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文檔簡介
1、會計學1MO真核生物的轉(zhuǎn)錄真核生物的轉(zhuǎn)錄(zhun l)與轉(zhuǎn)錄與轉(zhuǎn)錄(zhun l)調(diào)控調(diào)控第一頁,共102頁。酶位置轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物相對活性對-鵝膏蕈堿的敏感性RNA聚合酶核仁rRNA50-70%不敏感RNA聚合酶核質(zhì)hnRNA20-40%敏感RNA聚合酶核質(zhì)5S rRNA和tRNA約10%存在物種特異性真核細胞的三種RNA聚合酶特征(tzhng)比較第一節(jié)第一節(jié) 真核生物真核生物(shngw)的轉(zhuǎn)錄的轉(zhuǎn)錄第1頁/共101頁第二頁,共102頁。每種RNA聚合酶均含有12個或更多的不同亞基每種RNA聚合酶均含有類似于E.Coli core RNA polymerase的亞基,最大的兩個亞基彼此相似(x
2、in s),并與E.coli RNA聚合酶的和 亞基相似(xin s),其他亞基與E.coli 聚合酶中的a亞基具有同源性。另外還有五種亞基在這三種聚合酶中是共同的,剩下的其他的亞基是各種聚合酶所特有的。第2頁/共101頁第三頁,共102頁。不需要引物不需要引物,與細菌,與細菌(xjn)聚合聚合酶不同的是酶不同的是與與DNA結(jié)合結(jié)合時需要輔助時需要輔助因子因子第3頁/共101頁第四頁,共102頁。The largest subunit in RNA polymerase II has a CTD (carboxy-terminal domain) consisting of multiple
3、repeats of a septamer(七聚體). 羧基(su j)末端結(jié)構(gòu)域Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-SerRepeat 52 times in the mouse enzyme and 26 times in yeast重要的磷酸化現(xiàn)象重要的磷酸化現(xiàn)象(xinxing):ser,tyr 磷酸化發(fā)生在酶離開啟動子的延伸過程磷酸化發(fā)生在酶離開啟動子的延伸過程CTD 尾可與尾可與 mRNA加工因子發(fā)生相互作用,而對加工因子發(fā)生相互作用,而對mRNA的加工過程產(chǎn)生的加工過程產(chǎn)生直接或間接的影響直接或間接的影響(yngxing)。所以。所以CTD 尾在尾在mRNA轉(zhuǎn)錄和加工
4、的偶聯(lián)轉(zhuǎn)錄和加工的偶聯(lián)過程中發(fā)揮了重要作用。過程中發(fā)揮了重要作用。第4頁/共101頁第五頁,共102頁。第5頁/共101頁第六頁,共102頁。核仁的作用核仁的作用前前rRNArRNA由由RNARNA聚合酶聚合酶I I在核仁中合成。在核仁中合成。rRNArRNA基基因排列成環(huán)一起組成核仁,也就是因排列成環(huán)一起組成核仁,也就是(jish)(jish)熟知的核組織區(qū)域。熟知的核組織區(qū)域。第6頁/共101頁第七頁,共102頁。核心元件包括轉(zhuǎn)錄起始位點,跨越核心元件包括轉(zhuǎn)錄起始位點,跨越31到到6區(qū)域。這區(qū)域。這一序列為轉(zhuǎn)錄所必需的。一序列為轉(zhuǎn)錄所必需的。另一大約另一大約50一一80個堿基區(qū)域稱作個堿基
5、區(qū)域稱作(chn zu)上游控制上游控制元件元件(UCE),從起始上游大約,從起始上游大約100bp處處(100)起始。起始。與核心元件單獨作用相比,與核心元件單獨作用相比,UCE的存在使轉(zhuǎn)錄效率提高的存在使轉(zhuǎn)錄效率提高了了10100倍。倍。第7頁/共101頁第八頁,共102頁。第8頁/共101頁第九頁,共102頁。第9頁/共101頁第十頁,共102頁。選擇因子(選擇因子(SL1)與)與UBF-DNA復(fù)合物結(jié)合并復(fù)合物結(jié)合并使其穩(wěn)定,然后使其穩(wěn)定,然后RNA聚合酶聚合酶I結(jié)合,起始轉(zhuǎn)錄結(jié)合,起始轉(zhuǎn)錄(zhun l)SL1四亞基組成,包括四亞基組成,包括TATA結(jié)合蛋白(結(jié)合蛋白(TBP,為所有
