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文檔簡介
1、EASYspin Plus Complex Plant RNA KitEASYspin Plus多糖多酚/復雜植物RNA快速提取試劑盒目錄號:RN53v 適用范圍:適用于快速提取植物組織細胞總RNA,使用獨有基因組DNA清除柱技術可有效清除電泳可見gDNA殘留,RNA可用于反轉錄PCR,熒光定量PCR等。v 試劑盒組成、儲存、穩(wěn)定性:試劑盒組成保存50次(RN5301)裂解液CLB 室溫50 ml裂解液RLT Plus室溫25 ml去蛋白液RW1室溫40 ml漂洗液RW室溫10 ml第一次使用前按說明加指定量乙醇RNase-free H2O室溫10 ml基因組DNA清除柱和收集管室溫50套RN
2、ase-free吸附柱RA和收集管室溫50套本試劑盒在室溫儲存12個月不影響使用效果。儲存事項:1. 不合適的儲存于低溫(4或者20)會造成溶液沉淀,影響使用效果,因此運輸和儲存均在室溫下(1525)進行。2. 避免試劑長時間暴露于空氣中產生揮發(fā)、氧化、PH值變化,各溶液使用后應及時蓋緊蓋子。注意事項1. 所有的離心步驟均可在室溫完成(4離心也可以),使用轉速可以達到13,000 rpm的傳統(tǒng)臺式離心機,如Eppendorf 5415C 或者類似離心機。2. 需要自備-巰基乙醇,乙醇,研缽(可選)。- 1 - / 93. 樣品處理量絕對不要超過基因組清除柱DA和和RNA吸附柱RA處理能力,否則
3、造成DNA殘留或產量降低。開始摸索實驗條件時,如果不清楚樣品DNA/RNA含量時可使用較少的樣品處理量,將來根據樣品試驗情況增加或者減少處理量。4. 裂解液CLB和RLT Plus 和去蛋白液RW1中含有刺激性化合物,操作時戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時,要用大量清水或者生理鹽水沖洗。5. 關于DNA 的微量殘留:一般說來任何總RNA提取試劑在提取過程中無法完全避免DNA的微量殘留(DNase消化也無法做到100%無殘留),本公司的EASYspin Plus RNA提取產品,由于采取了本公司獨特的緩沖體系和基因組DNA清除柱技術,絕大多數(shù)DNA已經被清除,不需要DNa
4、se消化,可直接用于反轉錄PCR和熒光定量PCR。個別特殊情況如DNA含量過于豐富造成殘留或者要進行嚴格的mRNA表達量分析熒光定量PCR,我們建議在進行模板和引物的選擇時:1) 選用跨內含子的引物,以穿過mRNA中的連接區(qū),這樣DNA就不能作為模板參與擴增反應。2) 選擇基因組DNA和cDNA上擴增的產物大小不一樣的引物對。3) 將RNA提取物用RNase-free的DNase I 處理。本試劑盒還可以用于DNase I處理后的RNA清潔(cleanup) ,請聯(lián)系我們索取具體操作說明書。4) 在步驟去蛋白液RW1漂洗前,直接在吸附柱RA上進行DNase I柱上消化處理。購買DNA酶柱上消化
5、試劑盒(貨號:RN34)前可先索取具體操作說明書。v 操作步驟:(實驗前請先閱讀注意事項)提示:ð 第一次使用前請先在漂洗液RW瓶加入指定量無水乙醇!ð 取1ml裂解液 CLB至離心管內(如果CLB有析出或者沉淀需先置于65°C水浴重新溶解),在裂解液CLB中加入5% -巰基乙醇(1ml CLB加50l -巰基乙醇)。顛倒混勻后65°C水浴中預熱。多個樣品按照比例放大準備。1. 直接研磨法(實驗室無液氮情況下或者柔軟易研磨植物樣品推薦此法):a. 新鮮植物組織或者冰凍保存樣品稱重后取100-200mg(水分少的樣品如葉片種子等可加100-150mg,水分
6、多的樣品如草莓西瓜果實可多加一些)迅速剪成小塊放入研缽,加入 1ml CLB(已加有-巰基乙醇)室溫下充分研磨成勻漿,注意應該迅速研磨讓組織和裂解液CLB立刻充分接觸以抑制RNA酶活性。-巰基乙醇是裂解液CLB的關鍵成分,必要的時候可以提高終濃度到10-20%。如果特別復雜植物,可以嘗試在裂解液中加入PVP40至終濃度2%。b. 將裂解物轉入離心管,立即劇烈振蕩15秒,短時放回 65°C水浴中(5-10 min),中間偶爾顛倒1-2次幫助裂解。13,000rpm離心10分鐘,沉淀不能裂解的碎片。c. 取裂解物上清(在不超過基因組DNA清除柱能力的情況下可以取更多的上清,這樣可以提高產
