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1、Bac-to-Bac桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)試劑盒內(nèi)容物:Introduction:Overview:Bac-to-Bac桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)提供快速有效的方法產(chǎn)生重組桿狀病毒。此方法基于讓已經(jīng)轉(zhuǎn)入桿狀病的質(zhì)粒(桿粒)的位點(diǎn)特意轉(zhuǎn)座子的表達(dá)框的質(zhì)粒在Ecoli中擴(kuò)增。Bac-to-Bac桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)主要包括:*pFastBac捐獻(xiàn)質(zhì)粒的選擇,它要能夠產(chǎn)生包含目的位點(diǎn)的表達(dá)結(jié)構(gòu),這個(gè)目的基因的產(chǎn)生被桿狀病毒特意位點(diǎn)啟動(dòng)子控制。*一個(gè)Ecoli宿主,DH10Bac,包含桿狀病毒質(zhì)粒(桿粒)和輔助質(zhì)粒,在轉(zhuǎn)染pFastBac 表達(dá)結(jié)構(gòu)后可以產(chǎn)生重組桿粒。*一個(gè)控制表達(dá)的質(zhì)粒,包括Gus和/或CAT基因,以便
2、在感染細(xì)胞后產(chǎn)生重組桿狀病毒,表達(dá)-葡萄糖酸酐酶和/或氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶。Bac-to-Bac表達(dá)系統(tǒng)的優(yōu)點(diǎn):使用這個(gè)系統(tǒng)產(chǎn)生重組桿狀病毒較傳統(tǒng)的同源重組有以下優(yōu)點(diǎn):*與使用同源重組產(chǎn)生重組桿狀病毒所需的4-6周相比,鑒別純化重組病毒少于兩周*減少了從斑點(diǎn)篩選重組病毒DNA所包含親緣和非重組病毒的幾率*可以快速同時(shí)進(jìn)行大量重組,適合表達(dá)功能性研究的蛋白選擇pFastBac菌體(Vector):大量的pFastBac菌體都適于進(jìn)行Bac-to-Bac表達(dá)系統(tǒng)。選擇對(duì)于你的需要最合適的菌體。Vector特點(diǎn)參考pFastBacTM1高水平表達(dá)的強(qiáng)AcMNPV聚乙烯(PH)啟動(dòng)子用于簡(jiǎn)單克隆的大量克隆
3、位點(diǎn)Anderon 1996pFastBacTMHT高水平表達(dá)的聚乙烯啟動(dòng)子;N-末端含有6XHis,可以用來(lái)純化重組蛋白,并可用TEV蛋白酶切去;提供3個(gè)閱讀框Polayes 1996pFastBacTMDual兩個(gè)強(qiáng)啟動(dòng)子(PH和p10)可以同時(shí)表達(dá)兩種蛋白;兩個(gè)大的克隆位點(diǎn)Harris和Polaye 1997指南用途:指南提供了一個(gè)對(duì)于Bac-to-Bac表達(dá)系統(tǒng)的概述,并對(duì)以下提供指導(dǎo):1、 克隆目的基因到pFastBacTM供體質(zhì)粒的選擇2、 轉(zhuǎn)化pFastBacTM 結(jié)構(gòu)到最高效的DH10BacTM產(chǎn)生重組質(zhì)粒3、 轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒DNA到昆蟲細(xì)胞產(chǎn)生重組桿狀病毒4、 擴(kuò)增滴定(Amp
4、lify and titer)桿狀病毒株,使用病毒株感染昆蟲細(xì)胞表達(dá)目的重組蛋白重要的:Bac-to-Bac桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)是用來(lái)幫助你產(chǎn)生重組桿狀病毒,在昆蟲細(xì)胞中進(jìn)行高水平表達(dá)目的基因的系統(tǒng)。雖然他可以幫助你很容易的產(chǎn)生桿狀病毒表達(dá)你的重組蛋白,但是使用這系統(tǒng)更傾向于有桿狀病毒生物學(xué)和昆蟲表達(dá)背景的使用者。我們高度推薦使用者具有病毒和組織培養(yǎng)的技術(shù)和知識(shí)。Bac-to-Bac表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)系統(tǒng)的成分:表達(dá)系統(tǒng)簡(jiǎn)單高效的產(chǎn)生重組桿狀不能給黨?;贚uckow1993年的方法,此系統(tǒng)利用了位點(diǎn)特意的專座子Tn7區(qū)簡(jiǎn)化和提高重組質(zhì)粒DNA*系統(tǒng)的第一個(gè)成分是用來(lái)克隆目的基因的pFastBacTM菌
5、株?;趐FastBacTM菌株的選擇,表達(dá)基因被AcMNPV的PH或p10啟動(dòng)子控制,在昆蟲細(xì)胞內(nèi)高水平表達(dá)表達(dá)框被Tn7 的左右臂包圍,并且包含一個(gè)慶大霉素抗性點(diǎn)和SV40多腺苷酸化信號(hào),形成一個(gè)微型的Tn7 *第二個(gè)主要結(jié)構(gòu)是Ecoli的DH10BacTM品系,用來(lái)作為pFastBacTM菌株的宿主。DH10BacTM細(xì)胞包含帶有微型-attTn7靶位點(diǎn)的病毒質(zhì)粒和輔助質(zhì)粒(詳細(xì)見(jiàn)下文)。一旦pFastBacTM表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)入DH10Bac細(xì)胞,轉(zhuǎn)化就會(huì)發(fā)生在pFastBacTM菌株的微型Tn7單位和微型-attTn7的靶位點(diǎn)之間產(chǎn)生重組質(zhì)粒。這個(gè)轉(zhuǎn)化反應(yīng)發(fā)生在輔助質(zhì)粒提供的轉(zhuǎn)化蛋白處。如
6、果你已經(jīng)完成了轉(zhuǎn)化反應(yīng),你需要分離這個(gè)高分子量的重組質(zhì)粒DNA并將質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染如昆蟲細(xì)胞趨產(chǎn)生重組桿狀病毒,用來(lái)進(jìn)行初步表達(dá)實(shí)驗(yàn)。在桿狀病毒株擴(kuò)增和滴定后,高效價(jià)的病毒株可以用來(lái)感染細(xì)胞,進(jìn)行大規(guī)模的重組蛋白的表達(dá)。桿狀病毒菌株:病毒菌株(桿粒),bMON14272(136KB),在DH10Bac Ecoli中包括:*一個(gè)低拷貝的 微型F復(fù)制子*卡那霉素的抗性標(biāo)記*一個(gè)來(lái)自于pUC載體的編碼LacZa肽的DNA片段,用來(lái)接觸病毒轉(zhuǎn)座子,Tn7(微型attTn7)已經(jīng)被插入。插入的微型attTn7不會(huì)中斷LacZa肽的閱讀框。桿粒在具有卡那抗性的大的質(zhì)粒Ecoli DH10Bac中擴(kuò)增,在顯色
