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(物理化學(xué)專(zhuān)業(yè)論文)碳酸及衍生物在各種小分子作用下分解反應(yīng)的機(jī)理研究.pdf.pdf 免費(fèi)下載
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山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 摘要 在化學(xué)領(lǐng)域中,碳酸是一種最基本的化合物。通常情況下,碳酸的分解相當(dāng) 迅速,長(zhǎng)期以來(lái)甚至不能觀測(cè)到純碳酸的存在。l o e r t i n g 等人認(rèn)為:從動(dòng)力學(xué)角 度而言,單個(gè)碳酸分子是很穩(wěn)定的,碳酸的迅速分解主要原因是水分子的作用, 因?yàn)樘妓岱纸馍伤投趸?,水分子催化碳酸,使其加快分解。一分子碳?對(duì)另一分子碳酸的分解是否起催化作用? 除水分子外,其它小分子催化碳酸分解 的效率如何? 關(guān)于這些問(wèn)題,就我們所知尚未見(jiàn)文獻(xiàn)報(bào)道。為此,我們采用密度 泛函方法研究氣相中碳酸在一分子h 2 c 0 3 和兩分子h 2 c 0 3 的催化下的分解反應(yīng) 機(jī)理。近年來(lái),酸堿雙功能小分子( 如h 2 0 、h f 、n h 3 、h f 、c h 3 0 h 等) 充當(dāng) 催化劑催化各種反應(yīng)不斷引起人們廣泛的研究興趣,這也激發(fā)了我們研究碳酸在 酸堿雙功能小分子作用下分解反應(yīng)的興趣。 碳酸衍生物種類(lèi)繁多,其中碳酸酯類(lèi)化合物是一種重要的有機(jī)化工中間體, 人們對(duì)此類(lèi)化合物作了許多研究,主要集中在合成問(wèn)題及作為有機(jī)合成的中間 體。而作為反應(yīng)中間體,其穩(wěn)定性非常重要。碳酸酯類(lèi)化合物在制備和作為中間 體的應(yīng)用中與小分子經(jīng)常共處于一個(gè)體系中,因此研究碳酸酯類(lèi)化合物在小分子 作用下的分解反應(yīng)在有機(jī)合成上具有重要意義。 綜合以上幾點(diǎn),在查閱文獻(xiàn)的基礎(chǔ)上,我們采用量子化學(xué)計(jì)算中的密度泛函 b 3 l y p 方法,對(duì)碳酸及衍生物在小分子( 如h 2 0 、h f 、c h 3 0 h 等) 作用下的分 解反應(yīng)展開(kāi)了系統(tǒng)研究,研究工作的主要內(nèi)容由以下幾個(gè)方面組成: 1 、碳酸在小分子作用下分解反應(yīng)的機(jī)理研究 采用密度泛函理論( d f t ) 中的b 3 l y p 方法,在6 3 11 g 料水平上,首先全 參數(shù)優(yōu)化氣相中碳酸孤立分子、及其與小分子( h 2 c 0 3 、2 h 2 c 0 3 、h 2 0 、2 h 2 0 、 h f 、n h 3 、c h 3 0 h ) 形成的復(fù)合物的構(gòu)型,并優(yōu)化產(chǎn)物復(fù)合物、過(guò)渡態(tài)構(gòu)型,通 過(guò)各構(gòu)型振動(dòng)頻率的計(jì)算,對(duì)平衡構(gòu)型和過(guò)渡態(tài)構(gòu)型進(jìn)行確證;通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐 標(biāo)( 瓜c ) 解析計(jì)算,確證過(guò)渡態(tài)與反應(yīng)物和產(chǎn)物連接的正確性;最后,從活化能 壘的角度對(duì)小分子的催化效能做出比較。結(jié)果表明:有小分子參與的反應(yīng)中,較 孤立碳酸分子的分解反應(yīng),活化能明顯降低,催化效能順序依次為: 2 h 2 0 h f n h 3 c h 3 0 h h 2 0 2 h 2 c o l 3 h 2 c 0 3 山東師范大學(xué)碩七學(xué)位論文 、2 、碳酸一甲酯在小分子作用下分解反應(yīng)的機(jī)理研究 采用d f t 中的b 3 l y p 方法,在6 3 1 1 g 木水平上,首先全參數(shù)優(yōu)化氣相中 碳酸一甲酯孤立分子、及其與小分子( h 2 0 、2 h 2 0 、h f 、c h 3 0 h ) 形成的復(fù)合物 構(gòu)型,并優(yōu)化產(chǎn)物復(fù)合物、過(guò)渡態(tài)構(gòu)型,通過(guò)各構(gòu)型振動(dòng)頻率的計(jì)算,對(duì)平衡構(gòu) 型和過(guò)渡態(tài)構(gòu)型進(jìn)行確證;通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)( 瓜c ) 解析計(jì)算,確證過(guò)渡態(tài)與反 應(yīng)物和產(chǎn)物連接的正確性;最后,從活化能壘的角度對(duì)小分子的催化效能做出比 較。結(jié)果表明:有小分子參與的反應(yīng)中,活化能明顯降低,且催化能順序依次為: 2 h 2 0 h f c h 3 0 h h 2 0 3 、碳酸二甲酯在小分子作用下分解反應(yīng)的機(jī)理研究 采用d f t 中的b 3 l y p 方法,在6 31 1 g 棗宰水平上,全參數(shù)優(yōu)化氣相中碳酸 二甲酯孤立分子、及其與小分子( h 2 0 、h f 、c h 3 0 h ) 形成的復(fù)合物,并優(yōu)化產(chǎn)物 復(fù)合物、過(guò)渡態(tài)構(gòu)型,通過(guò)各構(gòu)型振動(dòng)頻率的計(jì)算,對(duì)平衡構(gòu)型和過(guò)渡態(tài)構(gòu)型進(jìn) 行確證;通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)( 瓜c ) 解析計(jì)算,確證過(guò)渡態(tài)與反應(yīng)物和產(chǎn)物連接的 正確性;接下來(lái)對(duì)分子發(fā)生反應(yīng)的可能途徑、反應(yīng)活化能進(jìn)行分析和討論。結(jié)果 表明:有小分子參與的反應(yīng)較孤立分子活化能壘略有升高;各種反應(yīng)的活化能壘 相差不大,分解反應(yīng)受小分子影響不大。 