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1、蛋白定量ProteinQuantitation【蛋白定量的背景知識(shí)】“蛋白定量”即蛋白質(zhì)定量,蛋白質(zhì)定量根據(jù)其目的分為全蛋白質(zhì)的“總定量法”和特定蛋白質(zhì)的個(gè)別定量法”。蛋白定量是生物學(xué)實(shí)驗(yàn)不可缺少的一部分。為驗(yàn)證細(xì)胞裂解是否成功;2或?yàn)榱藢⒍鄠€(gè)樣品進(jìn)行平行實(shí)驗(yàn)比較或標(biāo)準(zhǔn)化保存, 需對(duì)細(xì)胞裂解液進(jìn)行蛋白定量;3為了判定蛋白的產(chǎn)量,需對(duì)純化好的蛋白進(jìn)行定量;4為了將純化好的蛋白用生物素或者報(bào)告酶進(jìn)行標(biāo)記,同樣需首先對(duì)蛋白樣品進(jìn)行定量,以保證標(biāo)記反應(yīng)在適當(dāng)?shù)幕瘜W(xué)濃度下進(jìn)行。蛋白定量分析涉及到生產(chǎn)科研的多個(gè)領(lǐng)域及行業(yè),也是生物學(xué)科、食品檢驗(yàn)及打擊摻假摻偽、臨床檢驗(yàn)、診斷疾病和質(zhì)量檢驗(yàn)中最常見(jiàn)的方法。|
2、【蛋白定量的方法】蛋白質(zhì)的定量分析是生物化學(xué)和其他生命學(xué)科常涉及的分析內(nèi)容。在生化實(shí)驗(yàn)中,對(duì)樣品中的蛋白質(zhì)進(jìn)行準(zhǔn)確可靠的定量分析,是一項(xiàng)經(jīng)常進(jìn)行的非常重要的工作。蛋白質(zhì)是一種十分重要的生物大分子,它的種類很多,結(jié)構(gòu)不均一,分子量又相差很大,功能各異,這樣就給建立一個(gè)理想而又通用的蛋白質(zhì)定量分析的方法帶來(lái)了許多具體的因難?,F(xiàn)測(cè)定蛋白質(zhì)含量方法有很多:根據(jù)物理性質(zhì):紫外分光光度法;根據(jù)化學(xué)性質(zhì):凱氏定氮法、雙縮服法、Folin-酚試劑法(Lowry法)、BCA法、膠體金法;3根據(jù)染色性質(zhì):考馬斯亮藍(lán)染色法、銀染法;4根據(jù)其他性質(zhì):熒光法;蛋白定量的測(cè)試方法有很多種,其中較為常見(jiàn)的有五種,分別是Br
3、adford法、Bradford斑點(diǎn)試驗(yàn)、Coomassie斑點(diǎn)試驗(yàn)、紫外分光度檢測(cè)法及BCA法這五種。當(dāng)然,每種方法適用的情況都有所不同。實(shí)驗(yàn)最常用的蛋白定量方法為BCA法和Bradford法(也就是考馬斯染色法)BCABCA 蛋白定量和 BradfordBradford 法蛋白定量的區(qū)別|(1)Bradford法測(cè)得的主要是堿性氨基酸和芳香族氨基酸,BCA則沒(méi)有選擇性;該方法用于大多數(shù)蛋白質(zhì)定量是相當(dāng)精確的,特別是用于小分子多肽定量,如核糖核酸酶或溶菌酶等。但是,去污劑(裂解液)的濃度超過(guò)0.2%則影響定量結(jié)果。如TritonX-100,SDS,NP-40等。(2) BCA法 蛋 白 濃
4、度 定 量 是Cu2+ 在 堿 性 的 條 件 下 , 可 以 被 蛋 白 質(zhì) 還 原 成Cu+(BiuretReaction),Cu+和獨(dú)特的BCASolutionA(含有BCA)相互作用產(chǎn)生敏感的顏色反應(yīng)。兩分子的BCA螯合一個(gè)Cu+,形成紫色的反應(yīng)復(fù)合物。該水溶性的復(fù)合物在562nm處顯示強(qiáng)烈的吸光性,吸光度和蛋白濃度在廣泛范圍內(nèi)有良好的線性關(guān)系,因此根據(jù)吸光值可以推算出蛋白濃度。Bradford法蛋白定量是染料與蛋白質(zhì)結(jié)合后引起染料最大吸收波峰的改變,從465nm變?yōu)?95nm,光吸收增加。蛋白質(zhì)染料復(fù)合物具有高的消光系數(shù),因此大大提高了蛋白質(zhì)測(cè)定的靈敏度,最低檢出量為1口蛋白。染料與
