Nextseq 二代測序實驗室要求

1、NextSeq 500 實驗室指導方案一、 實驗室要求.1-2二、 電的要求3三、 不間斷電源（UPS）.4四、 環(huán)境限制5五、 計算網(wǎng)絡要求.6六、 用戶提供的消耗品和設備.7-8一 實驗室要求1. Nexseq 500儀器尺寸：測量尺寸高度58.5 cm (23 in.)寬度53.4 cm (21 in.)深度63.5 cm (25 in.)重量83 kg (183 lbs.)2. 安置要求儀器安裝的位置必須保證有足夠的空間，以確保能夠接觸電源開關和電源插座，以及進行設備的檢修，同時應當保持適當?shù)耐L。 1) 儀器的左側應有足夠的空間，以確保實驗人員能夠控制位于儀器背部電板電源線上的電源開

2、關。2) 放置儀器以便工作人員可以迅速的從電源插座上斷開電源線。3) 該儀器四周能夠讓實驗人員進入操作的空隙不能小于以下數(shù)值。進入最小間隙邊距至少61cm，儀器的每一邊背部至少10.2cm，儀器背面頂部至少61cm，儀器頂部；如果儀器放在隔板下，依然要符合此規(guī)定注：移動儀器需要聯(lián)系廠家代表。如果移動儀器不當會影響光學校準以及數(shù)據(jù)的完整性。3. 放置Nextseq 500的實驗臺要求儀器中有精密的光學原件，應該被安裝在堅固的實驗臺上，并遠離振動源。寬度高度深度腳輪122 cm (48 in.)91.4 cm (36 in.)76.2 cm (30 in.)非強制的4. 防止震動源使用以下指導意見

3、最小化測序過程中的震動，以保證光學表現(xiàn)。1) 把儀器安裝在堅固牢靠的實驗臺上。2) 不要將其他任何可能導致震動的設備放置在同一實驗臺上，如搖床，渦旋器，離心機，或能引起空氣流動的裝置。3) 在測序過程中，不要打開試劑箱門，緩沖液門，右側的服務面板，或流式細胞門。不要在儀器上放置任何物品。5. PCR工序的實驗室設置實驗室在使用前應建立專用區(qū)域和實驗程序，并確保實驗室設置合理，以減少被PCR產(chǎn)物污染的風險（PCR產(chǎn)物會污染試劑，儀器，樣本等，并導致實驗結果的不準確性）。1) 專用的完全獨立區(qū)域如果您打算進行PCR序列擴增，儀器必須設在PCR后處理實驗室。l 專用的完全獨立的PCR前處理實驗室進行

4、PCR前處理工序（DNA的提取，量化和標準化）。 l 專用的完全獨立的PCR后處理實驗室進行PCR產(chǎn)品制造和加工。l 絕不使用同一水池進行PCR前處理和PCR后處理材料的清洗工作。l 絕不使用同一個水純化系統(tǒng)進行PCR前處理和PCR后處理的工序。l PCR前處理方法中使用的所有物品均應保存在PCR前處理區(qū)，并根據(jù)需要送到PCR后處理區(qū)。2) 專用設備和用品l 進行PCR前處理和PCR后處理的實驗室工序所使用的設備和用品應當進行專用的獨立的設置（移液器，孵化器，加熱區(qū)，渦旋器，離心機等），同時，PCR前處理和PCR后處理工序不能共用這些設備和用品。l PCR前處理和PCR后處理的實驗耗材應設置專

5、用的獨立的儲存區(qū)域（冰柜和冰箱）二 電的要求1. 電源規(guī)格型號規(guī)格線電壓100240 V AC 50/60 Hz功率600 Watts2. 插座您的設備必須連接下列設備： 1) 對于100-120伏交流電-15安培地接，適當電壓的專用線和電接地是必需的。 北美和日本的插座類型：NEMA5-15 2) 對于220-240伏交流電-10安培的有適當電壓的接地線和電接地是必需的。 3) 如果電壓波動超過10時，電源線調節(jié)器是必需的。3. 安全接地線1) 通過外殼，儀器具有一個來保護接地安全的接點。2) 安全地面通過電源線的返回去保護接地是一種安全參考方案。3) 使用設備的時候，電源線上的保護接地的接