4 、氨基甲酸甲酯在小分子作用下分解反應(yīng)的機(jī)理研究 采用d f t 中的b 3 l y p 方法,在6 3 1 1 g 宰水平上,全參數(shù)優(yōu)化氣相中氨基 甲酸甲酯孤立分子、及其與小分子( h 2 0 、h f 、c h 3 0 h ) 形成的復(fù)合物,并優(yōu)化產(chǎn) 物復(fù)合物、過(guò)渡態(tài)構(gòu)型,通過(guò)各構(gòu)型振動(dòng)頻率的計(jì)算,對(duì)平衡構(gòu)型和過(guò)渡態(tài)構(gòu)型 進(jìn)行確證;通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)( i r c ) 解析計(jì)算,確證過(guò)渡態(tài)與反應(yīng)物和產(chǎn)物連接 的正確性;接下來(lái)對(duì)分子發(fā)生反應(yīng)的可能途徑、反應(yīng)活化能進(jìn)行分析和討論。結(jié) 果表明:有小分子參與的反應(yīng)較孤立分子活化能壘顯著較低;h f 參與反應(yīng)時(shí), 活化能壘最小,反應(yīng)最容易進(jìn)行。 全部量子化學(xué)計(jì)算工作使用g a u s s i a n 0 3 程序完成。 關(guān)鍵詞:碳酸及衍生物、分解反應(yīng)、小分子、活化能、密度泛函方法 分類(lèi)號(hào):0 6 4 3 1 2 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 a bs t r a c t i nt h ec h e m i c a lf i e l d ,c a r b o n i ca c i di sab a s i cc o m p o u n d u n d e rn o r m a l c i r c u m s t a n c e s ,t h ed e c o m p o s i t i o no fc a r b o n i ca c i di sv e r yr a p i d h e r e ,l o e r t i n g e l u c i d a t et h a tw a t e rm o l e c u l e si n f l u e n c et h e d e c o m p o s i t i o n r a t e w h e t h e ro n e c a r b o n i ca c i dh a sac a t a l y t i ce f f e c to no t h e r ? b e s i d e sw a t e rm o l e c u l a r s ,w h a ti s c a t a l y t i ce f f i c i e n c yo fo t h e rm o l e c u l a r so nc a r b o n i ca c i d ? a sf a ra sw ek n o w , t h e s e i s s u e sh a v en o tb e e nr e p o r t e d w eh a v ea d o p t e dd f tt os t u d yc a r b o n i ca c i d d e c o m p o s i t i o nr e a c t i o nm e c h a n i s mi ng a sa to n em o l e c u l e so fh 2 c 0 3 o rt w oh 2 c 0 3 ; a c i d - b a s eb i f u n c t i o n a ls m a l lm o l e c u l e s ( s u c ha sh 2 0 ,c h 3 0 h ,n h 3 ,h f , e t c ) h a v i n g ac a t a l y t i ce f f e c to nt h er e a c t i o n c o n t i n u o u s l ya t t r a c t e de x t e n s i v er e s e a r c hi n t e r e s t , w h i c hh a ss t i m u l a t e do u rs t u d yo nc a r b o n i ca c i dd e c o m p o s i t i o nr e a c t i o ni n t h e a c i d - b a s eb i f u n c t i o n a ls m a l lm o l e c u l e s aw i d er a n g eo fc a r b o m ca c i dd e r i v a t i v e s ,c a r b o n i ca c i de s t e r sa r ei m p o r t a n t o r g a n i cc h e m i c a li n t e r m e d i a t e s t h e r ei sm u c hr e s e a r c ho nt h e s ec o m p o u n d s ,m a i n l y c o n c e n t r a t e di nt h es y n t h e s i sp r o b l e m a n da sr e a c t i o ni n t e r m e d i a t e s ,i t ss t a b i l i t yi s v e r yi m p o r t a n tf o rr e a c t i o n s c a r b o n i ca c i de s t e r sw i t hs m a l lm o l e c u l a r sa r eo f t e ni na s y s t e mw h i l ei nt h ep r e p a r a t i o na n da p p l i c a t i o n sa si n t e r m e d i a t e s s os t u d y i n gt h e d e c o m p o s i t i o no fc a r b o n i ca c i de s t e r si n t h er o l eo fs m a l lm o l e c u l e si no r g a n i c s y n t h e s i si so fg r e a ts i g n i f i c a n c e c o n s i d e r i n gt h ea b o v ef a c e t s ,w es t a r to u rs y s t e m i cs t u d yd e c o m p o s i t i o no f c a r b o n i ca c i da n dd e r i v a t i v e si nt h