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文檔簡(jiǎn)介
1、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院-分子遺傳學(xué) 期末考試資料整理名詞解釋:1. loss of heterozygoteity(LOH) 雜合性丟失:出現(xiàn)于某一特定基因正常的兩個(gè)對(duì)等位基因不同的基因組變化,常反映為喪失該基因的一個(gè)等位基因的部分或全部基因組部分。2. SNP:單核苷酸多態(tài)性,不同個(gè)體基因組DNA同一位置上單個(gè)核苷酸的差別,在一個(gè)群體中的頻率不低于1%。 SNP被認(rèn)為是疾病臨床表現(xiàn)的遺傳基礎(chǔ),是疾病發(fā)生的本質(zhì)。因此,SNP成為第三代遺傳標(biāo)志,人體許多表型差異、對(duì)藥物或疾病的易感性等等都可能與SNP有關(guān)。人類基因組中約每1000個(gè)堿基就有一個(gè)SNP。3. anticipation 遺傳早現(xiàn):指一些遺傳
2、?。ㄍǔ轱@性遺傳病)在連續(xù)幾代的遺傳中,發(fā)病年齡提前而且病情嚴(yán)重程度增加。即某種遺傳病的癥狀一代比一代嚴(yán)重,而發(fā)病時(shí)間一代早于一代的現(xiàn)象。如HD,常父親遺傳突變等位基因,遺傳早現(xiàn)的現(xiàn)象是增加了CAG的重復(fù)數(shù),并且提前了發(fā)病年齡;4 epigenetics 表觀遺傳學(xué):研究不涉及DNA序列改變的基因表達(dá)和調(diào)控的可遺傳變化 的學(xué)科,或者說(shuō)是研究從基因演繹為表型的過(guò)程和機(jī)制的一門新興的遺傳學(xué)分支。它研究在沒有細(xì)胞核DNA序列改變的情況時(shí),基因功能的可逆的、可遺傳的改變。也指生物發(fā)育過(guò)程中包含的程序的研究。Heritable change in patterns of gene expression
3、 mediated by mechanisms other than alterations in primary nucleotide sequence4. gain-of-function 在不太多的情況下,突變也可能因增強(qiáng)了突變蛋白的活性而改變了機(jī)體的生化表型,這種現(xiàn)象稱為功能加強(qiáng)突變。導(dǎo)致突變蛋白活性增加的原因有二:(1)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的改變使該蛋白質(zhì)活性增強(qiáng);(2)調(diào)節(jié)區(qū)域突變,使該蛋白質(zhì)合成的數(shù)量增加,活性也相應(yīng)增強(qiáng);但活性增強(qiáng)同樣可導(dǎo)致疾病的發(fā)生,主要有兩種形式:(1)基因拷貝數(shù)增加;(2)突變蛋白某種活性增強(qiáng)。5. loss-of-function 功能丟失突變是一種最常見的突變形
4、式。不論是編碼區(qū)域的突變,還是調(diào)節(jié)區(qū)域的突變,多數(shù)發(fā)生了突變的蛋白質(zhì)都失去了正常功能。由于突變蛋白往往穩(wěn)定性差,所以在細(xì)胞內(nèi)的含量也相應(yīng)下降。主要有下面兩種方式:(1)基因缺失,基因雜合缺失是使該基因編碼的蛋白質(zhì)減少一半;純合缺失則導(dǎo)致該基因編碼蛋白質(zhì)完全缺失;(2)基因突變。6. Whole genome scanning (Genome-wide scanning) 由于人類基因組多態(tài)性的研究以及SNP分型技術(shù)的發(fā)展,目前全基因組連鎖分析和關(guān)聯(lián)研究亦變得切實(shí)可行。根據(jù)研究規(guī)模的大小,可以將疾病遺傳分析分為定位克隆、連鎖不平衡基因定位、全基因組候選基因分析、候選基因關(guān)聯(lián)研究和定位候選基因克隆
