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文檔簡介
1、生化技術(shù)思考題1. *生物大分子制備的主要特點?與化學產(chǎn)品的分離相比較:1) 蛋白質(zhì)的組成、結(jié)構(gòu)極其復(fù)雜,分子差異大導致分離、純化和鑒定有難度和特殊性;核酸較之要簡單。2) 通常以復(fù)合物的形式存在,提取分離困難。3) 許多生物大分子離開了生物體環(huán)境就極易失活,因此分離過程中如何防止其失活,是生物大分子提取制備最困難之處。4) 許多生物大分子在生物材料中的含量極微,分離純化的步驟繁多,流程長。5) 生物材料的組成極其復(fù)雜,常常包含有數(shù)百種乃至幾千種化合物,方法的通用性較差。2. 影響抽提的主要因素有哪些?1) PH(堿性物質(zhì)易溶于酸性溶劑,酸性物質(zhì)易溶于堿性物質(zhì));2) 溶劑的極性和離子強度(極
2、性物質(zhì)易溶于極性溶劑,非極性物質(zhì)易溶于非極性溶劑);3) 水解酶(組織細胞破壞后均會釋放水解酶降解生物大分子,故需加入抑制劑或調(diào)節(jié)提取液的PH等方法使水解酶失去活性);4) 溫度(溫度升高,溶解度加大);5) 攪拌(采用溫和的攪拌促使提取物的溶解);6) 氧化(一般在提取液中加入少量巰基乙醇或半胱氨酸以防止蛋白質(zhì)中的巰基氧化);7) 金屬離子;8) 抽提液與抽提物的比例(一般以5:1為宜)。3. *分離純化方法主要有哪幾類?1) 以分子大小和形態(tài)的差異為依據(jù)的方法:差速離心、區(qū)帶離心、超濾、透析和凝膠過濾等。2) 以溶解度的差異為依據(jù)的方法:鹽析、萃取、分配層析、選擇性沉淀和結(jié)晶等。3) 以電
3、荷差異為依據(jù)的方法:電泳、電滲析、等電點沉淀、吸附層析和離子交換層析等。4) 以生物學功能專一性為依據(jù)的方法:親和層析等。(1)沉淀法:鹽析,有機溶劑沉淀,選擇性沉淀;(2)層析技術(shù):吸附層析,疏水層析,離子交換層析,親和層析,聚焦層析,凝膠層析;(3)快速制備型液相色譜以及等電聚焦制備電泳;(4)離心。4. 早期分離純化的特點和要求?1) 特點:a) 粗提取液中物質(zhì)成份十分復(fù)雜b) 欲制備的生物大分子濃度很稀c) 物理化學性質(zhì)相近的物質(zhì)很多d) 希望能除去大部分與目的產(chǎn)物物理化學性質(zhì)差異大的雜質(zhì)2) 要求:a) 要快速、粗放b) 能較大地縮小體積c) 分辨力不必太高d) 負荷能力要大5. *
4、鹽析法的優(yōu)點?鹽析的影響因素?1) 優(yōu)點:a) 成本低,不需要特別昂貴的設(shè)備。b) 操作簡單、安全。c) 對許多生物活性物質(zhì)具有穩(wěn)定作用。2) 影響因素(主要與鹽析常數(shù)Ks有關(guān)):a) 蛋白質(zhì)的種類:蛋白質(zhì)的種類不同,Ks值會有所不同;分子量越大,沉淀所需鹽的量越少; 蛋白質(zhì)分子不對稱性越大,越容易沉淀。b) 蛋白質(zhì)的初始濃度:0.2%到2%較適宜。c) 無機鹽種類:陰離子鹽析作用順序:檸檬酸鹽>PO43>SO42>CH3COO>Cl>NO3>SCN陽離子鹽析作用順序(一價):NH4+>K+>Nad) 溫度:(0到4)在高離子強度溶液中,升高溫度