es m a l lm o l e c u l e ( s u c ha sh 2 0 ,h f ,c h 3 0 h ,e t c ) b yu s i n gt h eb 3l y pm e t h o di nt h ed e n s i t yf u n c t i o n a lt h e o r y t h et h e s i sc o n s i s t so ft h r e ep a r t sa sf o l l o w s : 1 、m e c h a n i s ms t u d yo nc a r b o n i ca c i dd e c o m p o s i t i o na tt h er o l eo fs m a l l m o l e c u l e s w eu s e dt h ed f tm e t h o da tt h eb 3 l y p 6 31 1g 棗木l e v e lo ft h e o r yt oo p t i m i z e t h ec o n f i g u r a t i o n so fi s o l a t e da n dc o m p l e xc a r b o n i ca c i da n da l lt h e i rp r o d u c to f c o m p l e xa n dt h es t r u c t u r e so fc o r r e s p o n d i n gt r a n s i t i o ns t a t i o n ;t h e nw eb e g a nt o 3 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 d i s c u s st h er e l a t i v es t a b i l i t yo ft h ec o m l e xa n dt h ep o s s i b l er e a c t i o np a t h w a y s ;a tl a s t t h ec a t a l y t i ce f f e c to ft h es m a l lm o l e c u l ew a sc o m p a r e dw i t hr e s p e c tt ot h er e a c t i o n s a c t i v ee n e r g y t h er e s u l t ss h o w e dt h a t :w h i l et h e r ei sas m a l lm o l e c u l ei n v o l v e di nt h er e a c t i o n , t h ea c t i v a t i o ne n e r g yd e c r e a s e ss i g n i f i c a n t l y ,t h eo r d e ro fc a t a l y t i ce f f e c t i v e n e so 2 h 2 0 h f n h 3 c h 3 0 h h 2 0 2 h 2 c 0 3 h 2 c 0 3 2 、m e c h a n i s ms t u d yo nm e t h y lc a r b o n a t ed e c o m p o s i t i o na tt h er o l eo fs m a l l m o l e c u l e s w eu s e dt h ed f tm e t h o da tt h eb 3l y p 6 311g 宰母l e v e lo ft h e o r yt oo p t i m i z e t h ec o n f i g u r a t i o n so fi s o l a t e da n dc o m p l e xc a r b o n i ca c i da n da l lt h e i rp r o d u c to f c o m p l e xa n dt h e s t r u c t u r e so fc o r r e s p o n d i n gt r a n s i t i o ns t a t i o n ;t h e nw eb e g a nt o d i s c u s st h er e l a t i v es t a b i l i t yo ft h ec o m l e xa n dt h ep o s s i b l er e a c t i o np a t h w a y s ;a tl a s t t h ec a t a l y t i ce f f e c to ft h es m a l lm o l e c u l ew a sc o m p a r e dw i t hr e s p e c tt ot h er e a c t i o n s a c t i v ee n e r g y t h er e s u l t ss h o w e dt h a t :w h i l et h e r ei sas m a l lm o l e c u l ei n v o l v e di nt h er e a c t i o n , t h ea c t i v a t i o ne n e r g yd e c r e a s e ss i g n i f i c a n t l y ,t h eo r d e ro fc a t a l y t i ce f f e c t i v e n e sf o rt h e 2 h 2 0 h f c h 3 0 h h 2 0 3 、m e c h a n i s ms t u d yo nd i m e t h y lc a r b o n a t ed e c o m p o s i t i o na tt h er o l eo fs m a l l m o l e c u l e s w eu s e dt h ed f tm e t h o da tt h eb 3l y p 6 - 311g 宰宰l e v e lo ft h e o r yt oo p t i m i z e t h ec o n f i g u r a t i o n so fi s o l a t e da n dc o m p l e xc a r b o n i ca c i da n da l lt h e i rp r o d u c to f c o m p l e xa n dt h e s t r u c t u r e so fc o r r e s p o n d i n gt r a n s i t i o ns t a t i o nt h e nw eb e g a nt o d i