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摘要 超分子l 乏學(xué)怒當(dāng)蓑詫學(xué)疆突筑熱轟之一。它怒- - f 交叉學(xué)辯,涉及伲學(xué)、生螽辯學(xué) 和材料科學(xué)等諸多領(lǐng)域。冠醚和杯勢(shì)烴分別作為第代和第三代主體化合物。以它們?cè)诜?子識(shí)剮和分予綴裝方面酶特殊牲矮,一直敷引著廣泛豹研究興趣。主要由天然氨鎣酸組成 的環(huán)肽及類環(huán)肽是類特殊的主體分子,因艇生命相關(guān)的特性從發(fā)現(xiàn)至今已在離子識(shí)別和 自組裝方面取得了意義重大的研究成果。本文嘗試將冠醚、杯芳烴和環(huán)肽的優(yōu)勢(shì)結(jié)合起來, 設(shè)詩癌天然鬣基酸弓l 入梅芳囂醚襄芳香囂醚體系,會(huì)殘一類耨型圭裕分子,藩初步聶舞究了 它們對(duì)客體的識(shí)別效果。 本文主要包括以下離寨: 一設(shè)計(jì)合成了6 個(gè)食l 氨艇酸杯 4 】冠醚類化合物4 a 4 f il o 個(gè)含l 一氨基酸芳香冠 醚類仡臺(tái)物1 1 0 ;共1 6 個(gè)薪蝥化舍物,均經(jīng)過了1 h n m r 鑒定襁質(zhì)譜,元素分析靜測(cè) 試。 二 用二維核磁手段研究了化合物4 a 4 d 猩溶液中的構(gòu)象,發(fā)現(xiàn)它們采取的是c 2 對(duì)囂鮑褰式構(gòu)攘。我稍將4 a 銷據(jù)為石英晶體徽天乎敏感涂層物質(zhì),磷究了它們對(duì)于 氣相脂肪胺和脂肪醇的識(shí)別能力,發(fā)現(xiàn)瓶德華力和疏水相互作用是結(jié)合的主要驅(qū)動(dòng)力, 結(jié)合模式是蠹懿縫:我豢瘸紫終霹燹競(jìng)港滾定法磷究t4 a - 4 d 在己精漆渡孛對(duì)丁胺舞 構(gòu)體的識(shí)別能力,發(fā)現(xiàn)了相反的選擇憾,說明張液相中氳鍵是燕要驅(qū)動(dòng)力,結(jié)合模式 采用黢扶衍生環(huán)的正面與酚羥蒸發(fā)生黌子交換蕊形成l :l 配合耪。 三我們用核磁滴定手段研究了化倉物l ,5 ,1 0 在氘代氯仿中同鹵族負(fù)離子和磷 酸二氫根的配能絡(luò)合情況,發(fā)現(xiàn)主體化合物均與客體負(fù)離子形成了l :l 配合物。選擇 性秘終會(huì)情況主要受醛膣大小,窖傣受離子半徑大小以及側(cè)譬蒸圈空湖位阻效應(yīng)的影 響。 關(guān)鍵譎:越分子綻學(xué)囂菰氮基羧檉芳遮醚勢(shì)香囂醚褰子諼萎 a b s t r a c t s u p r a m o l e c u l a rc h e m i s t r yi s o n eo ft h em a i nf o c u s e si nc h e m i c a lr e s e a r c ht o d a y , i ti s a l l i n t e r d i s c i p l i n a r ys t u d y o fc h e m i s t r y 、l i f es c i e n c ea n dm a t e r i a l s c i e n c e c r o w ne t h e r s a n d c a l i x a r e n e st a k e na st h ef i r s ta n dt h i r dg e n e r a ls u p r a m o l e c u l a rc o m p o u n d ss t i l lr e c e i v ei n t e r e s t f r o maw i l dr a n g eo fc h e m i s t sd u et ot h e i rp a r t i c u l a rp r o p e r t i e si nm o l e c u l a rr e c o g n i t i o na n d a s s e m b l y c y c l i cp e p t i d e sa n dc y c l i cp s e u d op e p t i d e sa r eap a r t i c u l a rf a m i l yo fh o s tm o l e c u l e s w h i c ha r em a i n l ym a d e u po f n a t u r a la m i n oa c i d d u et ot h e i rb i o r e l e v a n c eg r e a ta c h i e v e m e n t s o fc y c l i cp e p t i d e sh a sb e e nm a d ei ni o nc o m p l e x a t i o na n ds e l f - a s s e m b l ys i n c et h e i rf i r s t f i n d i n g i nt h i sw o r k ,w ea r et r y i n gt oc o m b i n et h ea d v a n t a g e so fc a l i x a r e n e s ,c r o w ne t h e r sa n dc y c l i c p e p t i d e s w es y n t h e s i z e dan o v e lf a m i l yo f h o s tm o l e c u l e s b yi n c o r p o r a t i n gl a m i n oa c i di n t ot h e s k e l e t o no fc a l i x 4 c r o w ne t h e r sa n da r y lc r o w ne t h e r sa n di n v e s t i g a t e dt h e i rb i n d i n ga b i l i t y t o w a r d sv a r i o u sg u e s tm o l e c u l e s t h em a j o rc o n t e n t sa r ea sf o l l o w s 1 w ed e s i g n e da n ds y n t h e s i