5、,其中定位克隆、連鎖不平衡基因定位和全基因組候選基因分析均屬于全基因組掃描。7. Genomic imprinting 基因組印記:又稱為遺傳印記;個(gè)個(gè)體的同源染色體(或相應(yīng)的一對(duì)等位基因)因分別來(lái)自父方或母方而表現(xiàn)出功能上的差異, 控制某一表型的一對(duì)等位基因由于親源不同而差異性表達(dá),而當(dāng)其一發(fā)生變化,機(jī)體只表達(dá)來(lái)自親本一方的等位基因,所形成的表型也有不同。而與其自身性別無(wú)關(guān),或當(dāng)它們其一發(fā)生改變時(shí),所形成的表型也有不同,屬于非孟德爾遺傳學(xué)的表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域。 基因組印記是一正常過(guò)程,印記的基因只占人類基因組中的少數(shù),可能不超過(guò)5%,但在胎兒的生長(zhǎng)和行為發(fā)育中起著至關(guān)重要的作用?;蚪M印記病主要
6、表現(xiàn)為過(guò)度生長(zhǎng)、生長(zhǎng)遲緩、智力障礙、行為異常。 8.Haplotype :位于一條染色體特定區(qū)域的一組SNPs,并傾向于以整體遺傳給后代的單核苷酸多態(tài)的組合,又稱單倍型或單體型。它是一系列存在于一個(gè)染色單體上的SNPs,它們?cè)诮y(tǒng)計(jì)學(xué)上相關(guān);通過(guò)這些相關(guān)的SNPs組成的單體型可以明確地確定這一區(qū)域其它多態(tài)性位點(diǎn)。A group of alleles in coupling at closely linked loci, usually inherited as a unit.8. Genetic heterogeneity 遺傳異質(zhì)性:不同基因型決定相同表型的現(xiàn)象,即一種性狀可以由多個(gè)不同的基因
7、控制。 表現(xiàn)型一致的個(gè)體或同種疾病臨床表現(xiàn)相同,但可能具有不同的基因型。由于遺傳基礎(chǔ)不同,它們的遺傳方式、發(fā)病年齡、病程進(jìn)展、病情嚴(yán)重程度、預(yù)后以及復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)等都可能不同。Locus heterogeneity (The production of identical phenotypes by mutations at two or more different loci.)9. pleiotropy 基因的多效性:指一個(gè)基因可以決定或影響多個(gè)相關(guān)或不相關(guān)的性狀,因此, 若突變發(fā)生在多效性基因上時(shí),就可能導(dǎo)致影響幾個(gè)或全部的性狀。10. expressivity表現(xiàn)度:是特定的基因在個(gè)體中的表
8、達(dá)程度或者說(shuō)是具有同一基因型的不同個(gè)體或同一個(gè)體的不同部位,基因所表達(dá)的程度可有顯著的差異。11. penetrance 外顯率:是突變的基因或特定基因型在群體中表達(dá)相關(guān)性狀個(gè)體所占的比例;它是基因表達(dá)的另一變異方式。在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)中,疾病相關(guān)突變外顯率是帶有突變基因的個(gè)體表現(xiàn)臨床癥狀時(shí)的比例。如,某個(gè)基因突變對(duì)特定常染色體疾病有95%的外顯率,則95%帶有這個(gè)突變的個(gè)體會(huì)發(fā)病,只有5%不會(huì)發(fā)病。12. phenocopy 擬表型:由于環(huán)境因素的作用使個(gè)體的表型恰好與某一特定基因所產(chǎn)生的表型相同或相似,或一個(gè)個(gè)體在特定條件下的表現(xiàn)型相同或相似于另外個(gè)體由基因決定的表型;換句話說(shuō),就是環(huán)境條件產(chǎn)生