s c u s st h er e l a t i v es t a b i l i t yo ft h ec o m l e xa n dt h ep o s s i b l er e a c t i o np a t h w a y sa n d r e a c t i o na c t i v a t i o ne n e r g y t h er e s u l t ss h o w e dt h a t :a c t i v a t i o ne n e r g yb a r r i e ri sh i g h e ri nt h er e a c t i o no f s m a l lm o l e c u l e sp a r t i c i p a t i n gt h a ni s o l a t e dm o l e c u l e s ;t h e r ei sl i t t l ed i f f e r e n c ei n v a r i e t i e so fr e a c t i o na c t i v a t i o n e n e r g yb a r r i e r ,s m a l l m o l e c u l e s e f f e c t i n g d e c o m p o s i t i o nr e a c t i o ni sv e r yl i t t l e 4 、m e c h a n i s ms t u d yo nm e t h y lc a r b a m a t ed e c o m p o s i t i o na tt h er o l eo fs m a l l m o l e c u l e s 4 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 w eu s e dt h ed f tm e t h o da tt h eb 3 l y p 6 311g 宰幸l e v e lo ft h e o r yt oo p t i m i z e t h ec o n f i g u r a t i o n so fi s o l a t e da n dc o m p l e xc a r b o n i ca c i da n da l lt h e i rp r o d u c to f c o m p l e xa n dt h es t r u c t u r e so fc o r r e s p o n d i n gt r a n s i t i o ns t a t i o n ;t h e nw eb e g a nt o d i s c u s st h er e l a t i v es t a b i l i t yo ft h ec o m l e x 、t h ep o s s i b l er e a c t i o np a t h w a y sa n d r e a c t i o na c t i v a t i o ne n e r g y t h er e s u l t ss h o w e dt h a t :a c t i v a t i o ne n e r g yb a r r i e ri sl o w e ri nt h er e a c t i o no f s m a l lm o l e c u l e sp a r t i c i p a t i n gt h a ni s o l a t e dm o l e c u l e s ;w h i l eh f p a r t i c i p a t i n gi nt h e r e a c t i o n s ,a c t i v a t i o ne n e r g yb a r r i e ri st h es m a l l e s t ,t h er e a c t i o nc a r r i e so u tm o s te a s i l y a l lc a l c u l a t i o n sh e r ea r ep e r f o r m e do np p cc o m p u t e rb yu s i n gg a u s s i a n0 3 p r o g r a ms y s t e m k e yw o r d s :c a r b o n i ca c i da n dd e r i v a t i v e s ,d e c o m p o s i t i o nr e a c t i o n ,s m a l lm o l e c u l e , t h ea c t i v a t i o ne n e r g y ,d e n s i t yf u n c t i o n a lm e t h o d s c a t e g o r yn u m b e r :0 6 4 3 1 2 5 獨(dú)創(chuàng)聲明 本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。 據(jù)我所知,除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫(xiě) 過(guò)的研究成果,也不包含為獲得( 注:如沒(méi)有其他需要特別聲明的,本欄 可空) 或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書(shū)使用過(guò)的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任 何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說(shuō)明并表示謝意。 學(xué)位論文作者簽名: 糶患槐 導(dǎo)師簽字: 學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書(shū) 乒| 垮 1 本學(xué)位論文作者完全了解堂拉有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,有權(quán)保留并向國(guó) 家有關(guān)部門(mén)或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤(pán),允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)堂撞可 以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等 復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。