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1、精選優(yōu)質(zhì)文檔-傾情為你奉上 合理選擇耐熱DNA聚合酶是PCR成敗與否的一個關(guān)鍵因素,如何選擇最合適的耐熱聚合酶,是進行PCR實驗首先要考慮的問題。目前市面上有許多耐熱DNA聚合酶,雖然名稱各不相同,但主要區(qū)別在于特異性、保真性、耐熱性、擴增速率、擴增片段長度等幾個指標。 Taq DNA聚合酶 存在于水生嗜熱菌(Thermus aquaticus)的嗜熱DNA聚合酶,可在74復(fù)制DNA,在95仍具有酶活力。該酶可在離體條件下,以DNA為模板,延伸引物,合成雙鏈DNA。這個酶只有53DNA聚合酶活性和53的外切酶活性,缺少35的外切酶活性,即具有5-3DNA聚合酶活性和對雙鏈DNA特異的5-3外切
2、核酸酶活性,無3-5外切酶活性。使用該產(chǎn)品擴增得到的PCR產(chǎn)物的3末端附有一個“A”堿基,可直接用于TA克隆。由于不具有3-5外切酶活性,因而在合成中對某些單核苷酸錯配沒有校正功能。 TaqDNA聚合酶還具有非模板依賴性活性,可將PCR雙鏈產(chǎn)物的每一條鏈3加入單核苷酸尾,故可使PCR產(chǎn)物具有3突出的單A核苷酸尾;另一方面,在僅有dTTP存在時,它可將平端的質(zhì)粒的3端加入單T核苷酸尾,產(chǎn)生3端突出的單T核苷酸尾。應(yīng)用這一特性,可實現(xiàn)PCR產(chǎn)物的T-A克隆法。適用于: 普通PCR,TA克隆 Super Taq DNA聚合酶 Super Taq DNA聚合酶是由耐熱的Taq DNA聚合酶和具有3-5
3、外切酶活性的高保真DNA聚合酶按照最合適的比例混合而成,具有擴增效率高和錯配率低的優(yōu)良性能,使用該產(chǎn)品擴增得到的PCR產(chǎn)物的3末端附有一個“A”堿基,可直接用于TA克隆。適用于:要求效率高保真性好的PCR反應(yīng)。UlltraPF DNA聚合酶 UlltraPF DNA Polymerase是一種耐熱的超保真DNA聚合酶,具有5-3聚合酶活性和3-5外切酶活性,具有比Pfu DNA Polymerase更好的保真性能和更快的擴增效率。使用該產(chǎn)品擴增得到的PCR產(chǎn)物為平滑末端,可直接克隆于平滑末端載體中。 LA Taq DNA 聚合酶 LA Taq DNA polymerase是一種具有5-3DNA
4、聚合酶活性和3-5校對活性的聚合酶,可用于擴增較長的富含GC的片段。作為具有3-5校對活性的且熱穩(wěn)定性最強的DNA聚合酶之一,該酶可在最佳溫度(75)催化DNA合成,且錯配率低(準確率約是標準Taq DNA polymerase的10倍)。該酶可擴增人基因組DNA長達17.5 kb的片段和DNA長達20 kb的片段。在較長的PCR擴增中應(yīng)用LApro Taq DNA polymerase可減少拖尾效應(yīng),實際上減少背景影響。LA Taq DNA polymerase擴增產(chǎn)物帶有A尾可用于T-A克隆。LA Taq DNA聚合酶的應(yīng)用: LA Taq DNA polymerase可應(yīng)用于許多方面:擴
5、增人基因組中長達20 kb的片段;高忠實度擴增;比普通Taq聚合酶更穩(wěn)定;T-A克??;定點突變;片段分析。 Tth DNA聚合酶 Tth DNA聚合酶是一種熱穩(wěn)定性酶,分子量為92kDa,從Thermus thermophilus HB-8中分離。該酶在74時可進行DNA復(fù)制,在95的半衰期為20分鐘。 Tth DNA聚合酶在鎂離子存在的條件下可催化核苷酸沿53方向發(fā)生聚合反應(yīng),形成雙鏈DNA,也可在鎂離子存在的條件下,以RNA為模板沿53方向發(fā)生核苷酸聚合反應(yīng)。該酶也具有53外切酶活力。 Tth DNA聚合酶可用于PCR、RT-PCR、逆轉(zhuǎn)錄和較高溫度條件下的引物延伸反應(yīng)。產(chǎn)品特點:1、RT
6、-PCR反應(yīng)的特異性增加:在較高的溫度下進行逆 轉(zhuǎn)錄,增加了引物雜交和延伸的特異性2、二級結(jié)構(gòu)減少:在較高的溫度下進行逆轉(zhuǎn)錄,減少了由于RNA二級結(jié)構(gòu)引起的問題3、當加入Mg2+后,該酶的聚合活性大大增加,從而使cDNA合成與擴增可用一種酶催化。生產(chǎn)公司:美國 promage 公司 Pfu DNA 聚合酶 該酶在75時可進行DNA復(fù)制,Pfu DNA聚合酶在鎂存在的條件下可催化核苷酸沿53方向發(fā)生聚合反應(yīng),形成雙鏈DNA,Pfu DNA聚合酶具有3 5外切酶校正活性。當聚合反應(yīng)發(fā)生堿基錯配時,聚合酶的校正活性可將錯配的堿基切除。在所有熱穩(wěn)定性聚合酶中Pfu DNA聚合酶的錯誤幾率最低,錯誤率約
