第01章蛋白質(zhì)_第1頁(yè)
第01章蛋白質(zhì)_第2頁(yè)
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1、目目 錄錄蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能第第 一一 章章Structure and Function of Protein目目 錄錄一、什么是蛋白質(zhì)一、什么是蛋白質(zhì)?蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)(protein)是由許多氨基酸是由許多氨基酸(amino acids)通過(guò)肽鍵通過(guò)肽鍵(peptide bond)相連相連形成的高分子含氮化合物。形成的高分子含氮化合物。目目 錄錄二、蛋白質(zhì)的生物學(xué)重要性二、蛋白質(zhì)的生物學(xué)重要性1. 蛋白質(zhì)是生物蛋白質(zhì)是生物 體重要組成成分體重要組成成分分布廣:分布廣:所有器官、組織都含有蛋白質(zhì);所有器官、組織都含有蛋白質(zhì);細(xì)胞的各個(gè)部分都含有蛋白質(zhì)。細(xì)胞的各個(gè)部分都含有蛋白質(zhì)

2、。含量高:含量高:蛋白質(zhì)是細(xì)胞內(nèi)最豐富的有機(jī)蛋白質(zhì)是細(xì)胞內(nèi)最豐富的有機(jī)分子,占人體干重的分子,占人體干重的45,某些組織含量更,某些組織含量更高,例如脾、肺及橫紋肌等高達(dá)高,例如脾、肺及橫紋肌等高達(dá)80。目目 錄錄1 1)作為生物催化劑(酶)作為生物催化劑(酶)2 2)代謝調(diào)節(jié)作用)代謝調(diào)節(jié)作用3 3)免疫保護(hù)作用)免疫保護(hù)作用4 4)物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)和存儲(chǔ))物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)和存儲(chǔ)5 5)運(yùn)動(dòng)與支持作用)運(yùn)動(dòng)與支持作用6 6)參與細(xì)胞間信息傳遞)參與細(xì)胞間信息傳遞2. 蛋白質(zhì)具有重要的生物學(xué)功能蛋白質(zhì)具有重要的生物學(xué)功能3. 氧化供能氧化供能目目 錄錄蛋蛋 白白 質(zhì)質(zhì) 的的 分分 子子 組組 成成The

3、Molecular Component of Protein第第 一一 節(jié)節(jié)目目 錄錄 組成蛋白質(zhì)的元素組成蛋白質(zhì)的元素主要有主要有C、H、O、N和和S。 有些蛋白質(zhì)含有少量有些蛋白質(zhì)含有少量磷磷或金屬元素或金屬元素鐵、鐵、銅、鋅、錳、鈷、鉬銅、鋅、錳、鈷、鉬,個(gè)別蛋白質(zhì)還含有,個(gè)別蛋白質(zhì)還含有碘碘 。目目 錄錄 各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16。 由于體內(nèi)的含氮物質(zhì)以蛋白質(zhì)為主,因此,由于體內(nèi)的含氮物質(zhì)以蛋白質(zhì)為主,因此,只要測(cè)定生物樣品中的含氮量,就可以根據(jù)以只要測(cè)定生物樣品中的含氮量,就可以根據(jù)以下公式推算出蛋白質(zhì)的大致含量:下公式推算出蛋白質(zhì)的大致含

4、量:100克樣品中蛋白質(zhì)的含量克樣品中蛋白質(zhì)的含量 ( g % )= 每克樣品含氮克數(shù)每克樣品含氮克數(shù) 6.251001/16% 蛋白質(zhì)元素組成的特點(diǎn)蛋白質(zhì)元素組成的特點(diǎn)目目 錄錄一、氨基酸一、氨基酸 組成蛋白質(zhì)的基本單位組成蛋白質(zhì)的基本單位存在自然界中的氨基酸有存在自然界中的氨基酸有300余種,但余種,但組成人體蛋白質(zhì)的氨基酸僅有組成人體蛋白質(zhì)的氨基酸僅有20種,且均種,且均屬屬 L-氨基酸氨基酸(甘氨酸除外)。(甘氨酸除外)。目目 錄錄H甘氨酸甘氨酸CH3丙氨酸丙氨酸L-L-氨基酸的通式氨基酸的通式RC+NH3COO-H目目 錄錄1. 非極性疏水性氨基酸非極性疏水性氨基酸2. 極性中性氨基

5、酸極性中性氨基酸3. 酸性氨基酸酸性氨基酸4. 堿性氨基酸堿性氨基酸(一)氨基酸的分類(lèi)(一)氨基酸的分類(lèi)* * 20 20種氨基酸的英文名稱(chēng)、縮寫(xiě)符號(hào)及分類(lèi)如下種氨基酸的英文名稱(chēng)、縮寫(xiě)符號(hào)及分類(lèi)如下: :目目 錄錄甘氨酸甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸丙氨酸 alanine Ala A 6.00纈氨酸纈氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸亮氨酸 leucine Leu L 5.98 異亮氨酸異亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02 苯丙氨酸苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48脯氨酸脯氨酸 proline Pro P 6.301. 非