6、,為所有RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄聚合酶轉(zhuǎn)錄(zhun l)起始所需起始所需)和)和RNA聚合酶聚合酶I特異的特異的TBP相關(guān)因子(相關(guān)因子(TAF)第10頁/共101頁第十一頁,共102頁。第11頁/共101頁第十二頁,共102頁。RNA聚合酶聚合酶III基因基因(jyn):5S與與tRNA基因基因(jyn)的轉(zhuǎn)錄的轉(zhuǎn)錄RNA聚合酶聚合酶III 核質(zhì)中,由核質(zhì)中,由16或更多亞基構(gòu)成,或更多亞基構(gòu)成,負責轉(zhuǎn)錄負責轉(zhuǎn)錄(zhun l)5S rRNA的前體,的前體,tRNA,其他,其他snRNA和胞質(zhì)和胞質(zhì)RNAtRNA基因基因 轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄(zhun l)控制區(qū)位于轉(zhuǎn)錄控制區(qū)位于轉(zhuǎn)錄(zhun l)單元內(nèi)的
7、轉(zhuǎn)錄單元內(nèi)的轉(zhuǎn)錄(zhun l)起始位點之后。起始位點之后。有兩個高度保守的序列,即有兩個高度保守的序列,即A框框(5TGGCNNAGTGG3 ) 和和B框框(5 GGTTCGANNCC3)。該序列同時也是編碼該序列同時也是編碼tRNA自身的重要序列,即編自身的重要序列,即編碼碼tRNA的的D環(huán)和環(huán)和TvC環(huán)。環(huán)。tRNA內(nèi)的高度保守序列內(nèi)的高度保守序列同時也是高度保守的啟動子同時也是高度保守的啟動子DNA 序列。序列。第12頁/共101頁第十三頁,共102頁。第13頁/共101頁第十四頁,共102頁。5S rRNA基因基因 基因串聯(lián)成簇,基因串聯(lián)成簇,啟動子含有啟動子含有(hn yu)2個保
8、守框:個保守框:C框位于起框位于起始位點下游始位點下游81-99個堿基個堿基處;處;A框位于起始位點框位于起始位點下游下游50-65個個bpTFIIIA結(jié)合在啟動子結(jié)合在啟動子C框后,框后,TIIIC與與TFIIIA-DNA復(fù)合體結(jié)合,并與復(fù)合體結(jié)合,并與A框結(jié)合,框結(jié)合,TFIIIB結(jié)合進來募集聚結(jié)合進來募集聚合酶,起始轉(zhuǎn)錄。合酶,起始轉(zhuǎn)錄。第14頁/共101頁第十五頁,共102頁。第15頁/共101頁第十六頁,共102頁。RNA聚合酶聚合酶II基因基因(jyn):啟動子與增:啟動子與增強子強子RNA聚合酶聚合酶II 催化所有編碼催化所有編碼(bin m)基因的基因的mRNA前體的合成。前體
9、的合成。RNA聚合酶聚合酶II轉(zhuǎn)錄的前轉(zhuǎn)錄的前mRNA須經(jīng)過加帽、加尾和剪接等加工過程須經(jīng)過加帽、加尾和剪接等加工過程順式作用順式作用(zuyng)(zuyng)元件元件定義:影響自身基因表達活性的非編碼定義:影響自身基因表達活性的非編碼DNADNA序列。序列。 例:例: 啟動子、增強子、沉默子等啟動子、增強子、沉默子等第16頁/共101頁第十七頁,共102頁。真核生物(shngw)啟動子的結(jié)構(gòu)核心(hxn)啟動子(core promoter)上游啟動子元件(upstream promoter element,UPE)(1)啟動子:在DNA分子(fnz)中,RNA聚合酶能夠識別、結(jié)合并導致轉(zhuǎn)錄
