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1、實(shí)驗(yàn)十一 植物組織總DNA的提取,掌握用CTAB法提取植物總DNA的方法和基本原理。 學(xué)習(xí)利用紫外分光光度法測(cè)定DNA溶液的濃度。,一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?1,二、實(shí)驗(yàn)原理,通常采用機(jī)械研磨的方法破碎植物的組織和細(xì)胞,由于植物細(xì)胞勻漿含有多種酶類(尤其是氧化酶類)對(duì)DNA的抽提產(chǎn)生不利的影響,在抽提緩沖液中需加入抗氧化劑或強(qiáng)還原劑(如巰基乙醇)以降低這些酶類的活性。在液氮中研磨,材料易于破碎,并減少研磨過程中各種酶類的作用。 CTAB, SDS等離子型表面活性劑,能溶解細(xì)胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,從而使DNA得以游離出來。,2,再加入苯酚和氯仿等有機(jī)溶劑,能使蛋白質(zhì)變性,并使抽提液分相,因核酸(DN
2、A、RNA)水溶性很強(qiáng),經(jīng)離心后即可從抽提液中除去細(xì)胞碎片和大部分蛋白質(zhì)。上清液中加入異丙醇或乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于雙蒸水或TE溶液中,即得植物總DNA溶液。之后可加入RNA酶降解其中的RNA,再用氯仿除去RNA酶,得到較純的DNA制劑。,3,DNA的吸收光譜峰在260 nm處,據(jù)計(jì)算,測(cè)定此波長(zhǎng)下DNA溶液的OD值,當(dāng)OD260=1時(shí),雙鏈DNA含量約為50 g/ml,據(jù)此可用紫外分光光度計(jì)測(cè)定溶液中DNA含量。 由于蛋白質(zhì)的吸收峰在280 nm處,在測(cè)定DNA含量時(shí),還常計(jì)算OD260/OD280之值,如該值為1.8-2.0時(shí),認(rèn)為已達(dá)到較高的純度,如低于此值,表明其內(nèi)含雜質(zhì)較多
3、,可能影響酶切反應(yīng)。,4,水稻品種的幼苗葉片,三、實(shí)驗(yàn)材料,5,四、實(shí)驗(yàn)器具、藥品試劑,水浴鍋,研缽,微量移液器,槍頭,離心管,臺(tái)式離心機(jī),液氮,恒溫箱,標(biāo)簽紙,紫外分光光度計(jì),磁力攪拌機(jī),剪刀等。,2% CTAB抽提緩沖溶液,異丙醇, 氯仿-異戊醇等,6,CTAB法流程圖,7,五、實(shí)驗(yàn)方法,(1) 2%CTAB抽提緩沖液在65水浴中預(yù)熱。 (2)取少量葉片(約0.2 g)置于研缽中,用液氮磨至粉狀; (3) 在液氮揮發(fā)將盡而植物組織尚未解凍時(shí)迅即加入700 l的2%CTAB抽提緩沖液,輕輕攪動(dòng); (4) 將磨碎液分倒入1.5 ml的滅菌離心管中,磨碎液的高度約占管的三分之二; (5) 置于6
4、5的水浴槽或恒溫箱中,每隔10 min輕輕搖動(dòng),40 min后取出;,1. DNA的提取,8,(6)冷卻2 min后,加入氯仿-異戊醇(24:1)至滿管,劇烈振蕩23 min,使兩者混合均勻; (7)放入離心機(jī)中10 000 rpm離心10 min,與此同時(shí),將600 l的異丙醇加入另一新的滅菌離心管中; (8) 用移液器輕輕地吸取上清夜,轉(zhuǎn)入含有異丙醇的離心管內(nèi),將離心管慢慢上下?lián)u動(dòng)30 sec,使異丙醇與水層充分混合至能見到DNA絮狀物;,9,(9)10000 rpm離心1 min后,立即倒掉液體,注意勿將白色DNA沉淀倒出,將離心管倒立于鋪開的紙巾上; (10)60 sec后,直立離心管
5、,加入720 l的75%乙醇及80 l 5 M的醋酸鈉,輕輕轉(zhuǎn)動(dòng),用手指彈管尖,使沉淀與管底的DNA塊狀物浮游于液體中; (11)放置30 min,使DNA塊狀物的不純物溶解; (12) 10000 rpm離心1 min后,倒掉液體,再加入800 l 75%的乙醇,將DNA再洗 30 min;,10,(13)10000 rpm離心30 sec后,立即倒掉液體,將離心管倒立于鋪開的紙巾上;數(shù)分鐘后,直立離心管,干燥DNA(自然風(fēng)干或用風(fēng)筒吹干); (14)加入50 l 0.5 TE(含RNase)緩沖液,使DNA溶解,置于37恒溫箱約15 h,使RNA消解; (15)置于-20保存、備用。,11
6、,稱取樣品,液氮研磨,加入預(yù)熱的(65 ) CTAB及-巰基乙醇,保溫1h,期間不停的搖均,吸取上清液,移至新的離心管中,加入等體積氯仿:異戊醇(24:1),輕緩顛倒混勻,10000rpm,10min,取上清液,移至新的離心管中,加等體積氯仿:異戊醇,顛倒混勻, 10000rpm,10min,取上清液,加入0.6-0.7V的異丙醇(預(yù)冷),后4 /-20 保溫沉淀,10000rpm,10min離心取沉淀,70%乙醇清洗兩次,吹干,用TE溶解DNA,然后低溫保存,12,(1)葉片磨得越細(xì)越好。 (2)移液器的使用。 (3)由于植物細(xì)胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性外,第一步的操作應(yīng)迅速,以免組織解凍,導(dǎo)致細(xì)胞裂解,釋放出DNA酶,使DNA降解。,六、注意事項(xiàng),13,七、作業(yè),(1)本實(shí)驗(yàn)所得的植物總DNA制劑中含有哪
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