9、的擬表型模擬了由基因產(chǎn)生的表型。13. sex-conditioned inheritance 從性遺傳:位于常染色體上的基因,由于性別的差異而顯示出男女分布比例或基因表達(dá)程度上的差異。14. sex-limited inheritance 限性遺傳:指常染色體上的基因,由于基因表達(dá)的性別限制,只在一種性別表現(xiàn),而在另一種性別則完全不能表現(xiàn)。15. incomplete dominance 不完全顯性遺傳:也稱為半顯性遺傳,指雜合子的表現(xiàn)度介于顯性純合子和隱性純合子的表現(xiàn)型之間,即在雜合子中顯性基因和隱性基因均得到一定程度的表現(xiàn)。16. delayed dominance 延遲顯性:雜合子在生
10、命的早期,因致病基因并不表達(dá)或雖表達(dá)但尚不足以引起明顯的臨床表現(xiàn),只在一定年齡后才表現(xiàn)出疾病,這一顯性形式稱為延遲表達(dá)。17. irregular dominance 不規(guī)則顯性遺傳:是指雜合子的顯性基因由于某種原因而不表現(xiàn)出相應(yīng)的性狀,因此在系譜中可以出現(xiàn)隔代遺傳的現(xiàn)象。 也就是說(shuō)在具有某一顯性基因的雜合體中,并不是每個(gè)個(gè)體都能表現(xiàn)出該顯性基因所控制的性狀。但是帶有顯性基因的某些個(gè)體,本身雖然不表現(xiàn)出顯性性狀,但他們卻可以生出具有該性狀的后代。18. codominance 共顯性,是指一對(duì)等位基因之間沒有顯性和隱性的區(qū)別,在雜合子時(shí)兩種基因的作用都完全表現(xiàn)出來(lái)。19. susceptibi
11、lity 易感性:在多基因遺傳病中,若干作用微小但有累積效應(yīng)的致病基因構(gòu)成了個(gè)體患某種病的遺傳因素。這種由遺傳基礎(chǔ)決定一個(gè)個(gè)體患病的風(fēng)險(xiǎn)稱為易感性。也可以理解為在相同環(huán)境下,不同個(gè)體患病的風(fēng)險(xiǎn)。An inherited predisposition to a disease which is not due to a single-gene cause and is usually the result of a complex interaction of the effects of multiple different genes, i.e. polygenic inheritance.
12、 20. liability 易患性:由遺傳因素和環(huán)境因素等多種因素共同決定一個(gè)個(gè)體是否易患某種遺傳病的可能性稱為易患性。A concept used in disorders which are multifactorially determined to take into account all possible causative factors.21. haploinsufficiency 單倍劑量不足:指一個(gè)等位基因突變后,另一個(gè)等位基因能正常表達(dá),但正常表達(dá)的等位基因不能夠產(chǎn)生基因產(chǎn)物(如蛋白質(zhì))來(lái)維持野生型條件,從而導(dǎo)致異?;蚣膊顟B(tài);一般是導(dǎo)致一些常染色體顯性遺傳病。22.