7、物質(zhì)如Bluo-gal 或X-gal和誘導(dǎo)劑IPTG存在時(shí),能補(bǔ)充染色體LacZ的缺失形成藍(lán)斑(LacZ+)輔助質(zhì)粒:DH10Bac Ecoli也包含輔助質(zhì)粒,pMON7124(13.2kb),他編碼轉(zhuǎn)移酶和四環(huán)素抗性基因。這個(gè)輔助質(zhì)粒提供Tn7 轉(zhuǎn)化功能。圖示Bac-toBac系統(tǒng):下圖刻畫了重組病毒的產(chǎn)生和目的基因的表達(dá)實(shí)驗(yàn)輪廓:流程:下圖揭示了表達(dá)目的基因的一般步驟1、 pFastBac donor 質(zhì)粒(步驟:目的基因的克隆 ) 得到2、 pFastBac重組體 (轉(zhuǎn)化至DN10Bac細(xì)胞(含有桿粒和helper) 得到3、 含有重組桿粒的Ecoli細(xì)胞 (重新劃線) 得到4、 驗(yàn)證過(guò)
8、的含有重組桿粒的Ecoli細(xì)胞 (過(guò)夜培養(yǎng),分離重組桿粒DNA) 得到5、 重組桿粒DNA (使用Cellfectin試劑感染細(xì)胞) 得到6、 P1 重組桿狀病毒株(106pfu/ml) (感染昆蟲細(xì)胞擴(kuò)增病毒) 得到7、 P2 重組桿狀病毒株(107pfu/ml) (滴定感染昆蟲細(xì)胞) 得到8、 蛋白的表達(dá)培養(yǎng)昆蟲細(xì)胞:一般指導(dǎo):介紹:對(duì)于您的桿狀病毒轉(zhuǎn)移菌,我們推薦使用Sf9和Sf21昆蟲細(xì)胞作為宿主。在開(kāi)始你的轉(zhuǎn)化試驗(yàn)和表達(dá)之前,確定你有收獲的Sf9和Sf21,并將其凍存。使用無(wú)血清的介質(zhì):昆蟲細(xì)胞可能在無(wú)血清的條件下收獲。我們推薦使用Sf900 SFM。Sf900 SFM對(duì)于維持Sf9
9、 和Sf21以及對(duì)于大規(guī)模生產(chǎn)重組蛋白,都是無(wú)蛋白的最優(yōu)的介質(zhì)。昆蟲細(xì)胞培養(yǎng)參考指導(dǎo):維持和傳代昆蟲細(xì)胞在貼壁和懸浮條件下 冷凍細(xì)胞 使用無(wú)血清的介質(zhì) 按比例增加細(xì)胞產(chǎn)量一般指導(dǎo):昆蟲細(xì)胞對(duì)于環(huán)境很敏感,此外化學(xué)和營(yíng)養(yǎng)因素,物理因素都可以影響昆蟲細(xì)胞的成長(zhǎng)。需要優(yōu)化以得到最大產(chǎn)量??紤]以下培養(yǎng)條件:*溫度:細(xì)胞的感染和成長(zhǎng)的最適合范圍是27-28度*PH:對(duì)于許多培養(yǎng)系統(tǒng)6.1-6.4時(shí)合適的范圍。Sf900 SFM在此范圍內(nèi)支持一般的空氣和開(kāi)蓋培養(yǎng)*同滲重摩:鱗翅類細(xì)胞使用介質(zhì)的最優(yōu)同滲重摩是345-380 mOsm/kg*通風(fēng):對(duì)于最優(yōu)生長(zhǎng)條件和蛋白的表達(dá),昆蟲細(xì)胞要求被動(dòng)的通氧。積極的通
10、氧系統(tǒng)要求溶氧飽和在10%-50%*剪切力:懸浮培養(yǎng)產(chǎn)生機(jī)械剪切力。生長(zhǎng)的昆蟲細(xì)胞在含有血清的介質(zhì)中(10%-20% FBS),對(duì)于細(xì)胞的剪切力一般會(huì)得到足夠的保護(hù)。如果你的細(xì)胞在無(wú)血清條件下生長(zhǎng),加入剪切力保護(hù)劑例如PluronicF-68。注意:在Sf900 SFM中生長(zhǎng)的細(xì)胞不需要加入剪切力保護(hù)劑。轉(zhuǎn)染的細(xì)胞:你需要的是對(duì)數(shù)期的細(xì)胞95%發(fā)育能力,可以完成成功的轉(zhuǎn)染。產(chǎn)生重組的pFastBacTM菌株(Vector)一般信息:介紹:為了產(chǎn)生包含目的基因的重組質(zhì)粒,使用Bac-to-Bac桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng),你需要使用限制酶消化和連接,將你的目的基因克隆進(jìn)入pFastBac 菌的其中一種。一
11、般分子生物學(xué)技術(shù):為了幫助限制酶消化和連接DNA的序列,需要其他一般的分子生物學(xué)技術(shù)擴(kuò)增和保存質(zhì)粒:pFastBac菌種和他的相應(yīng)的表達(dá)對(duì)照質(zhì)粒包含氨芐青霉素抗性基因,可以使用Ecoli進(jìn)行Amp篩選。為了擴(kuò)增和保存pFastBac和pFastBac對(duì)照質(zhì)粒,使用以下方法:1、 使用載體株系感染一個(gè)recA ,endA Ecoli株,例如Top10,DH10B或者DH52、 在含有100ug/ml Amp的LB瓊脂糖平板選擇轉(zhuǎn)化株。3、 選擇含有質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化子制備甘油菌以便長(zhǎng)期保存克隆進(jìn)入pFastBacTM1介紹:為了幫助你設(shè)計(jì)策略克隆你的目的基因進(jìn)入pFastBacTM1,參考以下建議和表格
12、克隆考慮事項(xiàng):pFastBacTM1菌株是非融合菌株(無(wú)融合標(biāo)簽)。為了保證重組蛋白的表達(dá),你的插入必須含有:*一個(gè)ATG起始密碼子用于轉(zhuǎn)錄起始*一個(gè)終止密碼子。注意:終止密碼子包含在所有三個(gè)閱讀框中的多克隆位點(diǎn)中注意:重組蛋白的產(chǎn)生要求你的插入包含一個(gè)轉(zhuǎn)錄起始ATG。一般來(lái)說(shuō),轉(zhuǎn)移載體包含完整的PH引導(dǎo)序列,可以提高表達(dá)的產(chǎn)量。蛋白翻譯能夠起始于多克隆位點(diǎn)上游突變的ATG(ATT),盡管如此,從這個(gè)位點(diǎn)起始的效率是低的,而且一般不干涉表達(dá)和重組蛋白的檢測(cè)。pFastBacTM1的多克隆位點(diǎn):下圖是pFastBacTM1的多克隆位點(diǎn)。限制位點(diǎn)標(biāo)出來(lái)以便顯示實(shí)際切刻位點(diǎn)。潛在的終止密碼子下劃線表
