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文檔簡(jiǎn)介
1、第一章 DNA重組技術(shù),討論4個(gè)問題: 1.什么是基因工程基因工程的概念。 2.為什么能進(jìn)行基因工程基因工程的原理和技術(shù)。(包括3大理論和3大技術(shù)準(zhǔn)備) 3.怎樣進(jìn)行基因工程3大步驟(DNA體外重組,重組DNA導(dǎo)入宿主細(xì)胞后擴(kuò)增和表達(dá),基因工程后處理) 4.基因工程的應(yīng)用和前景對(duì)于醫(yī)學(xué)來(lái)說即生產(chǎn)基因工程產(chǎn)品、開展基因治療等。,第一節(jié) 概 述,一.現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)發(fā)展的特點(diǎn) (一)科學(xué)技術(shù)加速發(fā)展和急劇變革 1.當(dāng)代科學(xué)發(fā)展成指數(shù)增長(zhǎng)趨勢(shì),全世界發(fā)表科技論文60008000/天,平均1篇/10.8秒問世。 2.人類科技知識(shí)在19世紀(jì)半衰期是50年,現(xiàn)在是35年(終身教育學(xué)習(xí))。 3.1973年,Co
2、hen Group第一次實(shí)現(xiàn)了細(xì)菌遺傳性狀的轉(zhuǎn)移terr+nersrterrner ,導(dǎo)致基因工程技術(shù)誕生,至今不到30年,人類已經(jīng)擁有了克隆羊、豬等等的技術(shù),可以復(fù)制一個(gè)生命體。(克隆羊多利19972003,體細(xì)胞克隆,胚胎細(xì)胞克?。?Psclol,tetr,Rb-3,ner,sr,tetr,ner,tetr ner,O,tetr,ner,Cohen Group第一次實(shí)現(xiàn)了細(xì)菌遺傳性狀轉(zhuǎn)移示意圖,一.現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)發(fā)展的特點(diǎn) (二)科學(xué)技術(shù)發(fā)展的綜合化 1.19世紀(jì)中葉,科學(xué)和技術(shù)是二者分離的,它們各有獨(dú)自文化傳統(tǒng),它們的發(fā)展往往是脫節(jié)的。 2.科學(xué)回答“是什么”“為什么”,技術(shù)回答“做什么”
3、“怎么做”。當(dāng)今科技發(fā)展已經(jīng)密不可分,科學(xué)里包含技術(shù),技術(shù)里體現(xiàn)科學(xué)。 3.當(dāng)代科技發(fā)展有兩種形式:一是突破,二是融合。突破是線性的,即從研究開發(fā)新一代的科技成果取代原有一代科技成果。融合是非線性的,即混合原有不同的科技領(lǐng)域,進(jìn)而發(fā)展新產(chǎn)品,造成革命性市場(chǎng),它們是互補(bǔ)和合作的結(jié)果。,二基因工程的概念 (一)基因(gene):從化學(xué)上來(lái)說,指的是一段DNA或RNA順序,該順序可以產(chǎn)生或影響某種表型(genotype,phenotype),可以由于突變生成等位基因變異體(體細(xì)胞父源和母源;正常和突變基因);從遺傳學(xué)上來(lái)說,基因代表一個(gè)遺傳單位,一個(gè)功能單位,一個(gè)突變單位。 (二)基因工程(gene
4、tic engineering):在體外通過人工剪、接,將不同來(lái)源的DNA分子組成一個(gè)雜合DNA分子(DNA分子重組體),然后導(dǎo)入宿主細(xì)胞去復(fù)制擴(kuò)增或表達(dá)。因?yàn)橥ㄟ^人工設(shè)計(jì),得到一定的設(shè)計(jì)方案,故稱為基因工程。由于整個(gè)操作在分子水平上進(jìn)行,所以也稱分子克隆。,二基因工程的概念 1.“基因剪刀” :剪取DNA的酶就像一把“基因剪刀”。 2.“縫紉針” :連接不同來(lái)源DNA分子的酶就像一根“縫紉針”,使二者連在一起。 3.“交通工具”:使用載體好比一輛車子。 4.“乘客”:有用基因如IL2好比使乘客,車子把乘客送進(jìn)宿主細(xì)胞中去繁衍生息,生產(chǎn)我們需要的產(chǎn)品或開展基因治療(IL2/LAK抗癌)。,我們