z e d6l a m i n oa c i db e a r i n g e a l i x 4 c r o w ne t h e r s ,4 a 一4 1 0l - a m i n o a c i db e a r i n ga r y lc r o w ne t h e r s ,t o t a l l y16n o v e lc o m p o u n d sw h i c hw e r ea l lr e c o g n i z e db y 1h n m r s p e c t r u m a n de x a m i n e dt h r o u g hm s s p e c t r u m a n de l e m e n t a l a n a l y s i s 2 w ee x a m i n e dt h ec o n f o r m a t i o no ft h e s ec a l i x 4 c r o w n st h r o u g hc a r e f u l a n a l y s i s o ft h e 2 d n o ea n d2 d r o e s p e c t r u m o f4 aa n d4 d r e s p e c t i v e l y t h e y a l l a d o p t e d a c o n e c o n f o r m a t i o na n dc 2s y m m e t r y e v a l u a t i o no ft h ea b i l i t yo f4 a - 4 dt oa c ta ss e n s o r c o a t i n g sd i s c r i m i n a t i n gb e t w e e nt h ea l k y la m i n ea n da l k y l a l c o h o lw a sa c h i e v e du s i n ga q u a r t zc r y s t a lm i c r o b a l a n c e ( q c m ) w ef o u n dt h a tt h ec o m p l e x a t i o nw a sm a i n l yd r i v e nb y v a n d e rw a a l sf o r c ea n dh y d r o p h o b i ci n t e r a c t i o n t h ec o o r d i n a t i o nm o d ew a st h ee n d o - c a l i x w h e nu v - v i st i t r a t i o nm e t h o dw a se m p l o y e dt oi n v e s t i g a t e , t h eb i n d i n ga b i l i t yo f4 a 一4 d t o w a r d si s o m e r so fb u t y l a m i n ei na c e t o n i t r i l e ,a l t h o u g ht h ef o r m a t i o no f1 :1c o m p l e xw a s r e c o g n i z e d ,t h er e v e r s es e l e c t i v i t yf r o mt h a ti ng a sp h a s ew a sf o u n d w ee x p l a i n e dt h a t a s e n d o c a l i x c o m p l e x a t i o nd i d n o to c c u ra n dh y d r o g e nb o n d i n gp l a y e dam a i nr o l ei nt h i s c o o r d i n a t i o np r o c e s s 3 t h ec o o r d i n a t i o na b i l i t yo f1 ,5 ,10t o w a r d si 一,b r ,c 1 ,h 2 p 0 4 。w a si n v e s t i g a t e du s i n g 1h n m rt i t r a t i o nm e t h o di nc d c l 3 t h el :1c o m p l e x a t i o nw a sf o u n d i tw a se s t i m a t e dt h a t s t e r e oh i n d r a n c ef r o mt h ea r m e dg r o u p ,t h ed i a m e t e ro ft h er i n gs t r u c t u r ea n dh a l i d ei o na l l p a r t i c i p a t e di nt h eb i n d i n gp r o c e s sn v o f i n g t h es e l e c t i v i t y k e yw o r d s :s u p r a m o l e c u l a rc h e m i s t r y , c y c l i cp e p t i d e ,a m i n oa c i d ,c a l i x 4 c r o w ne t h e r ,a r y l c r o w n e t h e r ,i o nr e c o g n i t i o n 第一章:前言 第一章:前言 l 。l 超分子純學(xué)籬分 1 9 8 7 年c j p e d e r s e n ,d 。j c r a m ,和j - m l e h n 被授予n o b e l 化學(xué)獎(jiǎng),這標(biāo)志著化學(xué) 韻發(fā)展進(jìn)入了個(gè)新的時(shí)代。住能新劍立的主客俸化學(xué),越分子化學(xué),超池了傳統(tǒng)化學(xué)對(duì) 化學(xué)鍵的理解,是次理論意義上的質(zhì)變和飛躍。超分子化學(xué)關(guān)注的對(duì)象之一是存在于共 價(jià)鍵結(jié)合的分子單元間的弱作用力,包括靜電力、氯鍵、7 r - t r 堆積和疏水作用等。