13、示。pFastBacTM1的全序列可以從網(wǎng)站下載。pFastBacTM1的圖譜和描述見(jiàn)后綴克隆進(jìn)入pFastBacTMHT A,B,C 介紹:pFastBacTMHT載體由三個(gè)讀碼框(A,B,C)提供的多克隆位點(diǎn)從而實(shí)現(xiàn)克隆目的基因,并且在N端帶有6XHis??寺。簆FastBacTMHT菌株是融合菌株。為了保證表達(dá)重組蛋白,你必須:*克隆你的基因要帶有ATG,位于4050-4052堿基對(duì)間。這個(gè)將會(huì)產(chǎn)生融合表達(dá),帶有6XHis標(biāo)簽,可以用TEV切除*你的插入要含有終止密碼注意:重組蛋白的產(chǎn)生要求你的插入包含一個(gè)轉(zhuǎn)錄起始ATG。一般來(lái)說(shuō),轉(zhuǎn)移載體包含完整的PH引導(dǎo)序列,可以提高表達(dá)的產(chǎn)量。蛋白
14、翻譯能夠起始于多克隆位點(diǎn)上游突變的ATG(ATT),盡管如此,從這個(gè)位點(diǎn)起始的效率是低的,而且一般不干涉表達(dá)和重組蛋白的檢測(cè)pFastBacTMHT A的多克隆位點(diǎn):下圖是pFastBacTMHT A的多克隆位點(diǎn)。其實(shí)ATG用黑體標(biāo)出。限制性位點(diǎn)標(biāo)出來(lái)以便顯示實(shí)際切刻位點(diǎn)。pFastBacTMHT B的多克隆位點(diǎn):下圖是pFastBacTMHT A的多克隆位點(diǎn)。其實(shí)ATG用黑體標(biāo)出。限制性位點(diǎn)標(biāo)出來(lái)以便顯示實(shí)際切刻位點(diǎn)??蜃〉暮塑账犸@示出的是易變區(qū)域。pFastBacTMHT C的多克隆位點(diǎn):下圖是pFastBacTMHT A的多克隆位點(diǎn)。其實(shí)ATG用黑體標(biāo)出。限制性位點(diǎn)標(biāo)出來(lái)以便顯示實(shí)際切刻
15、位點(diǎn)??蜃〉暮塑账犸@示出的是易變區(qū)域。注意pFastBacTMHT C在Xba 位點(diǎn)內(nèi)有一個(gè)終止密碼子,他在N端標(biāo)簽框內(nèi)。確定你的基因的5端是在Xba 位點(diǎn)上游開(kāi)始??寺∵M(jìn)入pFastBacTMDual介紹:pFastBacTMDual包含兩個(gè)多克隆位點(diǎn),可以同時(shí)表達(dá)兩個(gè)異源基因,一個(gè)通過(guò)PH啟動(dòng)子控制,另一個(gè)通過(guò)P10啟動(dòng)子控制。參見(jiàn)下列建議以便有助于你的基因克隆克隆事項(xiàng):pFastBacTMDual是一個(gè)非融合載體。為了保證重組蛋白的表達(dá),你的插入必須含有以下兩點(diǎn)*一個(gè)ATG起始密碼子*如果你不使用多克隆位點(diǎn)中的終止密碼子,就必須要有一個(gè)終止密碼子注意:重組蛋白的產(chǎn)生要求你的插入包含一個(gè)轉(zhuǎn)
16、錄起始ATG。一般來(lái)說(shuō),轉(zhuǎn)移載體包含完整的PH引導(dǎo)序列,可以提高表達(dá)的產(chǎn)量。對(duì)于插入克隆上游的聚乙烯啟動(dòng)子,注意到蛋白翻譯能夠起始于多克隆位點(diǎn)上游突變的ATG(ATT),盡管如此,從這個(gè)位點(diǎn)起始的效率是低的,而且一般不干涉表達(dá)和重組蛋白的檢測(cè)。PH啟動(dòng)子下游的多克隆位點(diǎn):下圖是pFastBacTMDual中PH啟動(dòng)子下游的多克隆位點(diǎn)的圖示。限制性位點(diǎn)標(biāo)記出來(lái)顯示了實(shí)際的切刻位點(diǎn)。潛在的終止密碼子有下劃線標(biāo)出。P10啟動(dòng)子下游的多克隆位點(diǎn):下圖是pFastBacTMDual的AcMNPV p10啟動(dòng)子下游的多克隆位點(diǎn)。限制性位點(diǎn)標(biāo)記出來(lái)以便顯示實(shí)際切刻位點(diǎn)。潛在的終止密碼子標(biāo)記下劃線。轉(zhuǎn)化和分析
17、介紹:如果你已經(jīng)完成了你的連接反應(yīng),你就要準(zhǔn)備把你的pFastBacTM結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化進(jìn)Ecoli了。很多Ecoli宿主菌和轉(zhuǎn)化程序都是可以使用的。一般推薦轉(zhuǎn)化Ecoli和分析轉(zhuǎn)化在下面列出Ecoli宿主:一旦你把你的插入序列克隆進(jìn)入了pFastBacTM,你需要轉(zhuǎn)化連接反應(yīng)到Ecoli,并選擇優(yōu)Amp抗性的轉(zhuǎn)化株。你可以使用任何recA,end A Ecoli菌。包括Top10,DH10B或者DH5進(jìn)行轉(zhuǎn)化。不要轉(zhuǎn)化連接反應(yīng)進(jìn)入DH10Bac細(xì)胞。注意TOP10和DH10B感受態(tài)細(xì)胞可以從Invitrogen得到轉(zhuǎn)化方法:你可以選擇使用任何方法對(duì)Ecoli進(jìn)行轉(zhuǎn)化。化學(xué)轉(zhuǎn)化是最便利的方法,而電轉(zhuǎn)對(duì)
18、大質(zhì)粒是最有效的方法。選擇好轉(zhuǎn)化株,使用含有100ug/ml Amp 的LB平板。轉(zhuǎn)化株分析:一旦你得到Amp抗性轉(zhuǎn)化株,我們有以下推薦:1、 選出10個(gè)轉(zhuǎn)化株,在含有100ug/ml的Amp的LB或S.O.B培養(yǎng)基過(guò)夜培養(yǎng)2、 使用你選的方法分離質(zhì)粒DNA。我們推薦使用公司的試劑盒3、 使用限制性方法分析質(zhì)粒,證明是重組質(zhì)粒并證明插入起始的正確。使用限制性酶或者酶化合物對(duì)Vector和插入端各進(jìn)行一次酶切。使用PCR對(duì)轉(zhuǎn)化株進(jìn)行分析:你也可以使用PCR方法對(duì)陽(yáng)性轉(zhuǎn)化株進(jìn)行分析。使用合適的PCR引物和Amp條件。如果你是第一次使用此方法,你最好使用限制性分析作平行試驗(yàn)。使用錯(cuò)誤的引物或污染的平
19、板可能會(huì)得到假象。以下方法可以給你提供便利。其他方法也是可用的。需要的材料:高保真PCRSuperMix,合時(shí)的PCR前后引物過(guò)程:1、對(duì)于每個(gè)樣品,在0.5ml的小離心管加入48ul的高保真PCR SuperMix和各1ul的前后引物。 2、選出10個(gè)克隆,在上述離心管中進(jìn)行重懸(記得做一個(gè)Patch板保護(hù)克隆以便進(jìn)行更深的分析) 3、94度10分鐘溶解細(xì)胞滅活核酸酶 4、20-30個(gè)循環(huán)進(jìn)行擴(kuò)增 5、延伸使用72度10分鐘。4度儲(chǔ)存 6、瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)測(cè)序:對(duì)于你的結(jié)構(gòu)需要進(jìn)行測(cè)序證明目的基因是正確的起始以便表達(dá)。如果你是將基因克隆進(jìn)入了pFastBacTMHT,證明的基因進(jìn)入了N末端