5、蛋白質(zhì)的結(jié)合是很迅速的過(guò)程,大約需2min,結(jié)合物的顏色在1h內(nèi)是穩(wěn)定的。一些陽(yáng)離子,如K+,Na+,Mg2+,(NH4)2SO4,乙醇等物質(zhì)不干擾測(cè)定,而大量的去污劑如TritonX100,SDS等嚴(yán)重干擾測(cè)定,少量的去污劑可通過(guò)用適當(dāng)?shù)膶?duì)照而消除。由于染色法簡(jiǎn)單迅速,干擾物質(zhì)少,靈敏度高,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)含量的測(cè)定?!緝?nèi)參(基因/蛋白)的背景知識(shí)】WesternBlot實(shí)驗(yàn)常用于檢測(cè)蛋白表達(dá)量、蛋白表達(dá)產(chǎn)物的正確性等。相對(duì)于其他檢測(cè)蛋白的方法而言WesternBlot實(shí)驗(yàn)在蛋白的定性定量分析、 與“目的蛋白”量的比較方面更簡(jiǎn)單一些。在定量分析時(shí),為排除各樣本蛋白總量不同的干擾,WB的每
6、個(gè)樣本的“上樣量”(并不僅僅指上樣量的體積)即對(duì)應(yīng)泳道的蛋白總量應(yīng)該均一。因此需提前對(duì)各蛋白樣本進(jìn)行定量,使得各樣本的蛋白濃度一致,如此WB時(shí),當(dāng)每泳道上樣體積一致時(shí),則對(duì)應(yīng)的蛋白總量也一致。作為Control,應(yīng)選擇能在各個(gè)細(xì)胞都能穩(wěn)定表達(dá)的內(nèi)參基因(常見(jiàn)的內(nèi)參基因有&Actin,GAPDH等,具體需參考文獻(xiàn)),如WB的結(jié)果顯示內(nèi)參基因一致,則表明本次實(shí)驗(yàn)各泳道的蛋白總量一致,實(shí)驗(yàn)也就具備了分析的前提和基礎(chǔ)。內(nèi)參即是內(nèi)部參照( (InternalControl),對(duì)于哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)來(lái)說(shuō)一般是指由管家基因編碼表達(dá)的蛋白( (HousekeepingProteins),它們?cè)诟鹘M織和細(xì)
7、胞中的表達(dá)相對(duì)恒定,在檢測(cè)蛋白的表達(dá)水平變化時(shí)常用它來(lái)做參照物。在WesternBlotting實(shí)驗(yàn)中,除了需要進(jìn)行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上樣電泳、轉(zhuǎn)膜、靶蛋白抗體孵育、顯色等步驟以外,還需要進(jìn)行內(nèi)參的檢測(cè),以校正蛋白質(zhì)定量、上樣過(guò)程中存在的實(shí)驗(yàn)誤差,保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。雖然,順利的時(shí)候WesternBlot做起來(lái)很簡(jiǎn)單,可不順的時(shí)候也很令人心煩一一做不出結(jié)果、假陽(yáng)性、結(jié)果出現(xiàn)多條帶、到底是一抗有問(wèn)題還是二抗有問(wèn)題畢竟,作為一種有活性的生物大分子,抗體和抗原的反應(yīng)不像“1+1”那么明確,而用這種不確定的試劑來(lái)測(cè)定同樣知之甚少的表達(dá)產(chǎn)物,確實(shí)是有一定的不確定性。所以,嚴(yán)謹(jǐn)?shù)腤estern
8、Blot實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中要求有良好的參照體系,對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分析非常有用。特別是當(dāng)實(shí)驗(yàn)出現(xiàn)問(wèn)題時(shí),借助參照體系很容易就可以查出問(wèn)題所在,而不必抓耳撓腮,怨天尤人。良好的參照體系通常包括分子量Marker(用來(lái)確定蛋白條帶對(duì)應(yīng)的分子量大小卜空白載體對(duì)照(如果是誘導(dǎo)表達(dá)體系還應(yīng)該有誘導(dǎo)前的對(duì)照卜已知量標(biāo)準(zhǔn)產(chǎn)物的正對(duì)照,另外還有內(nèi)參。可是由于經(jīng)費(fèi)限制或者偷懶的原因,國(guó)內(nèi)的不少人做WesternBlot往往省略參照,導(dǎo)致結(jié)果出現(xiàn)問(wèn)題時(shí)無(wú)法分析結(jié)果,即便有結(jié)果也可能影響結(jié)果的分析。實(shí)際上內(nèi)參是最容易被忽略的一項(xiàng)。我們知道,要用WesternBlot比較不同條件下或者不同組織中,目的蛋白表達(dá)量的相對(duì)多少,前提條件