這些弱作 饜力是生余劍始之秘,在警薅沒鴦盛要熬捉壤、綴純、遺傳等手段豹媾況下,將數(shù)量巨大 的性質(zhì)各舁的簡(jiǎn)單分子建筑塊組合建造成為復(fù)雜有序的,麒具有特定生理功能的分子集合 藩龔勺主要驅(qū)動(dòng)力。w a l d 鼴魏懿解釋是,分子建襞旋哥斂塞發(fā)瓣綴會(huì)形殘完熬懿生愈分子。 簡(jiǎn)言之,他認(rèn)為每個(gè)分子建筑塊都擁有識(shí)別和與其它分子作用所需臻的一切必要信息。這 些信惠通過菲共價(jià)鍵稻互作爝褥到表達(dá)”。這點(diǎn)已經(jīng)由事囊證驥,在實(shí)驗(yàn)嶷中,許多細(xì)胞 聚臺(tái)體,比如核糖體、線敉體以及種類繁多的酶聯(lián)含體,都可以由相對(duì)簡(jiǎn)單的初始物通過 非麩價(jià)相互作用合成得到。這種被人們模擬的并廣泛存在予生命俸內(nèi)的現(xiàn)象,我們稱之為 分予塞組裝( s e l f a s s e m b l y ) 2 1 。除7 - 分子凝集,程生命俸建國時(shí)存在著小分子和生物大分 子、分子傳輸、酶與底物、激素與受體、抗原與抗體、免疫抑制劑和免疫采體等等的相互 挈蹋,其鏊零魏魏象都是怒分子毒乏學(xué)關(guān)注熬戳分予潤(rùn)瓣弱裰互季箏瘸必蒸磷瓣跨暴羧識(shí)剽。 分子自組鼗和分子識(shí)別構(gòu)成了超分子化學(xué)最重要的兩大研究領(lǐng)域。分子識(shí)別和分予組裝是 超分子詫孥缺一不可的兩個(gè)特征,孺瑩,京稍不楚柱互獨(dú)立露是穗互菝賴的兩個(gè)避程,分 子聚集由識(shí)別來完成,而分子識(shí)別本身則依賴于分予形狀、尺寸和化學(xué)官能團(tuán)之間的補(bǔ)償 作廂。 經(jīng)過幾百萬年的進(jìn)化發(fā)展,識(shí)別和組裝配合的效能被彝然界完美的體現(xiàn)在對(duì)于生命有 機(jī)體存活和復(fù)制有蓬要意義的成熟的和有效的分予系統(tǒng)中,包括傳播和傳輸遺傳信息的 ( d n a ) ,羧裁零罄理生理茨應(yīng)戇鬣自主體,姆兜變成化學(xué)基量斡光合中心,以及越商效鎂 化反應(yīng)的生物酶。這些生命現(xiàn)象體現(xiàn)出的一種高效,精確,協(xié)作的過程為化學(xué)工作者提 供了改避會(huì)成策晦麓靈感滾采。臻代有瓿純攀筑一個(gè)重要豹縫成黟分,就是舍殘大量麓單 的作為模擬生命體系某些功能的主體分子。比較于自然界上百萬年的歷史,在合成分子聚 集體模叛生命體系的菜些磅能方面,莓裁化學(xué)工俸者舞取得酌成績(jī)已經(jīng)爨釋鬻豫入酶了。 比如,在選擇性識(shí)別核營、氨慧酸4 1 、碳水化食物5 1 和離子【6 】方面,化學(xué)工作輯均取得 懶開火學(xué)碩士學(xué)位論文第一岢 了矚目的成就。與此同時(shí),化學(xué)工作者不僅致力予發(fā)展模擬自然的體系,而且設(shè)計(jì)了許多 新穎的入造分子體系,院翻熒光搽針秘、垂賽復(fù)涮體f s j 、分子容器潮、分子耱烯以及分 子闡門l 舊】。超分子化學(xué)各個(gè)研究領(lǐng)域均取得了長(zhǎng)足的進(jìn)步,其研究的對(duì)象從低級(jí)結(jié)構(gòu)向簡(jiǎn) 級(jí)結(jié)構(gòu),從環(huán)狀結(jié)構(gòu)向多種結(jié)構(gòu)酌分子發(fā)展“,德是對(duì)各種類型大環(huán)純合物豹研究進(jìn)饜始 終餞表若超分子化學(xué)鮑磺究水平。 從很大的程度上說,部超分子化學(xué)發(fā)展的歷史,就是一代代具有優(yōu)秀功能主體分子 羧磺截、舞發(fā)、瘦瘸熬過疆。蠡栗以1 9 6 0 年我p e r d e s o n 發(fā)凌冠醚辮陽離子識(shí)裂效粱 乍為怒 分子化學(xué)開始的話,整個(gè)超分子化學(xué)可以簡(jiǎn)單的劃分為冠醚、環(huán)糊精、杯芳烴三個(gè)主體分 予時(shí)代。豫魏之外,還有環(huán)蕃( c y c l o p h a n e ) 、s c h i f f 堿等其它囂羧幫類舔狹缽系。隧這死 類化合物為基礎(chǔ),通過化學(xué)修飾就可以設(shè)計(jì)出具旃不同性能的主體化臺(tái)物,如具有特殊的 識(shí)別能力、優(yōu)秀的紫外城熒光效應(yīng)、優(yōu)辯的氧化還原性能等,饅之可盛翔于離子的分離凝 定、耀轉(zhuǎn)穆催化、擬酶催促、以及設(shè)計(jì)輿有特殊功能的分子器件等研究領(lǐng)域。以下,我們 就最常見的三類燕體化臺(tái)物冠醚、環(huán)糊精、杯芳烴作一個(gè)簡(jiǎn)要的介紹: 冠醚 1 9 6 7 年p e d e r s o n 于一個(gè)偶然的機(jī)會(huì)中臺(tái)成了二苯并1 8 一冠- 6 ( f i g u r e1 1 ) 【幢l ,并發(fā)現(xiàn) 這種化臺(tái)物在甲醇中的溶解度隨著氫氧化鈉的存在而顯麓避增大。這一不尋常的溶解行為 瞧菠p e d e r s o n 對(duì)大蓼多醚鮑性緩梭進(jìn)一步筠磷炎,發(fā)現(xiàn)這類大環(huán)多醚體系商一令凝圊特鑷, 即它們能與堿金屬及堿土金屬鹽興形成穩(wěn)定且能溶于有機(jī)溶劑的配合物,p e d e r s o n 將這擻 其饔絡(luò)臺(tái)金磊離子特薤懿大臻多熬純舍鐨逶稼受霪醚純舍諺( c r o w n e t h e r ) ?;鑼?duì)冠醚的 濺本性發(fā)現(xiàn),c j p e d e r s o n 開宅d 了從而開創(chuàng)了主一客體化舉( h o s t - g u e s t c h e m i s t r y ) 的先河 舊,作為第一代主體勢(shì)予,至今,冠醚戳箕對(duì)金耩離子穗殊戇選擇絡(luò)會(huì)昔笮臻幫分子韁裝方 式,仍有大量的研究成果見諸文獻(xiàn)【i 。 。,y 、刪筍 廠、g 弋,v 、 甌+ 氣 f i g u r e1 1 d i s c o v e r y o f t h ef i r s tc r o w ne t h e r c r o w ne t h e r 環(huán)糊精 環(huán)糖精( c y c l o d e x t r i n s , 燕稱c d ) 是出一定數(shù)疑的髓( + ) 一g 避蠛麓萄糖通過旺1 ,4 替 第一顰:前言 鍵首尾相連形成的環(huán)狀化合物。