20、標(biāo)簽的讀框中。長(zhǎng)期保存:一旦你證明了測(cè)序的正確,確定克隆的純度并制作甘油菌長(zhǎng)期保存。推薦儲(chǔ)存質(zhì)粒DNA在-20度1、 在含有100ug/ml的LB平板上對(duì)原始的克隆進(jìn)行劃線培養(yǎng)2、 挑單克隆在1-2ml含有Amp的LB撫育3、 培養(yǎng)至穩(wěn)定期4、 在0.85ml的培養(yǎng)物中混合0.15ml的過(guò)濾甘油,轉(zhuǎn)到冷凍小管5、 -80度儲(chǔ)存重組質(zhì)粒的產(chǎn)生轉(zhuǎn)化到DH10Bac Ecoli介紹:一旦你有了你的pFastBacTM結(jié)構(gòu),你就可以準(zhǔn)備轉(zhuǎn)化純化的質(zhì)粒DNA進(jìn)入DH10BacTMEcoli,轉(zhuǎn)變成為桿粒。你可以使用藍(lán)/白斑選出含有重組桿粒的克隆。Bac-toBac表達(dá)系統(tǒng)提供高效DH10BacTM感受態(tài)
21、細(xì)胞。陽(yáng)性對(duì)照:每個(gè)pFastBacTM質(zhì)粒都提供相應(yīng)的陽(yáng)性對(duì)照用來(lái)作為陽(yáng)性轉(zhuǎn)染和表達(dá)對(duì)照(下表)。根據(jù)pFastBacTMVecctor的使用,我們推薦在你的DH10Bac轉(zhuǎn)染試驗(yàn)中作相應(yīng)的對(duì)照。所需材料:開(kāi)始之前你需要有以下材料 *純化的pFastBacTM結(jié)構(gòu)(200pg/ul儲(chǔ)存于PH8.0的TE) *陽(yáng)性表達(dá)對(duì)照 *高效DH10BacTM感受態(tài)細(xì)胞(表達(dá)系統(tǒng)提供,每個(gè)轉(zhuǎn)化試驗(yàn)使用1管細(xì)胞) *pUC19(與DH10Bac一起提供,用來(lái)做對(duì)照) *LB平板,包含Kan,Gen(慶大),Tetracycline(四環(huán)素),Bluo-gal(鹵代吲哚基-beta-D-半乳糖苷)和IPTG。
22、 (每個(gè)轉(zhuǎn)化3個(gè)板,使用新鮮平板,推薦見(jiàn)下文) *LB板含有100ug/mlAmp(用于pUC19轉(zhuǎn)化對(duì)照) *S.O.C介質(zhì) *15ml圓底塑料管 *42度水域和37度搖床及37度培養(yǎng)箱。你需要準(zhǔn)備LB瓊脂糖平板,包含50ug/ml Kan,7ug/ml Gentamicin,10ug/ml tetracycline,100ug/ml Biuo-gal,40ug/ml IPTG,用來(lái)進(jìn)行DH10BacTM轉(zhuǎn)化株的篩選??梢詮奈夜绢A(yù)訂抗生素,Bbluo-gal,IPTG,在后面有制備平板的指導(dǎo)。如果你正準(zhǔn)備的LB平板使用的是事先混合好的,我們推薦使用Luria Broth Base代替LB。
23、使用LB板將會(huì)降低顏色敏感度,并可能降低克隆的數(shù)量。注意:在藍(lán)/白斑篩選中使用Bluo-gal代替X-Gal。Bluo-gal產(chǎn)生的藍(lán)斑顏色要比X-Gal深。準(zhǔn)備轉(zhuǎn)化:對(duì)于每個(gè)轉(zhuǎn)化,你都需要一小瓶感受態(tài)細(xì)胞和三個(gè)平板。 *42度水域平衡 *37度烘板30分鐘 *室溫放置SOC介質(zhì) *對(duì)于每個(gè)轉(zhuǎn)化試驗(yàn)預(yù)冷一個(gè)15ml管子轉(zhuǎn)化過(guò)程:按照以下過(guò)程用高效DH10BacTM感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化pFastBacTM結(jié)構(gòu)。我們推薦做陽(yáng)性對(duì)照的轉(zhuǎn)化來(lái)幫助你證明你的結(jié)果。1、 整管高效DH10BacTM感受態(tài)細(xì)胞冰上解凍。2、 每個(gè)轉(zhuǎn)化試驗(yàn),輕輕地混合,將100ul高效DH10BacTM感受態(tài)細(xì)胞倒入預(yù)冷的15ml管
24、子3、 向細(xì)胞中加入適量的質(zhì)粒DNA,輕輕混合。千萬(wàn)不要上下吹吸混合*pFastBacTM結(jié)構(gòu):1ng(5ul)*pFastBacTM對(duì)照質(zhì)粒:1ng*pUC19對(duì)照:50pg(5ul)4、 冰上撫育30分鐘5、 42度熱激45秒6、 立即冰上2分鐘7、 加入900ul室溫的SOC培養(yǎng)基8、 pFastBacTM轉(zhuǎn)化:37度225轉(zhuǎn)震蕩培養(yǎng)4小時(shí)。 pUC19轉(zhuǎn)化:37度225轉(zhuǎn)震蕩培養(yǎng)1小時(shí)9、 對(duì)于每個(gè)pFastBacTM的轉(zhuǎn)化:準(zhǔn)備10折連續(xù)(不知道什么意思)用SOC稀釋的細(xì)胞(10-1,10-2,10-3),每個(gè)稀釋用100ul鋪一個(gè)LB平板,平板包含50ug/ml Kan,7ug/m
25、l Gentamicin,10ug/ml tetracycline,100ug/ml Biuo-gal,40ug/ml IPTG。對(duì)于pUC19轉(zhuǎn)化:用SOC培養(yǎng)基1:100稀釋細(xì)胞,鋪100ul稀釋物在含有100ug/mlAmp的LB平板。10、37度撫育48小時(shí)。分析篩選的克隆(參見(jiàn)推薦)。注意:我們不推薦早于48小時(shí)挑單克隆,因?yàn)檫@樣可能會(huì)難于區(qū)分藍(lán)白斑。重要的:微型Tn7 插入到微型attTn7 附屬位點(diǎn)會(huì)干擾LacZa肽的表達(dá),所以包含重組質(zhì)粒的克隆在藍(lán)色背景下是白色的,可能隱藏在未改變的質(zhì)粒中。選擇白斑分析。真正的白斑克隆比較大;因此為了避免選擇成假陽(yáng)性,選擇最大的,最獨(dú)立的白斑。