6、極性疏水性氨基酸非極性疏水性氨基酸目目 錄錄目目 錄錄色氨酸色氨酸 tryptophan Trp W 5.89絲氨酸絲氨酸 serine Ser S 5.68酪氨酸酪氨酸 tyrosine Try Y 5.66 半胱氨酸半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41 谷氨酰胺谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 蘇氨酸蘇氨酸 threonine Thr T 5.602. 極性中性氨基酸極性中性氨基酸目目 錄錄目目 錄錄天冬氨酸天冬氨酸 aspartic acid

7、 Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22賴(lài)氨酸賴(lài)氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨酸 arginine Arg R 10.76組氨酸組氨酸 histidine His H 7.593. 酸性氨基酸酸性氨基酸4. 堿性氨基酸堿性氨基酸目目 錄錄目目 錄錄幾種特殊氨基酸幾種特殊氨基酸 脯氨酸脯氨酸(亞氨基酸)(亞氨基酸)CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2目目 錄錄-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3

8、 半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨酸二硫鍵二硫鍵-HH-OOC-CH-CH2-SH+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3目目 錄錄(二)氨基酸的理化性質(zhì)(二)氨基酸的理化性質(zhì)1. 兩性解離及等電點(diǎn)兩性解離及等電點(diǎn)氨基酸是兩性電解質(zhì),其解離程度取決氨基酸是兩性電解質(zhì),其解離程度取決于所處溶液的酸堿度。于所處溶液的酸堿度。等電點(diǎn)等電點(diǎn)(isoelectric point, pI) 在某一在某一pH的溶液中,氨基酸解離成的溶液中,氨基酸解離成陽(yáng)離子和陰離子的趨勢(shì)及程度相等,成為陽(yáng)離子和陰離子的趨勢(shì)及程度相等,成為兼性離子,呈

9、電中性。此時(shí)溶液的兼性離子,呈電中性。此時(shí)溶液的pH值值稱(chēng)為該氨基酸的稱(chēng)為該氨基酸的等電點(diǎn)等電點(diǎn)。目目 錄錄pH=pI+OH-pHpI+H+OH-+H+pHpI氨基酸的兼性離子氨基酸的兼性離子 陽(yáng)離子陽(yáng)離子陰離子陰離子CHNH2COOHR CHNH2COOHRCHNH3+COO-R CHNH3+COO-RCHNH2COO-R CHNH2COO-RCH COOHRNH3+CH COOHRNH3+目目 錄錄2. 紫外吸收紫外吸收 色氨酸、酪氨酸色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在的最大吸收峰在 280 nm 附近。附近。大多數(shù)蛋白質(zhì)含大多數(shù)蛋白質(zhì)含有這兩種氨基酸殘基,有這兩種氨基酸殘基,所以測(cè)定蛋白質(zhì)溶液

10、所以測(cè)定蛋白質(zhì)溶液280nm的光吸收值是分的光吸收值是分析溶液中蛋白質(zhì)含量析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡(jiǎn)便的方法。的快速簡(jiǎn)便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收芳香族氨基酸的紫外吸收目目 錄錄3. 茚三酮反應(yīng)茚三酮反應(yīng) 氨基酸與茚三酮水合物共熱,可生成氨基酸與茚三酮水合物共熱,可生成藍(lán)紫色藍(lán)紫色化合物,其最大吸收峰在化合物,其最大吸收峰在570nm處。處。由于此吸收峰值與氨基酸的含量存在正比由于此吸收峰值與氨基酸的含量存在正比關(guān)系,因此可作為氨基酸定量分析方法。關(guān)系,因此可作為氨基酸定量分析方法。目目 錄錄二、肽二、肽* 肽鍵肽鍵(peptide bond)是由一個(gè)氨基酸的是由一個(gè)氨基酸的 -羧基與另一

11、個(gè)氨基酸的羧基與另一個(gè)氨基酸的 -氨基脫水縮合氨基脫水縮合而形成的化學(xué)鍵。而形成的化學(xué)鍵。(一)肽(一)肽(peptide)目目 錄錄NH2-CH-CHOOH甘甘氨氨酸酸NH2-CH-CHOOH甘甘氨氨酸酸NH-CH-CHOHO OH甘甘氨氨酸酸+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽鍵NH2-CH-C-N-CH-COOHHHHONH2-CH-C-N-CH-COOHHHHO目目 錄錄* * 肽肽是由氨基酸通過(guò)肽鍵縮合而形成的化是由氨基酸通過(guò)肽鍵縮合而形成的化合物。合物。* * 兩分子氨基酸縮合形成兩分子氨基酸縮合形成二肽二肽,三分子氨,三分子氨基酸縮合則形成基酸縮合則形成三肽三肽* * 肽鏈中的氨

