)生變異，27%患者ABCC1基因發(fā)生變異，非癌癥患者中，變異分別只有15%和12%ABCB1和ABCC1的作用:去除肺部致癌物質(zhì)，防止吸入毒素導(dǎo)致肺癌18發(fā)現(xiàn)神經(jīng)母細(xì)胞瘤關(guān)鍵基因

CancerCell,15(1),January2009StabilizationofN-MycIsaCriticalFunctionofAuroraAinHumanNeuroblastoma神經(jīng)母細(xì)胞瘤是一種可致命的小兒惡性腫瘤,占患癌癥而死兒童15%,存活率只有40%德國烏茲堡大學(xué)的Martin

Eilers等對(duì)200種基因進(jìn)行了篩查AURKA基因產(chǎn)物為MYCN的基因提供養(yǎng)料MYCN基因?qū)ι窠?jīng)母細(xì)胞瘤生長起關(guān)鍵作用發(fā)現(xiàn)為開發(fā)新藥攻克神經(jīng)母細(xì)胞瘤提供了希望19發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致乳腺癌細(xì)胞擴(kuò)散基因

CancerCell，Volume15,Issue1,9-20，Micha