數(shù)量遺傳學(xué)PPT

1、第二章數(shù)量遺傳學(xué)基礎(chǔ)第節(jié)奔俸遺倍儲(chǔ)構(gòu)A群體(population):指在一定的時(shí)間和空 間范圍內(nèi)，具有特定的共同特征和特性的個(gè)體 集群?？梢允且粋€(gè)種、亞種、變種、品種或品 系等。A 孟德爾群體(Mendelian population):個(gè) 體間可以通過交配進(jìn)行基因交流的有性繁殖群 體。因此，最大的孟德爾群體應(yīng)該是一個(gè)種?；蝾l率（gene frequency J念：一個(gè)群體中某一等位基因的數(shù)量占同一基因座所有等位基因總數(shù)的比例。取值范圍：01,通常用小數(shù)表示;表示方法:小寫字母,如p、q、性 質(zhì)：全部等位基因頻率之和等于1 o基因型頻率（genotype frequency J義：某一基因座

2、特定基因型占全部基因型的比例。取值范圍：01,用小數(shù)表示“表示方法：大寫字母,如、H、R等。質(zhì)：同一基因座所有基因型之和基因頻率和基因型頻率的關(guān)糸p=DZ2H q=R+l/2HHardy_Weinberg 定律在隨機(jī)交配的大群體中，若沒其它因素的 影響，基因頻率始終保持不變。任何一個(gè)大群體，無(wú)論基因頻率如何，只要經(jīng)過一代隨機(jī)交配；一對(duì)常染色體基因的基 因型頻率就達(dá)到平衡狀態(tài)；若無(wú)其它因素影響, 以后一代一代隨機(jī)交配下去，這種平衡狀態(tài)始 終保持不變。平衡狀態(tài)下，D=p2 H=2pq R=q20 9 8 7 6 5 * 4 4-01 o o o o og2nbu.H(L9 1 o o 8 2 a

3、a 7 3 da 6 4 0.0. 5 5 da A 6 a o 3 7 a a 2 8 o.a .1.9 a a 0 41.00p gallelic frequencyThe distribution of genotypes in a population inHardy-Weinberg equilibriumHW定律的推廣復(fù)等住基因(Multiple Qlleles)氐個(gè)等位基因如、A2去，其基因頻率分另U為刃、2Pk,可形成氐種純合基因型和氐(弘1)/2種雜合基因型。遺傳平衡狀態(tài)下，基因 頻率和基因型頻率的關(guān)系為：2 = Ep*+2 Ypipj其中，Zp*表示純合子的頻率，仞表示 雜

4、合子的頻率。多基因屋(Multiple loci)達(dá)到遺傳平衡的速度主要取決于各基因座 間的連鎖程度；連鎖越緊密，達(dá)到平衡所需世 代數(shù)越多。連傾不平衡(Linkage disequilibrium)實(shí)際觀察的基因型頻率偏離理論平衡頻率 的現(xiàn)象，也叫配子相不平衡(Gametic phase disequilibrium) 0它常用連鎖不平衡系數(shù)(D) 表示，等于實(shí)際配子頻率和平衡時(shí)的理論配子 頻率之差。/配子相(Gametic phase)或連鎖相(Linkage phase)兩個(gè)基因座A和B,每個(gè)基因座兩個(gè)等位基因,分別為Ai、A2和Bi、B2：可形成4種配子:AiBi A1B2、AzBi 2

5、B2 相引相(Coupling phase) : A1B1/A2B2 相斥相(Repulsion phase) : A1B2/A2B1/配子頻率(Gametic frequency ):某一配子所包含的各個(gè)基因座上等位基因頻率的乘積。P(A1B1) =P(A1) X p(Bl)； P (A2B2) = P(A2) X (B2)丁 連鎖平衡(Linkage equlibrium): 一個(gè)基因 座上的一個(gè)等位基因與另一基因座上的一個(gè)等位 基因相互獨(dú)立，BP： p (AB) = p (A) p(B) 丁 連鎖不平衡(Linkage disequlibrium): 一 個(gè)基因座上的一個(gè)等位基因與另一基