5、有利于蛋白質(zhì)的失水,使之溶解度下降。在低離子強度溶液或純水中,蛋白質(zhì)的溶解度在一定溫度范圍內(nèi)一般隨溫度升高而增大。e) pH值:在接近蛋白質(zhì)等電點(PI)的溶液中進行鹽析有利于蛋白質(zhì)的沉淀。需要注意在高鹽溶液中蛋白質(zhì)的等電點會發(fā)生偏移。6. 影響帶點顆粒在電場中泳動速度的因子有哪些?(1)顆粒的理化性質(zhì):電荷、直徑、形狀等;(2)電場強度:電場強度越大,帶點顆粒的泳動速度越快;(3)溶液性質(zhì):PH、離子強度、溶液粘度等;(4)電滲;(5)焦耳熱;(6)篩孔:篩孔越大,泳動速度越快;7. 為什么不連續(xù)系統(tǒng)或連續(xù)系統(tǒng)的聚丙烯酰胺凝膠電泳比瓊脂糖電泳分辨率高?瓊脂糖凝膠孔徑大,僅對少數(shù)蛋白質(zhì)有篩分效
6、應(yīng);而不連續(xù)凝膠電泳中,集濃縮、分子篩和電荷效應(yīng)為一體,且孔徑大小可以調(diào)節(jié)。8. 配15%聚丙烯酰胺凝膠溶液10ml,問需要丙烯酰胺和雙丙烯酰胺各多少克?a:b=19:1,所以單體為1.425g,雙體為0.075g。9. 哪些因子影響聚丙烯酰胺凝膠的化學聚合速度?預(yù)電泳的目的是什么?預(yù)電泳時應(yīng)注意哪些因素? 聚合影響因素:1.大氣氧能淬滅自由基,阻止多聚體鏈長的增加。在進行化學聚合前,在膠液表面,往往覆蓋一層水或溶液,隔絕空氣,可加速聚合。2.低溫會減慢聚合反應(yīng)速度。3.有些材料如聚丙烯酸甲酯有機玻璃,一些金屬等可抑制聚合反應(yīng)。預(yù)電泳目的:除AP、未聚合丙烯酰胺、雜質(zhì)。(除AP以免它使某些欠穩(wěn)
7、定的樣品失活或產(chǎn)生意外的影響;另外,除去未聚合的丙烯酸以及能吸收紫外光的雜質(zhì)為確保電泳參數(shù)的恒定)注意事項:1.上下電極槽中均加入分離膠緩沖液,預(yù)電泳的電流為3mA/管,時間需30分鐘2小時。2.預(yù)電泳不能在制好濃縮膠后進行 3.不能用電極緩沖液進行,不然會破壞不連續(xù)系統(tǒng),而使?jié)饪s效應(yīng)失效。10. 簡述瓊脂糖凝膠電泳、不連續(xù)聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)、電聚焦、 SDS-PAGE的一般原理及方法。(1) 瓊脂糖凝膠電泳原理:借助瓊脂糖凝膠的分子篩作用,核酸片段因其分子量或分子形狀不同,電泳移動速度有差異而分離。方法:1.適合的電泳緩沖液;2.制備瓊脂糖凝膠;3.加樣;4.電泳的合適電壓和溫度
8、; 5.染色;6.凝膠成像.(二)不連續(xù)聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE): 原理:(1)聚丙烯酰胺凝膠合成:1. 丙烯酰胺和雙丙烯酰胺含量的確定2. 丙烯酰胺的聚合 (2)分離效應(yīng):濃縮效應(yīng)、電荷效應(yīng)、分子篩效應(yīng) 方法 擺好玻璃管 制備分離膠 預(yù)電泳:除AP、未聚合丙烯酰胺、雜質(zhì) 制備濃縮膠 加樣:濃縮膠緩沖液+樣本+蔗糖/甘油+指示劑 電泳:先低電流,樣品進膠后,調(diào)至所需電流 取膠 固定和譜帶檢測 遷移率測定 譜帶保存(三)SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳 (SDS-PAGE)原理:SDS是陰離子表面活性劑,能斷裂蛋白質(zhì)分子內(nèi)和分子間的氫鍵,破壞蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu),并與蛋白質(zhì)結(jié)合形成SDS-蛋白復(fù)合物,