7、為110-6/每堿基對 ,缺點是PCR擴增靈敏度較Taq 低。建議Pfu DNA聚合酶用于要求保真度比較高的PCR反應(yīng),引物的延伸反應(yīng)以及其它的一些應(yīng)用,包括克隆、DNA表達、突變分析等。Pfu DNA聚合酶產(chǎn)生的PCR產(chǎn)物為平端,無末端磷酸化。若要進行“T-A”克隆,可在PCR反應(yīng)完了之后,加入Taq DNA聚合酶,于72反應(yīng)1-2小時,以便在DNA 3端附加一個“A”。 GenStar Pfu DNA Polymerase是將克隆有Pyrococcus furiosis的DNA聚合酶基因在大腸桿菌中重組表達,經(jīng)多次柱層析純化而獲得的高純度、高效率耐熱DNA聚合酶。該酶具有53DNA聚合酶活
8、性和35的外切酶活性(即校讀活性),能夠糾正DNA擴增過程中產(chǎn)生的堿基錯配現(xiàn)象,適用于對保真性要求較高的DNA片段的擴增,如基因克隆、定點突變、SNP分析等,也可用于DNA片段的末端補平。本產(chǎn)品擴增得到的PCR產(chǎn)物無3端突出堿基,不可直接用于T載體克隆。用途:基因克隆、測序;定點突變。特點:高保真性:高純度的酶帶來優(yōu)于其它品牌的保真性。 VentR DNA 聚合酶 該酶是從Litoralis棲熱球菌中分離出的,不具有5-3外切酶活性,但具有3-5外切酶活性,可以去除錯配的堿基,具有校對功能。生產(chǎn)公司:美國NEB公司Phusion DNA聚合酶 特的Phusion DNA聚合酶是Finnzyme
9、s公司的拳頭產(chǎn)品,其合成準確率和合成速度無與倫比。Phusion DNA聚合酶的獨特的分子結(jié)構(gòu)和特性使其成為基因克隆的最佳選擇,為PCR擴增樹立了新的標準。Phusion DNA聚合酶(以及Phusion Hot Start DNA聚合酶)的出錯率是4.4 x 10-7,比Taq DNA聚合酶低50倍、比Pfu酶低6倍,是目前市場上準確性最高的DNA聚合酶;此外其擴增速率比Pfu快10倍,比Taq酶快2倍。Phusion DNA聚合酶的應(yīng)用:高保真PCR:擴增錯誤率只有4.4 x 10-7,是目前保真性最好的DNA聚合酶克?。篜husion DNA擴增保真性最好,基因克隆的最佳選擇長片段擴增:
10、最高的核苷酸滲入率,在短時間內(nèi)可以擴增更長的DNA片段DHPLC分析芯片分析 生產(chǎn)公司:Finnzymes公司KOD DNA聚合酶 1、最適合于克隆反應(yīng),具備超群的準確性 KOD DNA多聚酶的特點是具有很高水準的準確性,而KOD Plus的準確性則有了更大的提高,具有Taq DNA多聚酶82倍左右的PCR可信度,最適合于克隆。 2、通過熱啟動PCR,提高了PCR的性能。 通過采用兩種抗kod單克隆抗體,抑制了PCR反應(yīng)前常溫狀態(tài)下的多聚酶活性和35核酸外切酶活性。不需其他特殊操作即可進行熱啟動PCR。抗體的阻斷作用在94、2分鐘預(yù)熱下即發(fā)生失活,不需要冗長的變性步驟,實現(xiàn)了高特異性 的PCR
11、反應(yīng)。 3、伸長性、擴增效果的提高 對PCR反應(yīng)緩沖液的組成進行了最優(yōu)化重組,使之較以往的KOD DNA多聚酶相比伸長性及擴增效果均有所提高,可對更多種類的目標物進行PCR反應(yīng)。 4、超群的耐熱性 因來源于超嗜熱原始菌,其耐熱性比Taq DNA多聚酶還要高,在100、1小時的熱處理候仍可保持約70%的活性。故可以將熱變性步驟的溫度設(shè)定提高,對gc含量高的模板等具有特異性高級結(jié)構(gòu)的樣品非常有利。用途因準確性高,特別適用于pcr產(chǎn)物的克隆。另外,由于通過抗體法實現(xiàn)熱啟動反應(yīng),所以能夠輕松簡便地實施高特異性的pcr反應(yīng)。伸長性、擴增效率也很高, 可以進行更多種類目標物的pcr反應(yīng)。生產(chǎn)公司:toyo
12、bo公司最高擴增性能的PCR酶-KOD-FX- 貨號: KFX-101規(guī)格:200U優(yōu)勢:長片斷擴增效率,(DNA 40kb, 基因組DNA 24kb, cDNA 13.5kb)高擴增效率 ,(1ng的模板量即可擴增)對高GC含量的模版也有很高擴增效率 (70%以上GC含量也能擴增) KOD-PLUS-KOD-Plus- ver2.0 貨號:KOD-211規(guī)格:200U優(yōu)勢:世界最高水平保真度的PCR酶,是Taq酶的可信度的倍,pfu酶的7倍.用途:特別適合PCR產(chǎn)物的克?。贿M行熱啟動PCR,實現(xiàn)高特異反應(yīng)。 高效率高速度PCR酶-KOD Dash 貨號:LDP-101規(guī)格:250U優(yōu)勢:世界合成速度最快的PCR酶,是Taq酶的倍,pfu酶的6倍。用途:長距離PCR菌落直接法PCR病毒或細菌的快速檢測
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