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文檔簡介
1、NextSeq 500 實驗室指導(dǎo)方案一、 實驗室要求.1-2二、 電的要求3三、 不間斷電源(UPS).4四、 環(huán)境限制5五、 計算網(wǎng)絡(luò)要求.6六、 用戶提供的消耗品和設(shè)備.7-8一 實驗室要求1. Nexseq 500儀器尺寸:測量尺寸高度58.5 cm (23 in.)寬度53.4 cm (21 in.)深度63.5 cm (25 in.)重量83 kg (183 lbs.)2. 安置要求儀器安裝的位置必須保證有足夠的空間,以確保能夠接觸電源開關(guān)和電源插座,以及進行設(shè)備的檢修,同時應(yīng)當(dāng)保持適當(dāng)?shù)耐L(fēng)。 1) 儀器的左側(cè)應(yīng)有足夠的空間,以確保實驗人員能夠控制位于儀器背部電板電源線上的電源開
2、關(guān)。2) 放置儀器以便工作人員可以迅速的從電源插座上斷開電源線。3) 該儀器四周能夠讓實驗人員進入操作的空隙不能小于以下數(shù)值。進入最小間隙邊距至少61cm,儀器的每一邊背部至少10.2cm,儀器背面頂部至少61cm,儀器頂部;如果儀器放在隔板下,依然要符合此規(guī)定注:移動儀器需要聯(lián)系廠家代表。如果移動儀器不當(dāng)會影響光學(xué)校準(zhǔn)以及數(shù)據(jù)的完整性。3. 放置Nextseq 500的實驗臺要求儀器中有精密的光學(xué)原件,應(yīng)該被安裝在堅固的實驗臺上,并遠離振動源。寬度高度深度腳輪122 cm (48 in.)91.4 cm (36 in.)76.2 cm (30 in.)非強制的4. 防止震動源使用以下指導(dǎo)意見
3、最小化測序過程中的震動,以保證光學(xué)表現(xiàn)。1) 把儀器安裝在堅固牢靠的實驗臺上。2) 不要將其他任何可能導(dǎo)致震動的設(shè)備放置在同一實驗臺上,如搖床,渦旋器,離心機,或能引起空氣流動的裝置。3) 在測序過程中,不要打開試劑箱門,緩沖液門,右側(cè)的服務(wù)面板,或流式細胞門。不要在儀器上放置任何物品。5. PCR工序的實驗室設(shè)置實驗室在使用前應(yīng)建立專用區(qū)域和實驗程序,并確保實驗室設(shè)置合理,以減少被PCR產(chǎn)物污染的風(fēng)險(PCR產(chǎn)物會污染試劑,儀器,樣本等,并導(dǎo)致實驗結(jié)果的不準(zhǔn)確性)。1) 專用的完全獨立區(qū)域如果您打算進行PCR序列擴增,儀器必須設(shè)在PCR后處理實驗室。l 專用的完全獨立的PCR前處理實驗室進行
4、PCR前處理工序(DNA的提取,量化和標(biāo)準(zhǔn)化)。 l 專用的完全獨立的PCR后處理實驗室進行PCR產(chǎn)品制造和加工。l 絕不使用同一水池進行PCR前處理和PCR后處理材料的清洗工作。l 絕不使用同一個水純化系統(tǒng)進行PCR前處理和PCR后處理的工序。l PCR前處理方法中使用的所有物品均應(yīng)保存在PCR前處理區(qū),并根據(jù)需要送到PCR后處理區(qū)。2) 專用設(shè)備和用品l 進行PCR前處理和PCR后處理的實驗室工序所使用的設(shè)備和用品應(yīng)當(dāng)進行專用的獨立的設(shè)置(移液器,孵化器,加熱區(qū),渦旋器,離心機等),同時,PCR前處理和PCR后處理工序不能共用這些設(shè)備和用品。l PCR前處理和PCR后處理的實驗耗材應(yīng)設(shè)置專
5、用的獨立的儲存區(qū)域(冰柜和冰箱)二 電的要求1. 電源規(guī)格型號規(guī)格線電壓100240 V AC 50/60 Hz功率600 Watts2. 插座您的設(shè)備必須連接下列設(shè)備: 1) 對于100-120伏交流電-15安培地接,適當(dāng)電壓的專用線和電接地是必需的。 北美和日本的插座類型:NEMA5-15 2) 對于220-240伏交流電-10安培的有適當(dāng)電壓的接地線和電接地是必需的。 3) 如果電壓波動超過10時,電源線調(diào)節(jié)器是必需的。3. 安全接地線1) 通過外殼,儀器具有一個來保護接地安全的接點。2) 安全地面通過電源線的返回去保護接地是一種安全參考方案。3) 使用設(shè)備的時候,電源線上的保護接地的接