10、起始的序列。第17頁/共101頁第十八頁,共102頁。作用:選擇(xunz)正確的轉(zhuǎn)錄起始位點,保證精確起始TATA 常在-25bp左右,相當于原核的-10序列T T8585A A9797T T9393A A8585A A6363A A8383A A5050第18頁/共101頁第十九頁,共102頁。作用:控制(kngzh)轉(zhuǎn)錄起始頻率。CAAT:-70 - -80bpGGGCGG:-80 - -110bp第19頁/共101頁第二十頁,共102頁。增強子指能從啟動子的上游或下游數(shù)干個增強子指能從啟動子的上游或下游數(shù)干個bp處來激活轉(zhuǎn)錄處來激活轉(zhuǎn)錄(zhun l)的序列元件稱為增強子。的序列元件稱
11、為增強子。第20頁/共101頁第二十一頁,共102頁。 增強效應(yīng)與其位置和取向無關(guān),不論增強子以什么方向排列(53或35),甚至和靶基因(jyn)相距3 kb,或在靶基因(jyn)下游,均表現(xiàn)出增強效應(yīng);第21頁/共101頁第二十二頁,共102頁。An enhancer can activate a promoter from upstream or downstream locations, and its sequence can be inverted relative to the promoter第22頁/共101頁第二十三頁,共102頁。 增強效應(yīng)有嚴密的組織和細胞特異性,并擁有多
12、種基序。從極長的增強子元件到較短的啟動子元件,其內(nèi)(q ni)均存在一系列連續(xù)的調(diào)控元件。第23頁/共101頁第二十四頁,共102頁。 沒有基因?qū)R恍?,可以在不同的基因組合上表現(xiàn)(bioxin)增強效應(yīng); 許多增強子還受外部信號的調(diào)控(dio kn),如金屬硫蛋白的基因啟動區(qū)上游所帶的增強子,就可以對環(huán)境中的鋅、鎘濃度做出反應(yīng)。第24頁/共101頁第二十五頁,共102頁。第25頁/共101頁第二十六頁,共102頁。第26頁/共101頁第二十七頁,共102頁。第27頁/共101頁第二十八頁,共102頁。特征。特征。n以特定順序以特定順序在基本啟動在基本啟動子組裝,受子組裝,受不同水平調(diào)不同水平調(diào)
13、控控第28頁/共101頁第二十九頁,共102頁。nRNA聚合酶進入之后的結(jié)合因子聚合酶進入之后的結(jié)合因子(ynz) TFIIE,TFIIH和和TFIIJ,其,其中中TFIIH可使可使RNA聚合酶聚合酶II的羧基的羧基末端結(jié)構(gòu)域磷酸化,導致復(fù)合體形末端結(jié)構(gòu)域磷酸化,導致復(fù)合體形成。成。第29頁/共101頁第三十頁,共102頁。 真核生物轉(zhuǎn)錄(zhun l)起始復(fù)合物第30頁/共101頁第三十一頁,共102頁。5端加帽3端加尾RNA的剪接(jinji)RNA的編輯第31頁/共101頁第三十二頁,共102頁。第二節(jié)第二節(jié) 真核生物的轉(zhuǎn)錄真核生物的轉(zhuǎn)錄(zhun l)調(diào)控調(diào)控第32頁/共101頁第三十
14、三頁,共102頁。TFD(TATA)、CTF(CAAT)、SP1(GGGCGG)、HSF(熱激蛋白(dnbi)啟動區(qū)) 真核生物的轉(zhuǎn)錄因子真核生物的轉(zhuǎn)錄因子 與通用轉(zhuǎn)錄因子不與通用轉(zhuǎn)錄因子不同,通過與特定啟動子結(jié)構(gòu)如增強子的親和發(fā)現(xiàn),同,通過與特定啟動子結(jié)構(gòu)如增強子的親和發(fā)現(xiàn),先于特定先于特定DNA結(jié)合,然后激活轉(zhuǎn)錄。結(jié)合,然后激活轉(zhuǎn)錄。第33頁/共101頁第三十四頁,共102頁。第34頁/共101頁第三十五頁,共102頁。DNA結(jié)合結(jié)合(jih)結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)域轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄(zhun l)活化活化結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)域連接區(qū)一些轉(zhuǎn)錄因子還含有二聚體結(jié)構(gòu)域一些轉(zhuǎn)錄因子還含有二聚體結(jié)構(gòu)域第35頁/共1