26、避免挑出現(xiàn)灰色的或者在中間的菌落,因?yàn)樗麄兛赡苁前召|(zhì)粒的細(xì)胞核重組細(xì)胞的混合。驗(yàn)證顯性:1、挑10個(gè)白色的克隆,重新劃線在新鮮LB平板(50ug/ml Kan,7ug/ml Gentamicin,10ug/ml tetracycline,100ug/ml Biuo-gal,40ug/ml IPTG)。37度過(guò)夜培養(yǎng)。 2、在包含Bluo-Gal和IPTG的重新劃線的平板上選出單克隆證明是白色的顯性,嫁接至有50ug/ml Kan,7ug/ml Gentamicin,10ug/ml tetracycline的液體中 3、使用我公司的試劑盒抽提重組質(zhì)粒DNA。選擇性的,你可以使用附錄提供的操作
27、步驟。這個(gè)過(guò)程源于抽提大的質(zhì)粒DNA(100kb),適用于分離質(zhì)粒DNA。 4、分析重組質(zhì)粒DNA證明成功轉(zhuǎn)化到了桿粒中。我們推薦使用PCR分析桿粒DNA。 注意:適用瓊脂糖凝膠電泳可以證明轉(zhuǎn)化的成功與否,他可以分出高分子量的DNA。這個(gè)方法要比PCR分析可信度低,因?yàn)楦叻肿恿緿NA是很難見(jiàn)到的。使用PCR分析重組質(zhì)粒介紹:重組桿粒DNA要大于135kb。既然限制性分析很難完成這么大的DNA分析,我們推薦使用PCR分析鑒定重組桿粒中的目的基因。桿粒包含M13 正負(fù)引物位點(diǎn),位于LacZa互不區(qū)域的微型attTn7 位點(diǎn)兩側(cè),可以完成PCR檢驗(yàn)。本節(jié)提供使用M13 引物的PCR檢驗(yàn)指導(dǎo)。使用M1
28、3引物進(jìn)行PCR分析:使用PCR法證明你的目的基因在重組桿粒中,你可能會(huì): *使用M13Forward(-40)和M13 Reverse引物 *使用M13Forward(-40)或M13 Reverse引物于你的插入片段雜交成聯(lián)合物DNA聚合酶:你可能會(huì)使用任何DNA聚合酶在你的PCR試驗(yàn)中,包括Platinum Taq酶。如果希望PCR產(chǎn)物4kb,我們推薦使用聚合酶混合物。例如高保真的Platinum Taq酶得到PCR產(chǎn)物:使用下面過(guò)程擴(kuò)增重組桿粒DNA,適用M13正反引物和Platinum Taq酶。如果你使用M13F或M13 R與一個(gè)你的基因特意引物混合,你需要自己決定擴(kuò)增的條件。如果
29、你使用其它的聚合酶,依照供應(yīng)商提供的建議。注意:如果你的插入片段4kb擴(kuò)增條件需要被優(yōu)化.1、 每個(gè)樣品,在0.5ml微型管子中裝入50ul的量進(jìn)行PCR反映重組桿粒DNA(100ng) 1ul10XPCR Buffer 5ul 10mM dNTP Mix 5ul50mM MgCl2 1.5ulPCR引物(1.25ul/10uM) 2.5ul蒸餾水 38.5總體積 50ul2、 一滴礦物油覆蓋3、 一下參量進(jìn)行擴(kuò)增4、 從反應(yīng)產(chǎn)物吸取5-10ul進(jìn)行瓊脂糖電泳分析你將會(huì)看到:如果轉(zhuǎn)化發(fā)生了,而且你使用的是M13正負(fù)引物擴(kuò)增,你將會(huì)在電泳上看到下列PCR產(chǎn)物大小如果你使用的是M13 和你的特異引
30、物進(jìn)行的擴(kuò)增,你需要決定PCR產(chǎn)物是否是希望的。12頁(yè)的圖有助于你計(jì)算。重組桿狀病毒的產(chǎn)生轉(zhuǎn)染昆蟲細(xì)胞:介紹:一旦你證明了你的重組桿粒含有你的目的基因,就可以準(zhǔn)備進(jìn)行昆蟲細(xì)胞的轉(zhuǎn)染了,以產(chǎn)生重組桿狀病毒。本章提供指導(dǎo)和建議以便完成昆蟲細(xì)胞的轉(zhuǎn)染準(zhǔn)備質(zhì)粒:你可以使用任何方法準(zhǔn)備純化的重組桿粒DNA。桿粒DNA必須沒(méi)有酚和NaCl的污染,他們會(huì)殺死細(xì)胞,鹽類會(huì)干擾脂類復(fù)合物,降低轉(zhuǎn)染效率。我們推薦使用本公司產(chǎn)品提質(zhì)粒。轉(zhuǎn)染方法:推薦使用一個(gè)陽(yáng)離子脂質(zhì)體,例如Cellfectin試劑進(jìn)行轉(zhuǎn)染。此試劑用來(lái)提供給表達(dá)系統(tǒng)使用。Cellfectin試劑:不做翻譯昆蟲細(xì)胞系:推薦使用Sf9 和Sf21進(jìn)行轉(zhuǎn)
31、染。High Five and Mimic Sf9不推薦因?yàn)樗麄冝D(zhuǎn)染效率低下。不過(guò),如果你有了你的桿狀病毒株,你可以進(jìn)行High Five and Mimic Sf9表達(dá)試驗(yàn)。轉(zhuǎn)染介質(zhì):為了高效的轉(zhuǎn)染,我們推薦在無(wú)Grace的昆蟲細(xì)胞培養(yǎng)基中完成轉(zhuǎn)染。注意Grace的昆蟲細(xì)胞培養(yǎng)基應(yīng)該不含有FBS(血糖),因?yàn)榈鞍自谘呛推溲a(bǔ)充物中會(huì)與Cellfectin試劑互作,影響轉(zhuǎn)染。 注意:如果你在Sf-900 SFM中收獲了Sf9或Sf21,你可以在不含有Grace的培養(yǎng)基中完成轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染后可以容易的將Sf-900 SFM轉(zhuǎn)變回去陽(yáng)性對(duì)照:如果你有了從pFastBac對(duì)照質(zhì)粒中得到的重組桿粒,我們推
32、薦,包括這個(gè)陽(yáng)性對(duì)照在你的試驗(yàn)中和轉(zhuǎn)化中能夠評(píng)估你的結(jié)果。在這些桿粒中,包括-葡糖甘酶(Gus)和/或氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶(CAT)將會(huì)在PH或者P10啟動(dòng)子控制下表達(dá)。在轉(zhuǎn)染過(guò)后,表達(dá)的Gus和CAT可以適當(dāng)進(jìn)行驗(yàn)證。所需材料:開(kāi)始之前需要有下列材料: *從pFastBacTM結(jié)構(gòu)(500ng/ul TE溶解,PH8.0)中純化的重組桿粒DNA *從合適的pFastBacTM對(duì)照結(jié)構(gòu)中純化的重組桿粒DNA *合適培養(yǎng)基收獲的Sf9或者Sf21 *Cellfectin試劑(4度保存) *Graces昆蟲細(xì)胞培養(yǎng)基,未被補(bǔ)充的(培養(yǎng)基不含有補(bǔ)充劑,F(xiàn)BS或者抗生素) *6孔培養(yǎng)板或者其它組織 培養(yǎng)用