5、應(yīng)該記住他們 1.第一個(gè)實(shí)現(xiàn)DNA重組的人Berg 1972年,Berg用E.coR切割SV40DNA和 phageDNA,經(jīng)過連接組成重組的DNA分子。Berg是第一個(gè)實(shí)現(xiàn)DNA重組的人。,Paul Berg,SV40, phage,我們應(yīng)該記住他們 2.第一個(gè)取得基因工程成功的人Cohen 1973年,Cohen Group將E. coli 的tetr質(zhì)粒psclol和nersrR6-3質(zhì)粒體外限制酶切割,連接成一個(gè)新的質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化E. coli,在含四環(huán)素和新霉素的平板上篩選出了terrNer,實(shí)現(xiàn)了細(xì)菌遺傳性狀的轉(zhuǎn)移。這是基因工程史上的第一個(gè)克隆化并取得成功的例子,這一年被定為基因工程誕
6、生的元年。,三基因工程克隆技術(shù)人類對(duì)自然的干預(yù) (一)“多利”羊的誕生,“多利”羊誕生的技術(shù)路線,維爾穆特和克隆羊“多利”在一起,克隆羊“多利”,(二)胚胎細(xì)胞克隆和體細(xì)胞克隆的比較 項(xiàng)目 胚胎細(xì)胞克隆 體 細(xì) 胞 克 隆 供體細(xì)胞 胚胎細(xì)胞(核) 體細(xì)胞(核) 受體細(xì)胞 去核未受精的卵細(xì)胞 去核未受精的卵細(xì)胞 發(fā)育場(chǎng)所 母體宮腔 母體宮腔 關(guān)鍵區(qū)別 克隆的是子代(多生了一個(gè)) 復(fù)制的是自己(復(fù)制了一個(gè)) (三)克隆技術(shù)是一把雙刃劍,三基因工程克隆技術(shù)人類對(duì)自然的干預(yù),用克隆技術(shù)復(fù)制人類的假想圖,四基因工程三大理論,三大技術(shù)準(zhǔn)備 (一)理論上的三大發(fā)現(xiàn) 1. 20世紀(jì)40年代,Avery發(fā)現(xiàn)了
7、生物遺傳物質(zhì)的化學(xué)本質(zhì)是DNA。超越時(shí)代的科學(xué)成就往往不易被人們接受,Avery當(dāng)時(shí)并未贏得陣陣掌聲,他的論文事隔10年以后才公開發(fā)表。 2. 20世紀(jì)50年代,Watson-crick提出了DNA結(jié)構(gòu)的雙螺旋結(jié)構(gòu)模型,搞清楚了生物遺傳物質(zhì)的分子機(jī)制。 3. 20世紀(jì)60年代,確定了遺傳信息的傳遞方式:DNARNAPr,破譯了全部遺傳密碼,43。,(二) 技術(shù)上的三大發(fā)明 1“基因剪刀”限制性內(nèi)切酶的發(fā)明 1970年,Smith和Wilcox在流感嗜血桿菌(Haemophilus inffuenzae)分離純化了Hind,取得了突破,打破了基因工程的禁錮,迎來(lái)了改造生物的春天,為基因工程奠定了
8、最為重要的技術(shù)基礎(chǔ)。 2載體(“交通工具車子”) 直到1973年Cohen才能將質(zhì)粒作為基因工程載體使用(至今一直是基因工程最重要最廣泛使用的載體)。這是基因工程的第二個(gè)技術(shù)準(zhǔn)備。,(二) 技術(shù)上的三大發(fā)明 3逆轉(zhuǎn)錄酶 1970年Baltimove和Temin等同時(shí)各自發(fā)現(xiàn)了逆轉(zhuǎn)錄酶,打破了遺傳學(xué)(生物學(xué))中心法則,使真核基因的制備成為可能。 真核基因組龐大而復(fù)雜,不易制得基因圖譜。即使有了基因圖譜,因?yàn)檎婧嘶蛴袃?nèi)含子,不能在原核表達(dá)系統(tǒng)剪接出mRNA,沒有成熟的mRNA就不能得到相應(yīng)得產(chǎn)物。經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄mRNAcDNA (complementory DNA)文庫(kù)要比基因組文庫(kù)小得多,所以篩選