15、01頁第三十六頁,共102頁。第36頁/共101頁第三十七頁,共102頁。 同源同源(tn yun)(tn yun)域域是一個是一個DNADNA結(jié)合域,它結(jié)合域,它由由6060個氨基酸組成,并個氨基酸組成,并形成形成3 3個個螺旋。螺旋。C C端的端的螺旋有螺旋有1717個氨基酸,個氨基酸,它結(jié)合它結(jié)合DNADNA大溝。同源大溝。同源(tn yun)(tn yun)域域N N端臂插端臂插入入DNADNA小溝。小溝。 含同源含同源(tn yun)(tn yun)域的蛋白質(zhì)可能是轉(zhuǎn)錄域的蛋白質(zhì)可能是轉(zhuǎn)錄的激活劑或阻抑物。的激活劑或阻抑物。1、螺旋、螺旋(luxun)-轉(zhuǎn)折轉(zhuǎn)折-螺旋螺旋(luxun
16、)(helix-turn-helix) 現(xiàn)廣泛分布在從酵母到人類的各種真核生物中現(xiàn)廣泛分布在從酵母到人類的各種真核生物中,雖彼此在氨基酸的順序上差別很大,但高級結(jié),雖彼此在氨基酸的順序上差別很大,但高級結(jié)構(gòu)高度構(gòu)高度(god)(god)保守。保守。第37頁/共101頁第三十八頁,共102頁。Helix 3 of the homeodomain binds in the major groove of DNA, with helices 1 and 2 lying outside the double helix. The N-terminal arm lies in the minor gro
17、ove, and makes additional contacts. 第38頁/共101頁第三十九頁,共102頁。配位鍵配位鍵2-9個個定義:是一種常出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白中的結(jié)構(gòu)(jigu)基元。是由一個含有大約30個氨基酸的環(huán)和一個與環(huán)上的4個Cys或2個Cys和2個His配位的Zn構(gòu)成,形成的結(jié)構(gòu)(jigu)像手指狀。 “鋅指鋅指”是根據(jù)其結(jié)構(gòu)命名的,其中一小段保守氨基酸與是根據(jù)其結(jié)構(gòu)命名的,其中一小段保守氨基酸與Zn2+結(jié)合,形成一個相對獨立的區(qū)域結(jié)合,形成一個相對獨立的區(qū)域(qy)。有兩類。有兩類DNA結(jié)合蛋白含有這種結(jié)構(gòu):結(jié)合蛋白含有這種結(jié)構(gòu): 1)經(jīng)典的)經(jīng)典的“鋅指鋅指”蛋白質(zhì)
18、蛋白質(zhì) 2)類因醇受體)類因醇受體第39頁/共101頁第四十頁,共102頁。第40頁/共101頁第四十一頁,共102頁。1)經(jīng)典)經(jīng)典(jngdin)的的“鋅指鋅指”蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)典型典型“鋅指蛋白鋅指蛋白(dnbi)”(dnbi)”含有一連含有一連串鋅指。串鋅指。單個鋅指共有序列如下圖所示:單個鋅指共有序列如下圖所示:Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2- Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2- His-X3-His His-X3-His 稱為稱為Cys2/His2Cys2/His2鋅指。鋅指。轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄因子SP1 (GC盒)盒) 、連續(xù)連續(xù)(li