6、地線必須有穩(wěn)定工作條件。4. 電源線1) 儀器擁有一個IEC 60320 C20國際標準的插座盒以及一個區(qū)域特定的電源線。2) 只有當電源線從交流電源上斷開連接的時候，危險電壓才能從這個儀器上移除。3) 要獲得符合當?shù)貥藴实牡刃У牟遄螂娫淳€，咨詢第三方供應商，如Interpower公司注：別使用額外的電源線來連接儀器。5. 保險絲這個儀器有一個不能被用戶更換的保險絲三 不間斷電源（UPS）規(guī)格APC Smart UPS2200 VA LCD 120 V(日本/北美)APC Smart UPS2200 VA LCD 230 V(國際)最大功率1920 W1980 W輸入電壓100120 VAC

7、220240 VAC輸入頻率50/60 Hz50/60 Hz輸入連接NEMA 5-20PIEC-320 C20標準的運行時間（300W）90 分鐘90 分鐘標準的運行時間（600W）40 分鐘40 分鐘注：要獲得符合當?shù)貥藴实牡刃У腢PS，咨詢第三方供應商，如Interpower公司四 環(huán)境限制環(huán)境因素要求溫度維持實驗室溫度在19度到25度(223度).這個溫度是儀器的操作溫度。在運行過程中，別讓周圍溫度的改變超2度。濕度維持20-80%的不凝結的相對濕度。海拔儀器要安裝在海拔2000米以下。空氣質量儀器的操作應該在Pollution Degree II（二級污染）或更好的環(huán)境中。Pollut

8、ion Degree II：通常只包含有非導電污染物。通風請咨詢您的設備部門以便通風要求能夠滿足儀器預期熱量輸出的水平。1. 熱量輸出實測功率熱量輸出600watts2048 BTU/hour2. 噪音輸出噪音輸出（分貝）與儀器的距離 60分貝1米五 網(wǎng)絡考慮1. 對網(wǎng)絡連接來說，儀器提供了一個加保護罩的，3米長的CAT6網(wǎng)線。以下操作需要網(wǎng)絡與英特網(wǎng)連接：l 連接到Illumina BaseSpace或者BaseSpace Onsite。l 通過NextSeq 控制軟件(NCS)界面接收和安裝軟件更新。l 從儀器中移動運行數(shù)據(jù)到服務器位置。l 使用實時幫助, 一個在線的儀器的特點是連接你到I

9、llumina技術支持來排除障礙。2. 網(wǎng)絡支持Illumina并不提供儀器網(wǎng)絡化的安裝和技術支持。使用以下建議來安裝和維護網(wǎng)絡連接：l 在儀器和管理系統(tǒng)之間使用1GB的的連接。這個連接能被直接制作或者通過網(wǎng)絡開關。l 尋求網(wǎng)絡設備管理員對潛在的系統(tǒng)兼容性風險進行網(wǎng)絡維護活動的復查檢測。六 用戶提供的耗材及設備以下的耗材和設備是使用Nexseq 500進行測序所要求的。1. 用戶提供的耗材以下耗材在測序運行前就必須準備好耗材提供者目的1 N NaOH(sodium hydroxide)普通實驗室供應商Library denaturation, 稀釋到0.2 N200 mM Tris-HCl,

10、pH7普通實驗室供應商Library denaturationAlcohol wipes, 70%IsopropylorEthanol, 70%VWR, catalog # 15648-981*普通實驗室供應商流式細胞清洗和通用的目的無粉的一次性手套普通實驗室供應商通用的目的低棉纖維的實驗室紙巾VWR, catalog # 21905-026*流式細胞清洗3%6% NaOCl(sodium hypochlorite)Sigma-Aldrich, catalog #239305*清洗儀器, 稀釋到0.03%0.06% (自動和手動清洗)Tween 20Sigma-Aldrich, catalog #P7949清洗儀器 (手動清洗), 稀釋到0.05%實驗室級別的用水普通實驗室供應商清洗儀器 (手動清洗)2. 實驗室級別用水指導總是使用實驗室級別的水來運行儀器程序。絕不使用自來水或者去離子水。以下的任何一種樣品都是能被接受的： l Illumina PW1l 18 Megohm (M) wa