13、linkage disequilibrium連鎖不平衡:由于兩個(gè)位點(diǎn)在同一條染色體上的距離近,從而導(dǎo)致兩個(gè)位點(diǎn)上的對(duì)應(yīng)特定等位基因經(jīng)常同時(shí)出現(xiàn)在同一染色體上,即在某一群體中,不同座位上某兩個(gè)等位基因出現(xiàn)在同一條染色體上的頻率高于預(yù)期的隨機(jī)頻率的現(xiàn)象,稱連鎖不平衡 (linkage disequilibrium) 。23. 藥物基因組學(xué):研究基因變異所致的不同疾病對(duì)藥物的不同反應(yīng),并在此基礎(chǔ)上研制出新藥或新的用藥方法,這一新概念被稱為藥物基因組學(xué)。The study of the genome and its products (including RNA and protein) as it
14、relates to drug discovery and development. 藥物基因組學(xué)可以說(shuō)是基因功能學(xué)與分子藥理學(xué)的有機(jī)結(jié)合,在很多方面這種結(jié)合是非常必要的。藥物基因組學(xué)區(qū)別于一般意義上的基因?qū)W,它不是以發(fā)現(xiàn)人體基因組基因?yàn)橹饕康?,而是相?duì)簡(jiǎn)單地運(yùn)用已知的基因理論改善病人的治療。也可以這么說(shuō),藥物基因組學(xué)以藥物效應(yīng)及安全性為目標(biāo),研究各種基因突變與藥效及安全性的關(guān)系。 24. In situ hybridization 原位雜交:原位雜交是指將特定標(biāo)記的已知順序核酸為探針與細(xì)胞或組織切片中核酸進(jìn)行雜交,從而對(duì)特定核酸順序進(jìn)行精確定量定位的過(guò)程。原位雜交可以在細(xì)胞標(biāo)本或組織標(biāo)本上
15、進(jìn)行。 如在利用放射性或非放射性標(biāo)記的已知核酸探針雜交后,通過(guò)放射自顯影或非放射性檢測(cè)體系來(lái)檢測(cè)染色體上特異DNA或RNA序列,可用放射性顆粒在某條染色體的區(qū)帶出現(xiàn)的最高頻率或熒光的強(qiáng)弱來(lái)確定探針的位置,從而進(jìn)行準(zhǔn)確的基因定位。 25.Human genome: The sum of total human genes, consisting of nuclear & mitochondrial genomes. 26. RNAi:即“RNA干擾”。小的雙鏈RNA(siRNA)可以高效、特異地阻斷體內(nèi)特定基因的表達(dá),促使mRNA降解,誘使細(xì)胞表現(xiàn)出特定基因缺失的表型。 29. OMIM
16、:為“Online Mendelian Inheritance in Man”的簡(jiǎn)稱,意即“在線人類孟德爾遺傳”或“網(wǎng)上人類孟德爾遺傳”。美國(guó)Johns Hopkins大學(xué)醫(yī)學(xué)院Victor A McKusick教授被尊稱為“醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)之父”,由他主編的人類孟德爾遺傳(Mendelian Inheritance in Man:Catologs of Human Genes and Genetic Disorders,簡(jiǎn)稱MIM)一書,一直是醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)最權(quán)威的百科全書和數(shù)據(jù)庫(kù)。30. Candidate gene approach: 基于疾病的生理和生化作用的發(fā)展,基因結(jié)構(gòu)或影響性狀的調(diào)節(jié)或生化
17、通路上的基因,在其它物種有相似的功能,即動(dòng)物模型;強(qiáng)調(diào)基因突變與表現(xiàn)型或疾病的關(guān)聯(lián),這不同于GWAS,GWAS是全基因組的所有常見突變;侯選基因的方法是基于以前基因生物功能影響性狀或疾病的知識(shí)。31. Polymorphism: 是指在一個(gè)生物群體中,同時(shí)或經(jīng)常存在兩種或多種不連續(xù)的變異型或基因型(genotype)或等位基因(allele)。 Multiple functional alleles at a frequency of >1% in a population。33. Carrier genetic testing: 若疾病需要2個(gè)拷貝的基因才能表現(xiàn)性狀,則攜帶一個(gè)拷貝基因
18、的個(gè)體就是攜帶者,利用實(shí)驗(yàn)篩選攜帶者。 34. Null mutation: deletion of the whole gene35. Uniparental Disomy 單親二倍體: the two alleles came from only one parent (paternal or maternal)。 36. Mutable normal allele: Expansions of 27-35 CAG repeats never been associated with clinical symptoms of HD; however, his children are at