6、因座上的 一個(gè)等位基因不相互獨(dú)立，即不同基因座的等 位基因間存在非隨機(jī)關(guān)聯(lián)：P(AB)豐 p(A) p(B)D二 p(AB) - p(A) p(B)D的取值范圍是0250.25。/連鎖不平衡系數(shù)隨世代的變化：Dt = D0 (1 小其中，D。、0分別為初始和隨交/個(gè)世代后的 連鎖不平衡系數(shù)，廠為二基因座間的重組率。連緘越緊密，r越小，LD下陣遠(yuǎn)度越慢，反之，越快。r= 0,01r = 0.05r = 0.1 r = 0.5(Q) En_Gn=nb0p sew- 40 luooE ooGenerationr=0影響群體遺傳結(jié)構(gòu)的主要因素 系統(tǒng)性因素(Systematic factors)引起遺傳

7、結(jié)構(gòu)的變化方向和量可以預(yù)測(cè)O 包括選擇.突變.遷移.熒配方式等。選擇(selection):有利基因頻率增加,不利基因頻率降低。突變(mutation):如突變基因具有選擇優(yōu)勢(shì),則其基因頻率提高；如是中性突變(Neutralmutation),則其頻率大小取決于遺傳漂變。遷移(Migrationjt通過不同頻率的群體間 基因流動(dòng)引起基因頻率變化?？梢允菃蜗虻?， 也可以是雙向的。夾配體制(Mating system):例如，近交提 高純合基因型頻率；雜交提高雜合基因型頻率; 隨交則對(duì)大的遺傳平衡群體的遺傳結(jié)構(gòu)無(wú)影響。A 非系統(tǒng)性因素(Non systematic factors) 引起遺傳結(jié)構(gòu)的

8、變化量可以預(yù)測(cè)，但其方 向是隨機(jī)的，不可預(yù)測(cè)。遺傳漂變(Genetic drift):有限群體，特別 是小群體中，因配子的隨機(jī)抽樣導(dǎo)致的基因頻 率在世代間的隨機(jī)變化，稱為隨機(jī)遺傳漂變(Random genetic drift),簡(jiǎn)稱遺傳漂變。群體越小，遺傳漂變的作用越大。第二爺數(shù)置徃狀的遺傳性狀的分類質(zhì)量性狀(Qualitative traits or characters)遺傳上受一對(duì)或少數(shù)幾對(duì)基因控制，性狀變異不連續(xù)，表型不易受環(huán)境因素影響的性狀，如:毛色、角的有無(wú)等。數(shù)董性 狀(Quantitative traits)遺傳上受許多微效基因控制，性狀變異連,表型易受環(huán)境因素影響的性狀，如：

9、生長(zhǎng)速度、產(chǎn)肉量、產(chǎn)奶量等。The Generalized Lactation CurveThe generalized growth curve of young animals爲(wèi)性狀(Threshold traits)遺傳上受許多微效基因控制，性狀變異不連續(xù)，表型易受或不易受環(huán)境因素影響的性狀。/有或無(wú)性狀(All or none traits):也稱為二分類性狀(Binary traits) o如有角與無(wú)角、抗病與不抗病、生存與死亡等。/分類性狀(Categorical traits):如產(chǎn)羔數(shù)、產(chǎn)仔數(shù)、乳頭數(shù)、肉質(zhì)評(píng)分等。質(zhì)量性狀、數(shù)量性狀與閾性狀的比較質(zhì)量性狀數(shù)量性狀閾性狀性狀主要品

10、種特征、生產(chǎn)、生長(zhǎng)生產(chǎn)、生長(zhǎng)性類型外貌暮征性狀狀遺傳單個(gè)或少數(shù)微效多基因微效多基因主基因變異表現(xiàn)間斷型連續(xù)型間斷型方式考察方式描述度量描述環(huán)境影響不敏感敏感敏感或不敏感研究水平家系群體群體數(shù)量性狀的遺傳基礎(chǔ)微效多基因假說(Polygenic hypothesis,Nilson - Ehle, H. 1908 )/多基因(Polygene):數(shù)量性狀是由許多基因 的聯(lián)合效應(yīng)控制的。丁做敗基因(Minor gene):控制數(shù)量性狀的基因效應(yīng)，絕大多數(shù)是微小的。/加性基因(Additive gene):控制數(shù)量性狀的 基因效應(yīng)是加性的，共同作用于性狀。丁無(wú)顯性基因(Null dominant gen