( 保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書(shū)) 學(xué)位論文作者簽名:采惡楊 簽字日期:2 0 07 年鄉(xiāng)月弼日 導(dǎo)師簽字支,慘缸 簽字日期:2 0 07 年鄉(xiāng)月“日 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 第一章緒論 1 1 研究意義 二氧化碳水合反應(yīng)是生物系統(tǒng)中的基本反應(yīng)之一【l ?!?,對(duì)于反應(yīng)產(chǎn)物碳酸, 無(wú)論從理論角度【4 即還是從實(shí)驗(yàn)角度9 。2 3 1 ,都做了廣泛的研究。在化學(xué)領(lǐng)域中,碳 酸是一種最基本的化合物,通常情況下,碳酸的分解相當(dāng)迅速,很難得到純碳酸, 長(zhǎng)期以來(lái)甚至不能觀測(cè)到純碳酸的存在2 4 1 。盡管如此,還是有化學(xué)家在從事這 方面的工作,文獻(xiàn)【4 4 】成功地對(duì)二氧化碳水合系統(tǒng)里的碳酸進(jìn)行了分離和表征, 甚至還將其升華,重新冷凝成固態(tài),從而證明了氣態(tài)碳酸的穩(wěn)定性【8 】。從動(dòng)力學(xué) 角度而言,單個(gè)碳酸分子是很穩(wěn)定的,碳酸的迅速分解主要原因是水分子的作用, 因?yàn)樘妓岱纸馍伤投趸?,水分子催化碳酸,使其加快分?2 4 1 。到目前為 止,就我們所知,關(guān)于其它分子影響碳酸分解的反應(yīng)未見(jiàn)報(bào)道??紤]到碳酸分子 對(duì)碳酸的催化反應(yīng),為了和水分子作催化劑時(shí)反應(yīng)的難易程度作出比較,我們研 究碳酸在一分子碳酸及兩分子碳酸的作用下的分解反應(yīng)的機(jī)理;近年來(lái),酸堿 雙功能小分子( 如h 2 0 、h f 、n h 3 、c h 3 0 h 等) 充當(dāng)催化劑催化各種反應(yīng)不斷 引起人們廣泛的研究興趣【2 5 捌】,這也激發(fā)了我們研究碳酸在酸堿雙功能小分子作 用下的分解反應(yīng)的興趣。酸堿雙功能水分子催化碳酸分解的反應(yīng),t h o m a s l o e r t i n g 等人已經(jīng)做了詳細(xì)的理論研究 2 4 】,為了在同種方法下比較各小分子作用 下的分解反應(yīng)的難易程度,我們對(duì)水分子作用的催化反應(yīng)也一并研究。為此,我 們采用密度泛函方法研究氣相中碳酸在一分子h 2 c 0 3 和兩分子h 2 c 0 3 作用下的 分解反應(yīng)機(jī)理、碳酸在酸堿雙功能小分子( h 2 0 、h f 、n h 3 等) 作用下的分解反 應(yīng)機(jī)理。 另外,碳酸衍生物種類(lèi)繁多,其中碳酸酯類(lèi)化合物是一種重要的有機(jī)化工中 間體,其分子結(jié)構(gòu)中含有羰基、甲基、甲氧基和羰基甲氧基,因而可將這些基團(tuán) 引入有機(jī)合成反應(yīng)中。人們對(duì)此類(lèi)化合物作了許多研究,主要集中在合成問(wèn)題及 作為有機(jī)反應(yīng)的中間體 5 2 - 6 0 】,而作為反應(yīng)中間體,其穩(wěn)定性非常重要。碳酸酯類(lèi) 化合物在制備和作為中間體的應(yīng)用中與小分子經(jīng)常共處于一個(gè)體系中,因此研究 碳酸酯類(lèi)化合物在小分子作用下的分解反應(yīng)在有機(jī)合成上具有重要意義。本文采 用密度泛函方法研究了氣相中碳酸酯類(lèi)化合物在小分子( h 2 0 、h f 、c h 3 0 h ) 作用 6 山東師范大學(xué)碩十學(xué)位論文 下的分解反應(yīng)的機(jī)理。 1 2 發(fā)展和現(xiàn)狀 碳酸分解生成水和二氧化碳,水分子作為催化劑的反應(yīng)研究大體上經(jīng)歷了以 下幾個(gè)發(fā)展階段: 1 9 7 6 年j o m s s o n 等人用從頭計(jì)算方法研究了二氧化碳的水合反應(yīng): h 2 0 + c 0 2 - h 2 c 0 3 計(jì)算得到e = 6 3k j m o l ,得至u k g = 4 0k j m o l ,于是從理論上 得出純碳酸分子在氣相中不可能被觀察到的結(jié)論9 1 。 1 9 8 4 年開(kāi)始,m i n ht h on g u y e n 課題組開(kāi)始研究二氧化碳水合反應(yīng)第二個(gè)水 分子的作用:c 0 2 + 2 h 2 0 = h 2 c 0 3 + h 2 0 ,得出活化能較一個(gè)水分子存在下有所降 低,從而得出第二個(gè)水分子對(duì)合成碳酸有催化作用【16 】;1 9 9 7 年,此課題組又系 統(tǒng)研究了c 0 2 + n h 2 0 = h 2 c 0 3 + ( n 1 ) h 2 0 ( n = l - - 4 ) ,計(jì)算了氣相反應(yīng)歷程中各物 質(zhì)的能量及熱力學(xué)函數(shù),得出在第四個(gè)h 2 0 分子存在的條件下反應(yīng)更有利于發(fā) 生的結(jié)論【2 3 1 。 2 0 0 0 年,t h o m a sl o e r t i n g 等人認(rèn)為:在常溫下,碳酸的分解與水分子有關(guān), 其分解反應(yīng)為:h 2 c 0 3 + n h 2 0 _ - - c 0 2 + ( n + 1 ) h 2 0( n = o 2 ) 【2 4 1 。t h o m a s l o e r t i n g 等人根據(jù)e y i n g 的過(guò)渡態(tài)理論,詳細(xì)計(jì)算了碳酸在n h 2 0 ( n = 0 - 2 ) 的反應(yīng) 速率常數(shù),計(jì)算得到氣相中單個(gè)碳酸分子在3 0 0 k 溫度下分解速率常數(shù)為1 2 1 0 。1 3 s ,半衰期為1 8 萬(wàn)年;但是同樣溫度條件下,當(dāng)存在一個(gè)h 2 0 分子時(shí),速 率常數(shù)變?yōu)? 0 7 1 0 9s ,半衰期變?yōu)? 0 h ;溫度不變,當(dāng)存在兩個(gè)h 2 0 分子時(shí), 速率常數(shù)卻變?yōu)榱? 0 2 1 0 3s ,半衰期縮短至l1 9 s 。這就是大多數(shù)化學(xué)家認(rèn)為碳 酸不穩(wěn)定的原斟2 4 1 。 