習(xí)慣上用個(gè)希臘字母來表示其葡萄糖單元數(shù)目,其中最 常覓的是氈、6 、y - 環(huán)糊精,分鞠糖翁6 、7 囂j8 個(gè)蘩萄糖蕈元( f i g u r el 。2 ) ,1 3 - 環(huán)鞠精盎予 易于制備、價(jià)格低廉且其環(huán)的空腔尺寸與芳香基團(tuán)暇配而應(yīng)用最為廣泛。環(huán)糊精分子中所 有的葡萄糖單元均為未扭i l | j 的椅式構(gòu)象,可以構(gòu)成比較固定的疏永空腔和索水的外綮,分 子本身所具有的手性微環(huán)境,使得環(huán)糊精可以選擇牲地鍵食多葺申中性無機(jī)、有機(jī)或多肽、 糖類等分子,形成比較穩(wěn)定的超分子配合物,結(jié)構(gòu)特點(diǎn)使得環(huán)糊稽可以包結(jié)許多無機(jī)、有 恚吃萋f l 手性客體分子形成主容體或越分子配合物,程怒分子化學(xué)的磺究中成為繼冠醚之后的 第二二代主體化合物得到j(luò) 、泛的應(yīng)闈。環(huán)糊精及其多種衍生物不儀在基礎(chǔ)科學(xué)研究中扮演 著鬟要懿角夔瑟曼農(nóng)諸多寂震菝本領(lǐng)域里逡褥到廣泛應(yīng)曩,這可熬主要婦因子該炎純合甥 的如下特征:首先。這類化合物是較易得到的半天然產(chǎn)物,可以通過淀粉和酶促降解大量 割備:其次,對(duì)予會(huì)藏訖擎家來說,這種純臺(tái)物經(jīng)藤穩(wěn)定,可以逡行各季孛逡擇佳黲飾;第 三,環(huán)糊精的空腔可以提供與模型底物結(jié)合的空間,當(dāng)?shù)孜锓肿优c環(huán)糊精影成包結(jié)配合物 后,其化學(xué)反應(yīng)性熊以及光、電、磁等物瑕性能在特定情況下有可能發(fā)生敬變;第滔,環(huán) 糊糖沒有毒性( 或低毒性) ,并可以在生物體內(nèi)降解,因此w 以作為脂溶性藥物載體【1 7 1 食 品添加劑i 聞、化妝品填料 j 9 在工業(yè)技術(shù)上得到應(yīng)用。此外,環(huán)糊精還在模擬酶研究中有著 廣泛懿應(yīng)靂矧,爨藏對(duì)予跌毽學(xué)聰贏霉瑗燮貔過程功# 來說瓣琢糊精及其 囂生物靛分子淡 別進(jìn)行的深入研究也具有爨要意義。 t f i g u r el 2 s t r u c t u r e so f a ,良a n dt 。c y c l o d e x t r i n s 轎芳烴 撂芳烴( c a l i x a r e n e ) 是由苯酚單元通過亞甲基在酚羥基鄰伎連接而構(gòu)成的一類環(huán)狀 低聚物,實(shí)際上也是環(huán)蕃( c y c l o p h a n e ) 畿化合物的一種。它的歷史可以遺述到1 8 7 2 年德 藿純學(xué)家b a e y e r f 2 2 2 對(duì)苯酚與零醛承溶滾窮囂熱反應(yīng)戇磅究,愛應(yīng)爨雩譬到靜樹l 鏨狀甥腰出于當(dāng) 南”大學(xué)碩士學(xué)倪論文第一章 時(shí)實(shí)驗(yàn)手段的限制并沒有進(jìn)行產(chǎn)品鑒定。2 0 世紀(jì)初比利時(shí)化學(xué)家b a c k e l a n d t 2 列又對(duì)這個(gè)反 應(yīng)進(jìn)行了詳細(xì)的研究,制備了酚醛樹脂,開創(chuàng)了高分子合成的新紀(jì)元。2 0 世紀(jì)4 0 年代澳 大利亞化學(xué)家z i n k e 2 4 1 用對(duì)叔丁基苯酚代替苯酚與甲醛水溶液在氫氧化鈉存在下反應(yīng),得到 一種高熔點(diǎn)的晶狀化合物,經(jīng)鑒定為環(huán)狀的四聚體結(jié)構(gòu),即通常所說的杯【4 芳烴。此后的 幾十年里杯芳烴這類化合物并沒有引起人們太多的注意,直至2 0 世紀(jì)八十年代初,g u t s c h e 和b 6 h m e r 等人在杯芳烴的大量合成方面做出了突出的工作,特別是g u t s c h e 的一鍋法合成 杯 n 芳烴大大簡(jiǎn)化了煩瑣的操作步驟,并極大地提高了反應(yīng)的產(chǎn)率,為人們進(jìn)一步進(jìn)行杯 芳烴的化學(xué)修飾提供了原料,從而啟動(dòng)了杯芳烴化學(xué) 2 ”,使其在近些年來的主一客體配位化 學(xué)和超分子化學(xué)中的地位日趨上升。由于本文分子設(shè)計(jì)基于的平臺(tái)正是杯 4 】芳烴,本文將 在后面的章節(jié)對(duì)杯芳烴化學(xué)進(jìn)彳亍更加詳細(xì)的介紹。 常見主體分子的缺陷 r 雖然前三代主體分子在超分子化學(xué)的各個(gè)研究領(lǐng)域均取得了巨大的成功,然而也并非 沒有缺憾。例如對(duì)于冠醚而言,盡管對(duì)主族金屬離子配位研究已經(jīng)相當(dāng)深入,然而設(shè)計(jì)能 選擇性絡(luò)合c a 2 + 、m f + 、t 1 + 的冠醚一直是一個(gè)無法解決的巨大難題 2 6 1 ;雖然杯芳烴既可識(shí) 別中性分子又可識(shí)別離子,但由于溶解性的限制,其研究現(xiàn)在主要集中于金屬離子的配位 【2 7 】。此外,這三類主體化合物對(duì)于負(fù)離子識(shí)別研究雖然取得了定的進(jìn)展,但并沒有很好 的解決這一課題28 1 。更重要的是,這三類主體并不是自然界存在的分子,大部分對(duì)生物體 是有害的,無法真實(shí)地模擬生物體內(nèi)的弱作用力。在超分子化學(xué)取得了巨大成就的今天, 尋找更貼近于生命體系的主體分子就被提上日程。其中,一類以氨基酸和肽作為分子構(gòu)建 單元的合成主體化合物已經(jīng)在文獻(xiàn)中越來越多的被報(bào)道【2 9 】,而天然離子載體纈氨霉素 ( v a l i r i o m y c i n ) 3 0 】和恩鐮孢菌素( e n n i a t i n s ) 3 1 】也許預(yù)示著一種可能:環(huán)肽可能是新一代 生物主體分子。 1 2 環(huán)肽( 類環(huán)肽) 的超分子化學(xué) 1 2 1 以氨基酸和肽作為分子器件構(gòu)建單元的優(yōu)越性 刖氮基酸和肽作為構(gòu)建分子識(shí)別主體和器件的骨架具有非常大的優(yōu)越性。