11、e):微效基因 間缺乏顯性，或稱之為共顯性(Codominant) o以上對(duì)數(shù)量遺傳基礎(chǔ)的解釋可以用無(wú)窮小位 點(diǎn)模型(in五nitesimal model, Fisher (1918)概括, 該模型假定：控制性狀的基因座很多(實(shí)際上是無(wú)窮多); 每個(gè)基因座的效應(yīng)無(wú)窮?。?I 各基因座不連鎖且不具上位效應(yīng)。 I數(shù)量性狀基因座/救量 性狀基因遂 (Quantitative traitslocus, QTL):控制數(shù)量性狀的基因在基因組中的位置，控制數(shù)量性狀的單個(gè)基因或染色體片段。丁 經(jīng)濟(jì)性狀基因屋(Economic traits locus,ETL)：控制經(jīng)濟(jì)性狀的基因在基因組中的位置，控制經(jīng)濟(jì)性

12、狀的單個(gè)基因或染色體片 段。數(shù)量性狀表型值的 剖 分P -G +通常，假定遺傳與環(huán)境間不存在互作，貝!)P=G + E其中，G = A + D +19 E = Eg + Es 則：P = A+ D+ I +Eg+ Es由于、/、E均為偏差，在大群體中，其 效應(yīng)值有正有負(fù)，因此：P = G = SA o表矍值(Phenotypicvalue):個(gè)多基因系統(tǒng)控制 的數(shù)量性狀能夠直接度量或觀察的數(shù)值?；蛐椭?Genotypic valuepb表型中由基因型決 定的那部分?jǐn)?shù)值。環(huán)境偏差(Environmental deviation)表型值與基 因型值的離差。加性敗應(yīng)(Additive effect

13、):等位基因間和非等位基因間的累加作用引起的遺傳效應(yīng)。顯性效應(yīng)(Dominant effect):同一基因座上等位基因間的互作所產(chǎn)生的遺傳效應(yīng)o上住敗應(yīng)(Epistatic effect):不同基因座間非等位 基因相互作用所產(chǎn)生的遺傳效應(yīng)。般環(huán)疣(General environment):是指影響個(gè)體全身的 時(shí)間上是持久的、空間上是非局部的環(huán)境。例如奶牛 在生長(zhǎng)發(fā)育早期營(yíng)養(yǎng)不良，生長(zhǎng)發(fā)育受阻，成年后無(wú) 法補(bǔ)嘗，影響是永久的。特殊環(huán)境(Special environment):是指暫時(shí)的或局部的 環(huán)境。例如，成年奶牛因一時(shí)營(yíng)養(yǎng)條件差而泌乳量減 少，但如果環(huán)境有了改善，其產(chǎn)量仍可恢復(fù)正常。永久性環(huán)

14、(Permanent environment):對(duì)某一特定個(gè) 體的性能產(chǎn)生持久影響，而且是以相似的方式影響一 個(gè)個(gè)體的每個(gè)記錄的環(huán)境。暫對(duì)性環(huán)(Temporary environment):只對(duì)某一特定性 能產(chǎn)生影響的環(huán)境。永久性環(huán)暫時(shí)性環(huán)境的剖分是針對(duì)重復(fù)測(cè)定性狀而吉的尙熱、方差鳥悌方差jW= E（X） =J（勺）Var（X） = E（X - 疔=乂（九 - M）7（）Cov（X,F） = E（X -代）（Y -旳）=（旺-叩 - Qf （兀切）數(shù)量性狀表型方差的 剖分假定，遺傳效應(yīng)間、環(huán)境效應(yīng)間及遺傳及環(huán)境效應(yīng)間無(wú)互作，則：Vp=VA+VD+Vi+VEg+VEs群體平均 基因型值和 基因型