12、基酸分子因?yàn)槊撍s合而基團(tuán)肽鏈中的氨基酸分子因?yàn)槊撍s合而基團(tuán)不全,被稱(chēng)為不全,被稱(chēng)為氨基酸殘基氨基酸殘基(residue)。* * 由十個(gè)以?xún)?nèi)由十個(gè)以?xún)?nèi)氨基酸氨基酸相連而相連而成成的的肽肽稱(chēng)為稱(chēng)為寡寡肽肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相連由更多的氨基酸相連形成的肽稱(chēng)形成的肽稱(chēng)多肽多肽(polypeptide)。目目 錄錄N 末端:多肽鏈中有末端:多肽鏈中有自由氨基自由氨基的一端的一端C 末端:多肽鏈中有末端:多肽鏈中有自由羧基自由羧基的一端的一端多肽鏈有兩端多肽鏈有兩端* 多肽鏈多肽鏈(polypeptide chain)是指許多氨基是指許多氨基酸之間以肽鍵連接而成的一種結(jié)構(gòu)。

13、酸之間以肽鍵連接而成的一種結(jié)構(gòu)。目目 錄錄N末端末端C末端末端牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶目目 錄錄(二)(二) 幾種生物活性肽幾種生物活性肽 1. 谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione, GSH)目目 錄錄GSH過(guò)氧過(guò)氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH還原酶還原酶NADPH+H+ NADP+ 目目 錄錄 體內(nèi)許多激素屬寡肽或多肽體內(nèi)許多激素屬寡肽或多肽 神經(jīng)肽神經(jīng)肽(neuropeptide)2. 多肽類(lèi)激素及神經(jīng)肽多肽類(lèi)激素及神經(jīng)肽目目 錄錄三、蛋白質(zhì)的分類(lèi)三、蛋白質(zhì)的分類(lèi) * * 根據(jù)蛋白質(zhì)組成成分根據(jù)蛋白質(zhì)組成成分 單純蛋白質(zhì)單純蛋白質(zhì)結(jié)合蛋白質(zhì)結(jié)合蛋白質(zhì) =

14、 = 蛋白質(zhì)部分蛋白質(zhì)部分 + + 非蛋白質(zhì)部分非蛋白質(zhì)部分* * 根據(jù)蛋白質(zhì)形狀根據(jù)蛋白質(zhì)形狀 纖維狀蛋白質(zhì)纖維狀蛋白質(zhì)球狀蛋白質(zhì)球狀蛋白質(zhì)目目 錄錄蛋蛋 白白 質(zhì)質(zhì) 的的 分分 子子 結(jié)結(jié) 構(gòu)構(gòu)The Molecular Structure of Protein 第第 二二 節(jié)節(jié)目目 錄錄蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)包括蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)包括 一級(jí)結(jié)構(gòu)一級(jí)結(jié)構(gòu)(primary structure)二級(jí)結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu)(secondary structure)三級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu)(tertiary structure)四級(jí)結(jié)構(gòu)四級(jí)結(jié)構(gòu)(quaternary structure)高級(jí)高級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)目目 錄錄定義定義蛋

15、白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)指多肽鏈中氨基酸的排列蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)指多肽鏈中氨基酸的排列順序。順序。一、蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)一、蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)主要的化學(xué)鍵主要的化學(xué)鍵肽鍵肽鍵,有些蛋白質(zhì)還包括二硫鍵。,有些蛋白質(zhì)還包括二硫鍵。 一級(jí)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)一級(jí)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ)。功能的基礎(chǔ)。目目 錄錄目目 錄錄二、蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)二、蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對(duì)空結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對(duì)空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象 。定義定義 主要的化學(xué)

16、鍵主要的化學(xué)鍵: 氫鍵氫鍵 目目 錄錄(一)肽單元(一)肽單元參與肽鍵的參與肽鍵的6個(gè)原子個(gè)原子C 1、C、O、N、H、C 2位于同一平面,位于同一平面,C 1和和C 2在平面上所處的位置在平面上所處的位置為反式為反式(trans)構(gòu)型,此同一平構(gòu)型,此同一平面上的面上的6個(gè)原子構(gòu)成了所謂的個(gè)原子構(gòu)成了所謂的肽肽單元單元 (peptide unit) 。目目 錄錄 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要形式蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要形式 - -螺旋螺旋 ( -helix ) - -折疊折疊 ( -pleated sheet ) - -轉(zhuǎn)角轉(zhuǎn)角 ( -turn ) 無(wú)規(guī)卷曲無(wú)規(guī)卷曲 ( random coil ) (二