作為生物體 系一個(gè)驚人的成就,經(jīng)過漫長(zhǎng)歲月的進(jìn)化,氨基酸和肽已經(jīng)成為構(gòu)建絕大多數(shù)官能系統(tǒng)的 分子材料。這種選擇絕不是偶然。事實(shí)上,多肽具有好些重要的特性使它們非常適合作為 4 第一辯:前言 構(gòu)建高效分子體系的材料。酋先,自然界存在有近2 0 種氨藏酸( 單體) 作為構(gòu)成蛋白質(zhì)的 基率單元,位于這些基本元件側(cè)鏈上的官能淘也就育2 0 耱之多( 酸性匏、中性酌、祭核的、 氫鍵等等) 可供自然界挑選。這些商組織的官能團(tuán)由此成為了酶的活性位點(diǎn)和蛋自主體分 子的絡(luò)合位點(diǎn)。另外,氨基酸同時(shí)擁有親電和親核的位點(diǎn),因此非常適合予瞧們有序的綴 合形成鏈狀多聚彩。 正是由于它們藏要的生理活性,長(zhǎng)時(shí)間以來人們從各個(gè)方面對(duì)氮基酸和多肽特性進(jìn)行 了深滅鰓磺究,基予這些】二 乍,科學(xué)工佟襲總結(jié)鑫氨基酸魏默 乍為橡建分予主體秘囂l 牛最 理想骨架材料的以下五點(diǎn)原因。 荔褥戇,我稻縫戳著邋接受鵑徐格買爨各耱各樣鼓手瞧楚靜n 溺保護(hù)瀚d 鍪,己型氨 基酸以及非天然氨基酸。另外,在j 建去幾肇中,化學(xué)工作者已經(jīng)發(fā)現(xiàn)并在實(shí)際工作中使用 一馥有效的臺(tái)成手性純氨蕊酸的方法f 翻。所有這塑讓純學(xué)工作者霹以磁自然賽更船充裕釃 利用合適的氨基酸,麗不是僅僅局限于生命開始之韌的2 0 種。 手性純,肽是豳天然光學(xué)活性的氨基酸組成,這種天然手性辯于設(shè)計(jì)避行不對(duì)稱識(shí)別 裁壤伲磅熨蕊體系鴦重要蛇意義。醞然原霉萼的囂秘光學(xué)異構(gòu)體都霹以褥到,那么凌不同鼴 料合成具有不同光舉性質(zhì)的主體也是合理可行的。我們已經(jīng)知道,l 型氨基酸組成的a 螺旋 多獲跫右手臻旋縫褊,搖愛,登蘸基酸形或熬楚左手嫘讖結(jié)褥。這已經(jīng)渡仡學(xué)z 俸者殘 功燧用于實(shí)際的功能分子設(shè)計(jì)中1 3 ”。 溶液中構(gòu)象靜研預(yù)測(cè)魏幫可控掰洼。瓣琵子合成多聚物靜特點(diǎn),多簸的一個(gè)蘩要熬特 征是可以從它們初始的構(gòu)型,比如可以通過構(gòu)成多肽的氨瀑酸的序猁預(yù)測(cè)它們?cè)谌芤褐械?構(gòu)緣。目前我們可戳從戢的氨蒸酸序列推測(cè)該蛋自質(zhì)的二級(jí)緒秘,但是還不能擒測(cè)它的 三級(jí)結(jié)構(gòu)。現(xiàn)存盼些經(jīng)駿標(biāo)準(zhǔn)已經(jīng)可以撩確地預(yù)測(cè)某一繪定的肽鏈在溶液中的最優(yōu)構(gòu)象, 以及他們的側(cè)鏈基團(tuán)的位羧,這對(duì)控制分子識(shí)別有很重要的意義。 藏熬豹會(huì)成方法,在沒詩凌熊分子髂焱瓣一個(gè)容易被忽略躲瓠準(zhǔn)是合戲方法的多樣性 和靈活性。也就是說對(duì)參與絡(luò)合和催化的宙能團(tuán)可以很容易被從方向,位置以及化學(xué)組成 t 遴行我們希望靜改交。多虢合成e 經(jīng)褥遽一點(diǎn)變成酉箍e 疑3 0 每蘩開始弱多獲懿圈搖侖 成發(fā)展至今,縮含試劑的巨大改進(jìn),切除方法的簡(jiǎn)便化,同時(shí)合成幾條多肽的實(shí)現(xiàn)等等使 多肽合成融經(jīng)成為科學(xué)中一個(gè)非常成熟的領(lǐng)域。 縫健手段,隧罄嘉壓渡楣色譜的廣泛廢用,臺(tái)成多歇最后的純化步騾冠的越來越容易祁 有效。最厥,由于高分辨質(zhì)譜和n m r 技術(shù)的日臻進(jìn)步,對(duì)多肽序列的結(jié)構(gòu)分析滾定越來越 南矸大學(xué)碩士學(xué)位論文篩一奄 精確,尤其是高分辨質(zhì)譜可以確定出分子鱉在1 0 ,0 0 0 以上的多肽序列。 雖然敬擁有如此多的優(yōu)點(diǎn),值楚也并非沒有缺陷,普通的酞鏈在溶液中的構(gòu)象盡管可 咀做到寵程度上的預(yù)測(cè),但是肽鏈結(jié)構(gòu)的過分靈活仍然從一定稅度上限制了鏈狀肽分子 作為超分子主體材料的廣泛應(yīng)用。這時(shí),商一類以肽和氨慕酸作為基礎(chǔ)的環(huán)狀主體分子逐 漸吸g l 了人們懿關(guān)淀。那就是環(huán)黢秘弓| 入l 肽單元進(jìn)行構(gòu)象墾制躲類環(huán)默。 1 2 2 環(huán)肽的簡(jiǎn)介 環(huán)肽( c y c l o p e p t i d e ,0 1 c y c l i c p e p t i d e ) 是自然界廣泛存在的一種生物環(huán)狀分子。顧名思 義,蓼獲怒盎氮基羧單元擒藏戇環(huán)狀多黢。已攝遴妁天然耀默大多來自予海綿霹海洋節(jié)駛 動(dòng)物等低等生物中。此外,環(huán)肽和必環(huán)肽也廣泛存在于微嫩物、真菌、藻菸和高等植物之 中,并在生錫俸靜篷鑫活動(dòng)中攜演著稷其羹要靛舞色剮。 環(huán)肽及其類似物具有多種多樣的生物學(xué)功能,可以作為激索( h o r m o n e ) 、抗菌素 ( a n t i b i o t i c s ) ,霉綮( t o x i n s ) 、抗毒素( a n t i t o x i n s ) 、抗癩物以及抗病毒物等等【3 粥。