19、 some risk to inherit an allele with a larger allele size which could result in symptomatic HD. 37.heritability遺傳度:在多基因遺傳病中,易患性的高低受到遺傳因素和環(huán)境因素的雙重影響,其中遺傳因素所起作用的大小稱為遺傳度或遺傳率,一般用百分率表示。38.遺傳病:遺傳病是指由遺傳物質(zhì)發(fā)生改變而引起的或者是由致病基因所控制的疾病。遺傳病是指完全或部分由遺傳因素決定的疾病,常為先天性的,也可后天發(fā)病。如先天愚型、多指(趾)、先天性聾啞、血友病等。39.基因定位:將基因或有價(jià)值的DNA片段確定
20、于染色體的某一具體位置,在此基礎(chǔ)上便可繪制出人類基因圖。40.微衛(wèi)星標(biāo)記(microsatellite):又稱為短串聯(lián)重復(fù)序列(STRs),是均勻分布于真核生物基因組中的簡(jiǎn)單重復(fù)序列,由26個(gè)核苷酸的串聯(lián)重復(fù)片段構(gòu)成,由于重復(fù)單位的重復(fù)次數(shù)在個(gè)體間呈高度變異性且數(shù)量豐富,因此微衛(wèi)星標(biāo)記應(yīng)用非常廣泛。41.LOD值:確定兩個(gè)基因座是否在染色體上距離很近,因此可能一起遺傳的統(tǒng)計(jì)學(xué)評(píng)估,以確定兩個(gè)基因座或是按一定的重組率而相互連鎖的可能性或是互不連鎖的可能性;這兩種可能性之比,是基因座實(shí)際上為連鎖的可能性。42.癌基因oncogene:,癌基因是一類會(huì)引起細(xì)胞癌變的基因。其實(shí),癌基因有其正常的生物學(xué)
21、功能,主要是刺激細(xì)胞正常的生長(zhǎng),以滿足細(xì)胞更新的要求。只是當(dāng)癌基因發(fā)生突變后,才會(huì)在沒有接收到生長(zhǎng)信號(hào)的情況下仍然不斷地促使細(xì)胞生長(zhǎng)或使細(xì)胞免于死亡,最后導(dǎo)致細(xì)胞癌變。43.抑癌基因TSG:正常時(shí)起抑制細(xì)胞增殖和腫瘤發(fā)生的作用,它們的丟失、突變或失去功能,使激活的癌基因發(fā)揮作用而致癌。抑癌基因的產(chǎn)物是抑制細(xì)胞增殖,促進(jìn)細(xì)胞分化,和抑制細(xì)胞遷移,因此起負(fù)調(diào)控作用,通常認(rèn)為抑癌基因的突變是隱性的。44.細(xì)胞遺傳學(xué)(cytogenetics):是從細(xì)胞學(xué)的角度, 特別是從染色體的結(jié)構(gòu)和功能, 以及染色體和其他細(xì)胞器的關(guān)系來(lái)研究遺傳現(xiàn)象, 闡明遺傳和變異的機(jī)制。45.移碼突變(frame shift)
22、:在正常的DNA分子中,堿基缺失或增加非3的倍數(shù),造成這位置之后的一系列編碼發(fā)生移位錯(cuò)誤的改變,這種現(xiàn)象稱移碼突變。46.藥物遺傳學(xué)pharmacogenetics:研究遺傳因素對(duì)藥物代謝的影響,特別是遺傳因素引起的異常藥物反應(yīng)。47.寡基因oligogenic:一小部分基因共同作用所決定的性狀。A character that is determined by a small number of genes acting together.48.先天性代謝缺陷(inborn errors of metabolism)也稱遺傳性酶病(hereditary enzymopathy),指由于遺傳上
23、的原因(通常是基因突變)而造成的蛋白質(zhì)分子(一般指酶蛋白)結(jié)構(gòu)或數(shù)量的異常所引起的疾病。49.嵌合體chimera:遺傳學(xué)上有2個(gè)或多個(gè)基因型不同合子衍生出來(lái)的不同遺傳性狀嵌合或混雜表現(xiàn)的個(gè)體或器官;即一種含有兩種以上基因型組織的機(jī)體,可能是基因突變、染色體異常分離或移植的結(jié)果。An individual who is a mixture of cells from two or more genetically distinct populations of cells which have been derived from more than one zygote。50.鑲嵌性mosai
24、cism:體內(nèi)有從同一合子衍生出來(lái)的兩個(gè)或更多的不同基因型或核型的細(xì)胞系。An individual comprised of two or more genetically distinct populations of cells derived from a single zygote受精卵。51.germline mosaicism種系鑲嵌性:兩個(gè)或更多細(xì)胞系Two or more genetic or cytogenetic cell lines confined to the precursor (germline) cells of the egg or sperm; forme
25、rly called gonadal mosaicism. 52.微小嵌合現(xiàn)象Microchimerism:體內(nèi)存在少量來(lái)自另一個(gè)體的細(xì)胞。The presence of a small number of cells derived from another individual (transfusion, transplantation, twin, etc.)53.Dominant negative effect (A mutated gene encoding an altered protein) 某些信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白突變后不僅自身無(wú)功能,還能抑制或阻斷同一細(xì)胞內(nèi)的野生型信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白的作