17、)(二) - -螺旋螺旋目目 錄錄目目 錄錄(三)(三) - -折疊折疊目目 錄錄(四)(四) -轉(zhuǎn)角和無(wú)規(guī)卷曲轉(zhuǎn)角和無(wú)規(guī)卷曲 - -轉(zhuǎn)角轉(zhuǎn)角無(wú)規(guī)卷曲是用來(lái)闡述沒(méi)有確定規(guī)律性的那部無(wú)規(guī)卷曲是用來(lái)闡述沒(méi)有確定規(guī)律性的那部分肽鏈結(jié)構(gòu)。分肽鏈結(jié)構(gòu)。 目目 錄錄(五)模體(五)模體在許多蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn)二個(gè)或在許多蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn)二個(gè)或三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個(gè)特殊的空間構(gòu)象,被稱(chēng)為接近,形成一個(gè)特殊的空間構(gòu)象,被稱(chēng)為模體模體(motif)。目目 錄錄鈣結(jié)合蛋白中結(jié)鈣結(jié)合蛋白中結(jié)合鈣離子的模體合鈣離子的模體 鋅指結(jié)構(gòu)鋅指結(jié)構(gòu) 目目 錄

18、錄三、蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)三、蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)疏水鍵、離子鍵、氫鍵和疏水鍵、離子鍵、氫鍵和 Van der Waals力等。力等。 主要的化學(xué)鍵主要的化學(xué)鍵整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對(duì)空間位置。整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對(duì)空間位置。即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置。即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置。(一)(一) 定義定義 目目 錄錄目目 錄錄 肌紅蛋白肌紅蛋白 (Mb) N 端端 C端端目目 錄錄纖連蛋白分子的結(jié)構(gòu)域纖連蛋白分子的結(jié)構(gòu)域 (二)結(jié)構(gòu)域(二)結(jié)構(gòu)域大分子蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)??煞指畛梢粋€(gè)或大分子蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)常可分割成一個(gè)或數(shù)個(gè)球狀或纖維狀的區(qū)域,折疊得較為緊密,各數(shù)個(gè)球狀

19、或纖維狀的區(qū)域,折疊得較為緊密,各行使其功能,稱(chēng)為結(jié)構(gòu)域行使其功能,稱(chēng)為結(jié)構(gòu)域(domain) 。目目 錄錄(三)(三)分子伴侶分子伴侶分子伴侶分子伴侶(chaperon)通過(guò)提供一個(gè)保護(hù)環(huán)境從通過(guò)提供一個(gè)保護(hù)環(huán)境從而加速蛋白質(zhì)折疊成天然構(gòu)象或形成四級(jí)結(jié)構(gòu)。而加速蛋白質(zhì)折疊成天然構(gòu)象或形成四級(jí)結(jié)構(gòu)。* * 分子伴侶可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨分子伴侶可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨后松開(kāi),如此重復(fù)進(jìn)行可防止錯(cuò)誤的聚集發(fā)生,后松開(kāi),如此重復(fù)進(jìn)行可防止錯(cuò)誤的聚集發(fā)生,使肽鏈正確折疊。使肽鏈正確折疊。 * * 分子伴侶也可與錯(cuò)誤聚集的肽段結(jié)合,使之解聚分子伴侶也可與錯(cuò)誤聚集的肽段結(jié)合,使之解

20、聚后,再誘導(dǎo)其正確折疊。后,再誘導(dǎo)其正確折疊。 * * 分子伴侶在蛋白質(zhì)分子折疊過(guò)程中二硫鍵的正確分子伴侶在蛋白質(zhì)分子折疊過(guò)程中二硫鍵的正確形成起了重要的作用。形成起了重要的作用。 目目 錄錄亞基之間的結(jié)合力主要是疏水作用,其次亞基之間的結(jié)合力主要是疏水作用,其次是氫鍵和離子鍵。是氫鍵和離子鍵。四、蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)四、蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間排布及亞基接蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用,稱(chēng)為觸部位的布局和相互作用,稱(chēng)為蛋白質(zhì)的四級(jí)蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)。有些蛋白質(zhì)分子含有二條或多條多肽鏈,有些蛋白質(zhì)分子含有二條或多條多肽鏈,每一條多肽鏈都有完整的三級(jí)結(jié)構(gòu)

21、,稱(chēng)為蛋白每一條多肽鏈都有完整的三級(jí)結(jié)構(gòu),稱(chēng)為蛋白質(zhì)的質(zhì)的亞基亞基 (subunit)。目目 錄錄血紅蛋白血紅蛋白的四級(jí)結(jié)構(gòu)的四級(jí)結(jié)構(gòu) 目目 錄錄蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系The Relation of Structure and Function of Protein第第 三三 節(jié)節(jié)目目 錄錄(一)一級(jí)結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)(一)一級(jí)結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ) 一、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系一、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 牛核糖核酸酶的牛核糖核酸酶的一級(jí)結(jié)構(gòu)一級(jí)結(jié)構(gòu)二二硫硫鍵鍵目目 錄錄 天然狀態(tài),天然狀態(tài),有催化活性有催化活性 尿素、尿素、 -巰基乙醇巰基乙醇 去除尿素、去除尿素