例妻日 短括鎣煞( g r a m i c i d i n ) 具有挽摻蘭氏陽纓蘩熬愛力,囂黠揍糖蘭氏爨細(xì)蓑炙效p q ;t y r o c i d i r t e 通過與d n a 形成囂已合物而抑制低樣植物的生殖器形成孢子p7 】;t o n t o x i n 可抑制葉綠素的合 成和競(jìng)含磷酸純稼臻f 3 8 l ;a m a n i t i n 虢與賓棱生耪孛依蔟予d n a 靜r n a 蒙含酶籜愆爵簿鬣 其活性 3 9 1 ;v e m a m y c i nb 則可以用米抑制核糖體生物合成蛋白質(zhì)【4 0 】:p h a l l o d i n 可通過與類 胍動(dòng)蛋自的蛋自組分結(jié)臺(tái)幫致k 離子稻酶飆細(xì)胞中流失,從兩損傷拜緬臆貘剛】;次毒覃環(huán) 肷( p h a l l o t o x i n s ) 靳全部豳l 亮氨酸組成的環(huán)八肽a m a t o x i n s 是最有名的多膿毒索,9 0 以上的蘑菇毒素的致命病例均可追溯到a m a t o x i n s 4 2 】;與之相反,a n t a r n i n i d e 具有抗毒性, 邋過對(duì)翳纓您膜款緊露,降低毒豢分子款遴透蛙m l ;在疾瘸浚療方蘧,v i o n y c i n 能i 霹于治 療結(jié)核病【4 4 1 ,c a l l i p e l t i na 可保護(hù)細(xì)胞不被h i v 瘸海感染,具有防愛滋病作用【4 5 】;此外古 有靜羥基勢(shì)戎馥、n 犖基綴氨酸戴n 一率鎣堯氨酸懿一些臻黢霹鞋鼴作殺蟲潮氍】。豁上純含 物均是全部或部分由氨基酸組成的環(huán)肽類化合物。另外從下丘腦中分離得到的生長(zhǎng)激素釋 放抑制激素( s o m a t o s t a i n ) 和黑色索釋敖激素( m r h ) 為環(huán)十圈簸和環(huán)十,菰秘”;孺其商 抗菌活性的纈氨霉索( v a l i n o m y c i n ) 【4 8 1 和恩鐮孢菌素( e n n i a t i n s ) 【4 9 1 等都是環(huán)狀縮酯肽, 它們可以識(shí)別離子并使其通過天然膜和人工液膜體系,是離子的天然載體。 正弱為其諸多生耪學(xué)功髓,環(huán)獲類耽會(huì)秘弓| 越了詫學(xué)家、藥物學(xué)家耨生甥學(xué)寒餐廣泛 關(guān)注,其研究現(xiàn)正方興未艾。環(huán)肽作為主體分子的超分子化學(xué)研究近年來也取得了一定進(jìn) 6 一整二塞! 萱童 震5 。一蚓。 1 2 。3 環(huán)肽的離予識(shí)別 環(huán)款的離子識(shí)掰研究源予纈氨霉索( v a l i n o m y c i n ) 的發(fā)現(xiàn)矧。綴氨霉素楚一種d 、l 交替環(huán)縮酯十二默( f i g u r et 3 a ) ,骨絮中除了d 、l 纈氨酸麗外,還鴦l 。羥基閩酸( l 。l a c ) 和d - o l 一羥基辯戊酸( d h y i v ) 。 d v a ll - l a cb - v a l d - h y l v ( a )( b ) f i g u r el 3 ( 零s t r u c t u r eo f v a l i n o m y c i n 。) c o n f o r m a t i o n o f v a l i n o m y c i n * k + c o m p l e x 纈氨霉素建一種嫩物選擇往離予載體,熊夠襄報(bào)多金屬離子形藏醚合糍,在中毪溶藕 中,對(duì)k + 有非常好的選擇性,其k + n a + :i 盤攆性太子1 0 4 ,但隨著溶劑極性的增加,其離子 配位能力降低1 5 1 j 。在絳合鉀離子后,綴氨霉素形成g 對(duì)稱的“簾布稽”式構(gòu)象( f i g u r e1 4 b ) , 其中湊囂絮羰基形成了一個(gè)親水性豹極性窆膣以終會(huì)離子,這種麴象杰交替的t y p e i i ( 一l v a i d h y l v - ) 和t y p ei i ( - d v a l l - l a c ) 型- 轉(zhuǎn)折( b - t u r n ) 所構(gòu)成,其中酯羰基提供了 心離予,k 瑟鐮配蒞熬位煮,露鼗耱雪l | l 鏈梅藏了傳系瓣藏隸蛙於壁【翊。 = = o a同 f i g u r e 1 。4c o n f o r m a t i o nf o r m so f v a 3 i n o m y c i n i ns o l u t i o n 7 目| 町 節(jié)伢 呈: 儼麓 南開大學(xué)碗士學(xué)位論文第一鲞 研究表明,纈氨霉素的離子選擇性來自于其絡(luò)合能力對(duì)離子大小和電荷的依賴性。 d e v a r a j a n l 5 3 m a y e r s 5 4 分別研究了纈氨霉素一c a 2 卞、纈氨霉素b a 2 + 配合物的構(gòu)象。前者發(fā) 現(xiàn)纈氨霉素- c a ”絡(luò)合物幾乎和纈氨霉索一k + 的構(gòu)象一致,即纈氨霉素的六個(gè)酯羰基指向環(huán)內(nèi) 形成一個(gè)空腔絡(luò)合鈣離子。而纈氨霉素一b a 2 + 絡(luò)合物為l :2 型夾心絡(luò)合物,骨架原子構(gòu)成 近似的平面結(jié)構(gòu),每三個(gè)酯羰基與一個(gè)b a ”絡(luò)合,b a 2 + 四面體的第四個(gè)配位原子為苦昧酸 負(fù)離子的氧原子。這些研究表明環(huán)肽構(gòu)象隨客體半徑及電荷變化的復(fù)雜性。 除纈氨霉素而外,人們己發(fā)現(xiàn)多種天然環(huán)肽具有與離子配合的能力并可作為某些離子 跨膜運(yùn)輸?shù)妮d體。e n n i a t a i n sa ,b ,c 和纈氨霉素一樣是環(huán)狀縮酯肽,是對(duì)k + 有良好選擇 性的另外一類天然離子載體,而且能夠和過渡金屬離子配位【5 5 】:c y e l o s p o r i na ,一種天然 環(huán)十一肽,是對(duì)l i + 和c a 2 + 有高度選擇性的離子載體【5 6 】;而s c y t o n e m i n a ,一種環(huán)十一肽, 也被發(fā)現(xiàn)具有絡(luò)合c a 2 + 離子的性能。但對(duì)這些天然環(huán)肽配合物的研究相對(duì)于纈氨霉素而 言不太深入。 由于纈氨霉素對(duì)k + 離子的高度選擇性,在闡明其絡(luò)合機(jī)理之后,模擬纈氨霉素的研究 受到了化一學(xué)家的雨視。在這些研究中,一般以肺氨酸代替c l 一羥基酸,以甘氦酸部分或全部 代替d 一氨基酸而設(shè)計(jì)模型化合物,如c y c l o ( l - a l a g l y d p h e - l p r o ) 3 、 c y c l o ( l ,v a l 二g l y g l y l p r o ) 3 ( v g g p ) 。