15、值方差顯性水平(Dominance level)與顯性度設(shè)一對(duì)等位基因如、九的頻率分別為p和g, 三種基因型4詛1、AiA2 A2A2的基因型值分別 為+“、和也。其中決定于基因的顯性程度大 小，即顯性水平。顯性水平不同顯性水平下的d值顯性基因負(fù)向超顯性 負(fù)向完全顯性 負(fù)向部分顯性 無(wú)顯性 正向部分顯性 正向完全顯性力2a2 必2 無(wú)正向超顯性4力1Ardd da d = 0 0d a 平均基因型值(Average genotypic value)設(shè)群體處于HW平衡，則三種基因型頻率分 別為2、2pq和群體平均基因型值(“)為各基 因型值以其頻率加權(quán)的平均值，即：“ =p2a+2pqd+q2

16、(-a) / (p2+2pq+q2)=a (p - q) + 2pqd注意：用上式計(jì)算出的群體平均基因型值也等于 群體的平均表憂值(各基因型值是以與兩純合子平 均值的離爰度童的)； 莎及多個(gè)基因座對(duì)，根據(jù)加性廉理，由多個(gè)基因 座產(chǎn)生的群體平均值是各基因遂各令賈獻(xiàn)之和，即:平均基因型值方差Vg = E(G2)-(Eg)2E(G2) P?圧十 2pqd?十 q? (ayEg= Hp2 -2pq + q2VG = p2a2+2pqd2+q牡2 “ 2=引 ga+(gp)2+(端纖式中，匕4、切分別表示加性遺傳方差（育種值方 差）和顯性遺傳方差。A 概念(Average effect)在一個(gè)群體內(nèi)，攜

17、帶某一基因的配子，隨機(jī)和 群內(nèi)的配子結(jié)合，所形成的全部基因型的均值與群 體平均基因型值的離差。A計(jì)算設(shè)Ai、A2基因的平均效應(yīng)值分別為ai、（X2,Ai可以與知、Az形成兩種基因型4詛1、A詛2,其均值分別為a+M；同樣走可以與Ai、形成兩 種基因型詛2、42,其均值分別為/加-。因 此：ai = pa +qd - a (p -q)+2pqd =qa+d(q-p)ai =pd-qa-a(p-q) +2pqd =-pa+d(q-p)基因平均效應(yīng)的計(jì)算配子產(chǎn)生基因型的頻率基因型平均值A(chǔ)iAi(a)21詛2人必2)Apqpa+qdapqpd-qa基因替代的平均效應(yīng)(Average effect of

18、gene substitution )用a表示，是二基因平均效應(yīng)之差，即:a = ai-a2=a+rf (qp)ai = a+a2 =qaU2= ai-a =-pa概念育種值(Breeding value),即加性遺傳效應(yīng)值(Additive genetic value),為組成某一基因型 的兩個(gè)等位基因平均效應(yīng)之和。即：A（A1A1）=2ai = 2qaA（A1A2）= ai + a2 = （q-p）aA（A2A2）=2a2 = -2paA說明/育種值是用群體平均值的離差表示的;/ 一個(gè)HW平衡的大群體中，平均育種值等于0,即:A=14=2p2qa +2pq (q-p)a2g2pa=2pqa

19、(p+qpq)=0/如用絕對(duì)值表示，則平均育種值等于平均基因型值，也等于平均表型值, 育種值方差(Additive genetic variance)Va=/A2.=p2(2qa)2+2pq(q-p)a2+q2(-2pa)2 W =2pqa 2=2pqa+d(q-p)21顯性離差和顯性遺傳方差A(yù)概念考慮一個(gè)基因座時(shí),特定基因型值G與育種值A(chǔ)之差，稱為顯性離差(Dominant deviation)常用D表計(jì)算/將各基因型值表示為與群體平均值的離差:Ga(A1A1)= a 屮=2q(a-qd)Ga(aia2)二弘“ =(q-p)a+2pqdGa(A2A2)/i =-2p(a+pd) D= Gd-

