pubmed檢索教程

美國(guó)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù) 2013 4 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 1 一 數(shù)據(jù)庫(kù)概況 一 編制單位 美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館 NLM 二 收錄學(xué)科內(nèi)容 主要收錄生物醫(yī)學(xué) 衛(wèi)生保健以及生命科學(xué)相關(guān)文獻(xiàn) 包括行為科學(xué) 健康專業(yè)所需要的化學(xué) 生物工藝學(xué) 基礎(chǔ)研究 臨床 護(hù)理 公共衛(wèi)生 衛(wèi)生政策發(fā)展或相關(guān)教育活動(dòng)的內(nèi)容 2000年起增加了生物 環(huán)境科學(xué) 海洋生物 植物和動(dòng)物學(xué) 生物物理學(xué)和生物化學(xué)等生命科學(xué)方面的研究?jī)?nèi)容 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 2 一 數(shù)據(jù)庫(kù)概況 三 文獻(xiàn)來源 70多個(gè)國(guó)家和地區(qū) 近5000種生物醫(yī)學(xué)期刊美國(guó)衛(wèi)生研究院文獻(xiàn)選擇技術(shù)評(píng)估委員會(huì)LiteratureSelectionTechnicalReviewCommittee LSTRC 評(píng)估挑選NLM和各專業(yè)協(xié)會(huì)的數(shù)據(jù)協(xié)作采集專家推薦 近年數(shù)據(jù)涉及37種語種 回溯至1949年的數(shù)據(jù)涉及60種語種 47 為美國(guó)本土出版文獻(xiàn) 90 為英文文獻(xiàn) 79 的文獻(xiàn)有文摘 以上由2009年7月數(shù)據(jù)庫(kù)提供 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 3 二 MEDLINE的檢索平臺(tái) 廣域網(wǎng)免費(fèi)平臺(tái) NCBI PubMed 含非MEDLINE數(shù)據(jù) 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 4 二 MEDLINE的檢索平臺(tái) 校園網(wǎng)內(nèi)可用平臺(tái) IP控制 OvidSPWebofKnowledgeEBSCOOCLCFirstSearch 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 5 校園網(wǎng)內(nèi)可用平臺(tái)的Medline 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 6 PubMed數(shù)據(jù)庫(kù) http www pubmed gov 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 7 一 PubMed簡(jiǎn)介 開發(fā)機(jī)構(gòu) NCBI 美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心 http www ncbi nlm nih gov任務(wù) 利用計(jì)算機(jī)信息處理技術(shù) 建立分子生物學(xué) 生物化學(xué) 遺傳學(xué)知識(shí)的自動(dòng)存儲(chǔ)和分析系統(tǒng) 并開展相關(guān)先進(jìn)方法的研究 促進(jìn)生物技術(shù)研究者和醫(yī)藥治療人員對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)和軟件的使用 促進(jìn)全世界范圍內(nèi)生物技術(shù)信息收集的合作 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 8 NCBI網(wǎng)站 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 9 NCBI提供的數(shù)據(jù)庫(kù) 檢索大分子生物學(xué)數(shù)據(jù)獲取GenBank EMBL等數(shù)據(jù)庫(kù)的核酸序列 獲取Swiss port PIR PRF PDB等蛋白質(zhì)序列 從核酸序列翻譯到蛋白質(zhì)的序列 獲取基因和染色體圖譜 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)及大分子模式 MMDB 等其他生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)檢索 PubMed等文獻(xiàn)數(shù)據(jù) 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 10 二 PubMed的特點(diǎn) 廣域網(wǎng)免費(fèi)提供題錄和文摘提供與原文的網(wǎng)址鏈接 部分免費(fèi)獲取 提供檢索詞智能轉(zhuǎn)換匹配界面簡(jiǎn)潔 操作簡(jiǎn)便 須IE7 0以上版本 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 11 三 PubMed收錄數(shù)據(jù) MEDLINEIndexed1966toprensent的MEDLINE已標(biāo)引數(shù)據(jù) 有MeSH字段和摘要 每條記錄標(biāo)有 PubMed indexedforMEDLINE OldMEDLINE1949 1965年間的MEDLINE數(shù)據(jù) 無MeSH字段和摘要 每條記錄標(biāo)有 PubMed OLDMEDLINEforPre1966 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 12 三 PubMed收錄數(shù)據(jù) MEDLINEInprocess最新的MEDLINE處理中數(shù)據(jù) 未標(biāo)引 無MeSH字段 每條記錄標(biāo)有 PubMed inprocess Publisher Supplied出版商提供的電子文獻(xiàn)題錄 