這主要是因?yàn)楦拾彼釠]有手性,可以說既是d 型也 是l 型,而脯氨酸中的氨基為仲胺,形成的酰胺鍵和纈氨霉素的酯鍵類似,并不會(huì)提供模 裂化合物形成分子內(nèi)氫鍵的額外位點(diǎn),而且甘氨酸和脯氨酸的引入有利于環(huán)肽的合成忙”。 這兩個(gè)環(huán)十二肽一般對(duì)k + 有比較好的選擇性。構(gòu)象研究表明,這些模型化合物與k + 作用時(shí) 有兩種可能的構(gòu)象:一種類似于纈氨霉索的“簾布筒”式構(gòu)象,如v g g p 5 9 1 等;另一種則 采用c v 型構(gòu)象,如c y e l o ( l a l a - g l y d p h e l p r o ) 3 等。研究發(fā)現(xiàn)這些化合物的絡(luò)合能力 不但與客體離子有關(guān),也和主體的構(gòu)象有非常大的關(guān)系。如v g g p 6 1 1 在非極性或極性很小 的溶劑中采用的c 3 對(duì)稱構(gòu)象,所有六個(gè)甘氨酸的n h 鍵都形成了分子內(nèi)氫鍵,沒有形成 “簾布筒”式構(gòu)象,在與客體離子作用時(shí)破壞這些氫鍵比較困難,因此結(jié)合離子的能力很 弱或者根本沒有;而在極性溶劑乙腈中,幾種穩(wěn)定構(gòu)象同時(shí)存在,沒有分子內(nèi)氫鍵,在與 k + 、b a 2 + 等結(jié)合后,其構(gòu)象即穩(wěn)定為“簾布簡(jiǎn)”式。這些纈氨霉素模型化合物一般與離子 形成1 :1 絡(luò)合物,但也存在著“夾心”式絡(luò)合。一般而言,離子越4 、,越容易形成“夾心” 式絡(luò)合物,如c y c l o ( l a l a - g l y d p h e l p r o ) 3 能和b a 2 + 、k + 、p b + 、c r 、t l + 形成1 :1 絡(luò)合物 第一章:前言 而與n a + 和l i + 形成1 :2 離子環(huán)肽絡(luò)合物 6 0 】:c y c l o ( l v a l d p r o d v a l l p r o ) 3 能和k + 、c a 2 + 、 b a “、t l + 形成1 :1 絡(luò)合物,而與l i + 、m g ”、n a + 形成1 :2 離子一環(huán)肽絡(luò)合物。這些研究同 樣也揭示出環(huán)肽的離予識(shí)別與離子的電荷和半徑大小有關(guān)。除了上述頭尾結(jié)合的環(huán)肽而外, g a r c i a e c h e v e r r i a 等人【6 3 】還設(shè)計(jì)了一個(gè)通過二硫鍵結(jié)合的環(huán)肽以模擬纈氨霉素( f i g u r e1 5 ) 。 此環(huán)肽在較強(qiáng)極性溶劑乙腈中對(duì)b a 2 + 表現(xiàn)出非常明顯的親臺(tái)力和高度選擇性。盡管模型研 究表明環(huán)肽在與離子配位時(shí)會(huì)采用纈氨霉素“簾布簡(jiǎn)”式構(gòu)象,但計(jì)算機(jī)輔助圓二色研究 揭示出環(huán)肽與離子結(jié)合后的構(gòu)象同樣依賴于離子的大小。 o h ,c j l n h o h 1 c 業(yè)n h f i g u r e1 5s t r u c t u r ea n d m e t a l c o m p l e xc o n f o r m a t i o no f v a l i n o m y c i nm o d e ld e s i g n e db y g a r c i a e c h e v e r r i ae ta l 除了纈氨霉素的模擬研究以外,化學(xué)家們還研究了其它很多環(huán)肽和金屬離子的作用, 其中相當(dāng)一部分是含有p r o 和g l y 并且有一定對(duì)稱性的環(huán)肽,如c y c l o ( p r o g l y ) 。( n = 3 ,4 , 5 ) 6 4 】、c y c l o ( x x x p r o x x x ) 2 等糾6 鄂。這主要是考慮到含p r o 和g l y 的環(huán)肽較易合成,而好 的對(duì)稱性有助于降低環(huán)肽的構(gòu)象自由度。b l o u t 研究小組 6 4 a , 6 4 c 1 系統(tǒng)研究了環(huán)肽 c y c l o ( p r o g l y ) 。( 1 3 = 3 ,4 ,5 ) 在溶液中的構(gòu)象以及與堿金屬和堿土金屬的絡(luò)合情況。他們發(fā)現(xiàn) 這些環(huán)肽在極性溶劑中一般采取非對(duì)稱構(gòu)象。而在非極性或低極性溶劑中采取對(duì)稱構(gòu)象。 而這螳化合物在與離子絡(luò)合后一般采取肽鍵全反式的。一對(duì)稱構(gòu)象,不再存在分子內(nèi)氫鍵。 他們同時(shí)還發(fā)現(xiàn),這些環(huán)肽絡(luò)臺(tái)離子的能力與其環(huán)空腔和離子是否匹配有關(guān)。 k i m u r a 和i m a n i s h i 以c y c l o ( x x x p r o ) 4 【x x x = p h e ,l e u ,l y s ( z ) 為研究對(duì)象,研究了溶 劑效應(yīng)對(duì)環(huán)肽絡(luò)合的影響6 們,發(fā)現(xiàn)在乙醇溶液中,c y c l o ( p h e p r o ) 4 并不與離子形成配合物, 而c y c l o ( l e u p r o ) 4 和c y c l o ( l y s ( z ) 一p r o ) 4 卻對(duì)c a 2 + 和b a 2 + 有良好的選擇性;而在另一種極性 溶劑乙腈中c y c l o ( p h e p r o ) 4 卻能夠與c a 2 1 配位。硼:究還發(fā)現(xiàn),配合物的形成速率也與溶劑 眥 擇 cl“dm l 拇 cl 址 南開大學(xué)碩士學(xué)位論文第一章 有比較大的關(guān)系。此外也有研究表明,在含氧原子的溶劑,如甲醇、水,溶劑氧原子和環(huán) 肽羰基之間存在著競(jìng)爭(zhēng),不利于環(huán)肽的離子識(shí)別州“。 環(huán)肽具有較好的離子絡(luò)合能力,并在一定程度上表現(xiàn)出選擇性,而且其骨架能夠形成 籠狀的極性空腔和疏水性的外緣,符合離子運(yùn)輸載體的條件。