20、A,有：D（aiAx）= Gd（AiAi）-A（aiAi）= -2q2dD（aiA2）= Gd（Ai42A（Api2）= 2pqdD（42A2）= Gd（A2A2）A32A2）=2p2dA說明/所有基因型的顯性離差都是d的函數(shù);/在一個(gè)HW平衡群體中，平均顯性離差值為0,即:D =fD=2p2q2d + 4p2q2d - 2p2q2d=0A 顯性遺傳方差（Dominant genetic variance）VD=TfD2=p2（.2q2d）2+2pq（2pqdy+q2（2p2d）2.=（2pqd）2第三節(jié)桌屬間相關(guān)今祈親屬間相關(guān)的分類親屬間的表型相關(guān)(Phenotypic correlatio

21、n) 親屬間性狀表型值的相關(guān)，包括遺傳相關(guān) 和環(huán)境相關(guān)兩部分。親屬間的遺傳相關(guān)(Genetic correlation)親屬間的親緣相關(guān)程度，因親屬個(gè)體具有共同祖先而產(chǎn)生，用來自共同祖先的概率來計(jì) 算，與性狀無(wú)關(guān)系。A親屬間的環(huán)境相關(guān)(Environmental correlation)/主要是指由共同環(huán)境造成的親屬間的相似性 程度。/共同環(huán)境效應(yīng)(Common envirbnmental effects) 是指不同的動(dòng)物組(如家系)在同一環(huán)境條件下而產(chǎn)生的相似性的增加。它可以嚴(yán)重影響遺傳協(xié)方差估值的準(zhǔn)確性。/同環(huán)境效應(yīng)的主娶來源母體效應(yīng)(Maternal effect):因同一母體環(huán)境而 造

22、成的后代與母親以及后代間相似性的增加。這一 效應(yīng)可能會(huì)持續(xù)到斷奶后較長(zhǎng)一段時(shí)間，因此，遺 傳評(píng)估時(shí)，往往要考慮母體效應(yīng)，并將其稱作母體 永久環(huán)境效應(yīng)。采食競(jìng)爭(zhēng)(Competition for feed):是一種不利的共 同環(huán)境效應(yīng)，往往造成親屬間負(fù)的協(xié)方差，即導(dǎo)致 相似性的降低。親屬間的遺傳協(xié)方差有關(guān)概念凌傳協(xié)方差(Genetic covarihiice):為兩個(gè)有 親緣關(guān)系個(gè)體的基因型值Gr和$間的協(xié)方差。同源相同(IBD, Identical by destent)基因與同態(tài)基因(Identical in state)IBD基因：親屬個(gè)體共享的來自某一共同祖 先的等位基因。同態(tài)基因：狀態(tài)相

23、同，但不一定來自同一共同祖先。同(Identity-in-state) 同源相同(Identity-by-descent)Two alleles are identical by descent if they arecopies of thesame parental allele-Ru、A|A】 1A1A2IBD遺傳協(xié)方差的計(jì)算/公 扎利用親屬個(gè)體間基因同源的概率和基因效應(yīng)，即對(duì)遺傳協(xié)方差的貢獻(xiàn)，可計(jì)算它們間的遺傳協(xié)方差O若不考慮互作，則:=+ 九若進(jìn)一步不考慮顯性效應(yīng)，則:匚=其中,卩= 1/2 （兩個(gè)個(gè)體共享1個(gè)IBD基因的概率）+ （兩個(gè)個(gè)體共享2個(gè)IBD基因的概率九=兩個(gè)個(gè)體共享2

24、個(gè)IBD基因的概率/舉例全同胞（Full sibs）Pr （2個(gè)IBD基因）二來自父親IBD基因的概率 x來自母親IBD基因的概率 =1/2 x 1/2=1/4Pr （0個(gè)IBD基因）二來自父親非IBD基因的概率 x來自母親非IBD基因的概率 =1/2 x 1/2=1/4Pr（l個(gè)IBD基因）二1卩丫（2個(gè)田?；颍㏄r （0個(gè)IBD基因）=1-1/4-1/4=1/2 p =1/2* 1/2+1/4=1/2 ,九=1/4 o BP：處勺5 = 1宀兀+1/4處半同胞（Half sibs）Pr （2個(gè)IBD基因）=1/2 x 0 （或0 x 2）=0Pr （0個(gè)IBD基因）=1/2 x 1=1/