9、是等量的細(xì)胞上樣,才有比較的基礎(chǔ),特別表達(dá)量不高時(shí),上樣量的差別就很可能影響結(jié)果的分析,所以需要內(nèi)參。在國(guó)外發(fā)表的文章中,WesternBlotting實(shí)驗(yàn)結(jié)果須進(jìn)行內(nèi)參校正已成為一種慣例。但是,國(guó)內(nèi)仍有不少科研人員在WesternBlotting實(shí)驗(yàn)中忽略了內(nèi)參的使用,將蛋白濃度測(cè)定作為規(guī)范需相互比較的各種樣品間上樣量等同的唯一方法。然而各種蛋白質(zhì)濃度定量方法,都存在局限性,不能完全準(zhǔn)確的確定各種樣品的蛋白濃度。如UV法直接定量,適合測(cè)試較純凈、成分相對(duì)單一的蛋白質(zhì),相對(duì)于比色法來(lái)說(shuō),操作簡(jiǎn)單,但是容易受到平行物質(zhì)如DNA的干擾,且敏感度低,要求蛋白的濃度較高。比色法測(cè)定蛋白濃度一般有BCA
10、、Bradford、Lowry等幾種方法。BCA法與Lowry法都容易受到蛋白質(zhì)之間以及去污劑的干擾。Bradford法敏感度最高,且與一系列干擾Lowry、BCA反應(yīng)的還原劑(如DTT,疏基乙醇)相容,但是對(duì)去污劑依然是敏感的,其最主要的缺點(diǎn)是不同的標(biāo)準(zhǔn)品會(huì)導(dǎo)致同一樣品的結(jié)果差異較大,無(wú)可比性。另外,蛋白質(zhì)定量以后進(jìn)行電泳時(shí)需要等量上樣,此步驟也存在操作誤差。在Westernblotting實(shí)驗(yàn)時(shí)使用內(nèi)參,即可簡(jiǎn)便地對(duì)定量和上樣步驟產(chǎn)生的誤差進(jìn)行校正。在WesternBlot中使用內(nèi)參其實(shí)就是在WB過(guò)程中另外用內(nèi)參對(duì)應(yīng)的抗體檢測(cè)內(nèi)參,這樣在檢測(cè)目的產(chǎn)物的同時(shí)可以檢測(cè)內(nèi)參的表達(dá),由于內(nèi)參在各組
11、織和細(xì)胞中的表達(dá)相對(duì)恒定,借助檢測(cè)每個(gè)樣品內(nèi)參的量就可以用于校正上樣誤差,這樣半定量的結(jié)果才更為可信。此外使用內(nèi)參可以作為空白對(duì)照,檢測(cè)蛋白轉(zhuǎn)膜情況是否完全、整個(gè)WesternBlot顯色或者發(fā)光體系是否正常。在 WesternBlottingWesternBlotting 實(shí)驗(yàn)過(guò)程中使用內(nèi)參的方法通常有以下三種:(1)第一種是超級(jí)簡(jiǎn)便的標(biāo)記內(nèi)參使用法,只要在二抗孵育時(shí)加入HRP標(biāo)記內(nèi)參抗體,按照正常操作即可;(2)第二種是普通內(nèi)參,當(dāng)目的蛋白的分子量大小與選用的內(nèi)參蛋白分子量相差不大時(shí),可以先進(jìn)行目的蛋白的抗體溫育顯色和檢測(cè), 然后使用Strip緩沖液洗掉膜上的抗體, 重新進(jìn)行內(nèi)參蛋白的抗體
12、溫育、顯色檢測(cè)。(3)第三種(最常用),當(dāng)目的蛋白的分子量大小與選用的內(nèi)參蛋白分子量大小相差比較明顯情況下,可以在轉(zhuǎn)膜后預(yù)染,根據(jù)蛋白質(zhì)Marker的大小將膜剪為大分子量和小分子量?jī)刹糠?,使?nèi)參蛋白與目的蛋白分開(kāi),然后兩塊膜分別與內(nèi)參蛋白抗體以及目的蛋白抗體進(jìn)行孵育,二抗孵育以及顯色。常用的蛋白質(zhì)內(nèi)參有GAPDH甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphatedehydrogenase)和細(xì)胞骨架蛋白beta-actin或beta-tubulino一般我們選擇內(nèi)參與要檢測(cè)的目的蛋白的分子量最好相差10kDa以上。因此你要知道你檢測(cè)的蛋白的分子量來(lái)選擇合適的內(nèi)參?!?