9、蛋白質(zhì)分子即帶大量的負電荷,并遠遠超過原來所帶的電荷,使天然蛋白質(zhì)分子之間的電荷差別降低,甚至可以忽略。因此,排除了蛋白質(zhì)的電荷和結(jié)構(gòu)差異,SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物在電泳時的泳動差異就由蛋白質(zhì)的分子量所決定。方法 凝膠的制備:用0.1% SDS-0.1mol/L磷酸鈉緩沖液配置 樣品制備:樣品溶于2% SDS- 0.1%巰基乙醇-0.01mol/L磷酸鈉緩沖液 電泳條件:電極液(0.1% SDS-0.1mol/L磷酸鈉緩沖液,pH7.2) 固定與染色:考馬斯亮藍(四)電聚焦:原理:利用各種蛋白質(zhì)pI不同,以聚丙烯酰胺凝膠為電泳支持物,并在其中加入兩性電解質(zhì)載體,兩性電解質(zhì)載體在電場作用下,按各自p
10、I形成從陽極到陰極逐漸增加的連續(xù)pH梯度。蛋白質(zhì)是兩性電解質(zhì),其pI有差異,電泳時分別聚焦于支持物上pH等于各自pI的區(qū)域。方法:a.凝膠配制(不考慮分子篩效應(yīng),同時加入一定PH范圍的載體兩性電解質(zhì));b加樣;c聚焦(陽極液酸性;陰極液堿性);d固定與染色;e樣品PH的測定;f蛋白質(zhì)的洗脫、定量;gpI的測定。11. 幾種常見的蛋白電泳。常見的核酸電泳。蛋白質(zhì)電泳:1.聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE); 2SDS-PAGE:常用于蛋白質(zhì)分子量的測定; 3.等電聚焦電泳(IEF):通過蛋白質(zhì)PI差異分離; 4.雙向電泳:蛋白質(zhì)組學研究的重要技術(shù)。核酸電泳:1.瓊脂糖凝膠電泳; 2.PAGE(分離只
11、有幾個bp差別的核酸)12. 轉(zhuǎn)移電泳有哪幾類?各有何用途?1.Southern blot 檢測DNA片段2.Northern blot 檢測RNA片段3.Western blot 蛋白質(zhì)印跡4.Eastern bolt 雙向蛋白質(zhì)印跡法13. 層析的分類?1) 根據(jù)固定相“床”的形式分類,層析可以分為柱層析、薄層層析、紙層析和薄膜層析。紙層析是指以濾紙作為基質(zhì),點樣后用流動相展開,使各組分分離。薄層層析是將適當粘度的固定相均勻涂鋪在薄板上,點樣后用流動相展開,使各組分分離。柱層析則是指將固定相填裝在管中形成柱形,在柱中進行層析。薄膜層析是將適當?shù)母叻肿佑袡C吸附劑制成薄膜,以類似紙層析的方法進
12、行物質(zhì)的分離。2) 根據(jù)流動相的形式分類,層析可以分為液相層析和氣相層析。氣相層析是指流動相為氣體的層析,而液相層析指流動相為液體的層析。3) 根據(jù)分離的原理不同分類,層析主要可以分為吸附層析、分配層析、凝膠過濾層析、離子交換層析、親和層析等。吸附層析是以吸附劑為固定相,根據(jù)待分離物與吸附劑之間吸附力不同而達到分離目的的一種層析技術(shù)。分配層析是根據(jù)在一個有兩相同時存在的溶劑系統(tǒng)中,不同物質(zhì)的分配系數(shù)不同而達到分離目的的一種層析技術(shù)。凝膠過濾層析是以具有網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠顆粒作為固定相,根據(jù)物質(zhì)的分子大小進行分離的一種層析技術(shù)。離子交換層析是以離子交換劑為固定相,根據(jù)物質(zhì)的帶電性質(zhì)不同而進行分離的一