22、、-巰基乙醇巰基乙醇非折疊狀態(tài),無(wú)活性非折疊狀態(tài),無(wú)活性目目 錄錄(二)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系(二)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系例:鐮刀形紅細(xì)胞貧血例:鐮刀形紅細(xì)胞貧血N-val his leu thr pro glu glu C(146) HbS 肽鏈肽鏈HbA 肽肽 鏈鏈N-val his leu thr pro val glu C(146) 這種由蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病,這種由蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病,稱(chēng)為稱(chēng)為“分子病分子病”。目目 錄錄(一)肌紅蛋白與血紅蛋白的結(jié)構(gòu)(一)肌紅蛋白與血紅蛋白的結(jié)構(gòu) 二、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系二、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 目目 錄錄目目 錄錄Hb

23、與與Mb一樣能可逆地與一樣能可逆地與O2結(jié)合,結(jié)合, Hb與與O2結(jié)合后稱(chēng)為結(jié)合后稱(chēng)為氧合氧合Hb。氧合。氧合Hb占總占總Hb的百的百分?jǐn)?shù)(稱(chēng)分?jǐn)?shù)(稱(chēng)百分飽和度百分飽和度)隨)隨O2濃度變化而改變。濃度變化而改變。(二)血紅蛋白的構(gòu)象變化與結(jié)合氧(二)血紅蛋白的構(gòu)象變化與結(jié)合氧 目目 錄錄肌紅蛋白肌紅蛋白(Mb)和血紅蛋白和血紅蛋白(Hb)的氧解離曲線的氧解離曲線目目 錄錄* 協(xié)同效應(yīng)協(xié)同效應(yīng)(cooperativity) 一個(gè)寡聚體蛋白質(zhì)的一個(gè)亞基與其配體結(jié)合一個(gè)寡聚體蛋白質(zhì)的一個(gè)亞基與其配體結(jié)合后,能影響此寡聚體中另一個(gè)亞基與配體結(jié)合能后,能影響此寡聚體中另一個(gè)亞基與配體結(jié)合能力的現(xiàn)象,稱(chēng)

24、為力的現(xiàn)象,稱(chēng)為協(xié)同效應(yīng)協(xié)同效應(yīng)。 如果是促進(jìn)作用則稱(chēng)為如果是促進(jìn)作用則稱(chēng)為正協(xié)同效應(yīng)正協(xié)同效應(yīng) (positive cooperativity)如果是抑制作用則稱(chēng)為如果是抑制作用則稱(chēng)為負(fù)協(xié)同效應(yīng)負(fù)協(xié)同效應(yīng) (negative cooperativity)目目 錄錄目目 錄錄O2血紅素與氧結(jié)血紅素與氧結(jié)合后,鐵原子半徑合后,鐵原子半徑變小,就能進(jìn)入卟變小,就能進(jìn)入卟啉環(huán)的小孔中,繼啉環(huán)的小孔中,繼而引起肽鏈位置的而引起肽鏈位置的變動(dòng)。變動(dòng)。目目 錄錄變構(gòu)效應(yīng)變構(gòu)效應(yīng)(allosteric effect)蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的改變伴隨其功蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的改變伴隨其功能的變化,稱(chēng)為能的變化,稱(chēng)為變構(gòu)效應(yīng)

25、變構(gòu)效應(yīng)。目目 錄錄(三)蛋白質(zhì)構(gòu)象改變與疾?。ㄈ┑鞍踪|(zhì)構(gòu)象改變與疾病 蛋白質(zhì)構(gòu)象疾病蛋白質(zhì)構(gòu)象疾病:若蛋白質(zhì)的折疊發(fā)生:若蛋白質(zhì)的折疊發(fā)生錯(cuò)誤,盡管其一級(jí)結(jié)構(gòu)不變,但蛋白質(zhì)的構(gòu)錯(cuò)誤,盡管其一級(jí)結(jié)構(gòu)不變,但蛋白質(zhì)的構(gòu)象發(fā)生改變,仍可影響其功能,嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)象發(fā)生改變,仍可影響其功能,嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)致疾病發(fā)生。致疾病發(fā)生。目目 錄錄蛋白質(zhì)構(gòu)象改變導(dǎo)致疾病的機(jī)理蛋白質(zhì)構(gòu)象改變導(dǎo)致疾病的機(jī)理:有些蛋:有些蛋白質(zhì)錯(cuò)誤折疊后相互聚集,常形成抗蛋白水解白質(zhì)錯(cuò)誤折疊后相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的淀粉樣纖維沉淀,產(chǎn)生毒性而致病,表現(xiàn)酶的淀粉樣纖維沉淀,產(chǎn)生毒性而致病,表現(xiàn)為蛋白質(zhì)淀粉樣纖維沉淀的病理改變。為蛋白