13、amp;ActinActin、GAPDHGAPDH、TubulinTubulin 的具體應(yīng)用】actin即肌動(dòng)蛋白,是細(xì)胞的一種重要骨架蛋白。Actin大致可分為六種,其中四種是不同肌肉組織特異性的,包括alpha-skeletalmuscleactin、alpha-cardiacmuscleactin、alpha-smoothmuscleactin和gamma-smoothmuscleactin,其余兩種廣泛分布于各種組織中,包括beta-actin(&non-muscle)和gamma-non-muscleactin。這些不同的亞型組織分布是不一樣的,在肌肉組織中的beta-act
14、in分布就很少,心肌主要是alpha-cardiacmuscleactin。因此不同的組織本來(lái)就應(yīng)該選擇不同的內(nèi)參,不能一概而論的。Beta-actin作為內(nèi)參是得到了公認(rèn)的,這是針對(duì)大多數(shù)組織和細(xì)胞來(lái)說(shuō)的,它廣泛分布于細(xì)胞漿內(nèi),表達(dá)量非常豐富。盡管最近有一些文章已經(jīng)開(kāi)始質(zhì)疑beta-actin作為內(nèi)參的有效性(疑似對(duì)于上樣量20的的蛋白區(qū)分能力下降),但是發(fā)文章應(yīng)該還是沒(méi)有問(wèn)題的。至于其他的內(nèi)參也是可以考慮用的,GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)是參與糖酵解的一種關(guān)鍵酶,而tubulin和actin類似,是細(xì)胞骨架的組成部分,但不是肌肉的主要成分,應(yīng)該是一個(gè)代替品。上述三種內(nèi)參同時(shí)發(fā)生變化
15、的情況很少,需要具體分析。一旦出現(xiàn)上述三種內(nèi)參同時(shí)發(fā)生變化,如果是總蛋白可以用胞核的內(nèi)參如PCNA,TATA-boxbindingprotein(TBP)甚至線粒體的內(nèi)參來(lái)代替,當(dāng)然一般這種可能性出現(xiàn)的幾率微乎其微。不同異構(gòu)體表達(dá)對(duì)蛋白的檢測(cè)是有很大的影響,買抗體前要好好熟悉自己的目的蛋白,很多抗體雜不出條帶其實(shí)未必是抗體質(zhì)量的問(wèn)題。很多公司的內(nèi)參抗體是用抗原片段制備的, 不同的公司選擇的片段不一樣。 以最常用的beta-actin為例,有的公司選擇N-端,有的選擇C-端。選用N-端Ac-Asp-Asp-Asp-Ile-Ala-Ala-Leu-Val-Ile-Asp-Asn-Gly-Ser-G
16、ly-Lys16aa作為抗原制備抗體(單抗和多抗)的占大多數(shù),主要有SantaCruz(Cat#sc-69879),sigma(Cat#A197等),ProSci(Cat#3779),CellSignaling(Cat#4967),AxxoraPLATFORM(BET-A300)等,這類抗體均不能檢測(cè)心肌和橫紋肌中的actin條帶。選用C-端16aa短肽作為抗原制備抗體的主要有AxxoraPLATFORM(PSC-3777),EPITOMICS(1784-1,1854-1等), 這類抗體可以在肌肉細(xì)胞中檢測(cè)到actin陽(yáng)性信號(hào)。有時(shí)候在實(shí)驗(yàn)中檢測(cè)內(nèi)參時(shí)產(chǎn)生組織特異性”,就是由于抗體選擇不對(duì)造成
17、的。actin幾種異構(gòu)體存在組織分布特異性,不同型actin之間具有較高的序列相似性(90%)。&actin是分布于非肌細(xì)胞中的一種骨架蛋白,選擇作lactin內(nèi)參時(shí)首先得保證是組織廣泛表達(dá)的(尤其是做蛋白的組織表達(dá)譜時(shí))。那么制備(-actin抗體的抗原應(yīng)該是選用與actin其它異構(gòu)體一致的氨基酸序列。公司制備抗體是選用lactin的某一段小短肽作為免疫原,可能會(huì)因?yàn)檫x取的短肽在不同型actin之間保守與否,而導(dǎo)致所制備抗體具有一定的組織特異性.如選取的短肽僅在beta型存在,所得抗體就僅能檢測(cè)非肌細(xì)胞中的actin,而選取的短肽在六型中均存在,則此抗體除非肌細(xì)胞外,還可以檢測(cè)car