13、種層析技術(shù)。親和層析是根據(jù)生物大分子和配體之間的特異性親和力(如酶和抑制劑、抗體和抗原、激素和受體等),將某種配體連接在載體上作為固定相,而對能與配體特異性結(jié)合的生物大分子進行分離的一種層析技術(shù)。親和層析是分離生物大分子最為有效的層析技術(shù),具有很高分辨率。14. 凝膠層析中分離系數(shù)與洗脫體積及分子的關(guān)系?對某物質(zhì)在凝膠柱內(nèi)洗脫體積Ve、Vo和Vi之間的關(guān)系可用下式表示: VeVoKd*Vi 可改寫為: (Ve-Vo) Kd = Vi當Kd0時,Ve=Vo,說明這種溶質(zhì)相對分子質(zhì)量大,完全不能進入凝膠顆粒微孔內(nèi),被排阻于凝膠顆粒之外而最先洗脫下來;當Kd1時,即Ve小分子 VoVi= Vt ,說
14、明這種溶質(zhì)的相對分子質(zhì)量小,完全向凝膠顆粒內(nèi)擴散,在洗脫過程中將最后流出柱外。當0Kdl時,意味著溶質(zhì)分子只有部分向凝膠顆粒內(nèi)擴散,Kd愈大,進入凝膠顆粒內(nèi)的程度愈大,分子量介于二者之間的分子,它們的洗脫體積也介于二者之間。15. 不同原理層析中K值代表的含義?v 吸附層析中K值表示吸附平衡常數(shù)v 分配層析中K值表示分配系數(shù)v 離子交換層析中K表示交換常數(shù)v 親和層析中K表示親和常數(shù)16. K 值與那些因素有關(guān),其大小代表的含義? 被分離物質(zhì)本身的性質(zhì) 固定相和流動相的性質(zhì) 層析柱的溫度。v K值大表示其溶質(zhì)在固定相中濃度大,在洗脫過程中溶質(zhì)出現(xiàn)較晚v K值小表示某溶質(zhì)在流動相中濃度大,故在洗
15、脫液中出現(xiàn)較早v 有相似的K值,則表明兩組分層析峰會發(fā)生重疊,分離效果差17. 概述哪些因素影響離子交換劑的工作交換容量,為什么?工作交換容量,表示樹脂在某一定條件下的離子交換能力,它與樹脂種類和總交換容量,以及具體工作條件如溶液的組成、流速、溫度等因素有關(guān)。18. *影響凝膠過濾分離效果的有哪些因素,為什么?凝膠層析的固定相是惰性的珠狀凝膠顆粒,凝膠顆粒的內(nèi)部具有立體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),形成很多孔穴。當含有不同分子大小的組分的樣品進入凝膠層析柱后,各個組分就向固定相的孔穴內(nèi)擴散,組分的擴散程度取決于孔穴的大小和組分分子大小。影響凝膠過濾分離效果的因素:樣品體積和柱體積之間的比值、流速、柱子直徑、顆粒大
16、小及分布、裝柱密度、顆粒的孔洞以及流動相的粘性。(1)層析柱的選擇:層析柱大小主要是根據(jù)樣品量的多少以及對分辨率的要求來進行選擇。一般來講,主要是層析柱的長度對分辨率影響較大,長的層析柱分辨率要比短的高;但層析柱長度不能過長,否則會引起柱子不均一、流速過慢等實驗上的一些困難。(2)凝膠柱的鑒定:凝膠柱的填裝情況將直接影響分離效果,凝膠柱填裝后用肉眼觀察應(yīng)均勻、無紋路、無氣泡.(3)洗脫液的選擇:在凝膠層析中流動相只是起運載工具的作用,一般不依賴于流動相性質(zhì)和組成的改變來提高分辨率.凝膠層析洗脫液的選擇不那么嚴格,為了防止凝膠可能有吸附作用,一般洗脫液都含有一定濃度的鹽。(4)加樣量:要盡量快速