33、具 *12X75mm滅菌管 *培養(yǎng)昆蟲細(xì)胞的完全培養(yǎng)基計(jì)算出你的轉(zhuǎn)染試驗(yàn)所需的Sf9 細(xì)胞數(shù)量,進(jìn)行擴(kuò)增。轉(zhuǎn)染前確定細(xì)胞健康且繁殖能力97%。轉(zhuǎn)染條件:我們通常使用下列條件在Sf9中擴(kuò)增桿狀病毒株。對(duì)于你的轉(zhuǎn)染試驗(yàn)這些條件應(yīng)該作為一個(gè)起始點(diǎn),你可以通過(guò)改變DNA和Cellfectin試劑的濃度以及細(xì)胞密度對(duì)條件進(jìn)行優(yōu)化。 轉(zhuǎn)染步驟:適用下列步驟在6孔板進(jìn)行Sf9 細(xì)胞的轉(zhuǎn)染。如果你想在其它細(xì)胞培養(yǎng)用具中轉(zhuǎn)染細(xì)胞,你需要對(duì)你的條件進(jìn)行優(yōu)化。記得使用無(wú)補(bǔ)充的Graces培養(yǎng)基,他不含有FBS或抗生素1、 在6孔板或35mm組織培養(yǎng)板,與每個(gè)孔2ml含有抗生素的培養(yǎng)基中(例如:2ml的SF900SF
34、M包含50單位/ml青霉素和50ug/ml鏈霉素)接種9X105Sf9細(xì)胞。2、 27度細(xì)胞最少接觸1小時(shí)3、 對(duì)于每個(gè)轉(zhuǎn)染的樣品,準(zhǔn)備桿粒DNA:Cellfectin試劑混合在12X75mm的滅菌管中1) 將1ug純化的桿粒DNA稀釋進(jìn)入100ul未補(bǔ)充Grace培養(yǎng)基2) 完全混勻Cellfectin試劑,翻轉(zhuǎn)混合5-10次。吸出6ulCellfectin試劑稀釋進(jìn)100ul未補(bǔ)充Grace培養(yǎng)基。3) 使用稀釋的Cellfectin試劑連接稀釋的桿粒DNA(總體積約210ul)。輕混合,室溫?fù)嵊?5-45分鐘。4、 在DNA/脂肪混合體撫育過(guò)程中,從細(xì)胞中除去培養(yǎng)基并用2ml未補(bǔ)充Gra
35、ce培養(yǎng)基清洗。棄去清洗培養(yǎng)基。5、 向每個(gè)含有混合體的管子中加入0.8ml未補(bǔ)充Grace培養(yǎng)基,清混勻,將混合體加入到含有細(xì)胞的孔中。6、 27度培養(yǎng)5小時(shí)7、 棄去DNA/脂肪混合體,向細(xì)胞中加入2ml全培養(yǎng)基(例如SF900SFM含有抗生素)8、 27度潮濕條件撫育72小時(shí)或者指導(dǎo)你開(kāi)始能夠看到病毒感染的現(xiàn)象。提取P1病毒株。分離P1病毒株介紹:帶有芽孢的病毒應(yīng)該在轉(zhuǎn)染以后釋放入培養(yǎng)基72小時(shí)。但是,如果你的轉(zhuǎn)染效率不好,細(xì)胞可能在轉(zhuǎn)染后的4-5天也沒(méi)有被病毒感染的跡象。轉(zhuǎn)染過(guò)后的72小時(shí),你需要親自檢查細(xì)胞是否有感染信號(hào)(下表)一旦細(xì)胞出現(xiàn)感染,使用下列步驟從培養(yǎng)基中收獲細(xì)胞。感染細(xì)
36、胞的特性:使用倒差顯微鏡在250-400X觀察感染細(xì)胞時(shí),可以看到病毒感染的細(xì)胞具有以下特點(diǎn):感染記號(hào)顯性描述早期(第一個(gè)24小時(shí))細(xì)胞直徑增加可以看到直徑增大了25-50% 細(xì)胞核增大細(xì)胞核可能充滿細(xì)胞晚期(24-72小時(shí))細(xì)胞停止增長(zhǎng)與單個(gè)細(xì)胞相比,細(xì)胞不再增大出現(xiàn)顆粒體病毒芽孢信號(hào),出現(xiàn)小泡分離細(xì)胞從平板或曲頸瓶脫離很晚期(大于72小時(shí))細(xì)胞消亡細(xì)胞出現(xiàn)消亡,單層細(xì)胞開(kāi)始出現(xiàn)消亡制備P1病毒株:1、一旦從第8步得到轉(zhuǎn)染細(xì)胞,上述的晚期轉(zhuǎn)染現(xiàn)象出現(xiàn),就可以從每個(gè)孔中收集含有病毒的細(xì)胞,并轉(zhuǎn)入滅過(guò)菌的15ml帶蓋管子。500Xg離心5分鐘除去細(xì)胞和大的碎片 2、將上清轉(zhuǎn)到新的15ml離心管。
37、這就是P1病毒株。4度避光儲(chǔ)存。儲(chǔ)存信息見(jiàn)下頁(yè) 注意:如果你希望濃縮的病毒株,你可以在離心后,使用0.2um低蛋白吸附的濾器完成。病毒株的儲(chǔ)存:按下列條件儲(chǔ)存:1、 避光,4度2、 如果培養(yǎng)基不含血清,加入FBS至終濃度為2%,血清可以作為蛋白酶底物。3、 對(duì)于長(zhǎng)期保存,重新擴(kuò)增后保存整株病毒于-80度4、 不要在4度時(shí)儲(chǔ)存經(jīng)常使用的病毒。重復(fù)凍融會(huì)降低病毒的滴度。下一步:得到你的純化P1桿狀病毒株之后,你可以:1、 擴(kuò)增毒株(下節(jié)詳細(xì)介紹)這個(gè)過(guò)程推薦得到最高滴度的毒株,而且在你的試驗(yàn)中優(yōu)化結(jié)果2、 決定你的毒株的滴定度(見(jiàn)病毒斑點(diǎn)試驗(yàn))3、 如果你希望,純化你的病毒結(jié)構(gòu)4、 使用P1病毒株
38、感染Sf9進(jìn)行表達(dá)預(yù)試驗(yàn)。注意:如果你想做一個(gè)小規(guī)模的或者是預(yù)試驗(yàn),你可以直接使用P1毒株感染Sf9進(jìn)行表達(dá)試驗(yàn)。由于毒株數(shù)量小,表達(dá)條件可能不能再生(如果滴度未知,MOI是不可知的)擴(kuò)增你的病毒株介紹:P1毒株是小規(guī)模,低滴度的毒株,你需要使用這株去感染細(xì)胞,從而產(chǎn)生高滴度的P2株。轉(zhuǎn)染Sf9細(xì)胞得到的首株的滴度一般為1X106到1X107pfu/ml。用以下步驟擴(kuò)增得到的P2株滴度為1X107到1X108pfu/ml。本章提供P2株的制備和指導(dǎo)所需材料:SF9或Sf21;P1病毒株;合適的培養(yǎng)用具;組織培養(yǎng)試劑;27度潮濕培養(yǎng)箱重要的:擴(kuò)增P1病毒株,需要感染Sf9或者Sf21 ,使用懸浮
39、或單層培養(yǎng)。根據(jù)你的需要,你可以任何規(guī)模的擴(kuò)增,但是你因你使用的P1菌株的量受到限制。一般擴(kuò)增P1在10ml懸浮培養(yǎng)基中培養(yǎng)2X106細(xì)胞/ml或在6孔板培養(yǎng)2X106細(xì)胞/ml。計(jì)算感染所需的Sf9細(xì)胞,隨后Expand細(xì)胞。使用前確定你的細(xì)胞健康并且繁殖力大于97%多樣性感染(MOI):為了擴(kuò)增毒株,在多樣性感染細(xì)胞的范圍是0.05-0.1。MOI就像每個(gè)細(xì)胞的病毒數(shù)量一樣需要定義。使用下列公式計(jì)算獲得特定的MOI需要多少病毒株:注意:如果你沒(méi)有滴定你的P1毒株,你需要假定滴度范圍是1X106至107pfu/ml例如:需要感染10ml細(xì)胞,2X106細(xì)胞/ml,使用MOI =0.1我們假定