18、diac,skeletal,smoothmuscle細(xì)胞的actin。WesternBlot實(shí)驗(yàn)中選擇內(nèi)參作為參照體系對(duì)于實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分析具有很好的說(shuō)明性。內(nèi)參的選擇往往使用一些常見(jiàn)的持家基因(管家基因),常用蛋白內(nèi)參有GAPDH、beta-actin等。WesternBlot實(shí)驗(yàn)中內(nèi)參的選擇及其使用方法都會(huì)直接影響對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分析。【BCABCA 法蛋白定量的原理】Cu2+在堿性的條件下,可以被蛋白質(zhì)還原成Cu+,Cu+和獨(dú)特的BCASolutionA(含有BCA)相互作用產(chǎn)生敏感的顏色反應(yīng)。從原來(lái)的蘋(píng)果綠色螯合成紫藍(lán)色的復(fù)合物。在562nm處顯示強(qiáng)烈的吸光性, 且吸光度和蛋白濃度在廣泛范圍內(nèi)
19、有良好的線性關(guān)系,因此根據(jù)吸光值可以推算出蛋白濃度。BCABCA 法蛋白定量的工作范圍BCA法測(cè)定蛋白質(zhì)濃度的范圍是20醫(yī)g/m1200醫(yī)g/ml【碧云天 BCABCA 試劑盒特點(diǎn)簡(jiǎn)介】碧云天BCA試劑盒官方說(shuō)明http:/ 37c37c 生化培養(yǎng)箱;一般推薦每天上午裂解細(xì)胞,收取蛋白樣品,下午立刻行BCA法進(jìn)行蛋白定量實(shí)驗(yàn),如此可以防止蛋白降解;如果裂解細(xì)胞第二天開(kāi)始進(jìn)行蛋白定量實(shí)驗(yàn),則務(wù)必檢查是否有足夠的冰;02.待檢測(cè)的蛋白樣品插置冰上且保存在 4c4c 冰箱待用;03.檢查預(yù)先配制的蛋白標(biāo)準(zhǔn)品是否夠用,如果不足,則重新配制;蛋白標(biāo)準(zhǔn)品在BCA試劑盒(碧云天)內(nèi),由廠家提前配制好貯存溶液
20、,用于標(biāo)準(zhǔn)曲線的測(cè)定;具體步驟為:完全溶解蛋白標(biāo)準(zhǔn)品,取10口稀釋至100口使終濃度為0.5mg/ml。一般而言,蛋白樣品在什么溶液中,標(biāo)準(zhǔn)品也宜用什么溶液稀釋。但為了簡(jiǎn)便起見(jiàn),也可以用0.9%NaCl溶液或PBS稀釋標(biāo)準(zhǔn)品。 稀釋后的0.5mg/ml蛋白標(biāo)準(zhǔn)可以放置在-20C長(zhǎng)期保存。根據(jù)實(shí)驗(yàn)方案,標(biāo)記相應(yīng)的 EPEP 管;由于BCA法需制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,故即便樣本量不大,也需要較多的EP管;如樣本量較大,以及需要雙梯度稀釋蛋白樣本時(shí),則需要大量的EP管,因此需提前標(biāo)記好待用;一般標(biāo)準(zhǔn)曲線8個(gè);樣本則需標(biāo)記3套EP管,20倍稀釋(1口樣品),10倍稀釋(2L樣品),最終的調(diào)平蛋白濃度(高濃度蛋白