26、質(zhì)淀粉樣纖維沉淀的病理改變。這類(lèi)疾病包括這類(lèi)疾病包括:人紋狀體脊髓變性病、老:人紋狀體脊髓變性病、老年癡呆癥、亨停頓舞蹈病、瘋牛病等。年癡呆癥、亨停頓舞蹈病、瘋牛病等。目目 錄錄瘋牛病中的蛋白質(zhì)構(gòu)象改變瘋牛病中的蛋白質(zhì)構(gòu)象改變瘋牛病是由朊病毒蛋白瘋牛病是由朊病毒蛋白(prion protein, PrP)引起的一組人和動(dòng)物神經(jīng)退行性病變。引起的一組人和動(dòng)物神經(jīng)退行性病變。正常的正常的PrP富含富含-螺旋,稱(chēng)為螺旋,稱(chēng)為PrPc。PrPc在某種未知蛋白質(zhì)的作用下可轉(zhuǎn)變成全在某種未知蛋白質(zhì)的作用下可轉(zhuǎn)變成全為為-折疊的折疊的PrPsc,從而致病。,從而致病。PrPc-螺旋螺旋PrPsc-折疊折疊正

27、常正常瘋牛病瘋牛病目目 錄錄第四節(jié)第四節(jié)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)與分離純化蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)與分離純化The Physical and Chemical Characters and Separation and Purification of Protein目目 錄錄(一)蛋白質(zhì)的兩性電離(一)蛋白質(zhì)的兩性電離 一、理化性質(zhì)一、理化性質(zhì) 蛋白質(zhì)分子除兩端的氨基和羧基可解離外,蛋白質(zhì)分子除兩端的氨基和羧基可解離外,氨基酸殘基側(cè)鏈中某些基團(tuán),在一定的溶液氨基酸殘基側(cè)鏈中某些基團(tuán),在一定的溶液pHpH條條件下都可解離成帶負(fù)電荷或正電荷的基團(tuán)。件下都可解離成帶負(fù)電荷或正電荷的基團(tuán)。 * 蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)蛋白質(zhì)的

28、等電點(diǎn)( isoelectric point, pI) 當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時(shí),蛋白質(zhì)解離成時(shí),蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢(shì)相等,即成為兼性離子,凈電正、負(fù)離子的趨勢(shì)相等,即成為兼性離子,凈電荷為零,此時(shí)溶液的荷為零,此時(shí)溶液的pH稱(chēng)為稱(chēng)為蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。目目 錄錄(二)蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)(二)蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì) 蛋白質(zhì)屬于生物大分子之一,分子量可自蛋白質(zhì)屬于生物大分子之一,分子量可自1萬(wàn)至萬(wàn)至100萬(wàn)之巨,其分子的直徑可達(dá)萬(wàn)之巨,其分子的直徑可達(dá)1100nm,為膠粒范圍之內(nèi)。,為膠粒范圍之內(nèi)。 * * 蛋白質(zhì)膠體穩(wěn)定的因素蛋白質(zhì)膠體穩(wěn)定的因素顆粒表面電荷顆

29、粒表面電荷水化膜水化膜目目 錄錄+帶正電荷的蛋白質(zhì)帶正電荷的蛋白質(zhì)帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)的蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)的蛋白質(zhì)水化膜水化膜+帶正電荷的蛋白質(zhì)帶正電荷的蛋白質(zhì)帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)不穩(wěn)定的蛋白質(zhì)顆粒不穩(wěn)定的蛋白質(zhì)顆粒酸酸堿堿酸酸堿堿酸酸堿堿脫水作用脫水作用脫水作用脫水作用脫水作用脫水作用溶液中蛋白質(zhì)的聚沉溶液中蛋白質(zhì)的聚沉目目 錄錄(三)蛋白質(zhì)的變性、沉淀和凝固(三)蛋白質(zhì)的變性、沉淀和凝固 * 蛋白質(zhì)的變性蛋白質(zhì)的變性(denaturation)在某些物理和化學(xué)因素作用下,其特定的在某些物理和化學(xué)因素作用下,其特定的空間構(gòu)象被破壞,也即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無(wú)空間構(gòu)象

30、被破壞,也即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無(wú)序的空間結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變和生序的空間結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變和生物活性的喪失。物活性的喪失。目目 錄錄 造成變性的因素造成變性的因素如如加熱、乙醇等有機(jī)溶劑、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、加熱、乙醇等有機(jī)溶劑、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、重金屬離子及生物堿試劑等重金屬離子及生物堿試劑等 。 變性的本質(zhì)變性的本質(zhì) 破壞非共價(jià)鍵和二硫鍵,不改變蛋白破壞非共價(jià)鍵和二硫鍵,不改變蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)。質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)。目目 錄錄 應(yīng)用舉例應(yīng)用舉例臨床醫(yī)學(xué)上,變性因素常被應(yīng)用來(lái)消毒及臨床醫(yī)學(xué)上,變性因素常被應(yīng)用來(lái)消毒及滅菌。滅菌。此外此外, , 防止蛋白質(zhì)變性也是有效保存蛋白質(zhì)防止蛋白質(zhì)變性也是有