19、nx)的的3個鋅指重復(fù)個鋅指重復(fù)結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)。 第41頁/共101頁第四十二頁,共102頁。謹慎理解鋅指存在的意義:謹慎理解鋅指存在的意義: 尤其是蛋白質(zhì)僅含有單個尤其是蛋白質(zhì)僅含有單個鋅指時,鋅指可能鋅指時,鋅指可能(knng)參與參與RNA的結(jié)合而不是的結(jié)合而不是DNA結(jié)合,或它與任何核酸結(jié)合結(jié)合,或它與任何核酸結(jié)合活性均無關(guān)?;钚跃鶡o關(guān)。第42頁/共101頁第四十三頁,共102頁。2 2)類)類固固醇受體醇受體 類固醇受體(類固醇受體( Steroid receptorsSteroid receptors)是配體應(yīng)答)是配體應(yīng)答的激活劑的激活劑, ,它通過結(jié)合類固醇(或其他相關(guān)分子)它通過
20、結(jié)合類固醇(或其他相關(guān)分子)而激活。它們有獨立的而激活。它們有獨立的DNADNA結(jié)合域和配體結(jié)合域。結(jié)合域和配體結(jié)合域。 類固醇受體的類固醇受體的DNADNA結(jié)合域是一類結(jié)合域是一類(y li)(y li)鋅指鋅指: Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys 被稱為被稱為Cys2/ Cys2Cys2/ Cys2鋅指。鋅指。 如糖皮質(zhì)激素受體和雌激素受體各含兩個鋅指。如糖皮質(zhì)激素受體和雌激素受體各含兩個鋅指。第43頁/共101頁第四十四頁,共102頁。配體的結(jié)合配體的結(jié)合(jih)使得受體(如類固醇受體)能夠結(jié)合使得受體(如類固醇受體
21、)能夠結(jié)合(jih)應(yīng)應(yīng)答元件:答元件:配體結(jié)合配體結(jié)合(jih)于受體的于受體的C端結(jié)構(gòu)域,提高了端結(jié)構(gòu)域,提高了DNA結(jié)合結(jié)合(jih)域域?qū)NA特異靶位點的親和力。特異靶位點的親和力。第44頁/共101頁第四十五頁,共102頁。二聚體結(jié)構(gòu)域二聚體結(jié)構(gòu)域亮氨酸之間相互作用形成亮氨酸之間相互作用形成二 聚 體 , 形 成二 聚 體 , 形 成 “ 拉 鏈拉 鏈(llin)” 。肽鏈氨基端肽鏈氨基端2030個富含個富含堿性氨基酸結(jié)構(gòu)域與堿性氨基酸結(jié)構(gòu)域與DNA結(jié)結(jié)合。合。第45頁/共101頁第四十六頁,共102頁。這類蛋白質(zhì)的這類蛋白質(zhì)的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域?qū)嶋H是以堿性區(qū)結(jié)合結(jié)構(gòu)域?qū)嶋H是以堿性
22、區(qū)和亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)域整體和亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)域整體(zhngt)作為基礎(chǔ)的。作為基礎(chǔ)的。這種基序含有這種基序含有4-8個亮氨酸,每兩個個亮氨酸,每兩個(lin )亮氨酸由亮氨酸由6個氨基酸間隔。個氨基酸間隔。第46頁/共101頁第四十七頁,共102頁。DNA結(jié)合蛋白結(jié)合蛋白(dnbi)有兩個共有兩個共同特征,即存在結(jié)同特征,即存在結(jié)合合DNA的螺旋區(qū)的螺旋區(qū)和形成蛋白和形成蛋白(dnbi)質(zhì)二聚體質(zhì)二聚體的能力。螺旋的能力。螺旋-環(huán)環(huán)-螺旋蛋白螺旋蛋白(dnbi)同時具有這兩特征同時具有這兩特征。第47頁/共101頁第四十八頁,共102頁。(2) 反式作用因子(ynz)中的轉(zhuǎn)錄激活域第48頁/共1
23、01頁第四十九頁,共102頁。第49頁/共101頁第五十頁,共102頁。第50頁/共101頁第五十一頁,共102頁。第51頁/共101頁第五十二頁,共102頁?;钚詠黹g接(jin ji)阻斷轉(zhuǎn)錄因子的活動,n或者本身就含有一個特定的直接阻抑的結(jié)構(gòu)域第52頁/共101頁第五十三頁,共102頁。n yu)3個個鋅鋅指指結(jié)結(jié)構(gòu)構(gòu)和和2個個富富含含谷谷氨氨酰酰胺胺轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)錄錄激激活活域。域。第53頁/共101頁第五十四頁,共102頁。轉(zhuǎn)錄調(diào)控(dio kn)舉例2第54頁/共101頁第五十五頁,共102頁。激活目標蛋激活目標蛋白表達白表達轉(zhuǎn)錄(zhun l)調(diào)控舉例3第55頁/共101頁第五十六頁,共10