17、、均勻.加樣過多,會造成洗脫峰的重疊,影響分離效果;加樣過少,提純后各組分量少、濃度較低,實驗效率低。(5)洗脫速度:一般洗脫速度要恒定而且合適,洗脫速度過慢會造成樣品擴散加劇、區(qū)帶變寬,反而會降低分辨率,而且實驗時間會大大延長.提高分辨率的選擇應(yīng)主要包括:選擇包括各個待分離組分但分離范圍盡量小一些的凝膠,選擇顆粒小的凝膠,選擇分辨率高的凝膠類型,選擇較長、直徑較大的層析柱、減少加樣量、降低洗脫速度等等。19. *離子交換劑有哪幾部分組成?何謂陽離子和陰離子交換劑?離子交換劑是由基質(zhì)、電荷基團(或功能基團)和反離子構(gòu)成。將離子交換劑按活性基團分,可分為陽離子交換劑(cation exchang
18、e)(含酸性基團,具有陽離子交換功能)和陰離子交換劑(anion exchange)(含堿性基團,具有陰離子交換功能)。各類交換劑根據(jù)其解離性大小,具體又可以分為: 強、中、弱陽和強、中、弱陰。20. 實用的離子交換劑應(yīng)足那些要求?(1)有高度的不溶性,在各種溶劑中進行交換時,不發(fā)生溶解;(2)有疏松的多孔結(jié)構(gòu)或巨大的表面積,使交換離子能在交換劑中進行自由擴散和交換;(3)有較多的交換基團;(4)有穩(wěn)定的物理化學性質(zhì),在使用過程中,不因物理或化學因子的變化而發(fā)生分解或變形等現(xiàn)象。1 空氣:空氣的影響主要是潮解、微生物污染和自動氧化。空氣中微生物的污染可使樣品腐敗變質(zhì),樣品吸濕后會引起潮解變性,
19、同時也為微生物污染提供了有利的條件。某些樣品與空氣中的氧接觸會自發(fā)引起游離基鏈式反應(yīng),還原性強的樣品易氧化變質(zhì)和失活,如維生素C、巰基酶等。溫度:每種生物大分子都有其穩(wěn)定的溫度范圍,溫度升高10,氧化反應(yīng)約加快數(shù)倍,酶促反應(yīng)增加13倍。因此通常絕大多數(shù)樣品都是低溫保存,以抑制氧化、水解等化學反應(yīng)和微生物的生成。水份:包括樣品本身所帶的水份和由空氣中吸收的水份。水可以參加水解、酶解、水合和加合。加速氧化、聚合、離解和霉變。光線:某些生物大分子可以吸收一定波長的光,使分子活化不利于樣品保存,尤其日光中的紫外線能量大,對生物大分子制品影響最大,樣品受光催化的反應(yīng)有變色、氧化和分解等,通稱光化作用。因
20、此樣品通常都要避光保存。樣品的pH:保存液態(tài)樣品時注意其穩(wěn)定的pH范圍,通??蓮奈墨I和手冊中查得或做實驗求得,因此正確選擇保存液態(tài)樣品的緩沖劑的種類和濃度就十分重要。時間:生化和分子生物學樣品不可能永久存活,不同的樣品有其不同的有效期,因此,保存的樣品必須寫明日期,定期檢查和處理。層析;根據(jù)待分離混合物中各組分理化性質(zhì)的差異,使各組分以不同程度分布在固定相和流動相中,由于各組分在流動相中的遷移速度不同,從而得到有效分離的一類物理分離方法分配系數(shù);在一定條件下(如溫度、壓力)某種組分在固定相和流動相中含量的比值,分配系數(shù)是層析中分離純化物質(zhì)的主要依據(jù),常用K表示遷移率;在一定條件下,在相同的時間
21、內(nèi)某一組分在固定相中移動的距離與流動相本身移動距離的比值,常用Rf表示。親和層析;親和層析是一種吸附層析,抗原(或抗體)和相應(yīng)的抗體(或抗原)發(fā)生特異性結(jié)合,而這種結(jié)合在一定的條件下又是可逆的。所以將抗原(或抗體)固相化后,就可以使存在液相中的相應(yīng)抗體(或抗原)選擇性地結(jié)合在固相載體上,借以與液相中的其他蛋白質(zhì)分開,達到分離提純的目的內(nèi)水體積;凝膠顆粒中空穴的體積,凝膠層析中固定相的體積。柱床體積;凝膠柱所能容納的總體積排阻極限;不能進入凝膠顆??昭▋?nèi)部的最小分子量交換容量;指離子交換劑與溶液中離子或離子化合物進行交換的能力。交換容量是表征樹脂交換能力的重要參數(shù),其表示方法有質(zhì)量交換容量(mm