21、樣品補(bǔ)齊之后);加上此前裂解細(xì)胞提取蛋白所需的EP管(通常是一天之內(nèi)進(jìn)行),因此需要4套EP管;為實(shí)驗(yàn)方便,用于配制梯度稀釋的蛋白樣品的EP管的標(biāo)記,可以使用簡(jiǎn)寫(xiě),但操作時(shí)需嚴(yán)格得從始至終一一對(duì)應(yīng);05.估算擬加 BCABCA 工作液檢測(cè)的孔數(shù);標(biāo)準(zhǔn)曲線 1616 孔,蛋白樣品每個(gè)樣本 2 2 個(gè)副孔,共 3 3 個(gè)孔;考慮到 BCABCA 工作液的價(jià)格,一般預(yù)留 10%10%配制;04.01248121620 蛋白標(biāo)準(zhǔn)液體積標(biāo)準(zhǔn)曲線10 倍稀釋2HL士呈口件口口20 倍稀釋1pL樣品06.將上述實(shí)驗(yàn)方案簡(jiǎn)單繪制于檢測(cè)使用的 9696 孔板上,放在冰上孵育待用;蛋白極易降解,因此實(shí)驗(yàn)操作時(shí),除
22、需佩戴口罩外,全程皆應(yīng)在冰上進(jìn)行;有條件時(shí),盛放蛋白樣品的EP管,96孔板要進(jìn)行提前預(yù)冷;07.開(kāi)始配制標(biāo)準(zhǔn)曲線(蛋白標(biāo)準(zhǔn)品線性稀釋液)以及樣品孔的上樣溶液”;按照匯總配制的原則,標(biāo)準(zhǔn)曲線按 2.52.5 孔體積配制,樣品孔按3.53.5 孔體積配制;配好后,插冰待用;(1)蛋白標(biāo)準(zhǔn)曲線梯度樣品的配制將標(biāo)準(zhǔn)品按0、1、2、4、8、12、16、20醫(yī)加到96孔板的標(biāo)準(zhǔn)品孔中,力口標(biāo)準(zhǔn)品稀釋液補(bǔ)足到20醫(yī) 相當(dāng)于標(biāo)準(zhǔn)品濃度分別為0、0.025、0.05、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5mg/ml;蛋白標(biāo)準(zhǔn)品體積(dD01248121620對(duì)應(yīng)蛋白濃度(mg/ml)00.0250.050.10
23、.實(shí)際按照2.5個(gè)孔匯總配制;單塊96孔板(1根標(biāo)準(zhǔn)曲線)(2.5well)蛋白標(biāo)準(zhǔn)品體積(醫(yī)。01248121620應(yīng)加蛋白標(biāo)準(zhǔn)品體積(醫(yī)L)02.551020304050應(yīng)補(bǔ)充蛋白稀釋液體積(醫(yī)L)5047.545403020100兩塊96孔板(2根標(biāo)準(zhǔn)曲線)(Swell)(樣本量較大時(shí))蛋白標(biāo)準(zhǔn)品體積(01248121620P13應(yīng)加蛋白標(biāo)準(zhǔn)品體積(醫(yī)L)051020406080100應(yīng)補(bǔ)充蛋白稀釋液體積(醫(yī)L)1009590806040200上述為理想情況;一般實(shí)驗(yàn)時(shí),蛋白樣本量不會(huì)太大,同時(shí)制作兩根標(biāo)準(zhǔn)曲線也費(fèi)時(shí)費(fèi)力,一般制作一根即可;如一定要制作兩根標(biāo)準(zhǔn)曲線,則
24、檢測(cè)時(shí),一塊96孔板應(yīng)將全部樣品上樣(比如都上20倍稀釋的樣),如此才可以根據(jù)該標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行定量(樣品太多跨兩塊96孔板的話,則涉及到使用哪一根標(biāo)準(zhǔn)曲線的問(wèn)題);(2)待檢測(cè)蛋白樣品的配制稀釋20倍(樣品1L)匯總配方:3.5Lsample+66.5LPBS稀釋10倍(樣品2L)匯總配方:7dLsample+6dLPBS稀釋的目的是因?yàn)锽CA法測(cè)定蛋白濃度有工作范圍”;一般而言,裂解所得的蛋白樣品濃度過(guò)高,需進(jìn)行稀釋方能檢出;常見(jiàn)的稀釋倍數(shù)為10倍,即2dL樣品+18醫(yī)LPBS;但個(gè)別情況濃度還較高,為免重復(fù)實(shí)驗(yàn),一般還平行補(bǔ)充一組20倍稀釋的樣本;08.根據(jù)步驟 0505 估算的總孔數(shù)配制