對(duì)于碳酸系統(tǒng),無(wú)論從水合角度還是分解角度的研究,都是針對(duì)同一個(gè)反應(yīng), 只是闡述結(jié)果的角度不同。研究得出:?jiǎn)蝹€(gè)碳酸熱力學(xué)是不穩(wěn)定的9 , 1 2 , 1 4 ,動(dòng)力 學(xué)上是穩(wěn)定的,碳酸在水分子的作用下才容易分解【1 6 1 。 另外,碳酸酯類(lèi)化合物是一種重要的有機(jī)化工中間體,人們對(duì)此類(lèi)化合物作 了許多研究,主要集中在合成問(wèn)題及作為有機(jī)反應(yīng)的中間體合成其它有機(jī)物的研 究【5 2 6 0 1 ,在小分子的作用下的分解反應(yīng)未見(jiàn)報(bào)道。 1 3 酸堿雙功能催化反應(yīng)中的氫鍵 本文所研究的反應(yīng)中,分子之間先形成氫鍵復(fù)合物,再進(jìn)行分解反應(yīng);生成 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 物中分子間也存在分子間相互弱作用氫鍵,所以,我們對(duì)氫鍵做簡(jiǎn)要的介紹。 目前,關(guān)于氫鍵的理論主要是靜電相互作用理論和分子軌道理論。靜電相互 作用理論是一種傳統(tǒng)的理論,主要是氫鍵是兩個(gè)原子由h 原子生成的鍵,只有 電負(fù)性很強(qiáng)的原子才可以生成氫鍵,而且,兩個(gè)成鍵原子的電負(fù)性越大,氫鍵的 強(qiáng)度也應(yīng)該越大;分子軌道理論認(rèn)為,氫鍵是一種弱化學(xué)鍵,分子間的相互作用 使得體系能量降低,以生成較穩(wěn)定的體系【6 m 2 1 。由靜電相互作用理論可以判斷, 碳酸或碳酸酯類(lèi)化合物在h f 分子作用時(shí),由于h f 中f 的電負(fù)性大,所以形成 的氫鍵鍵長(zhǎng)短,氫鍵的強(qiáng)度大。 氫鍵的類(lèi)型可分為常規(guī)型的氫鍵、兀型氫鍵、雙氫鍵及單電子氫鍵。本文所 研究的分子所形成的氫鍵都屬于常規(guī)型的氫鍵。常規(guī)型的氫鍵通常是一種缺電子 的h 原子與富電子原子或原子團(tuán)之間的一種弱相互作用,比化學(xué)鍵的鍵能小得多, 與范德華力較為接近。通常情況下,常規(guī)型氫鍵可以表示為“x - h ”y ”,其中x 和y 一般都是電負(fù)性較大的原子,且y 原子有一對(duì)或一對(duì)以上的孤對(duì)電子,x _ h 稱(chēng)為質(zhì)子供體,y 稱(chēng)為質(zhì)子受體。h 2 c 0 3 、c h 3 0 c o o h 與小分子( h 2 0 、n h 3 、c h 3 0 h ) 之間形成的氫鍵中,小分子既是質(zhì)子供體又是質(zhì)子受體,這些小分子被稱(chēng)為酸堿 雙功能催化劑;c h 3 0 c o o c h 3 、c h 3 0 c o n h 2 與小分子( h 2 0 、h f 、c h 3 0 h ) 之間 形成的氫鍵中,小分子只作為質(zhì)子供體。常規(guī)型氫鍵中,鍵長(zhǎng)在2 2 0 3 2 0 h 之 間的屬于常規(guī)型弱氫鍵【6 3 1 ;鍵長(zhǎng)在在1 5 0 - 2 2 0a 之間,屬于常規(guī)型中強(qiáng)氫鍵【6 3 】。 分子間的弱相互作用氫鍵,具有穩(wěn)定性、方向性和飽和性,是一類(lèi)非常 重要的作用,是化學(xué)領(lǐng)域中活躍的研究熱點(diǎn)之一,早在上個(gè)世紀(jì)初,人們就發(fā)現(xiàn) 許多化學(xué)和物理化學(xué)現(xiàn)象都與這種分子間的弱相互作用有關(guān),它的存在影響著許 多物質(zhì)的性質(zhì),對(duì)生物分子的形狀和性質(zhì)、功能起著重要的作用陋。6 6 1 。這啟發(fā)了 我們研究碳酸及衍生物在小分子作用的分解反應(yīng)的機(jī)理研究。 通過(guò)氫鍵進(jìn)行的質(zhì)子轉(zhuǎn)移反應(yīng)是許多化學(xué)、生物學(xué)的基本步驟,由于實(shí)驗(yàn)和 理論的發(fā)展,近年來(lái)對(duì)小分子體系的氫鍵團(tuán)簇研究有了長(zhǎng)足的進(jìn)步,但是雜環(huán)化 合物的氫鍵團(tuán)簇研究仍有待進(jìn)一步開(kāi)展。雜環(huán)化合物廣泛的存在于自然界生物大 分子中( 如蛋白質(zhì)、核酸) ,其生物活性在很大程度上取決于分子的空間構(gòu)型, 而這些分子的空間構(gòu)型與氫鍵有很大關(guān)系。 自2 0 世紀(jì)初發(fā)現(xiàn)氫鍵以來(lái),人們對(duì)其進(jìn)行廣泛的研究,不斷發(fā)現(xiàn)新的形式 8 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 的氫鍵,對(duì)氫鍵的理解也不斷地豐富和完善。從最初的一般氫鍵到n 型氫鍵、雙 氫鍵、藍(lán)移型氫鍵以及單電子氫鍵,經(jīng)歷了質(zhì)的飛躍,從而使氫鍵在生物、化學(xué) 等領(lǐng)域占有舉足輕重的地位,并廣泛用于分子識(shí)別和分子組裝等方面,所以,對(duì) 氫鍵的研究有著廣闊的前景和重要的應(yīng)用價(jià)值。 1 4 研究工作 在查閱文獻(xiàn)的基礎(chǔ)上,我們采用量子化學(xué)計(jì)算密度泛函中的b 3 l y p 方法, 在6 3 1 1 g 木木基組下,對(duì)碳酸及衍生物在小分子( 如h 2 0 、h f 、c h 3 0 h 等) 作用 下的幾組分解反應(yīng)展開(kāi)了系統(tǒng)研究,研究工作的主要內(nèi)容由以下幾個(gè)方面組成: 本論文的具體工作主要包括: l 、碳酸在小分子作用下分解反應(yīng)的機(jī)理研究 采用密度泛函理論( d f t ) 中的b 3 l y p 方法,在6 3 1 1 g 幸木水平上,首先全 參數(shù)優(yōu)化氣相中碳酸孤立分子、及其與一分子( h 2 c 0 3 、h 2 0 、h f 、n h 3 、c h 3 0 h ) 、 兩分子( h 2 c 0 3 、h 2 0 ) 形成的氫鍵復(fù)合物,并優(yōu)化產(chǎn)物復(fù)合物、過(guò)渡態(tài)構(gòu)型,通 過(guò)各構(gòu)型振動(dòng)頻率的計(jì)算,對(duì)平衡構(gòu)型和過(guò)渡態(tài)構(gòu)型進(jìn)行確證;通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐 標(biāo)( r r c ) 解析計(jì)算,確證過(guò)渡態(tài)與反應(yīng)物和產(chǎn)物連接的正確性;最后,從活化能 壘的角度對(duì)小分子的催化效能做出比較。 