22、ol/g干樹脂)和體積交換容量(mmolmL樹脂)交聯(lián)度; 表示離子交換樹脂中交聯(lián)劑的含量。交聯(lián)度越大,凝膠的網(wǎng)結(jié)構(gòu)越緊密,吸水后膨脹越小,能分離的分子量越小,反之交聯(lián)度越小,網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)愈疏松,吸水后膨脹越大1、 層析的分類?根據(jù)固定相“床”的形式分類,層析可以分為柱層析、薄層層析、紙層析和薄膜層析。紙層析是指以濾紙作為基質(zhì),點樣后用流動相展開,使各組分分離。薄層層析是將適當粘度的固定相均勻涂鋪在薄板上,點樣后用流動相展開,使各組分分離。柱層析則是指將固定相填裝在管中形成柱形,在柱中進行層析。薄膜層析是將適當?shù)母叻肿佑袡C吸附劑制成薄膜,以類似紙層析的方法進行物質(zhì)的分離。根據(jù)流動相的形式
23、分類,層析可以分為液相層析和氣相層析。氣相層析是指流動相為氣體的層析,而液相層析指流動相為液體的層析。根據(jù)分離的原理不同分類,層析主要可以分為吸附層析、分配層析、凝膠過濾層析、離子交換層析、親和層析等。吸附層析是以吸附劑為固定相,根據(jù)待分離物與吸附劑之間吸附力不同而達到分離目的的一種層析技術(shù)。分配層析是根據(jù)在一個有兩相同時存在的溶劑系統(tǒng)中,不同物質(zhì)的分配系數(shù)不同而達到分離目的的一種層析技術(shù)。凝膠過濾層析是以具有網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠顆粒作為固定相,根據(jù)物質(zhì)的分子大小進行分離的一種層析技術(shù)。離子交換層析是以離子交換劑為固定相,根據(jù)物質(zhì)的帶電性質(zhì)不同而進行分離的一種層析技術(shù)。親和層析是根據(jù)生物大分子和配體
24、之間的特異性親和力(如酶和抑制劑、抗體和抗原、激素和受體等),將某種配體連接在載體上作為固定相,而對能與配體特異性結(jié)合的生物大分子進行分離的一種層析技術(shù)。親和層析是分離生物大分子最為有效的層析技術(shù),具有很高分辨率。2、 影響凝膠過濾分離效果的有哪些因素,為什么?凝膠層析的固定相是惰性的珠狀凝膠顆粒,凝膠顆粒的內(nèi)部具有立體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),形成很多孔穴。當含有不同分子大小的組分的樣品進入凝膠層析柱后,各個組分就向固定相的孔穴內(nèi)擴散,組分的擴散程度取決于孔穴的大小和組分分子大小。影響凝膠過濾分離效果的因素:樣品體積和柱體積之間的比值、流速、柱子直徑、顆粒大小及分布、裝柱密度、顆粒的孔洞以及流動相的粘性。(1)層析柱的選擇:層析柱大小主要是根據(jù)樣品量的多少以及對分辨率的要求來進行選擇。一般來講,主要是層析柱的長度對分辨率影響較大,長的層析柱分辨率要比短的高;但層析柱長度不能過長,否則會引起柱子不均一、流速過慢等實驗上的一些困難。(2)凝膠柱的鑒定:凝膠柱的填裝情況將直接影響分離效果,凝膠柱填裝后用肉眼觀察應(yīng)均勻、無紋路、無氣泡.(3)洗脫液的選擇:在凝膠層析中流動相只是起運載工具的作用,一般不依賴于流動相性質(zhì)和組成的改變來提高分辨率.凝膠層析洗脫液的選擇不那么嚴格,為了防止凝膠可能有吸附作用,一般洗脫液都含有一定
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