24、2頁。第三節(jié)第三節(jié) RNA加工加工(ji gng)與核糖核蛋白復(fù)合體與核糖核蛋白復(fù)合體 RNA processing and RNPsRNA processing and RNPs發(fā)生在轉(zhuǎn)錄過程中和轉(zhuǎn)錄后,新合成發(fā)生在轉(zhuǎn)錄過程中和轉(zhuǎn)錄后,新合成的的RNARNA分子分子(fnz)(fnz)在結(jié)構(gòu)和化學方面的成在結(jié)構(gòu)和化學方面的成熟。熟。 第56頁/共101頁第五十七頁,共102頁。第57頁/共101頁第五十八頁,共102頁。ClassFunctionPositionhnRNA成熟mRNA的前體核內(nèi)snRNA參與hnRNA的剪接、轉(zhuǎn)運核內(nèi)scRNA蛋白質(zhì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位合成的信號識別體的組成成分胞內(nèi)rR
25、NA核蛋白體組成成分tRNA轉(zhuǎn)運氨基酸mRNA蛋白質(zhì)合成模板第58頁/共101頁第五十九頁,共102頁。nDeletion: 5-leader, 3-tail, intronnAddition: 5-cap, 3-poly(A), editingnModification: methylation第59頁/共101頁第六十頁,共102頁。第60頁/共101頁第六十一頁,共102頁。第61頁/共101頁第六十二頁,共102頁。第62頁/共101頁第六十三頁,共102頁。第63頁/共101頁第六十四頁,共102頁。第64頁/共101頁第六十五頁,共102頁。第65頁/共101頁第六十六頁,共102
26、頁。第66頁/共101頁第六十七頁,共102頁。第67頁/共101頁第六十八頁,共102頁。第68頁/共101頁第六十九頁,共102頁。第69頁/共101頁第七十頁,共102頁。1) 前體形成莖環(huán)結(jié)構(gòu).;2)內(nèi)切酶的識別切除(qich)5/端16 nt和3/端2nt.3核苷轉(zhuǎn)移酶,在3/端加上, 5/-CCA-3/結(jié)構(gòu).;4)切除(qich)內(nèi)合子再連接.第70頁/共101頁第七十一頁,共102頁。核糖核酸核糖核酸(h tn h sun)酶酶P和核酶和核酶RnaseP核酶核酶: 可催化特定反應(yīng)的可催化特定反應(yīng)的RNA分子。細胞內(nèi)蛋白有助分子。細胞內(nèi)蛋白有助于催化,鎂離子可提高活性于催化,鎂離子
27、可提高活性RNaseP內(nèi)切核酸酶;內(nèi)含子的自我剪接內(nèi)切核酸酶;內(nèi)含子的自我剪接利用人工設(shè)計核酶可體內(nèi)剪切利用人工設(shè)計核酶可體內(nèi)剪切mRNA分子抑制轉(zhuǎn)錄分子抑制轉(zhuǎn)錄(zhun l)表達,組織病毒復(fù)制、殺死癌細胞及基因表達,組織病毒復(fù)制、殺死癌細胞及基因失活失活.第71頁/共101頁第七十二頁,共102頁。mRNA加工加工(ji gng)hnRNP和和SnRNP 第72頁/共101頁第七十三頁,共102頁。snRNP 顆粒(kl)參與(cny)前mRNA的剪接和rRNA 甲基化位點的確定第73頁/共101頁第七十四頁,共102頁。55端加帽端加帽第74頁/共101頁第七十五頁,共102頁。第75頁
28、/共101頁第七十六頁,共102頁。第76頁/共101頁第七十七頁,共102頁。多聚腺苷酸尾巴(wi ba)AAUAAA:準確(zhnqu)切割加poly(A)第77頁/共101頁第七十八頁,共102頁。第78頁/共101頁第七十九頁,共102頁。第79頁/共101頁第八十頁,共102頁。地中海貧血病人(bngrn)的珠蛋白基因,1/4切除內(nèi)含子將外含子連接在一起的過程,發(fā)生(fshng)在核內(nèi),mRNA成熟后轉(zhuǎn)錄到胞質(zhì)第80頁/共101頁第八十一頁,共102頁。第81頁/共101頁第八十二頁,共102頁。mRNA splicing: Two-stepFirst, the bond in fr