25、2Pr （1 個(gè) IBD 基因）=101/2二1/2 P =1/2*1/2=1/4，九=0。即： 處卩射沖=4處親子 （Offspring and one parent）Pr（2個(gè)IBD基因）=0 （不可能共享2個(gè)IBD基因）Pr （OIBD基因）=0 （不可能不共享IBD基因）Pr（l個(gè)IBD基因）二1 （只可能共享1個(gè)IBD基因） p =1/2 x 1+0=1/2，九=0。即：/計(jì)算0和加另外方廉公式Q = (0 + Q/2 丸=其中，0和0是兩個(gè)個(gè)體父系基因和母系基 因?yàn)橥聪嗤母怕?。例X (a, b) Y (c, d)全同胞關(guān)系示意圖全同胞關(guān)系示意圖中，S和D分別為父親和母親, 括號(hào)

26、中前面的小寫字母表示毬系基因，后面的表示 母系基因。假定S和D是非近交個(gè)體，則因此有:p（e = f） = P（g = h） = O+1 f 1 1 9 1 9 P -2 2-4 CVg（x,y）= CoVg（fs）= 6 + 才若X和Y為父系半同胞，則Q0。因此有:C0Vg（x,y）= C0Vg（hs）=才6第四節(jié)遺傳泰赦A估計(jì)遺傳參數(shù)的目的丁預(yù)測(cè)育種值(Predict breeding values)遺傳評(píng)估/預(yù)測(cè)選擇反應(yīng)(Predict response to selection)丁 役計(jì)選擇方親(Design selection programs)估計(jì)遺傳參數(shù)的時(shí)機(jī)/一個(gè)新性狀，其參數(shù)

27、商未估計(jì)/育種群中，方蓋和協(xié)方蓋巳K對(duì)間發(fā)生變化，如 經(jīng)過短期的強(qiáng)度選擇。/育種群結(jié)構(gòu)發(fā)生了較大歐變，如由于引種。遺傳力(Heritability)遺傳力的概念c V VH2=-= gV V +vV p v G v E/廣義遺傳力(Heritability in general sense，H2)基因型值方差占表型方差的比例：反映一個(gè)性狀受遺傳效應(yīng)影響有多大，受環(huán)境效應(yīng) 影響多大。/狹義遺傳力(Heritability in ngirow sen歸?)育種值方差占表型方差的比例: 在育種上具有重要意義，一般情況下所說的遺傳力 就是指狹義遺傳力。/ 賣現(xiàn)遺傳力(Real遜d heritabili

28、ty)選擇數(shù)量性狀時(shí)，親代的選擇效果（選擇差）能遺 傳給后代的比例：實(shí)際上通常是通過遺傳力來預(yù)測(cè)選擇反應(yīng)大小痰富苦于植狀的箕況遺傳力AnimalTraitHeiitobilityCattleBirth weight0.49Milk vieldJ0.30PoultryBody weight0.31Egg production0.30Egg we ight0.60SwineBirth weight0.06Growth rate0.30Litter size0.15SheepWbol length0.55Fleece weiglit0.40/遺傳力的其他概念遺傳力是育種值對(duì)表型值的決定系數(shù)(h2 =

29、 dP.A )一通徑分析的原理：用決定系數(shù)表示原因?qū)Y(jié)果決定的程度。A =Pp.A =bAP= W) =加遺傳力是育種值對(duì)表型值的回歸系數(shù)(2 0AP )第=簫=h育種值不能直接度量，而表型值可以度量 一原理：回歸分析和育種值估計(jì)遺傳力是育種值與表型值的相關(guān)程度，即根據(jù) 表型值估計(jì)育種值的準(zhǔn)確度(k2 =) oP4 = ncrpg (jpA遺傳力估計(jì)的基本方法/索子資料估計(jì)遺傳孑、子女表型值對(duì)一個(gè)親本的回1零相關(guān)估計(jì)/在隨機(jī)交配情況下，親子間的親緣系數(shù)近似等于05,假設(shè)/V表示單親（任何一個(gè) 親本）表型值，P。表示子女表型值，可以得到 利用簡(jiǎn)單回歸或相關(guān)方法估計(jì)的遺傳力為：T走用雷提：親子對(duì)間