25、BCABCA 工作液;一般以 A A 液體積為準(zhǔn),忽略 B B 液體積;A A 液:B B 液=50:1;=50:1;BCA工作液需現(xiàn)用現(xiàn)配,一般在樣本加入96孔前配制即可;09.將步驟 0707 所配置的各土樣蛋白溶液,按每孔 2020pLpL 的體積加入到對(duì)應(yīng)孔中;96孔板在實(shí)驗(yàn)時(shí)容易看錯(cuò),操作時(shí)應(yīng)嚴(yán)格“唱名”,一一對(duì)應(yīng);同一樣品同一梯度可不換Tip頭,但吸取不同的土樣蛋白溶液”時(shí)則需及時(shí)更換Tip頭;止匕外,當(dāng)移液槍殘留液體較多時(shí),則每加完一上樣孔,需更換Tip頭;先加20口的土樣蛋白溶液”再加200口的BCA工作液看似違背加液體的原則(只能小體積加入大體積),但采取此辦法,一則加樣品時(shí)
26、不需要每孔都要換Tip頭,二則節(jié)約更換Tip頭的時(shí)間,可以使得各孔內(nèi)BCA反應(yīng)更均一;操作時(shí),96孔板應(yīng)始終置于冰上;10.每檢測(cè)孔加入 200pLBCAI200pLBCAI 作液;加BCA工作液前,打勻勿忘記;11.將待檢測(cè) 9696 孔板放入 37c37c 生化培養(yǎng)箱內(nèi),孵育 3030min;min;也可以室溫放置2小時(shí),或60c放置30分鐘;如忘記打開(kāi)生化培養(yǎng)箱,則放入60c烘箱內(nèi);BCA法測(cè)定蛋白濃度時(shí),顏色會(huì)隨著時(shí)間的延長(zhǎng)不斷加深。并且顯色反應(yīng)會(huì)因溫度升高而加快。如果濃度較低,適合在較高溫度孵育,或適當(dāng)延長(zhǎng)孵育時(shí)間;12.將待檢測(cè) 9 96 6 孔板放入酶標(biāo)儀內(nèi),如實(shí)驗(yàn)室的酶標(biāo)儀非全
27、波長(zhǎng)而又沒(méi)有540-595nm之間的其他波長(zhǎng)的濾光片進(jìn)行檢測(cè);蛋白定量(蛋白總量配平)的數(shù)據(jù)處理本次實(shí)驗(yàn)酶標(biāo)儀檢測(cè)結(jié)果如下所示:程序:Demo219.12.201611.50.00標(biāo)準(zhǔn)曲線區(qū)域板格式-96孔2。倍稀釋區(qū)域吸光率漉鏡1:完 2納米10 倍稀釋區(qū)域1不34567S9101112A0.1310.1340.1410,】590.190.2070.2250.2470.1470.1480.1560.16B0.1280.134。13901560.1880.2010.222Q.2430.1460.0590.1540.044C0.1350.134013201360.1320.1290.1310.1
28、31013401430.1390.142D0.1350.135013401320.1320.1360.1301301310.140.13S0.142E0.1350.13201320.1340.1320.130.1310.1310.13201390.1410.1-HF0.1420.1430.1410.1320,1390.1380.1320.1470.1380.1530.1510.154G0.1420140.1401380.140.1360.1390.1390.13801520.1560.153H0.1450.143014301420.1+40.140.M0.1420.142015701570.1
29、5601.數(shù)據(jù)區(qū)域劃分待用,并審核是否有異常數(shù)據(jù);562nm562nm 波長(zhǎng)處測(cè)定 ODOD 值;562nm波長(zhǎng)的濾光片,則選取標(biāo)涯曲線OD值0.1510.1340.1410.1590.190.2070.2250.2470.12B0.H40.1390.1560.1380.2010.2220.243標(biāo)準(zhǔn)曲線OD均值0.12950.1340.140.15750.1890.2040.22350.245如R2值0.99,則本次實(shí)驗(yàn)可信;如R2值V0.99,則根據(jù)情況,剔除不可信值或重復(fù)實(shí)驗(yàn);標(biāo)準(zhǔn)曲線方程的制作|選定數(shù)據(jù)后,“插入”菜單欄里選擇“散點(diǎn)圖”,再選擇僅帶數(shù)據(jù)標(biāo)記的散點(diǎn)圖;選定上圖中的“數(shù)據(jù)點(diǎn)