9、陽(yáng)性克隆就方便得多。,以上理論和技術(shù)的武裝,基因工程的臨盆降生指日可待,Berg和Cohen兩位科學(xué)的“助產(chǎn)士”,把基因工程接到了人間。,五與基因工程相關(guān)的概念 (一)克隆(clone,cloning) 1.原意是指單細(xì)胞純系無(wú)性繁殖。 2.現(xiàn)代概念是將實(shí)驗(yàn)得到的人們所需的微量基因結(jié)構(gòu),引入適當(dāng)?shù)乃拗骷?xì)胞中去。在合適的生理環(huán)境中進(jìn)行無(wú)性繁殖,從而利用宿主的生理機(jī)制繁衍人們所需要的基因結(jié)構(gòu),并進(jìn)行表達(dá)。由于整個(gè)操作在分子水平上進(jìn)行,所以稱為分子克?。╩olecular cloning)。,五與基因工程相關(guān)的概念 (一)克隆(clone,cloning) 3. 這個(gè)術(shù)語(yǔ)的幾種含義: (1)作為名詞
10、 帶有相同插入順序的重組DNA分子的1個(gè)群體。 基因型(genetype)相同的細(xì)胞或生物體的一個(gè)群體。 最常用的是描述一個(gè)微生物的一個(gè)菌落,這些微生物帶有插入了特定DNA片斷的載體分子。 (2)作為動(dòng)詞,是“去克隆”,即利用體外DNA重組技術(shù)將一個(gè)特定的基因或DNA順序插入一個(gè)載體分子。,(二)重組DNA技術(shù)(DNA recombination technique) 重組DNA技術(shù)是用酶學(xué)的方法將不同來(lái)源的DNA在體外切割,連接組成一個(gè)雜合的DNA分子的技術(shù)?;蚬こ贪―NA重組技術(shù)。 (三)生物工程(Biologic engineering) 生物工程是更大范圍內(nèi)生產(chǎn)及產(chǎn)品的工程技術(shù),是
11、現(xiàn)代生物學(xué)中一切工程技術(shù)的總稱,包括: 1.遺傳工程:基因工程,物理化學(xué)誘變;細(xì)胞融合;花粉培育;有性雜交等。 2發(fā)酵工程 3酶學(xué)工程 4細(xì)胞工程,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),Enzymes,常用的工具酶(tool enzymes): 1.限制性核酸內(nèi)切酶(resriction enzymes,restriction endonadease) 2.DNA連接酶(DNA ligase,ligase) 3.逆轉(zhuǎn)錄酶(reverse transcriptase) 4.DNA聚合酶(DNA polymerase,DNA pol) 5.核酸酶(nuclease) 6.末端轉(zhuǎn)移酶(terminal tra
12、nsferase) 7.堿性磷酸酶(BAP或CIP) 以1和2最為常用,最為重要。工具酶現(xiàn)已商品化。,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),1.限制性核酸內(nèi)切酶(Restriction endonuclease) 限制性核酸內(nèi)切酶是一類能夠識(shí)別雙鏈DNA分子中的某種特定核苷酸序列(48bp),并由此處切割DNA雙鏈的核酸內(nèi)切酶。來(lái)源于原核生物,屬于核酸內(nèi)切酶,即在核酸分子鏈的內(nèi)部制造切口的酶。 1.1限制與修飾現(xiàn)象 細(xì)菌的限制和修飾系統(tǒng)(R/M體系),是細(xì)菌的一種自我保護(hù)作用。,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),限制性內(nèi)切酶將侵入細(xì)菌體內(nèi)的外源DNA切成小片斷,(1)限制(Restriction),細(xì)菌自身的