30、沒有親緣關(guān)系-祀錄類媲：只有一個(gè)親本有表型記錄，如產(chǎn)奶 量，只有母親和女兒有記錄。子女表型值對(duì)雙親均值的回歸或相關(guān)估計(jì)m陽(yáng) 與子女表型值對(duì)單親表型值的回歸或相關(guān)估計(jì)類似，只是用雙親均值（網(wǎng)）來代替單親表型值，可以得到利用簡(jiǎn)單回歸或相關(guān)方法估計(jì)的遺傳力為:T走用備件；親子對(duì)間沒有親緣關(guān)系；假定兩親本間不存在親緣相關(guān)和表型相關(guān)，即非近交情況；如果性狀在公、母畜親本表現(xiàn)相差太大，變異程度不同，或限性性狀 時(shí)，不宜采用這兩種方法。公畜內(nèi)女母回歸或型關(guān)估計(jì)實(shí)際育種中，一頭公畜往往配多頭母畜，且各公 畜與配的母畜數(shù)不等。應(yīng)該剔除公畜效應(yīng)，計(jì)算公畜 內(nèi)母、女各自的方差及協(xié)方差，然后計(jì)算公畜內(nèi)女母 回歸系數(shù)或

31、相關(guān)系數(shù)，再估計(jì)遺傳力。公畜內(nèi)母、女平方和及乘積和變異來源df母親平方和女兒平方和母女乘積和公畜間S-lDuY fcsv）2di為山z Di匸匕州比0皿Dij恵oj母畜間2X sdiXXDijij-Ldin _ Z 2_ Z bw（r）w（）/2_c_O UHv（OQ） _obw（）bw（O） JSSw（）SSw（o）/同胞界料估計(jì)站X半同胞組內(nèi)相關(guān)法T原理與心HS)h2 =式中，fhs表示半同胞個(gè)體間的表型相關(guān)，是一個(gè)組內(nèi)相關(guān) 系數(shù)。一般通過單因方差分析估計(jì)方差組分來計(jì)算。半同胞遺傳力估計(jì)方差分析表變異來源自由度平方和均方期望均方公畜間dfs=S-lw低冷）2血xjaW +丘0於公畜內(nèi)dfw

32、 =Ynisss廠EX：呈丄SS”2MSs = % + kQcsMSW =此遺傳力 ftfi：-Ay - 4C7SH _分仏2 ,2bs +bwT應(yīng)用條件：除公畜個(gè)體效應(yīng)外，所有變異來源應(yīng) 全部為誤差效應(yīng)；公畜內(nèi)個(gè)體間的遺傳關(guān)系必須完全一致，即不應(yīng)有全 同胞個(gè)體，否則使組內(nèi)變異減小，遺傳力估值偏高；公畜間無(wú)親緣相關(guān)，否則使半同胞間一致性增加，導(dǎo)致公畜間變異下降，遺傳力估值偏低。/同胞界料估計(jì)站X全同胞組內(nèi)相關(guān)法 f原理與公式仏二 0.52（慶+元）hsD 2 .2 .26+%+無(wú)在近似條件下，全同胞個(gè)體間的親緣系數(shù)為 遺傳力估計(jì)值為：式中，和S表示全同胞個(gè)體間的表型相關(guān)。通過方差分析估 計(jì)方差