每條記錄標(biāo)有 PubMed assuppliedbypublisher 分為兩類 MEDLINE收錄 逐步轉(zhuǎn)為InProcess Indexed狀態(tài) NotMEDLINE PubMed收錄 MEDLINE不收錄 一直標(biāo)注 PubMed assuppliedbypublisher 或 PubMed 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 13 二 PubMed的檢索功能 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 14 基本檢索輸入框 高級(jí)檢索 檢索指南 檢索工具 特定文獻(xiàn)檢索臨床查詢專題查詢 其他資源 規(guī)范詞數(shù)據(jù)庫(kù)期刊數(shù)據(jù)庫(kù)臨床試驗(yàn)等 個(gè)人空間 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 15 檢索欄可輸入一個(gè)或多個(gè)檢索詞 系統(tǒng)默認(rèn)空格為AND檢索 如 strokethrombolysis 中風(fēng)與溶栓 三 PubMed基本檢索規(guī)則 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 16 檢索欄可輸入布爾邏輯運(yùn)算式 運(yùn)算符須大寫 如 asthmaAND therapyORtreatment 字段限定符 空格按詞組匹配試比較 strokeANDthrombolysis ti strokethrombolysis ti stroke ti ANDthrombolysis ti stroke ti thrombolysis ti 三 PubMed基本檢索規(guī)則 著者檢索 姓全稱在前 名首字母在后 au 如 smithab au paulsene au 思考題 中國(guó)學(xué)者的名字該如何轉(zhuǎn)換呢 如 聞?dòng)衩繁R正宏 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 17 三 PubMed基本檢索規(guī)則 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 18 刊名檢索 全稱或MEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫 so 如 Journalofinvestigativedermatology so Jinvestdermatol so 三 PubMed基本檢索規(guī)則 輸入刊名檢索發(fā)表在該刊上的文獻(xiàn) 限定出處字段SO PubMed記錄字段說明 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 19 文摘第一著者單位地址出版商提供文獻(xiàn)識(shí)別號(hào)著者群版權(quán)說明參考評(píng)論文獻(xiàn)合著者文獻(xiàn)參考評(píng)論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 20 電子出版日期文獻(xiàn)出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻(xiàn)相關(guān)注釋基金編號(hào)基因符號(hào)期編號(hào)資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)期刊號(hào)美國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館識(shí)別號(hào)期刊全稱 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 21 最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機(jī)構(gòu)的識(shí)別號(hào)病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機(jī)構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時(shí)間期刊出版國(guó)數(shù)據(jù)庫(kù)文獻(xiàn)編號(hào) 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 22 作為主題詞的個(gè)人姓名出版狀態(tài)文獻(xiàn)類型出版模式 紙張或電子 參考文獻(xiàn)數(shù)已撤回的文獻(xiàn)酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻(xiàn)修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)以及文章討論的分子序列訪問號(hào)原文來源引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼標(biāo)準(zhǔn)期刊縮寫文獻(xiàn)標(biāo)題翻譯標(biāo)題更新文獻(xiàn)文獻(xiàn)正在更新期刊卷號(hào) 三 PubMed基本檢索規(guī)則 截詞檢索 treat 可檢出 treat treated treatment 強(qiáng)迫短語檢索 不進(jìn)行自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配和擴(kuò)展檢索如 acutelowbackpain ang1 血管緊張素1縮寫 檢出1085篇比較 ang1檢出9956篇 誤檢多 其中有 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 23 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 24 三 PubMed基本檢索規(guī)則 自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配檢索詞 對(duì)常用醫(yī)學(xué)名詞自動(dòng)在規(guī)范詞索引 主題詞 副主題詞 物質(zhì)名稱 中轉(zhuǎn)換 并默認(rèn)在所有記錄字段中匹配 如 livercancer