31、效保存蛋白質(zhì)制劑(如疫苗等)的必要條件。制劑(如疫苗等)的必要條件。 目目 錄錄若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素后,蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)后,蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能,稱(chēng)為象和功能,稱(chēng)為復(fù)性復(fù)性(renaturation) 。目目 錄錄 天然狀態(tài),天然狀態(tài),有催化活性有催化活性 尿素、尿素、 -巰基乙醇巰基乙醇 去除尿素、去除尿素、-巰基乙醇巰基乙醇非折疊狀態(tài),無(wú)活性非折疊狀態(tài),無(wú)活性目目 錄錄* * 蛋白質(zhì)沉淀蛋白質(zhì)沉淀在一定條件下,蛋白疏水側(cè)鏈暴露在外,肽在一定條件下,蛋白疏水側(cè)鏈暴露在外,肽鏈融會(huì)相互纏繞繼而聚集,因而從溶

32、液中析出。鏈融會(huì)相互纏繞繼而聚集,因而從溶液中析出。變性的蛋白質(zhì)易于沉淀,有時(shí)蛋白質(zhì)發(fā)生沉變性的蛋白質(zhì)易于沉淀,有時(shí)蛋白質(zhì)發(fā)生沉淀,但并不變性。淀,但并不變性。 * 蛋白質(zhì)的凝固作用蛋白質(zhì)的凝固作用(protein coagulation) 蛋白質(zhì)變性后的絮狀物加熱可變成比較堅(jiān)固蛋白質(zhì)變性后的絮狀物加熱可變成比較堅(jiān)固的凝塊,此凝塊不易再溶于強(qiáng)酸和強(qiáng)堿中。的凝塊,此凝塊不易再溶于強(qiáng)酸和強(qiáng)堿中。 目目 錄錄(四)蛋白質(zhì)的紫外吸收(四)蛋白質(zhì)的紫外吸收由于蛋白質(zhì)分子中含有共軛雙鍵的酪氨酸由于蛋白質(zhì)分子中含有共軛雙鍵的酪氨酸和色氨酸,因此在和色氨酸,因此在280nm波長(zhǎng)處有特征性吸收波長(zhǎng)處有特征性吸收

33、峰。蛋白質(zhì)的峰。蛋白質(zhì)的OD280與其濃度呈正比關(guān)系,因與其濃度呈正比關(guān)系,因此可作蛋白質(zhì)定量測(cè)定。此可作蛋白質(zhì)定量測(cè)定。目目 錄錄(五)蛋白質(zhì)的呈色反應(yīng)(五)蛋白質(zhì)的呈色反應(yīng)茚三酮反應(yīng)茚三酮反應(yīng)(ninhydrin reaction) 蛋白質(zhì)經(jīng)水解后產(chǎn)生的氨基酸也可發(fā)生茚蛋白質(zhì)經(jīng)水解后產(chǎn)生的氨基酸也可發(fā)生茚三酮反應(yīng)。三酮反應(yīng)。 雙縮脲反應(yīng)雙縮脲反應(yīng)(biuret reaction)蛋白質(zhì)和多肽分子中肽鍵在稀堿溶液中與蛋白質(zhì)和多肽分子中肽鍵在稀堿溶液中與硫酸銅共熱,呈現(xiàn)紫色或紅色,此反應(yīng)稱(chēng)為硫酸銅共熱,呈現(xiàn)紫色或紅色,此反應(yīng)稱(chēng)為雙雙縮脲反應(yīng)縮脲反應(yīng),雙縮脲反應(yīng)可用來(lái)檢測(cè)蛋白質(zhì)水解,雙縮脲反應(yīng)可

34、用來(lái)檢測(cè)蛋白質(zhì)水解程度。程度。目目 錄錄二、蛋白質(zhì)的分離和純化二、蛋白質(zhì)的分離和純化(一)透析及超濾法(一)透析及超濾法* 透析透析(dialysis)利用透析袋把大分子蛋白質(zhì)與小分子化合物分利用透析袋把大分子蛋白質(zhì)與小分子化合物分開(kāi)的方法。開(kāi)的方法。* * 超濾法超濾法 應(yīng)用正壓或離心力使蛋白質(zhì)溶液透過(guò)有一定截留應(yīng)用正壓或離心力使蛋白質(zhì)溶液透過(guò)有一定截留分子量的超濾膜,達(dá)到濃縮蛋白質(zhì)溶液的目的。分子量的超濾膜,達(dá)到濃縮蛋白質(zhì)溶液的目的。目目 錄錄(二)丙酮沉淀、鹽析及免疫沉淀(二)丙酮沉淀、鹽析及免疫沉淀 *使用使用丙酮沉淀丙酮沉淀時(shí),必須在時(shí),必須在04低溫下進(jìn)行,低溫下進(jìn)行,丙酮用量一般