40、P1 毒株的滴度是5X106pfu/ml。擴(kuò)增步驟:依照下列步驟在6孔板擴(kuò)增P1毒株1、 感染當(dāng)天,準(zhǔn)備Sf9和Sf21細(xì)胞上清和細(xì)胞板,2X106細(xì)胞/孔。接觸培養(yǎng)細(xì)胞室溫1小時(shí)2、 1小時(shí)后倒差顯微鏡檢查細(xì)胞的吸附情況3、 每孔加入合適數(shù)量的P1毒株4、 27度潮濕培養(yǎng)箱撫育細(xì)胞48小時(shí)5、 感染后48小時(shí),從每個(gè)孔收集2ml含有病毒的培養(yǎng)基,轉(zhuǎn)到15ml的管子。500Xg離心5分鐘棄去細(xì)胞和碎片。注意:可以在感染晚期收獲病毒(72小時(shí))。每個(gè)桿狀病毒的結(jié)構(gòu)決定了優(yōu)化收獲時(shí)間。過(guò)度培養(yǎng)將會(huì)由于細(xì)胞的調(diào)亡使生殖能力衰減6、 將上清轉(zhuǎn)到15ml管子。這是P2毒株。4度避光保存。長(zhǎng)期保存需要整株
41、在-80度7、 檢測(cè)你的P2毒株的滴度梯度擴(kuò)增步驟:一旦你有了高滴度的P2桿狀病毒毒株,你可以梯度增加擴(kuò)增病毒至任何體積。為了產(chǎn)生高滴度的P3,梯度擴(kuò)增的細(xì)胞量和病毒體積要適當(dāng),遵照本章指導(dǎo)從冰凍的主毒株獲得高滴度毒株:如果你儲(chǔ)存你的毒株在-80度,我們推薦使用此株產(chǎn)生另外的高滴度毒株進(jìn)行表達(dá)試驗(yàn)。當(dāng)病毒在-80度保存時(shí),滴度會(huì)降低。下面為指導(dǎo)和擴(kuò)增過(guò)程病毒斑點(diǎn)試驗(yàn)(Performing a Viral Plaque Assy):介紹:我們推薦使用斑點(diǎn)試驗(yàn)進(jìn)行:決定你毒株的滴度;斑點(diǎn)純化病毒(可選)試驗(yàn)框架:決定病毒的滴度,你需要1、 在6孔板的Sf9細(xì)胞2、 準(zhǔn)備10-flod連續(xù)稀釋的病毒
42、株3、 將不同稀釋的桿狀病毒加入到Sf9 和感染細(xì)胞中1小時(shí)4、 棄去病毒覆蓋細(xì)胞層使用Plaquing培養(yǎng)基5、 撫育7-10天計(jì)算每個(gè)稀釋物中的斑點(diǎn)病毒滴度影響因素:影響滴度的因素很多:1、 目的基因的大小。滴度一般會(huì)隨著目的基因的增大而減小2、 轉(zhuǎn)染效率。為了高的轉(zhuǎn)染效率,我們推薦使用Cellfectin試劑轉(zhuǎn)染Sf9。準(zhǔn)備DNA/脂質(zhì)體混合物在非補(bǔ)充Grace昆蟲培養(yǎng)基3、 桿狀病毒株的年齡。長(zhǎng)期保存在4度或者-80度病毒的滴度都會(huì)減弱。如果你的病毒株已經(jīng)保存了6個(gè)月-1年我們推薦在使用前滴度或者重新滴度病毒4、 凍融次數(shù)。如果你儲(chǔ)存在-80度,每次凍融都會(huì)降低病毒10%的滴度5、 錯(cuò)
43、誤的儲(chǔ)存方式。為了經(jīng)常使用,病毒株應(yīng)該整株的保存在4度避光條件所需材料:實(shí)驗(yàn)前所需材料:1、 你的澄清的桿狀病毒株(使用前存在4度)2、 適當(dāng)培養(yǎng)基中的Sf9或Sf21(每個(gè)被滴度的桿狀病毒株為30ml對(duì)數(shù)期細(xì)胞,5X105細(xì)胞/ml)3、 SF900SFM或其它合適的完全生長(zhǎng)培養(yǎng)基4、 Sf900培養(yǎng)基(1.3X)(100ml;或其它何時(shí)的培養(yǎng)基)5、 4%瓊脂糖凝膠6、 滅菌的細(xì)胞培養(yǎng)級(jí)別的蒸餾水7、 100ml滅菌的玻璃瓶8、 6孔子之培養(yǎng)板(每個(gè)毒株2個(gè)板用來(lái)滴定)9、 無(wú)菌臺(tái) 10、40度和70度水域 11、微波爐(可選) 12、27度潮濕培養(yǎng)箱注意:如果你在血清補(bǔ)充培養(yǎng)基培養(yǎng)Sf9
44、 (完全TNM-FN)。你需要有以下試劑1、 Grace昆蟲培養(yǎng)基,補(bǔ)充過(guò)的2、 Grace昆蟲培養(yǎng)基(2X)3、 胎牛血清(FBS),高質(zhì)量的熱滅火的準(zhǔn)備斑點(diǎn)培養(yǎng)基(Plaquing Medium):斑點(diǎn)培養(yǎng)基由培養(yǎng)基和瓊脂糖混合組成,對(duì)于斑點(diǎn)試驗(yàn)用來(lái)固定昆蟲細(xì)胞。在開(kāi)始下列步驟前立即準(zhǔn)備斑點(diǎn)培養(yǎng)基。如果你培養(yǎng)Sf9在SF900SFM中,那準(zhǔn)備Sf900斑點(diǎn)培養(yǎng)基。如果你培養(yǎng)是在TNM-FH,準(zhǔn)備Grace斑點(diǎn)培養(yǎng)基。注意其它培養(yǎng)基也可以使用1、 在微波爐或者70度水域20-30分鐘溶化4%的瓊脂糖凝膠,溶化之后,下列物質(zhì)放入40度水域*空的,滅菌的100ml瓶子*Sf-900培養(yǎng)基(1.3
45、X)或者Grace昆蟲細(xì)胞培養(yǎng)基(2X) 2、4%的瓊脂糖凝膠液化后,將膠,培養(yǎng)基和空瓶子轉(zhuǎn)到超凈臺(tái) 3、用下列方法快速制備斑點(diǎn)培養(yǎng)基: Sf900 斑點(diǎn)培養(yǎng)基:混合30ml的Sf-900培養(yǎng)基(1.3X)和10ml的4%的瓊脂糖凝膠在100ml瓶子里,輕搖。 Graces斑點(diǎn)培養(yǎng)基:20ml熱滅活的FBS加入到100ml Grace昆蟲細(xì)胞培養(yǎng)基(2X)的瓶子。將25ml含有血清的Grace昆蟲細(xì)胞培養(yǎng)基(2X)和12.5ml細(xì)胞培養(yǎng)級(jí)別的滅菌蒸餾水以及12.5ml溶化的瓊脂糖膠混合在100ml空瓶子,輕輕混勻4、 使用之前將斑點(diǎn)培養(yǎng)基的瓶子放回40度水域斑點(diǎn)試驗(yàn)的過(guò)程:使用以下步驟在6孔板
46、完成斑點(diǎn)試驗(yàn)以決定擬的桿狀病毒株的滴度。如果你有了桿狀病毒表達(dá)對(duì)照,我們推薦你對(duì)這個(gè)也作滴度。記得在試驗(yàn)中做一個(gè)陰性對(duì)照(無(wú)病毒) 注意:下列過(guò)程提供的量適合滴度一個(gè)病毒株(每個(gè)病毒株2個(gè)6孔板)。如果你想滴度更多,相應(yīng)的增加試劑量1、 轉(zhuǎn)染當(dāng)天,收獲Sf9 ,在Sf900 SMF中制備30ml細(xì)胞上清,5X105細(xì)胞/ml。(或其它完全培養(yǎng)基)。如果你有陰性對(duì)照,你需要另外的一個(gè)板子2、 是細(xì)胞在板底定居,蓋蓋室溫?fù)嵊?小時(shí)3、 1小時(shí)培養(yǎng)之后,相差顯微鏡觀察細(xì)胞。Sf9應(yīng)該是已經(jīng)吸附而且50%已經(jīng)融合。4、 準(zhǔn)備8個(gè)梯度稀釋(10-1到10-8)的純化病毒株,在Sf900 SMF或者未補(bǔ)充