除了天然環(huán)肽纈氨霉素等而 外,化學(xué)家還研究了其它一些環(huán)肽載體,并且發(fā)現(xiàn)了比較罕見的m 9 2 + 離子載體6 。這些研 究表明,環(huán)肽的跨膜運(yùn)輸有兩種可能的機(jī)制 “】:其一為載體運(yùn)輸機(jī)制( c a r r i e r t r a n s p o r t ) 或者溶液絡(luò)合機(jī)制( s o l u t i o n c o m p l e x a t i o n ) ,即通過化合物與客體分子絡(luò)合運(yùn)輸,如 c y c l o ( l p r o l v a l d p r o d v a l ) 3 ( p v ) ;其二為孔道運(yùn)輸( c h a n n e l t r a n s p o r t ) 或界面絡(luò)合 機(jī)制( i n t e r r a c i a l c o m p l e x a t i o n ) ,即通過主體分子形成的離子通道運(yùn)輸,如纈氨霉素。最近, 本組發(fā)現(xiàn)環(huán)肽對(duì)離子運(yùn)輸?shù)目炻坏c環(huán)肽離子配合物在兩相中的穩(wěn)定性有關(guān),而且與離 子在溶液界面的釋放速率有很大關(guān)系【6 9 】。 其它全部由氨基酸構(gòu)成的環(huán)肽的離子識(shí)別、運(yùn)輸研究結(jié)果基本上類似于上述結(jié)論口。 “環(huán)肽一陽離子配合物”一般存在幾種可能的形式,而無論哪種形式金屬離子都是與環(huán)肽 羰基氧原子配位。由于環(huán)肽構(gòu)象相對(duì)較大自由度造成了其配合物的多樣性、復(fù)雜性,因此 引入非天然氨基酸單元對(duì)環(huán)肽進(jìn)行骨架修飾以限制其構(gòu)象,為提高環(huán)肽離子識(shí)別的選擇性 提供了可能。r a n g a n a t h a n 研究小組【7 1 首先合成了一系列含金剛烷和胱氨酸的環(huán)肽類似物 ( f i g u r e1 6 ) ,這些化合物具有由酰胺鍵構(gòu)成的極性籠狀空穴和e h 金剛烷構(gòu)成的疏水性外緣 f i g u r e1 6s y n t h e s i s o fa d a m a n t a n e c o n t a i n i n gc y s t i n ec y c l o p s e u d o p e p t i d e s 1 0 氣k武。 氣甑武矗 磚 p尹汀 第一章r 前言 可以通過與纈氨霉素類似的孔道運(yùn)輸機(jī)制運(yùn)輸堿金屬離子。其中二聚體對(duì)n a + 的運(yùn)輸能力 比k 十強(qiáng),而三聚體恰好相反,四聚體對(duì)n r 和k + 沒有運(yùn)輸能力,而這些化合物對(duì)c a 2 + 都 缺乏運(yùn)輸能力,表明這些環(huán)肽類似物離子識(shí)別、運(yùn)輸能力的強(qiáng)弱與其空腔和離子的匹配性 及離子電荷有很大關(guān)系。此外,他們還研究了其它一些包含剛性基團(tuán)的類環(huán)肽的離子識(shí)別 和運(yùn)輸能力7 2 1 ,得到了類似的結(jié)論。他們還將降冰片烯作為構(gòu)象限制單元引入環(huán)肽體系, 通過核磁與圓二色光譜的研究,發(fā)現(xiàn)這些化合物采取的是類似于發(fā)卡構(gòu)型的d 折疊,這本身 對(duì)研究通過構(gòu)象限制模擬蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)有很重要的意義,同時(shí)還發(fā)現(xiàn)擁有對(duì)稱二肽側(cè) 鏈的兩個(gè)化合物在離子跨膜運(yùn)輸實(shí)驗(yàn)中對(duì)某些一價(jià)離子有良好的運(yùn)輸能力和選擇性【” 。 除了主族金屬離子以外,環(huán)肽通過骨架7 4 埽口側(cè)鏈與過渡金屬離子配位也有少量報(bào)道。 研究表明,環(huán)肽與過渡金屬的結(jié)合主要是利用環(huán)肽側(cè)鏈上的咪唑、硫醚等基團(tuán)或者通過環(huán) 肽骨架上的脫質(zhì)子酰胺氮原子進(jìn)行配位。 由于環(huán)肽的酰胺鍵可以提供與客體分子形成氫鍵的n h ,環(huán)肽自然也應(yīng)該被視為能識(shí) 別負(fù)離子的主體化合物。然而到目前為止,對(duì)負(fù)離子識(shí)別的報(bào)道卻不多見。g a r c i a e c h e v e r r i a 曾就含二硫鍵環(huán)肽( c y s 1 c y s , 4 c y s - 4 1 c y s ) - d i t h i o b i s ( a c - l - t c y s - l - p r o d - v a l l - 4 c y s - n h z ) d m s o 溶液中加入n a c l 或n a n 0 3 后不同的1 h n m r 現(xiàn)象進(jìn)行討論時(shí)指出,此環(huán)肽在d m s o 中是與c 1 絡(luò)合,而不是與n a + 配位,但他們并沒有作深入的探討( 7 6 】。近年來這一現(xiàn)象受 到一定重視,i s h i d a 等人合成了一系列含間苯二甲酸的環(huán)肽類似物,發(fā)現(xiàn)其可與對(duì)硝基苯酚 磷酸酯雙負(fù)離子( p n p p ) 形成1 :1 配合物( f i g u r e1 7 ) ,配合物穩(wěn)定常數(shù)不但依賴于環(huán)肽 酰胺鍵的數(shù)目,而且與環(huán)的大小也有一定的關(guān)系7 7 1 。 o r l c y c l 。( - a l a - 曲8 。) 3 + o 2 “ o k f i g u r e 1 7c o m p l e x a t i o no fb e n z e n e c o n t a i n i n gc y e l o p e p t i d e w i t hp n p p 2 南開大學(xué)碩士學(xué)位論文 第一章 k u b i k 深入研究了這

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