7、量)轉到一個新離心管。加入上清體積一半的無水乙醇(0.5體積),此時可能出現(xiàn)沉淀,但是不影響提取過程,立即吹打混勻,不要離心。若上清表面有漂浮物,用吸頭挑開吸取下面液體即可。d. 立刻接操作步驟的步驟3。2. 液氮研磨法(適用廣泛,提取復雜難破碎,易降解樣品時推薦此法):a. 液氮中研磨新鮮或-70°C冷凍的材料至細粉。b. 轉移100-200mg細粉(水分少的樣品如葉片種子等可加100-150mg,水分多的樣品如草莓西瓜果實可多加一些)加至預熱的裂解液CLB(已加有-巰基乙醇)離心管中。立即劇烈渦旋30-60秒或者用吸頭吹打混勻裂解直得到滿意勻漿結果(或者電動勻漿30秒),可以剪切
8、DNA,降低粘稠度和提高產量。c. 短時放回 65°C水浴中(5-10 min),中間偶爾顛倒1-2次幫助裂解。d. 將裂解物13,000 rpm離心10分鐘,沉淀不能裂解的碎片。e. 取裂解物上清(在不超過基因組DNA清除柱能力的情況下可以取更多的上清,這樣可以提高產量)轉到一個新離心管。加入上清體積一半的無水乙醇(0.5體積),此時可能出現(xiàn)沉淀,但是不影響提取過程,立即吹打混勻,不要離心。若上清表面有漂浮物,用吸頭挑開吸取下面液體即可。f. 立刻接操作步驟的步驟3。3. 將混合物(每次小于720l,多可以分兩次加入)加入一個基因組清除柱中,(清除柱放入收集管中
9、)13,000 rpm離心2分鐘,棄掉廢液。確保離心后液體全部濾過去,膜上沒有殘留,如有必要,可以加大離心力和離心時間。4. 將基因組DNA清除柱子放在一個干凈2ml離心管內(不用RNAse free 或者DEPC處理,一般干凈的新離心管即可。也可使用RNA吸附柱配套的新的干凈收集管),在基因組清除柱內加500l裂解液RLT Plus,13,000 rpm離心30秒, 收集濾液(RNA在濾液中),用微量移液器較精確估計濾過液體積(通常為450-500l左右,濾過時候損失體積應該減去),加入0.5倍體積的無水乙醇,此時可能出現(xiàn)沉淀,但是不影響提取過程,立即吹打混勻,不要離心。5. 立刻將混合物(
10、每次小于720l,多可以分兩次加入)加入一個吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm離心2分鐘,棄掉廢液。確保離心后液體全部濾過去,膜上沒有殘留,如有必要,可以加大離心力和離心時間。6. 加700l 去蛋白液RW1,室溫放置1分鐘,13,000rpm 離心30秒,棄掉廢液。7. 加入500l漂洗液RW(請先檢查是否已加入無水乙醇!),13,000 rpm 離心30秒,棄掉廢液。加入500l漂洗液RW,重復一遍。8. 將吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應。9. 取出吸附柱RA,放入一個RNase free離
11、心管中,根據預期RNA產量在吸附膜的中間部位加30-50l RNase free water(事先在 70-90水浴中加熱可提高產量), 室溫放置1分鐘,12,000 rpm 離心1分鐘。10. 如果預期RNA產量>30g,加30-50l RNase free water重復步驟9,合并兩次洗液,或者使用第一次的洗脫液加回到吸附柱重復步驟一遍(如果需要RNA濃度高)。洗脫兩遍的RNA洗脫液濃度高,分兩次洗脫合并洗脫液的RNA產量比前者高1530%,但是濃度要低,用戶根據需要選擇。附錄1:DNA酶柱上消化(詳細請參考RN34 DNase I 柱上消化試劑盒說明書)1. 按照前面所列RN53
12、試劑盒操作步驟操作,直到做完操作步驟5。2. 取45l DNase I buffer和5l RNase free DNase I在離心管輕輕吹打混勻成工作液(處理多個離心柱子要按照比例放大制備工作液)。3. 向吸附柱RA 中加入350l去蛋白液RW1,12,000 rpm 離心30 秒,棄廢液,將吸附柱放回收集管中。4. 向吸附柱RA 中央加入50l的DNase I 工作液,室溫(20-30)放置15 分鐘。注意直接將工作液滴在膜中央上向膜四周浸潤充分和膜接觸,不要讓工作液滴在O型墊圈或是離心柱管壁上掛壁或者掛在墊圈上不能充分和膜接觸。5. 向吸附柱RA 中加入350l去蛋白液RW1, 12,
13、000 rpm 離心30-60 秒,棄廢液,將吸附柱放回收集管中。6. 接操作步驟7完成后續(xù)步驟。附錄2:RNA含量少樣品或者RNA復雜產量低的解決方案 可以提高樣品處理量到300-500mg/2ml裂解液CLB,上清過兩根基因組DNA清除柱子,洗脫下來的RNA,可以兩個合并到一根RNA吸附柱上,可以大大提高RNA濃度。附錄3:使用EASYspin/EASYspin Plus植物RNA提取系列試劑盒發(fā)表文章100多篇:1. 桃果實、花、根、葉:Isolation, characterisation and phylogenetic analysis of resistance gene
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