35、丙酮用量一般10倍于蛋白質(zhì)溶液體積。蛋白倍于蛋白質(zhì)溶液體積。蛋白質(zhì)被丙酮沉淀后,應(yīng)立即分離。除了丙酮以質(zhì)被丙酮沉淀后,應(yīng)立即分離。除了丙酮以外,也可用乙醇沉淀。外,也可用乙醇沉淀。 *鹽析鹽析(salt precipitation)是將硫酸銨、硫酸鈉是將硫酸銨、硫酸鈉或氯化鈉等加入蛋白質(zhì)溶液,使蛋白質(zhì)表面或氯化鈉等加入蛋白質(zhì)溶液,使蛋白質(zhì)表面電荷被中和以及水化膜被破壞,導(dǎo)致蛋白質(zhì)電荷被中和以及水化膜被破壞,導(dǎo)致蛋白質(zhì)沉淀。沉淀。 目目 錄錄* * 免疫沉淀法:免疫沉淀法:將某一純化蛋白質(zhì)免疫動(dòng)物將某一純化蛋白質(zhì)免疫動(dòng)物可獲得抗該蛋白的特異抗體。利用特異抗可獲得抗該蛋白的特異抗體。利用特異抗體識(shí)

36、別相應(yīng)的抗原蛋白,并形成抗原抗體體識(shí)別相應(yīng)的抗原蛋白,并形成抗原抗體復(fù)合物的性質(zhì),可從蛋白質(zhì)混合溶液中分復(fù)合物的性質(zhì),可從蛋白質(zhì)混合溶液中分離獲得抗原蛋白。離獲得抗原蛋白。 目目 錄錄(三)電泳(三)電泳蛋白質(zhì)在高于或低于其蛋白質(zhì)在高于或低于其pIpI的溶液中為帶電的溶液中為帶電的顆粒,在電場(chǎng)中能向正極或負(fù)極移動(dòng)。這種的顆粒,在電場(chǎng)中能向正極或負(fù)極移動(dòng)。這種通過(guò)蛋白質(zhì)在電場(chǎng)中泳動(dòng)而達(dá)到分離各種蛋白通過(guò)蛋白質(zhì)在電場(chǎng)中泳動(dòng)而達(dá)到分離各種蛋白質(zhì)的技術(shù)質(zhì)的技術(shù), , 稱(chēng)為稱(chēng)為電泳電泳(elctrophoresis) 。根據(jù)支撐物的不同,可分為薄膜電泳、凝根據(jù)支撐物的不同,可分為薄膜電泳、凝膠電泳等。膠

37、電泳等。 目目 錄錄幾種重要的蛋白質(zhì)電泳幾種重要的蛋白質(zhì)電泳*SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳聚丙烯酰胺凝膠電泳,常用于蛋白質(zhì),常用于蛋白質(zhì)分子量的測(cè)定。分子量的測(cè)定。*等電聚焦電泳等電聚焦電泳,通過(guò)蛋白質(zhì)等電點(diǎn)的差異,通過(guò)蛋白質(zhì)等電點(diǎn)的差異而分離蛋白質(zhì)的電泳方法。而分離蛋白質(zhì)的電泳方法。*雙向凝膠電泳雙向凝膠電泳是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要技是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要技術(shù)。術(shù)。目目 錄錄(四)層析(四)層析層析層析(chromatography)分離蛋白質(zhì)的原理分離蛋白質(zhì)的原理待分離蛋白質(zhì)溶液(流動(dòng)相)經(jīng)過(guò)一個(gè)待分離蛋白質(zhì)溶液(流動(dòng)相)經(jīng)過(guò)一個(gè)固態(tài)物質(zhì)(固定相)時(shí),根據(jù)溶液中待分離的固態(tài)物質(zhì)(固定相)時(shí),根

38、據(jù)溶液中待分離的蛋白質(zhì)顆粒大小、電荷多少及親和力等,使待蛋白質(zhì)顆粒大小、電荷多少及親和力等,使待分離的蛋白質(zhì)組分在兩相中反復(fù)分配,并以不分離的蛋白質(zhì)組分在兩相中反復(fù)分配,并以不同速度流經(jīng)固定相而達(dá)到分離蛋白質(zhì)的目的同速度流經(jīng)固定相而達(dá)到分離蛋白質(zhì)的目的 。目目 錄錄蛋白質(zhì)分離常用的層析方法蛋白質(zhì)分離常用的層析方法* * 離子交換層析:離子交換層析:利用各蛋白質(zhì)的電荷量及性利用各蛋白質(zhì)的電荷量及性質(zhì)不同進(jìn)行分離。質(zhì)不同進(jìn)行分離。* * 凝膠過(guò)濾凝膠過(guò)濾(gel filtration)又稱(chēng)分子篩層析,又稱(chēng)分子篩層析,利利用用各各蛋白質(zhì)分子大小不同分離。蛋白質(zhì)分子大小不同分離。目目 錄錄目目 錄錄目目 錄錄(五)超速離心(五)超速離心* * 超速離心法超速離心法(ultracentrifugation)既可以既可以用來(lái)分離純化蛋白質(zhì)也可以用作測(cè)定蛋用來(lái)分離純化蛋白質(zhì)也可以用作測(cè)定蛋白質(zhì)的分子量。白質(zhì)

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