13、DNA堿基被甲基化酶甲基化修飾所保護(hù),不能被自身的限制性內(nèi)切酶識(shí)別切割。 Dam甲基化酶: GATC 腺嘌呤N6位置引入甲基 Dcm甲基化酶: CCAGG或CCTGG序列在第二個(gè)C上C5位置上引入甲基,(2)修飾(Modification),1.2限制性內(nèi)切酶的類型,I型限制性內(nèi)切酶 首先由M. Meselson和R. Yuan在1968年從大腸桿菌 B株和 K株分離的,如 EcoB和 EcoK。 (1)識(shí)別位點(diǎn)序列:未甲基化修飾的特異序列。,EcoB: TGA(N)8TGCT EcoK:AAC(N)6GTGC,I 型限制性內(nèi)切酶 II 類限制性內(nèi)切酶 III類限制性內(nèi)切酶,第二節(jié) 基因工程的
14、酶學(xué)基礎(chǔ),(3)作用機(jī)理:需ATP、Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。,(2)切割位點(diǎn):在距離特異性識(shí)別位點(diǎn)約10001500 bp處隨機(jī)切開一條單鏈。,Recognize site,cut,1-1.5kb,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),II類限制性內(nèi)切酶 首先由H.O. Smith和K.W. Wilcox在1970年從流感嗜血菌中分離出來(lái)。分離的第一個(gè)酶是Hind 。 (1)識(shí)別位點(diǎn)序列:未甲基化修飾的雙鏈DNA上的特殊靶序列(多數(shù)是回文序列),與DNA的來(lái)源無(wú)關(guān)。 (2)切割位點(diǎn):識(shí)別位點(diǎn)處。切開雙鏈DNA,形成粘性末端(sticky end)或平末端(blunt end)。,第二節(jié) 基因
15、工程的酶學(xué)基礎(chǔ),(3)粘性末端:含有幾個(gè)核苷酸單鏈的末端。,GAATTC,CTTAA G,G AATTC,CTTAAG,5-,-3,3-,-5,5-,-3,3-,-5,5端凸出(如EcoR I切點(diǎn)),第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),CTGCAG,3端凸出(如Pst I切點(diǎn)),GACGTC,5-,-3,3-,-5,5-,-3,3-,-5,CTGCA G,G ACGTC,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),(4)粘性末端的意義 連接便利 i)不同的DNA雙鏈:只要粘性末端堿基互補(bǔ)就可以連接,這比連接兩個(gè)平齊末端容易的多。 ii)同一個(gè)DNA分子內(nèi)連接:通過兩個(gè)相同的粘性末端可以連接成環(huán)形分子。 5末端標(biāo)記:凸
16、出的5末端可用DNA多核苷酸激酶進(jìn)行32P標(biāo)記。 凸出的3端可以通過末端轉(zhuǎn)移酶添加幾個(gè)多聚核苷酸的尾巴(如AAA或TTT等)造成人工粘性末端。 補(bǔ)平成平齊末端:粘性末端可以用DNA聚合酶補(bǔ)平成平齊末端。,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),(5)同裂酶(Isoschizomers):識(shí)別位點(diǎn)的序列相同的限制性內(nèi)切酶。 完全同裂酶:識(shí)別位點(diǎn)和切點(diǎn)完全相同。如Hind 和Hsu I。,Hind 5-AAGCTT-3 3-TTCGAA-5 Hsu I 5-AAGCTT-3 3-TTCGAA-5, 不完全同裂酶:識(shí)別位點(diǎn)相同,但切點(diǎn)不同。如Xma I 和 Sma I。,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),(6)同尾酶