2 、碳酸一甲酯在小分子作用下分解反應(yīng)的機(jī)理研究 采用d f t 中的b 3 l y p 方法,在6 3 1 1 g 宰宰水平上,首先全參數(shù)優(yōu)化氣相中 碳酸一甲酯孤立分子、及其與小分子( h 2 0 、2 h 2 0 、h f 、c h 3 0 h ) 形成的氫鍵復(fù) 合物,并優(yōu)化產(chǎn)物復(fù)合物、過(guò)渡態(tài)構(gòu)型,通過(guò)各構(gòu)型振動(dòng)頻率的計(jì)算,對(duì)平衡構(gòu) 型和過(guò)渡態(tài)構(gòu)型進(jìn)行確證;通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)( 瓜c ) 解析計(jì)算,確證過(guò)渡態(tài)與 反應(yīng)物和產(chǎn)物連接的正確性;最后,從活化能壘的角度對(duì)小分子的催化效能做出 比較。 3 、碳酸二甲酯在小分子作用下分解反應(yīng)的機(jī)理研究 采用d f t 中的b 3 l y p 方法,在6 31 1 g 木木水平上,全參數(shù)優(yōu)化氣相中碳酸 二甲酯孤立分子、及其與小分子( h 2 0 、h f 、c h 3 0 h ) 形成的復(fù)合物,并優(yōu)化產(chǎn)物 復(fù)合物、過(guò)渡態(tài)構(gòu)型,通過(guò)各構(gòu)型振動(dòng)頻率的計(jì)算,對(duì)平衡構(gòu)型和過(guò)渡態(tài)構(gòu)型進(jìn) 行確證;通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)( i r c ) ,確證過(guò)渡態(tài)與反應(yīng)物和產(chǎn)物連接的正確性; 接下來(lái)對(duì)分子發(fā)生反應(yīng)的可能途徑、反應(yīng)活化能進(jìn)行分析和討論。 9 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 4 、氨基甲酸甲酯在小分子作用下分解反應(yīng)的機(jī)理研究 本文采用d f t 中的b 3 l y p 方法,在6 3 11 g 木木水平上,全參數(shù)優(yōu)化氨基甲 酸甲酯孤立分子、及其與小分子( h 2 0 、h f 、c h 3 0 h ) 形成的復(fù)合物,并優(yōu)化產(chǎn)物 復(fù)合物、過(guò)渡態(tài)構(gòu)型,通過(guò)各構(gòu)型振動(dòng)頻率的計(jì)算,對(duì)平衡構(gòu)型和過(guò)渡態(tài)構(gòu)型進(jìn) 行確證;通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)( i r c ) 解析計(jì)算,確證過(guò)渡態(tài)與反應(yīng)物和產(chǎn)物連接的 正確性;接下來(lái)對(duì)分子發(fā)生反應(yīng)的可能途徑、反應(yīng)活化能進(jìn)行分析和討論。 全部量子化學(xué)計(jì)算工作使用g a u s s i a n 0 3 程序完成 1 0 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 第二章計(jì)算方法與理論基礎(chǔ) 針對(duì)本文中所有的反應(yīng),我們是采用的量子化學(xué)計(jì)算密度泛函( d f t ) 中的 b 3 l y p 方法,在6 3 11 g 木幸基組下進(jìn)行的系統(tǒng)研究。并且通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)( i r c ) 解析計(jì)算,確證過(guò)渡態(tài)與反應(yīng)物和產(chǎn)物連接的正確性,最后從活化能的角度對(duì)反 應(yīng)的難易程度進(jìn)行了判斷。為此我們簡(jiǎn)單介紹其相關(guān)理論背景知識(shí)。 2 1 密度泛函理論( d f t ) 從2 0 世紀(jì)6 0 年代密度泛函理論( d f t ) 提出,并在局域密度近似( l d a ) 下導(dǎo)出著名的k o n h n s h a m 方程以來(lái),d f t 已成為結(jié)構(gòu)計(jì)算的有力工具【1 1 。密度 泛函理論的發(fā)展有一個(gè)很長(zhǎng)的過(guò)程,早在1 9 2 7 年t h o m a s 和f e m i 獨(dú)立的提出了 動(dòng)能作為電子密度泛函的表示式【2 1 。t h o m a s f e m i 模型中,多電子體系的能量泛 函形式為: 蹦俐珥p 址5 z 餅辦+ 三孵d r 2 但是它對(duì)原予的計(jì)算一直未得到應(yīng)有的殼層結(jié)構(gòu),因而被認(rèn)為只是一個(gè)統(tǒng)計(jì) 模型。1 9 3 0 年,d i r a c 在t h o m a s f e m i 模型基礎(chǔ)上,提出了t - f d 模型,增加了 電子交換能的影響【3 1 。許多學(xué)者嘗試?yán)酶鞣N模型提高計(jì)算精度,但效果一直不 理想。1 9 6 4 年,h o h e n b e r g 和k o h n 4 1 證明存在泛函e ( p ) ,對(duì)于精確的基態(tài)密度 它就給出精確的基態(tài)能量,同時(shí)也給出一種精確確定的p 和基態(tài)能量的變分原 則,從而證明了精確的t h o m a s f e m i 定理的存在。一年以后,w a l t e rk o h n 和l u s h a m 一起推導(dǎo)出總能用式【5 】= e = 孝t 一圭糌蛾協(xié)p 枷彷 k o n h n - s h a m 方程開(kāi)辟了一條途徑,只要成功地獲得l 防】近似,就可得到 準(zhǔn)確的電荷密度p 與能量。h o h e n b e r g k o h n 定理和k o n h n s h a m 方程構(gòu)成了現(xiàn)代 密度泛函理論( d f t ) 的基礎(chǔ)。經(jīng)過(guò)幾十年的發(fā)展和眾多科學(xué)家的努力,d f t 作 為處理多電子體系的理論方法日臻完善。