33、組分來計(jì)算。顯著性檢驗(yàn)/估計(jì)出遺傳力后均需進(jìn)行顯著性檢驗(yàn)：Ho：/z2=0；/相當(dāng)于回歸系數(shù)、相關(guān)系數(shù)和組內(nèi)相關(guān)系數(shù)的 檢驗(yàn)；/親子資料：t檢驗(yàn)或者F檢驗(yàn)，df=n-2,兀是親子 對(duì)子數(shù)；/半同胞資料檢驗(yàn)，爐誤差自由度，即公畜 內(nèi)自由度；/全同胞資料：F檢驗(yàn)，誤差二公畜母畜內(nèi)子女 間，F(xiàn) （公畜間，誤差）；F （公畜內(nèi)母畜間， 誤差）。影響遺傳力估計(jì)的因素/遺傳和環(huán)境的故變：如有無(wú)遺傳與環(huán)境互作;/共同環(huán)境:如有無(wú)母體效應(yīng)存在;擇：導(dǎo)致遺傳一致性增大，使遺傳力估值降低;/選紀(jì)方式，是否采用隨機(jī)交配，近交可導(dǎo)致遺 傳力估值下降； /樣本含量：是否足夠大；-選擇試驗(yàn)：幾百個(gè)；現(xiàn)場(chǎng)數(shù)據(jù)：上萬(wàn)個(gè)/估計(jì)

34、方法：現(xiàn)有方法局限性很大，應(yīng)考慮采用 基于混合模型的參數(shù)估計(jì)方法。重復(fù)力(Repeatability)重復(fù)力的概念/衡量數(shù)量性狀在同一個(gè)體多次度量值間相關(guān) 程度的_個(gè)指標(biāo);/從遺傳上講：是遺傳方差和永久環(huán)境方差占 表型方差的比例：Up/從估計(jì)方法上講：重復(fù)力實(shí)際上是以個(gè)體多 次度量值為組的組內(nèi)相關(guān)系數(shù)：重復(fù)力(Repeatability)重復(fù)力的概念/衡量數(shù)量性狀在同一個(gè)體多次度量值間相關(guān) 程度的_個(gè)指標(biāo);/從遺傳上講：是遺傳方差和永久環(huán)境方差占 表型方差的比例：Up/從估計(jì)方法上講：重復(fù)力實(shí)際上是以個(gè)體多 次度量值為組的組內(nèi)相關(guān)系數(shù)：2 2B +b“重復(fù)力的估計(jì)方法以個(gè)體的各次度量值為組內(nèi)觀

35、察值，用單 因素方差分析法計(jì)算組 麗鬆費(fèi):e MSb +(卅一 1)MSW dfw x SSg + (zz _ V)df B x SS式中，MSb為個(gè)體均方，MSw為個(gè)體內(nèi)度量值 間均方，為每一個(gè)體的度量次數(shù)。當(dāng)個(gè)體度量 次數(shù)不等時(shí)，可用加權(quán)平均數(shù)砒代入：重復(fù)力估值的顯著性檢驗(yàn)/實(shí)質(zhì)：對(duì)組內(nèi)相關(guān)系數(shù)的顯著性檢驗(yàn)/方法：t檢驗(yàn)re =(1 乙)1 + (1 1)乙df =叭重復(fù)力估值的含義/估值高說明性狀受暫時(shí)性環(huán)境效應(yīng)影響小，每 次度量值的代表性強(qiáng)，所需度量的次數(shù)就少；/估值低說明性狀受暫時(shí)性環(huán)境效應(yīng)影響大，每 次度量值的代表性差，所需度量的次數(shù)就多。重復(fù)力的作用/判斷遺傳力估計(jì)的正確性;T重復(fù)力估值是遺傳力估值的上限/確定性狀需要度量的次數(shù)；T估值宙所需度量的次數(shù)少T估值低所需度童的次數(shù)多/育種值估計(jì)時(shí)計(jì)算多次度量的均值遺傳力;nh21+（_1 比/估計(jì)畜禽終身可能的平均生產(chǎn)力。P嚴(yán)（Pp 比+P遺傳相關(guān)(Genetic correlation)A有關(guān)概念/ 表型相關(guān)(Phenotypic correlation):兩個(gè) 數(shù)量性狀度量值間的相關(guān)。丁遺傳相關(guān)(Genetic correlation)：兩個(gè)性狀加性遺傳效應(yīng)(育種值)間的相關(guān)。/ 環(huán)境