腸道定植和血流感染腸桿菌科細(xì)菌的流行病學(xué)分析

1、腸道定植和血流感染腸桿菌科細(xì)菌的流行病學(xué)分析目的：了解養(yǎng)老院居住者腸道定植產(chǎn)超廣譜B-內(nèi)酰胺酶(Extended-spectrum B -lactamase,ESBLs)腸桿菌科細(xì)菌的發(fā)生率和耐藥性,并 從居住者個(gè)人、醫(yī)護(hù)人員和養(yǎng)老院機(jī)構(gòu)三個(gè)層面確定定植危險(xiǎn)因素 ; 了解瑞金醫(yī) 院 2021 年住院患者血培養(yǎng)別離病原體種類和耐藥性, 在此根底上對(duì) 2021-2021年該院別離的引起血流感染 (Bloodstream infections,BSI) 大腸埃希菌的耐藥 性和分子流行病學(xué)特征進(jìn)行分析 , 進(jìn)而為臨床合理使用抗菌藥物、防控醫(yī)院獲得 性血流感染和耐藥菌的播散提供科學(xué)依據(jù)。方法:1)以VI

2、TEK2Compact全自動(dòng)微生物分析系統(tǒng)鑒定細(xì)菌作為參考方法 , 建立聯(lián)合應(yīng)用科瑪嘉定位顯色培養(yǎng)基、吲 哚試驗(yàn)、鳥氨酸脫羧酶試驗(yàn)、 賴氨酸脫羧酶試驗(yàn)鑒定常見氧化酶陰性革蘭陰性桿 菌的方法并進(jìn)行評(píng)估 ;2) 收集上海市 7 家養(yǎng)老機(jī)構(gòu)居住者的肛拭標(biāo)本和臨床病歷 資料, 對(duì)別離出的腸桿菌科細(xì)菌菌株采用上述方法進(jìn)行鑒定 , 紙片擴(kuò)散法進(jìn)行藥 敏試驗(yàn),聚合酶鏈?zhǔn)椒错?Polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增編碼ESBLs和碳 青霉烯酶的基因 , 應(yīng)用統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件從居住者個(gè)人、醫(yī)護(hù)人員、機(jī)構(gòu)水平三個(gè)層面 對(duì)所有可能的變量進(jìn)行分析并確定產(chǎn)ESBLs菌株定植的危險(xiǎn)因素；3)收集瑞金醫(yī)

3、院 2021年 1 月 1 日-12 月 31 日住院患者送檢所有血培養(yǎng)標(biāo)本的菌株信息和患者 信息以分析陽(yáng)性檢出率、病原體分布、科室分布、患者特征和耐藥性 ；4) 收集瑞 金醫(yī)院 2021 年 6月-2021 年 6 月引起血流感染最常見的大腸埃希菌菌株 , 紙片擴(kuò) 散法進(jìn)行藥敏試驗(yàn) ,pcr 擴(kuò)增編碼 esbls 和碳青霉烯酶的基因、系統(tǒng)發(fā)生群基因 和多位點(diǎn)序列分型 (multi-locussequencetyping,mlst) 基因 , 并采用軟件 eburst 對(duì)序列型 (sequencetype,st) 進(jìn)行分析以探究菌株間的同源性。結(jié)果:1) 采用本次研究所建立的以顯色培養(yǎng)基聯(lián)合簡(jiǎn)

4、單生化反響的鑒定方案 對(duì)8個(gè)屬 10個(gè)種共 318株菌的鑒定結(jié)果說(shuō)明 ,與 vitek2compact 全自動(dòng)微生物分 析系統(tǒng)鑒定結(jié)果相比 , 這 10 個(gè)菌種鑒定的特異性均大于 90%,靈敏度為 75%100%; 一致性分析說(shuō)明除弗勞地枸櫞酸桿菌的 kappa 值為 0.5947 外, 其余均大于 0.85;mcnemar 檢驗(yàn) p 值均大于 0.05; 該鑒定法本錢只有參考方法的 10%;2)390 位養(yǎng)老院居住者共別離到457株腸桿菌科細(xì)菌,其中183(46.92%)株產(chǎn)esbls;大 腸埃希菌 (365,79.87%) 、奇異變形桿菌 (40,8.75%) 和肺炎克雷伯桿菌 (24,5