26、用,這種作用被稱為顯性負(fù)效應(yīng)。機(jī)理是突變型蛋白和相關(guān)蛋白形成無(wú)功能的二聚體,野生型蛋白功能被抑制。54.Malformation (畸形) -is a morphologic defect of an organ, part of an organ, or a larger region of the body from an abnormal developmental process.55.Disruption (破裂) -is a morphologic defect of an organ, part of an organ, or a larger region of the bod
27、y resulting from breakdown of, or an interference with, an originally normal development process.56.Deformation (變形) -is an abnormal form, shape, or position of a part of the body caused by mechanical forces.57.Dysplasia (發(fā)育異常) -abnormal growth of a particular tissue.58.Epistatic effect(上位效應(yīng)): 影響同一性
28、狀的兩對(duì)非等位基因,其中一對(duì)基因(顯性或隱性的)抑制(或掩蓋)另一對(duì)顯性基因的作用時(shí)所表現(xiàn)的遺傳效應(yīng)。 即一對(duì)基因顯性基因的表現(xiàn)受到另一對(duì)非等位基因的作用,這種非等位基因間的抑制或遮掩作用叫上位效應(yīng)。起抑制作用的基因稱為上位基因,被抑制的基因稱為下位基因。(1) 顯性上位:一對(duì)基因中的顯性基因阻礙了其他對(duì)基因的作用。(2) 隱性上位:一對(duì)隱性基因?qū)α硪粚?duì)基因起阻礙作用時(shí)叫隱性上位。59.Tag SNPs:指能夠代表某一基因組區(qū)域的所有SNPs的最小子集,它們?cè)谌后w內(nèi)相互連鎖。Tag SNPs非常有用,因?yàn)樽钚∽蛹腟NPs的等位基因組成的單倍體能夠代表這一區(qū)域內(nèi)所有的單倍型。60.HapMap
29、: A set of haplotypes, defined by tag SNPs, distributed throughout the genome, used for association studies.61.二代測(cè)序技術(shù) massively parallel sequencing (MPS) technology OR next-generation sequencing OR second-generation sequencing OR high-throughput sequencing 62.Translational medicine: An effort to car
30、ry scientific knowledge "from bench to bedside," translational medicine builds on basic research advances - studies of biological processes using cell cultures, for example, or animal models - and uses them to develop new therapies or medical procedures.Answer questions ( 60 points )(注意任選5
31、題,請(qǐng)勿多選): 1.What are the effects of disease-causing mutations on function of gene product? a) Loss of functionb) Gain of functionc) Acquisition of novel propertyd) Abnormal expression: heterochronic(wrong time) or ectopic (wrong place) 2. How to identify and confirm a disease-causing gene? a) Disease
32、 gene can be identified by 2 major approaches: positional cloning and candidate geneb) Disease gene can be confirmed by segregation analysis, functional assay and animal study.3. What are the major types of Genetic Defects? Somatic cell genetic defects 體細(xì)胞 Multifactorial and polygenic defects 多因素和多基因=complex disorders Chromosomal genetic defects 染色體 Mi
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