PubMed使用詳解

1、Dept. of Medical Information2022-5-91PubMed數(shù)據(jù)庫2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 2 NCBI(美國生物技術(shù)信息中心）網(wǎng)址網(wǎng)址: :http:/NCBINCBI是美國國立衛(wèi)生研究院是美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)(NIH)下屬的一個機構(gòu)。下屬的一個機構(gòu)。NCBINCBI創(chuàng)建了生物醫(yī)學領(lǐng)域中最著名的信息檢索系創(chuàng)建了生物醫(yī)學領(lǐng)域中最著名的信息檢索系統(tǒng)。統(tǒng)。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedic

2、al Information 3NCBI生物醫(yī)學檢索系統(tǒng)(Entrez)PubmedPubmed：生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫；生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫；NucleotideNucleotide：核苷酸序列數(shù)據(jù)庫；核苷酸序列數(shù)據(jù)庫；ProteinProtein：蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫；蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫；GenomeGenome：完整的基因組匯編；完整的基因組匯編；StructureStructure：大分子三維結(jié)構(gòu)；大分子三維結(jié)構(gòu)；PMCPMC：數(shù)字化生物醫(yī)學期刊存儲與檢索系統(tǒng)數(shù)字化生物醫(yī)學期刊存儲與檢索系統(tǒng)TaxonomyTaxonomy：分類學數(shù)據(jù)庫；分類學數(shù)據(jù)庫；OMNIOMNI；孟德爾人類遺傳學數(shù)據(jù)庫；孟德

3、爾人類遺傳學數(shù)據(jù)庫；BooksBooks：生物醫(yī)學網(wǎng)絡(luò)版圖書。生物醫(yī)學網(wǎng)絡(luò)版圖書。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 4NCBI生物醫(yī)學檢索系統(tǒng)(Entrez)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 5 NCBI網(wǎng)站 ()2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 6PubMed主頁2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 71. Pubmed簡介NCBI

4、NCBI于于9797年年5 5月推出，月推出，InternetInternet用戶免費檢索。用戶免費檢索。檢索全世界生物醫(yī)學檢索全世界生物醫(yī)學期刊論文期刊論文的重要工具；的重要工具；學科覆蓋范圍：學科覆蓋范圍： 臨床醫(yī)學、基礎(chǔ)醫(yī)學、護理學、牙科學、獸醫(yī)臨床醫(yī)學、基礎(chǔ)醫(yī)學、護理學、牙科學、獸醫(yī)學、藥理學、環(huán)境和公共衛(wèi)生學、藥理學、環(huán)境和公共衛(wèi)生。收錄文獻的時間范圍：收錄文獻的時間范圍： 1948-1948- Update everyday (Tuesday - Saturday) Update everyday (Tuesday - Saturday)2022-5-95/9/2022Dept.

5、ofMedical Information 81. Pubmed簡介摘要型摘要型(Abstract)(Abstract)的數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)庫, , 提供提供文獻的線索；文獻的線索；部分文獻（約部分文獻（約5%5%）提供免費全文）提供免費全文( (鏈接網(wǎng)上免費資鏈接網(wǎng)上免費資源或者自己的圖書館已經(jīng)購買的電子期刊全文數(shù)據(jù)源或者自己的圖書館已經(jīng)購買的電子期刊全文數(shù)據(jù)庫中的全文。庫中的全文。 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 91. Pubmed簡介來源期刊來源期刊 50005000多種多種 English English 約約4800 4800 （約

6、占（約占85%)85%) Chinese Chinese French French Japanese Japanese Italy Italy Germany Germany期刊論文發(fā)表期刊論文發(fā)表時所用的語言時所用的語言2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 10PubMed中的非英文文獻中的非英文文獻2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 11PubMed主頁基本檢索 主題詞檢索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 123、PubMed檢索基本

7、檢索 簡單檢索 高級檢索主題詞檢索智能檢索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 133.1 PubMed基本檢索簡單檢索檢索詞的輸入形式：（1）單詞、短語、縮寫 如，interleukin；stomach cancer；AIDS（2）著者姓名：如，Smith W （3）期刊相關(guān)信息：刊名全稱、縮寫、ISSN 如，Cancer Research、JAMA5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 143.1 PubMed基本檢索檢索規(guī)則邏輯運算 and(空格)、or、not詞語檢索