17、(Isocaudamers):識(shí)別的序列不同,但能切出相同的粘性末端。如BamH I、Bgl 、Bcl I、Xho 等。,5-GGATCC-3 3-CCTAGG-5,BamH I,Bcl I,5-TGATCA-3 3-ACTAGT-5,5-AGATCT-3 3-TCTAGA-5,Bgl ,5-UGATCY-3 3-YCTAGU-5,Xho ,U代表嘌呤;Y代表嘧啶。,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),5-GATC-3 3-CTAG-5,Sau 3A,同尾酶的粘性末端互相結(jié)合后形成的新位點(diǎn)一般不能再被原來(lái)的酶識(shí)別。,?,5-G 3-CCTAG,GATCT-3 A-5,BamH I,Bgl ,5-GGA
18、TCT-3 3-CCTAGA-5,BamH I,Bgl ,Sau 3A,(7)限制酶的酶活性:限制性內(nèi)切酶的識(shí)別和酶切活性一般在一定的溫度、離子強(qiáng)度、pH等條件下才表現(xiàn)最佳切割能力和位點(diǎn)的專一性。因此,一般使用專一的反應(yīng)緩沖液。,星號(hào)(*)活性:如果改變反應(yīng)條件就會(huì)影響酶的專一性和切割效率,稱為星號(hào)(*)活性。 EcoR I和BamH I等都有*活性。,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),在低鹽、高pH(8)時(shí)可識(shí)別和切割,GAATTA、AAATTC、GAGTTC等,EcoR I: GAATTC,(8)s型限制性內(nèi)切酶 移動(dòng)切割(shifted cleavage):在離它的不對(duì)稱識(shí)別位點(diǎn)一側(cè)的特定距離
19、處切割DNA雙鏈。長(zhǎng)度為 4-7bp ,切割位點(diǎn)可能在識(shí)別位點(diǎn)一側(cè)的 20bp 范圍內(nèi)。,GACGCNNNNN,Hga I,CTGCGNNNNNNNNNN,5,3,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),1.3 III類限制性內(nèi)切酶 在完全肯定的位點(diǎn)切割DNA,但反應(yīng)需要ATP、 Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。它們的識(shí)別位點(diǎn)分別是 AGACC 和 CAGCAG ,切割位點(diǎn)則在下游 24-26bp 處。在基因工程操作中用途不大。,EcoP1: AGACC,EcoP15: CAGCAG,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),2. DNA連接酶 2.1 DNA連接酶(ligase)的發(fā)現(xiàn) 從細(xì)菌DNA環(huán)化現(xiàn)象推測(cè),