liverneoplasms MeSHTerms OR liver AllFields AND neoplasms AllFields OR liverneoplasms AllFields OR liver AllFields AND cancer AllFields OR livercancer AllFields 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 25 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 26 結(jié)果顯示頁右側(cè)Details顯示系統(tǒng)自動(dòng)匹配轉(zhuǎn)換的檢索詞 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 27 四 PubMed檢索限制 PubMed可以針對(duì)檢索結(jié)果作進(jìn)一步的限制 Articletypes文獻(xiàn)類型限定Textavailability全文 免費(fèi)全文 摘要限定Publicationdates出版日期限定Species研究對(duì)象人 動(dòng)物限定Languages語種限定Sex性別限定Subjects各主題領(lǐng)域限定Journalcategories各種專題子數(shù)據(jù)庫(kù)限定Ages年齡限定Searchfields字段限定 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 28 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 29 五 PubMed高級(jí)檢索 一個(gè)網(wǎng)頁中集多種功能于一體 其他檢索資源 檢索歷史 檢索式編制 檢索詞索引 基本檢索 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 30 SearchBuilder 檢索式編制 檢索框中只能輸入檢索詞 不能輸入檢索式 多個(gè)字段檢索要分多次輸入 SearchHistory 檢索歷史 檢索歷史中顯示歷次檢索式 時(shí)間和檢出篇數(shù) 可組配檢索式 如 1OR 2 1ANDchild點(diǎn)擊編號(hào)可對(duì)檢索式進(jìn)行刪除 保存等操作 五 PubMed高級(jí)檢索 六 PubMed其他資源 1 MeshDatabase 規(guī)范化醫(yī)學(xué)主題詞表 功能 確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋 樹狀結(jié)構(gòu)表選擇副主題詞 擴(kuò)展下位主題詞 指定主要主題詞進(jìn)入途徑 MeSHDatabase鏈接 PubMed主頁 AdvancedSearch界面MeSH選項(xiàng) 基本檢索框前Search下拉菜單的 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 31 文章A著者用詞 Livercancer規(guī)范主題詞MeSH Liverneoplasms 詞表中 livercancerSeeliverneoplasms 2 醫(yī)學(xué)主題詞表 MeSH 用規(guī)范詞查找 肝腫瘤 的文獻(xiàn) 文章B著者用詞 Livertumor規(guī)范主題詞MeSH Liverneoplasms 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 33 進(jìn)入MeSH MeSH注釋界面 MeSH詳細(xì)注釋界面 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 36 MeSH詞檢索 例1 檢索2009 2013年關(guān)于舌根癌治療的文獻(xiàn) 課題分析 舌根癌的不同表達(dá)形式 OR tonguebasecancer cancer carcinoma tumoroftonguebase cancerofthebaseoftongue 治療的不同表達(dá)形式 OR therapy treat treatment surgery radiotherapy 兩個(gè)概念之間 舌根癌AND治療 輸入檢索詞 查找規(guī)范詞 未匹配到規(guī)范詞 改用上級(jí)概念 舌癌 匹配 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 38 輸入自由詞 查找規(guī)范詞 規(guī)范詞 同義詞 副主題詞 規(guī)范詞隸屬關(guān)系樹 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 39 選擇副主題詞 建構(gòu)檢索語句 限定檢索主要主題詞 只查重點(diǎn)論述的文獻(xiàn) 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 40 輸入舌根的自由詞檢索式 進(jìn)行AND運(yùn)算 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 41 初步結(jié)果 未限定年份 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 42 設(shè)定的限制 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 43 自由詞檢索最新文獻(xiàn) 輸入 tongue ti ANDbase ti AND cancer ti ORcarcinoma ti ORtumor ti AND therapyORtreatORsurgeryORradiotherap ORrehabilitat 加工中 無MeSH詞 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 44 合并兩次檢索結(jié)果 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 45 文獻(xiàn)歸類功能 Abstract格式提供全文鏈接 規(guī)范詞等信息 排序方式選擇 免費(fèi)全文鏈接 點(diǎn)擊標(biāo)題顯示文摘增強(qiáng)格式 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 46 