5、.25%) 是最常見的菌種；ctx-m是最常見的B -內(nèi)酰胺酶(198,99.00%),其中 ctx-m-14(84,42.00%) 的比例最高;兩株產(chǎn)碳青霉烯酶的肺炎克雷伯桿菌別離自 同一家養(yǎng)老院 , 均攜帶 blakpc-2 且均為 st11; 別離菌對(duì)碳青霉烯類、 tzp,ak,fos,cl 和 tgc 的耐藥率低 ; 侵入性醫(yī)療操作 (or=3.112,95%ci1.725-5.615,p=0.000) 、喹諾酮使用史 (or=1.808,95%ci1.047-3.121,p=0.034) 和每周洗澡次數(shù) (or=1.959,95%ci1.163-3.302,p=0.012) 是腸道定

6、植產(chǎn) esbls 腸桿菌科細(xì)菌的獨(dú) 立相關(guān)變量;3)2021 年瑞金醫(yī)院 5546例住院患者送檢血培養(yǎng)標(biāo)本 16428份,血培 養(yǎng)陽(yáng)性者384例，陽(yáng)性率為6.92%;檢出病原體398株，其中革蘭陰性(g-)菌272 株(68.34%),革蘭陽(yáng)性(g+)菌94株(23.62%),真菌32株(8.04%);6180歲患者陽(yáng) 性率(8.26%)最高,送檢陽(yáng)性率居前 5位的科室分別是灼傷整形科、 中醫(yī)科、心外 監(jiān)護(hù)病區(qū)、移植病區(qū)和創(chuàng)傷外科；g+球菌對(duì)va、tec、Izd保持高敏感率，發(fā)現(xiàn)1 株耐萬(wàn)古霉素屎腸球菌 ;g- 桿菌中腸桿菌科細(xì)菌對(duì) ak 和碳青霉烯類藥物敏感率 高, 腸桿菌科細(xì)菌、鮑曼不動(dòng)桿

7、菌、銅綠假單胞菌對(duì)碳青霉烯類藥物的耐藥率分 別為 7.51%、 70.97%、 35.90%;4)2021 年6月至 2021年6月共連續(xù)收集到引起血流感染大腸埃希菌128株,其中80株產(chǎn)esbls,未發(fā)現(xiàn)產(chǎn)碳青霉烯酶菌株；別離株 對(duì)ak,tzp和碳青霉烯類抗生素保持高敏感率；ctx-m-14(40/80)是最常見的B -內(nèi)酰胺酶,其次是ctx-m-55(17/80)和ctx-m-15(14/80);b2 群是最常見的系統(tǒng)發(fā) 生群，但是在產(chǎn)esbls菌株中d群的比例最高；共檢測(cè)到49個(gè)序列型，分為6個(gè)非 重復(fù)的進(jìn)化組或克隆復(fù)合物以及 33個(gè)單體, 其中 st131(17/128) 是最常見的序

8、列 型, 其次是 st69(12/128) 和 st648(10/128) 。結(jié)論:1) 顯色培養(yǎng)基聯(lián)合簡(jiǎn)單生化試 驗(yàn)可快速經(jīng)濟(jì)有效地鑒定數(shù)種常見氧化酶陰性革蘭陰性桿菌 ;2) 養(yǎng)老院居住者每 周的洗澡次數(shù)、侵入性醫(yī)療操作史和喹諾酮類抗生素使用史是產(chǎn)ESBLs腸桿菌科細(xì)菌腸道定植的獨(dú)立相關(guān)變量 , 抗生素的合理使用、遵循無(wú)菌操作和護(hù)理原那么、 注意養(yǎng)老院居住者的個(gè)人衛(wèi)生是控制耐藥菌在養(yǎng)老機(jī)構(gòu)播散的重要措施 ;3) 瑞金 醫(yī)院血流感染病原體以G-菌為主,老年患者血培養(yǎng)陽(yáng)性率咼，引起血流感染大腸 埃希菌的同源性低,不存在產(chǎn)ESBLs菌株的院內(nèi)克隆傳播；4)養(yǎng)老院居住者腸道 產(chǎn)ESBLs腸桿菌科細(xì)菌的定植率和瑞金醫(yī)院血流感染產(chǎn)ESBLs大腸埃希菌的發(fā)