29、ont of the G at the 5-end of the intron at the so-called 5-splice site is attacked by the 2-hydroxyl group of the A residue of the branchpoint sequence to creat a tailed circular molecule called a lariat and free exon 1. in the second step, cleavage at 3-splice site occurs after the G of the AG, as
30、the two exon sequences are joined togather. The intron is released in the lariat from and is eventually degraded. 第82頁/共101頁第八十三頁,共102頁。mRNA splicing is accomplished through small RNAs (U1, U2, U4, U5 and U6) and associated proteins (snRNPs) which form a complex called the splicesome. First, U1 bind
31、s to the 5-splice site and the U2 binds to the branchpoint. The tri-snRNP compex of U4, U5 and U6 can the bind, and in so doing the intron is looped out and the 5- and 3exons are brought into close proximity. mRNA splicing:snRNPU1U1U2U2U2U2U2Molecular BiologyMolecular Biology第83頁/共101頁第八十四頁,共102頁。 5
32、.AGGUAAGU .CURAY.(10-40)(U/C)11NCAG G.3 Intronexonexon多聚嘧啶多聚嘧啶(m dn)AG前一位核苷酸影響剪接前一位核苷酸影響剪接(jinji)效率,存在剪效率,存在剪接接(jinji)競爭競爭CAG = UAG AAG GAG生物體內(nèi)內(nèi)含子的主要(zhyo)類型:GU-AG、AU-AC、類內(nèi)含子、類內(nèi)含子第84頁/共101頁第八十五頁,共102頁。第85頁/共101頁第八十六頁,共102頁。第86頁/共101頁第八十七頁,共102頁。2021-12-488第87頁/共101頁第八十八頁,共102頁。第88頁/共101頁第八十九頁,共102頁。
33、Patterns of Alternative Splicing(A) A cassette exon is defined as a regulated exon that is either included in the mRNA or excluded. (B) Alternative 5 site. (C) Alternative 3 site. (D) Alternative initiation. (E) Alternative polyadenylation. (F) Intron retention. (G) Mutually exclusive exons. (H) Others 第89頁/共101頁第九十頁,共102頁。2021-12-491第90頁/共101頁第九十一頁,共102頁。RNA editingAn unusal form of RNA processing in which the sequence of the primary transcrip
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