文摘增強(qiáng)格式 相關(guān)論文 MeSH詞 物質(zhì)名 文獻(xiàn)類型等信息 LinkOut外部資源鏈接 全文鏈接 我校訂購(gòu)的數(shù)據(jù)庫(kù)可鏈全文 需在校園網(wǎng)內(nèi)設(shè)免費(fèi)代理 相關(guān)的網(wǎng)上免費(fèi)醫(yī)學(xué)指南信息 全文鏈接 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 47 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 48 輸出方式選擇 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 49 八 輸出方式選擇 sendto File 保存檢索結(jié)果為文本文件Clipboard剪貼板 多次檢索 可暫存每次檢索需下載的記錄 最后一起保存 最多允許存儲(chǔ)500條 保留8小時(shí) Email 通過郵件發(fā)送Collections 將檢索結(jié)果存到MyNCBI中Order 全文傳遞服務(wù) 需帳號(hào) 收費(fèi) 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 50 訂閱最新結(jié)果 點(diǎn)擊后點(diǎn) XML 按鈕 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 51 需IE7 0以上版本 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 52 定期點(diǎn)擊鏈接 接收課題最新相關(guān)論文 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 53 MeSH詞檢索 例2 用MeSH檢索2003 09年期間關(guān)于霉酚酸酯在腎衰竭治療中療效觀察的文獻(xiàn) 課題分析 匹配物質(zhì)名稱 mycophenolatemofetil匹配主題詞 renalfailure treatmenteffect AND 匹配副主題詞 drugtherapy surgery therapy rehabilitation 藥物名稱MeSH檢索 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 55 疾病概念MeSH檢索 療效觀察MeSH檢索 MeSH檢索的優(yōu)點(diǎn) 查全同義詞 如 renal kidneyinsufficiency tonguecancer tumor 查全子概念 如 acutekidneyinjury ATN chronickidneyinsufficiency 查全子概念 自動(dòng)擴(kuò)展檢索下位詞 勾選后不擴(kuò)展下位詞 樹形結(jié)構(gòu) 上位詞 MeSH檢索的優(yōu)點(diǎn) 查全同義詞 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 61 MeSH檢索的優(yōu)點(diǎn) 根據(jù)樹形結(jié)構(gòu)調(diào)整檢索詞縮小 不擴(kuò)展下位詞 或選用某個(gè)下位詞 擴(kuò)大 選用上位詞 或選用多個(gè)同位詞 了解同一概念的同義詞 近義詞 供自由詞檢索參考 款目詞 規(guī)范詞所替代的不同表達(dá)形式的自由詞 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 62 MeSH檢索的優(yōu)點(diǎn) 提高文獻(xiàn)相關(guān)度標(biāo)有MeSH詞的都是文章的主題 篩去非主題的文章MajorTopicHeadings 加權(quán) 重點(diǎn)論述的主題 帶 的是文獻(xiàn)重點(diǎn)論述的主題 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 63 MeSH檢索的缺陷 人工標(biāo)引費(fèi)時(shí) 最新論文還未標(biāo)MeSH詞 InProcess 用MeSH會(huì)漏檢 Medline不收錄的文獻(xiàn) Suppliedbypublisher的文獻(xiàn) 不標(biāo)MeSH詞 新詞 一些很專指的概念沒有對(duì)應(yīng)的規(guī)范詞 如 SARS 03年詞表中沒有 舌根癌查上述類型的文獻(xiàn)需結(jié)合自由詞檢索 九 PubMed其他資源 2 JournalinNCBIDatabase 期刊信息庫(kù) 通過輸入刊名全稱或縮寫 ISSN號(hào)等瀏覽期刊出版社等詳細(xì)信息 提供期刊 在PMC中的免費(fèi)全文鏈接在Nucleotide Protein Pubmed等庫(kù)中的記錄鏈接 相關(guān)的其他期刊 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 64 輸入待檢期刊名 期刊詳細(xì)信息 全文等鏈接 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 66 十 PMC PubMedCentral 生命科學(xué)免費(fèi)期刊資源中心免費(fèi)提供900多種期刊的10多萬篇全文其中部分文獻(xiàn)被PubMed涵蓋 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 67 進(jìn)入PubMedCentral 下拉主頁滾動(dòng)條至底 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 68 PMC首頁進(jìn)入高級(jí)檢索 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 69 查找腎衰竭的藥物療法 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 69 全文鏈接 GoPubmed文獻(xiàn)分析 2020 4 13 復(fù)旦大學(xué)圖書館文獻(xiàn)檢索教研室 71 GoPubmed PubMed文獻(xiàn)分析工具 GoPubMed是德國(guó)Transinsight公司和德國(guó)德累斯頓大學(xué)合作開發(fā) 對(duì)PubMed檢索結(jié)果進(jìn)行篩選 分析的工具 智能