它既克服了傳統(tǒng)的a bi n i t i oh fs c f 方 法難以考慮電子相關(guān)的缺點(diǎn),又避開(kāi)了m p 、c i s d 、c c s d ( t ) 等方法處理大體系 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 耗費(fèi)時(shí)間的不足。 在d f t 理論中,更加精確的交換相關(guān)泛函替代了h a r t r e e f o c k 方程中的交 換能。在h a r t r e e f o c k 理論中,能量可表示為: e 肝:y 十 + i 1 一i 1 此處,v 是核排斥能,p 是密度矩陣, 是單電子能( 動(dòng)能+ 勢(shì)能) ,妄 是經(jīng)典的電子排斥庫(kù)侖積分,一i 1 是由于電子的費(fèi)米特性而引起的交 換能。顯然沒(méi)有包括電子相關(guān)能這一項(xiàng)。而在密度泛函理論中,交換積分部 分被更為廣泛的表達(dá)式一交換相關(guān)方程代替,這一方程包含了交換能和電子相 關(guān)能, 1 e r s = y + + - - :三 + e x p 】+ e c 尸】 、,llj 其中以 用是交換能【6 ,e c p 是相關(guān)能【8 砌】,可見(jiàn)h a r t r e e f o c k 理論實(shí)際上是 密度泛函理論中當(dāng)以 尸】= 一i 1 ,e c 【尸 :o 的一個(gè)特例。 密度泛函理論方法有許多種類(lèi),除了純d f t 方法,還有混合方法,在混合 方法中,交換函數(shù)是h a r t r e e f o c k 交換積分和上述形式的函數(shù)積分的線性組合。 u b 3 l y p 方法是指b e c k st h r e ep a r a - m e t e rh y b r i dm e t h o du s i n gt h el y p c o r r e l a t i o nf u n c t i o n a l 方法。b e c k s 三參數(shù)方程具有如下形式【1 1 】: k 岔e 詈恤r + q a 丫e 掌+ b e 警c 慨+ e ? n + c 1 e 莒常h | o 鋤 此處,n o n - l o c a l ( 非定域) 相關(guān)能由l y p 表達(dá)式給出,l y p 表達(dá)式是指由l e e ,y a n g , 及p a r r 確定的相關(guān)方程,這一方程中包含了定域和非定域相關(guān)能t 9 1 2 1 ;v w n 通 常指局域自旋密度相關(guān)能1 3 1 ,參數(shù)a ,b ,c 是由b e c k 通過(guò)調(diào)整而適于g 1 分子 組而得到的常數(shù)。 d f t 提供了第一性原理從頭算的計(jì)算框架:它可以解決原子、分子中許多 問(wèn)題,如電離勢(shì)的計(jì)算,振動(dòng)光譜的研究、催化活性位的選擇、生物分子的電子 結(jié)構(gòu)等。d f t 與分子動(dòng)力學(xué)( m d ) 結(jié)合的分子模擬是當(dāng)前理論化學(xué)研究化學(xué)反 應(yīng)動(dòng)態(tài)過(guò)程的有力工具,成為當(dāng)前國(guó)際研究的主流方向。最近的報(bào)道表明,在得 到分子構(gòu)型、振動(dòng)頻率和化學(xué)反應(yīng)能量方面,密度泛函理論取得了令人滿意的結(jié) 果。就目前的計(jì)算條件和計(jì)算方法而言,相比之下,d f t 方法既有高效的計(jì)算 1 2 山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文 精度( 與m p 相比) ,又考慮了電子相關(guān)( 與h f 相比) ,也不費(fèi)機(jī)時(shí),因而成為 目前在我們現(xiàn)有的條件下,開(kāi)展目標(biāo)分子研究以及預(yù)測(cè)平衡體系的分子結(jié)構(gòu)和振 動(dòng)頻率最理想的計(jì)算方法【1 4 。1 6 1 。 2 2 基函數(shù)和基組【1 7 。8 】 2 2 1s l a t e r 型基函數(shù)( s t o ) s l a t e r 在量子化學(xué)計(jì)算中發(fā)現(xiàn),類(lèi)氫離子波函數(shù)的計(jì)算瓶頸在徑向函數(shù)部分, 即加以改造,提出新的徑向函數(shù),后人稱(chēng)之為s l a t e r 函數(shù)s t o 。 2 , a = n c 。1 e - ( r a 影朋( 吼,紈) a 為軌道中心,n ,l ,m 為量子數(shù),芒為軌道指數(shù)。此類(lèi)基函數(shù)的優(yōu)點(diǎn)是具有 精確軌道的漸進(jìn)行為,特別是r 葉o 時(shí)滿足軌道的“歧點(diǎn)條件”。缺點(diǎn)是計(jì)算三中 心和四中心積分時(shí)很困難。 2 2 2g a u s s 型基函數(shù)( g t o ) 利用g a u s s 型函數(shù)計(jì)算多中心量子化學(xué)積分的方法,是由b o y s 在1 9 5 0 年首 先提出來(lái)的【19 1 。 磯= n r 1 e - r 彳髟卅( 吼,仍) a 為軌道中心,n ,1 ,m 為量子數(shù),a 為軌道數(shù)。g t o 有幾個(gè)明顯的優(yōu)點(diǎn),故被 普遍使用。首先它很容易變數(shù)分離,其次g t o 乘積定理能將雙中心積分化為單 中心積分,以此類(lèi)推,三中心、四中心積分亦可化作雙積分,最后化作單中心積 分來(lái)處理,使多電子體系中許多問(wèn)題得以解決。缺點(diǎn)是波函數(shù)沒(méi)有正確的h 0 和r 一的漸進(jìn)行為,尤其是r - - - + 0 時(shí)不滿足原子軌道的“歧點(diǎn)條件”。 為了克服s t o 和g t o 的缺點(diǎn),保留它們的優(yōu)點(diǎn),常用的方法是用g t o 的 線性組合作為基函數(shù),即將s t o 展開(kāi)為g t o 的線性組合,這種基組稱(chēng)為簡(jiǎn)縮 g u a s s 基組。例如s t o k g 就是指用k 個(gè)g t o 代替一個(gè)s t o 進(jìn)行分子計(jì)算。這 樣做需要計(jì)算的g t o 積分?jǐn)?shù)目并未減少,但需存儲(chǔ)的分子積分?jǐn)?shù)目則少許多。 2 2 3 基函數(shù)選擇規(guī)則及相關(guān)基組介紹
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