20、必定存在一種能把兩條DNA雙鏈連接到一起的酶。,DNA復(fù)制一定有斷口,斷口一定由酶連接,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),2.2 DNA ligase的特點(diǎn) 兩種DNA連接酶(1)大腸桿菌連接酶:只能連接粘性末端。 (2)T4噬菌體的連接酶:不但能連接粘性末端,還能連接平末端。 連接條件(1)必須是兩條雙鏈DNA。 (2)DNA3端有游離的-OH, 5端有一個(gè)磷酸基團(tuán)(P)。(3)需要能量 動(dòng)物或噬菌體中:ATP 大腸桿菌中: NAD+,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),3. DNA聚合酶 3.1 基因工程中常用的DNA聚合酶 大腸桿菌DNA聚合酶 Klenow fragment T7 DNA聚合酶 T4
21、 DNA聚合酶 修飾過的T7 DNA聚合酶 逆轉(zhuǎn)錄酶,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),3.2常用的DNA聚合酶的特點(diǎn) 共同特點(diǎn) 把dNTPs連續(xù)地加到引物的3OH端。 主要區(qū)別 持續(xù)合成能力和外切酶活性不同。 T7 DNA聚合酶可以連續(xù)添加數(shù)千個(gè)dNTPs而不從模板上掉下來(lái)。 其它幾種DNA聚合酶只能連續(xù)添加10多個(gè)dNTPs就會(huì)從模板上解離下來(lái)。,第二節(jié) 基因工程的酶學(xué)基礎(chǔ),常用DNA聚合酶的特性比較,第三節(jié) 載 體 一、載體的概念 1.要把一個(gè)有用的基因(目的基因研究或應(yīng)用基因)通過基因工程手段送到生物細(xì)胞(受體細(xì)胞),需要運(yùn)載工具(交通工具)攜帶外源基因進(jìn)入受體細(xì)胞,這種運(yùn)載工具就叫做載體(
22、vector)。 2.凡來(lái)源于質(zhì)?;蚴删w的DNA分子,可以插入或克隆DNA片段統(tǒng)稱為vector。 3.基因工程所用的vector實(shí)際上是DNA分子,是用來(lái)攜帶目的基因片段進(jìn)入受體細(xì)胞的DNA,二、載體的分類,說 明: 1.穿梭載體(sbuttle vector): 指在兩種宿主生物體內(nèi)復(fù)制的載體分子,因而可以運(yùn)載目的基因(穿梭往返兩種生物之間,如:YEP,DIDB219 2.YAC:Yeast Artificial Chromsome 由酵母基因和PBR322質(zhì)粒衍生物構(gòu)成,對(duì)克隆大的真核基因十分有用,在HGP中發(fā)揮主要作用。 3.BAC :細(xì)菌人工染色體。,三、基因工程載體的特點(diǎn) (一)
23、能獨(dú)立自主的復(fù)制 載體DNA分子中有一段不影響它們擴(kuò)增的非必需區(qū)域,如MCS,插在其中的外源DNA片段,能被動(dòng)的跟著載體一起復(fù)制/擴(kuò)增,就像載體的正常成分一樣。 (二)能便利的加以檢測(cè) 如載體的藥物抗性基因,多是抗生素抗性基因,將受體細(xì)胞放在含有該抗生素培養(yǎng)板上培養(yǎng)生長(zhǎng)時(shí),只有攜帶這些抗性基因的載體分子的受體細(xì)胞才能存活。 (三)容易進(jìn)入宿主細(xì)胞中去,也易從宿主細(xì)胞中分離純化出來(lái)。,四、克隆載體和表達(dá)載體 所有的載體可以分成兩大類:克隆載體和表達(dá)載體。其中最常用的是質(zhì)粒載體。 (一)概念 1.克隆載體(cloning vector) 都有一個(gè)松弛的復(fù)制子,能帶動(dòng)外源基因,在宿主細(xì)胞中復(fù)制擴(kuò)增。
24、它是用來(lái)克隆和擴(kuò)增DNA片段(基因)的載體。 2.表達(dá)載體(Expression vector) 具有克隆載體的基本元件(ori,Ampr,MCS等)還具有轉(zhuǎn)錄/翻譯所必需的DNA順序的載體。為了有效的轉(zhuǎn)錄,必需有強(qiáng)大的能夠被宿主細(xì)胞識(shí)別的啟動(dòng)子,為了實(shí)現(xiàn)翻譯,克隆基因必需有合適的SD序列和RBS。這樣一個(gè)基因表達(dá)需要的具有表達(dá)和調(diào)控能力的載體稱表達(dá)載體。,(二)載體的元件及性質(zhì),(三)元件的類別和質(zhì)量 基因工程前考慮的4個(gè)問題: (1)基因工程的目的 克隆擴(kuò)增/表達(dá):生產(chǎn)產(chǎn)品 基因治療 (2)載體的容量 克隆片段的大小運(yùn)載多大重量的車子。 (3)受體細(xì)胞類型 真核/原核/穿梭。 (4)載體本