6、地線必須有穩(wěn)定工作條件。4. 電源線1) 儀器擁有一個IEC 60320 C20國際標(biāo)準(zhǔn)的插座盒以及一個區(qū)域特定的電源線。2) 只有當(dāng)電源線從交流電源上斷開連接的時候,危險電壓才能從這個儀器上移除。3) 要獲得符合當(dāng)?shù)貥?biāo)準(zhǔn)的等效的插座或電源線,咨詢第三方供應(yīng)商,如Interpower公司注:別使用額外的電源線來連接儀器。5. 保險絲這個儀器有一個不能被用戶更換的保險絲三 不間斷電源(UPS)規(guī)格APC Smart UPS2200 VA LCD 120 V(日本/北美)APC Smart UPS2200 VA LCD 230 V(國際)最大功率1920 W1980 W輸入電壓100120 VAC
7、220240 VAC輸入頻率50/60 Hz50/60 Hz輸入連接NEMA 5-20PIEC-320 C20標(biāo)準(zhǔn)的運行時間(300W)90 分鐘90 分鐘標(biāo)準(zhǔn)的運行時間(600W)40 分鐘40 分鐘注:要獲得符合當(dāng)?shù)貥?biāo)準(zhǔn)的等效的UPS,咨詢第三方供應(yīng)商,如Interpower公司四 環(huán)境限制環(huán)境因素要求溫度維持實驗室溫度在19度到25度(223度).這個溫度是儀器的操作溫度。在運行過程中,別讓周圍溫度的改變超2度。濕度維持20-80%的不凝結(jié)的相對濕度。海拔儀器要安裝在海拔2000米以下。空氣質(zhì)量儀器的操作應(yīng)該在Pollution Degree II(二級污染)或更好的環(huán)境中。Pollut
8、ion Degree II:通常只包含有非導(dǎo)電污染物。通風(fēng)請咨詢您的設(shè)備部門以便通風(fēng)要求能夠滿足儀器預(yù)期熱量輸出的水平。1. 熱量輸出實測功率熱量輸出600watts2048 BTU/hour2. 噪音輸出噪音輸出(分貝)與儀器的距離 60分貝1米五 網(wǎng)絡(luò)考慮1. 對網(wǎng)絡(luò)連接來說,儀器提供了一個加保護罩的,3米長的CAT6網(wǎng)線。以下操作需要網(wǎng)絡(luò)與英特網(wǎng)連接:l 連接到Illumina BaseSpace或者BaseSpace Onsite。l 通過NextSeq 控制軟件(NCS)界面接收和安裝軟件更新。l 從儀器中移動運行數(shù)據(jù)到服務(wù)器位置。l 使用實時幫助, 一個在線的儀器的特點是連接你到I
9、llumina技術(shù)支持來排除障礙。2. 網(wǎng)絡(luò)支持Illumina并不提供儀器網(wǎng)絡(luò)化的安裝和技術(shù)支持。使用以下建議來安裝和維護網(wǎng)絡(luò)連接:l 在儀器和管理系統(tǒng)之間使用1GB的的連接。這個連接能被直接制作或者通過網(wǎng)絡(luò)開關(guān)。l 尋求網(wǎng)絡(luò)設(shè)備管理員對潛在的系統(tǒng)兼容性風(fēng)險進行網(wǎng)絡(luò)維護活動的復(fù)查檢測。六 用戶提供的耗材及設(shè)備以下的耗材和設(shè)備是使用Nexseq 500進行測序所要求的。1. 用戶提供的耗材以下耗材在測序運行前就必須準(zhǔn)備好耗材提供者目的1 N NaOH(sodium hydroxide)普通實驗室供應(yīng)商Library denaturation, 稀釋到0.2 N200 mM Tris-HCl,
10、pH7普通實驗室供應(yīng)商Library denaturationAlcohol wipes, 70%IsopropylorEthanol, 70%VWR, catalog # 15648-981*普通實驗室供應(yīng)商流式細胞清洗和通用的目的無粉的一次性手套普通實驗室供應(yīng)商通用的目的低棉纖維的實驗室紙巾VWR, catalog # 21905-026*流式細胞清洗3%6% NaOCl(sodium hypochlorite)Sigma-Aldrich, catalog #239305*清洗儀器, 稀釋到0.03%0.06% (自動和手動清洗)Tween 20Sigma-Aldrich, catalog #P7949清洗儀器 (手動清洗), 稀釋到0.05%實驗室級別的用水普通實驗室供應(yīng)商清洗儀器 (手動清洗)2. 實驗室級別用水指導(dǎo)總是使用實驗室級別的水來運行儀器程序。絕不使用自來水或者去離子水。以下的任何一種樣品都是能被接受的: l Illumina PW1l 18 Megohm (M) wa
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