8、“single cell”；“l(fā)iver cancer”截詞檢索 bacter*， disease? bacter disease bacteria diseases bacterium作者檢索 smith ja; jones k julia s wong; wong julia s(2002年始） 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 15例: 肝癌的化學療法2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 16例: 肝癌的化學療法2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Infor

9、mation 173.1 PubMed基本檢索高級檢索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 183.1 PubMed基本檢索高級檢索字段限定檢索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 19 PubMed檢索字段 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 203.1 PubMed基本檢索 Limits功能1)字段限定檢索2)限定文獻類型、語種、出版日期、年齡、性別、研究對象等2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Informat

10、ion 21Limits功能 （限定檢索）2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 22字段限定2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 23 Limits：限定文獻類型、語種、出版日期、年齡、性別、研究對象等2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 243.1 PubMed基本檢索檢索歷史2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 25查看檢索歷史，進行邏輯運算2022-5-95/9/2022Dept. ofMe

11、dical Information 263.1 PubMed基本檢索實例1 1、哮喘治療、哮喘治療( (限定題目字段限定題目字段) )的英文綜述文獻的英文綜述文獻2 2、近五年來中國研究者發(fā)表的有關(guān)、近五年來中國研究者發(fā)表的有關(guān)AidsAids病研究的文病研究的文獻獻2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 273.2 PubMed主題詞檢索(MeSH）2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 28什么是主題詞(MeSH詞)?主題詞是經(jīng)人工主題詞是經(jīng)人工規(guī)范化處理規(guī)范化處理的最能表達文章主題概的最能表達

12、文章主題概念的語詞。所謂規(guī)范化處理，就是在文獻存儲時，念的語詞。所謂規(guī)范化處理，就是在文獻存儲時，對文獻中的同義詞、近義詞、多義詞等加以嚴格的對文獻中的同義詞、近義詞、多義詞等加以嚴格的控制和規(guī)范，使得同一主題概念的文獻相對集中在控制和規(guī)范，使得同一主題概念的文獻相對集中在一個主題詞下。一個主題詞下。 主題詞主題詞 關(guān)鍵詞關(guān)鍵詞 NeoplasmsNeoplasms neoplasm neoplasm、tumorstumors、tumortumor、cancercancer AspirinAspirin aspirinaspirin、acetylsalicylic acidacetylsali

13、cylic acid、 micristinmicristin、 solprinsolprin2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 29 Medical Subject Headings, MeSH字順表字順表(2(2萬多個醫(yī)學詞匯萬多個醫(yī)學詞匯) ) 如如: :aspirin,hepatitis,asthmaaspirin,hepatitis,asthma等等 樹狀結(jié)構(gòu)表樹狀結(jié)構(gòu)表（分類表）分類表） 1616大類大類副主題詞表（副主題詞表（8080多個副主題詞）多個副主題詞）2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Inf

14、ormation 30MeSH字順表2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 31MeSH樹狀結(jié)構(gòu)(Tree Structures)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 32MeSH副主題詞表(Subheadings)Abnormalities、Administration & Dosage、Adverse Effects、Analysis、Anatomy & Histology、Biosynthesis、Blood、Complication、Congenital、Cytology、

15、DiagnosisDiagnosis use、Diet therapy、Drug therapy、Epidemiology、Etiology、Genetics、Immunology、Injuries、Metabolism、Microbiology、Mortality、Pathology、Psychology、Surgery、Therapeutic Use、Therapy.2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 33MeSH的標引和檢索MeSH應(yīng)用 PubMed（Medline） 中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫(CBMdisc) 醫(yī)學搜索引擎標引人員根據(jù)文

16、章的內(nèi)容，給出多個MeSH詞，以確切描述一篇文章內(nèi)容的重點。檢索人員根據(jù)檢索需求，選擇相關(guān)MeSH詞進行檢索。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 34例:肝癌的手術(shù)治療2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 35例:肝癌的手術(shù)治療2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 362022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 372022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information