25、身及其元件的質(zhì)量 不能搞成“豆腐渣工程”,如P要“強(qiáng)大陣容”。,第四節(jié) 重組DNA技術(shù)的基本過程,基因工程包括3個(gè)步驟: 1 DNA重組 2 重組DNA導(dǎo)入宿主細(xì)胞克隆擴(kuò)增或表達(dá) 3 基因工程的后處理(downstream techniques of GE) 重組DNA技術(shù)的基本過程: 1 載體的選擇和制備分; 2 制備目的基因片段切; 3 DNA片段的重組連接接; 4 重組DNA導(dǎo)入受體細(xì)胞轉(zhuǎn); 5 轉(zhuǎn)化子的篩選篩; 6 重組子的篩選篩; 7 重組子的鑒定鑒; 8 克隆擴(kuò)增或表達(dá)擴(kuò)/表達(dá); 9 基因工程的后處理分。,DNA重組技術(shù),DNA連接酶能把不同的DNA片段連接成一個(gè)整體,Pvu,DN
26、A重組操作過程示意圖,一、基因工程載體及其選用/制備/獲取/構(gòu)建 (一)載體的選擇 1.構(gòu)建DNA重組體的目的 2.載體的類型 3.選用質(zhì)粒載體的要求: 選分子量小的質(zhì)粒,即小載體不易損壞,在細(xì)菌里面拷貝數(shù)也多(也有大載體); 一般使用松弛型質(zhì)粒在細(xì)菌里擴(kuò)增不受約束,一般10個(gè)以上的拷貝,而嚴(yán)謹(jǐn)型質(zhì)粒10個(gè)。 必需具備一個(gè)以上的酶切位點(diǎn),有選擇的余地; 必需有易檢測(cè)的標(biāo)記,多是抗生素的抗性基因。 (二)載體的制備 (三)載體的獲取,二、目的基因的制備和獲取 目的基因是所要研究或應(yīng)用的基因,也就是將要克隆或表達(dá)的基因或基因的一個(gè)片段。獲取目的基因是分子克隆中最重要的一步。 (一)目的基因制備的目
27、的 1. 克隆特定的基因或cDNA; 2. 構(gòu)建克隆或表達(dá)載體; 3. 構(gòu)建基因文庫(kù):基因組DNA文庫(kù)和cDNA文庫(kù),第四節(jié) 重組DNA技術(shù)的基本過程,(二)目的基因常用的制備方法 1.限制酶切除 (1)從原核基因組DNA制備視基因組物理圖譜已知或未知,克隆方法不同。 (2)從真核基因組DNA制備染色體步移法(chromosome walking)。 (3)從已克隆的DNA片段制備直接酶切回收 2. PCR或RT/PCR方法制備目的基因 (1) 獲取已知基因 (2) 構(gòu)建RT/PCR文庫(kù)法獲取未知基因 3.計(jì)算機(jī)克?。杭蠢肎enBank信息,利用不同種屬同源性設(shè)計(jì)引物,嘗試獲取未知基因片段,這有賴于各種計(jì)算機(jī)軟件的應(yīng)用。 4.化學(xué)合成法:制備基因片段用DNA合成儀,對(duì)目的基因分段合成,連接,可以得到所需的目的基因。,三、DNA片斷的重組連接 目的基因和載體DNA是重組的基本構(gòu)件,DNA片斷的重組連接是目的基因與載體的連接。 獲得目的基因后必須將其放在一定的載體上才能進(jìn)入宿主細(xì)胞擴(kuò)增或表達(dá)。習(xí)慣上將目的基因與載體連接及其后續(xù)的轉(zhuǎn)化過程稱為克隆,可能是目的基因載體形成一個(gè)新的DNA重組分子(新的genotype),后者必然會(huì)產(chǎn)生一個(gè)新的菌體克?。╬henotype)。 限制酶剪切或機(jī)械剪切
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