30、”后,右鍵選擇“添加趨勢(shì)線”國(guó)H叼.0E福爵里表格SEJ表格BCA-2016112116無(wú)血清譏限L匚M返北賽峭證白Ft&sl取看5油敝二圉特西站亙制圖表rfEjffi住造困谷虧方俏FTig-ml)比砥物藪瓦cone.泳HE帶省國(guó)二MHC.(收時(shí)睛值不以X軸為度序,atMi示獨(dú)立的的刖可慎用該圖.苴31布局公式近施畝間唄溝Acrobar形狀SmarlArt號(hào)苜做圉柱F溷折短期語(yǔ)圖條形能Ac1238 值concr(40.12950501340025G0.140.0570.15750.1艮0.1850290.2040.3ID0.22350.4110.2J50.51213141516B3理粒
31、(Eanc.(rne/ml)單欄中選擇“線性”,同時(shí)下方的“顯示公式”和“顯示R平方值”兩個(gè)02.計(jì)算出標(biāo)準(zhǔn)曲線方程待用;OD值cone,(mgml)0.129500.1340.0250.140.050.15750,10.1890.20.2040.30.2454545SOSO+ +;在彈出來(lái)的菜選項(xiàng)框也一并勾選;03.計(jì)算出樣本的 ODOD 平均值,結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)曲線分析評(píng)估;1計(jì)算樣本OD均值之前,要對(duì)相關(guān)孔的OD值進(jìn)行初篩,如出現(xiàn)數(shù)值明顯異常的,需提前排除;2樣本OD值一般無(wú)特殊情況,數(shù)值不會(huì)相差懸殊;OD值需在標(biāo)準(zhǔn)曲線的區(qū)間之間,即不得低于最低值(樣本蛋白質(zhì)濃度太低),高于最高值(樣本蛋白質(zhì)濃
32、度太高,稀釋不夠);3如進(jìn)行了雙梯度稀釋,選擇的標(biāo)準(zhǔn)在于,何者更接近標(biāo)準(zhǔn)曲線的中間段;1匹稀釋2。倍0.1350.13404320.1360.1320.1290.1310.1310.134 0,1430.1390,142OD值0J35043504340,1320.1320.B60.130,130.1310.140.1380.1420.135OJ320.1320.1340.1320,130.1310.1310,132 0.1390,1410.141IpLOD均值0.1350.1340.1330.1340,1320.1320310.1310.1320.1410.1390.142標(biāo)準(zhǔn)曲線OD均值范圍
33、0.1295-02452ML稀釋2。倍0.1420.1430.1410.13204390.13804320.1470.138 0.1530.1510.154OD值0.143S0.140.1360.1390.1390.138 0.1520.1560.1530.1450.1430J430,14204420,142 0,1570,1570.1562HL0口均值0.1430.1420.1410.1370.1410.1380.1370.1430.139 0.1540.155Q.1S4出字fist更審息到任就能型m.選解莊正;.彳H3niIIliB0t5!如$45;和蔚3,1)tone*(mg/ml)的兇.S至1.10五正)_招除必生波以年舊5式圖04.確定使用某一稀釋梯度的數(shù)值后,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線方程,得出各樣品的蛋白濃度;本實(shí)驗(yàn)采納稀釋10倍(2L樣品)的數(shù)值;05.確定基準(zhǔn)(最小值)濃度,根
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