17、 382022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 39MeSH詞檢索的特點不必考慮自由詞的各種變化形式，提高檢索效不必考慮自由詞的各種變化形式，提高檢索效率。率?？梢院苋菀椎貦z索寬廣的概念，提高查全率；可以很容易地檢索寬廣的概念，提高查全率；MeSHMeSH詞一般都反映了記錄較為重要的內(nèi)容，具詞一般都反映了記錄較為重要的內(nèi)容，具有較高的檢準率；有較高的檢準率；可以選用相關(guān)的副主題詞進行組配，對檢索進可以選用相關(guān)的副主題詞進行組配，對檢索進行限定。行限定。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 40舉例:

18、消化系統(tǒng)疾病的CT診斷擴展主要主題2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 41 3.3 PubMed的智能檢索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 42詞語自動匹配，優(yōu)化檢索策略自由詞和MeSH詞聯(lián)合2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 43PubMed智能檢索原理對于輸入檢索框中的非限定檢索詞，系統(tǒng)將依次到MeSH詞轉(zhuǎn)換表、刊名轉(zhuǎn)換表、短語表以及作者索引表中進行詞語匹配查找。檢索詞加入有些限定（如字段限止, 引號等），自動匹配檢索功能關(guān)閉。 例：

19、 heart diseaseti“l(fā)iver cancer”2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 44自動匹配檢索功能關(guān)閉2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 454. PubMed檢索結(jié)果處理Display(Display(顯示顯示) )Send to(Send to(輸出輸出) )2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 46Display(檢索結(jié)果顯示)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 47

20、Send to(檢索結(jié)果輸出)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 48Clipboard剪貼板可集中存放一次或多次檢索結(jié)果當中的選定記錄，方便用戶集剪貼板可集中存放一次或多次檢索結(jié)果當中的選定記錄，方便用戶集中打印、下載文獻。剪貼板中可存的最多記錄為中打印、下載文獻。剪貼板中可存的最多記錄為500500條，如果八小時內(nèi)條，如果八小時內(nèi)無作何操作，記錄將自動消失。無作何操作，記錄將自動消失。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 495. PubMed鏈接Related ArticlesFull

21、Text2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 50Related Articles(相關(guān)文獻鏈接)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 51Full Text(全文鏈接)網(wǎng)上免費資源 或者自己的圖書館已經(jīng)購買的電子期刊全文數(shù)據(jù)庫中的全文 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 526. My NCBI(個性化功能) 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 536. My NCBI(個性化功能)2022

22、-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 546. My NCBIMy Saved Data2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 556. My NCBI Save Search2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 566. My NCBI Save SearchEmail發(fā)送新文獻跟蹤專題最新文獻2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 57通過My NCBI查看新文獻2022-5-95/9/2022Dept.

23、 ofMedical Information 586. My NCBISearch Filters2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 596. My NCBISearch Filters2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 602022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 616. My NCBIPreferences2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 627. 其他輔助工具2022-5-95/9/2

24、022Dept. ofMedical Information 637.1 Journal Database可以從期刊的名稱可以從期刊的名稱( (全稱或縮寫全稱或縮寫) )、ISSNISSN號、刊名中的任意詞來查找期刊信息。號、刊名中的任意詞來查找期刊信息。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 642022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 65專為臨床醫(yī)生設(shè)計的查找有關(guān)某一疾病的治療、診斷、病因、預后等與臨床密切相關(guān)問題的文獻。7.2 Clinical Queries檢索系統(tǒng)評價(循證醫(yī)學證據(jù))2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 667.3 Citation Matcher 引文匹配器引文匹配器可通過已知的刊名、日期、卷、引文匹配器可通過已知的刊名、日期、卷、期、論文首頁碼、作者名等任一項信息查找期、論文首頁碼、作者名等任一項信息查找論文的詳細信息。論文的詳細信息。 經(jīng)常用于核對參考文獻經(jīng)常用于核對參考文獻2022-5-95