如何上傳序列 劉崇靈

1、如何上傳序列如何上傳序列How to submit sequence劉崇靈2014.3 為什么要上傳序列？為什么要上傳序列？ 上傳序列的方法有哪些？上傳序列的方法有哪些？ 具體提交步驟是怎樣？具體提交步驟是怎樣？為什么要上傳序列？為什么要上傳序列？v可簡(jiǎn)化數(shù)據(jù)篇幅，用可簡(jiǎn)化數(shù)據(jù)篇幅，用GenBank登錄號(hào)代替登錄號(hào)代替v可資源共享，便于掌握研究進(jìn)展可資源共享，便于掌握研究進(jìn)展v可輕松查找到相關(guān)序列信息可輕松查找到相關(guān)序列信息 。上傳序列的方法有哪些？上傳序列的方法有哪些？進(jìn)入進(jìn)入NCBI主頁主頁從左側(cè)列表進(jìn)入從左側(cè)列表進(jìn)入“Data and software”右側(cè)右側(cè)“Quick Link”選

2、擇提交方法選擇提交方法上傳序列的方法上傳序列的方法BankitSequin 在線提交在線提交，需注冊(cè)，需注冊(cè) 適合單個(gè)或少量適合單個(gè)或少量 序列的提交序列的提交 序列注釋不復(fù)雜序列注釋不復(fù)雜 需下載軟件需下載軟件 適合批量序列提交適合批量序列提交 更更多多選項(xiàng)和功能，選項(xiàng)和功能， 可以批量修改可以批量修改該兩種方法大同小異，接下來以該兩種方法大同小異，接下來以sequinsequin方法為例介紹。方法為例介紹。用用Sequin提交序列步驟：提交序列步驟：1. 下載下載Sequin軟件，安裝軟件，安裝2. 準(zhǔn)備提交前的材料準(zhǔn)備提交前的材料3. 運(yùn)行運(yùn)行Sequin，并按照要求，并按照要求填填 寫

3、相應(yīng)內(nèi)容，保存提交內(nèi)容寫相應(yīng)內(nèi)容，保存提交內(nèi)容 （.sqn格式）格式）4. 正式提交：將生成的正式提交：將生成的“.sqn” 文件以附件形式發(fā)郵件至文件以附件形式發(fā)郵件至 ， 并簡(jiǎn)要說明提交內(nèi)容。并簡(jiǎn)要說明提交內(nèi)容。1. 下載下載Sequin軟件，安裝軟件，安裝用用Sequin提交序列步驟：提交序列步驟：1. 下載下載Sequin軟件，安裝軟件，安裝2. 準(zhǔn)備提交前的材料準(zhǔn)備提交前的材料3. 運(yùn)行運(yùn)行Sequin，并按照要求，并按照要求填填 寫相應(yīng)內(nèi)容，保存提交內(nèi)容寫相應(yīng)內(nèi)容，保存提交內(nèi)容 （.sqn格式）格式）4. 正式提交：將生成的正式提交：將生

4、成的“.sqn” 文件以附件形式發(fā)郵件至文件以附件形式發(fā)郵件至 ， 并簡(jiǎn)要說明提交內(nèi)容。并簡(jiǎn)要說明提交內(nèi)容。2. 準(zhǔn)備提交前的材料準(zhǔn)備提交前的材料準(zhǔn)備材料準(zhǔn)備材料序列序列（Fasta格式）格式）聯(lián)系信息聯(lián)系信息序列信息序列信息序列文件序列文件 格式必需是格式必需是Fasta，擴(kuò)展名不限，擴(kuò)展名不限 序列內(nèi)容僅為常見的序列內(nèi)容僅為常見的5種堿基（種堿基（A/T/C/G/U）聯(lián)系信息聯(lián)系信息注意：注意：聯(lián)系信息可保存，聯(lián)系信息可保存，并導(dǎo)出為模板。并導(dǎo)出為模板。序列信息序列信息用用excel表列出該序列相關(guān)信息表列出該序列相關(guān)信息例如：例如：Organism、Isolate/Strain、Country、Collection-date、 Host、Serotype.一般僅在批量提交時(shí)需要準(zhǔn)備序列信息。一般僅在批量提交時(shí)需要準(zhǔn)備序列信息。Sequin操作