47、的Grace培養(yǎng)基,無(wú)FBS。為了做這些,你需要在12ml管子順序稀釋0.5ml的病毒株或前面稀釋過(guò)的4.5ml培養(yǎng)基。需要完成8個(gè)管子。5、 將裝有Sf9的6孔板和稀釋過(guò)病毒的管子轉(zhuǎn)移到超凈臺(tái)。標(biāo)記上板子,需要2體積(一個(gè)樣品一個(gè)復(fù)制品)按如下方法:10-3,10-4,10-5,10-6,10-7,10-8。6、 從孔中除去培養(yǎng)基,立即用1ml適合的稀釋的病毒代替。7、 室溫?fù)嵊?小時(shí)8、 撫育1小時(shí)后,從40度水域中除去細(xì)胞和培養(yǎng)基瓶。9、 從最高的稀釋到最低的稀釋(10-8至10-3)順序,從孔中除去含有病毒的培養(yǎng)基,使用2ml斑點(diǎn)培養(yǎng)基代替。盡快操作避免細(xì)胞單層干燥10、 移動(dòng)板子之前
48、使用瓊脂糖培養(yǎng)基覆蓋10-20分鐘11、 27度潮濕培養(yǎng)箱撫育7-10天之道斑點(diǎn)可見(jiàn)并可以計(jì)數(shù)。如果你想著色斑點(diǎn)計(jì)數(shù),見(jiàn)下面,計(jì)算滴度,見(jiàn)前面注意:為了改進(jìn)斑點(diǎn)的可見(jiàn)度,用中性紅染色平板。其它平板染料比如水晶藍(lán)不推薦,因?yàn)樗麄儼挠袡C(jī)溶劑能殺死宿主細(xì)胞。你可以使用下列之一:1、準(zhǔn)備瓊脂糖溶液包含有中性紅,將溶液覆蓋感染后的板子子上4天。感染后7-10天計(jì)算板子數(shù)量。2、準(zhǔn)備中性紅溶液加入到計(jì)數(shù)前1-2小時(shí)的平板(感染后7-10天)。重要的:如果你想斑點(diǎn)純化你的病毒,不要染色斑點(diǎn)使用中性紅,它可以誘導(dǎo)重組病毒的突變所需材料:開(kāi)始試驗(yàn)前你需要有下列物質(zhì): 1、中性紅 2、細(xì)胞培養(yǎng)級(jí)別的蒸餾水 3
49、、Sf900 SMF或其它培養(yǎng)基(如果制備瓊脂糖溶液) 4、4%瓊脂糖凝膠(如果準(zhǔn)備瓊脂糖溶液) 5、40水域(如果制備瓊脂糖溶液)中性紅染色過(guò)程:準(zhǔn)備瓊脂糖覆蓋的中性紅(第4天使用)1、 在 Sf900 SMF(或其它全培養(yǎng)基)中制備1mg/ml的中性紅。過(guò)濾除菌。2、 40度水域中50ml的管子混合下列試劑:1mg/ml的中性紅(1.5ml);Sf900 SMF(16.5ml)3、 微波爐溶化4%的瓊脂糖凝膠,40度水域5分鐘4、 將含有中性紅溶液的50ml管子和凝膠轉(zhuǎn)到超凈臺(tái)。加入6ml瓊脂糖凝膠到中性紅溶液5、 每個(gè)孔用1ml中性紅覆蓋。瓊脂糖凝膠凝固后,將平板放回27度潮濕培養(yǎng)箱知道
50、斑點(diǎn)可以計(jì)數(shù)。紅色單層中將會(huì)出現(xiàn)清楚地斑點(diǎn)準(zhǔn)備中性紅染色(第7-10天計(jì)數(shù)前使用)1、 準(zhǔn)備1mg/ml的中性紅加入到細(xì)胞培養(yǎng)級(jí)別的蒸餾水2、 每個(gè)孔加入0.5ml中性紅溶液,室溫?fù)嵊?-2小時(shí)3、 用濾紙或吸耳球輕輕除去過(guò)量的燃料,計(jì)算斑點(diǎn)。在紅的背景下,透明膠上的斑點(diǎn)會(huì)清楚可見(jiàn)計(jì)算滴度:是用下列公式計(jì)算你的毒株的滴度。注意優(yōu)化范圍是6孔板上每個(gè)孔計(jì)算3-20個(gè)斑 滴度(pfu/ml)=斑的數(shù)量X稀釋因子X(jué)(1/接種體積ml/孔)例如:我們?cè)诿靠缀?0-6病毒稀釋的孔中加入了1ml接種體積,得到了20個(gè)斑。使用公式得到滴度:滴度=20(斑)X106X(1/1ml/孔)=2X107pfu/m
51、l你將會(huì)看到:當(dāng)?shù)味葪U狀病毒株時(shí),一般得到的滴度范圍為:P1為1X106-1X107 pfu/ml;P2為1X107-1X108 pfu/ml。注意:如果你的P1毒株滴度小于為1X106pfu/ml或P2小于1X107 pfu/ml,推薦生產(chǎn)新的毒株。斑點(diǎn)純化:你可以通過(guò)斑點(diǎn)純化從單個(gè)的病毒克隆得到毒株。使用下列步驟 所需材料:Well-Space的病毒斑點(diǎn)的平板(來(lái)自斑點(diǎn)試驗(yàn));活性大于95%的對(duì)數(shù)期的Sf9或Sf21;滅菌的巴斯德吸管和曲徑瓶 過(guò)程:1、培養(yǎng)Sf9或者Sf21參照斑點(diǎn)試驗(yàn)的1-3步2、 使用巴斯德管和曲徑瓶,小心的選擇一個(gè)清澈斑點(diǎn),將瓊脂糖蓋子(含有病毒)轉(zhuǎn)到1.5ml離心
52、管,其中包含有500ul全培養(yǎng)基。使用漩渦震蕩混合均勻3、 每個(gè)孔加入100ul瓊脂糖蓋子溶液4、 27度潮濕培養(yǎng)箱撫育72小時(shí)5、 從每個(gè)孔收集含有毒株的培養(yǎng)基,轉(zhuǎn)到15ml滅菌管。500Xg離心5分鐘除去細(xì)胞和殘片6、 將上清轉(zhuǎn)到新鮮的15ml管子。這個(gè)是斑點(diǎn)純化的毒株7、 以后過(guò)程為擴(kuò)增桿狀病毒株表達(dá)重組蛋白介紹:一旦你有了合適滴度的pFastBac 桿狀病毒株,你可以感染昆蟲細(xì)胞進(jìn)行重組蛋白試驗(yàn)陽(yáng)性對(duì)照:如果你有高滴度的pFastBac 桿狀病毒對(duì)照結(jié)構(gòu),你可能希望做一個(gè)你的試驗(yàn)對(duì)照。一旦你的對(duì)照病毒感染了你的細(xì)胞,基因編碼的Gus和/或CAT將會(huì)限制表達(dá),以便進(jìn)行簡(jiǎn)單的試驗(yàn)。表達(dá)指導(dǎo)
53、:下面提供了一個(gè)使用重組病毒感染昆蟲細(xì)胞表達(dá)目的蛋白的指導(dǎo) *細(xì)胞系:取決于你的需要和目的基因,你可以使用任何昆蟲細(xì)胞包括Sf9和Sf21或MimicTMSf9進(jìn)行表達(dá)。細(xì)胞可以進(jìn)行懸浮和貼壁培養(yǎng)。注意:你如果表達(dá)分泌蛋白,需要使用High Five細(xì)胞改進(jìn)表達(dá) *培養(yǎng)條件:一般在無(wú)血清條件下使用Sf900 SMF或表達(dá)FiveSFM培養(yǎng)細(xì)胞。依據(jù)你的需要和目的蛋白,注意可能在感染后期需要添加0.1%-0.5%的FBS或BSA以便保護(hù)重組蛋白不被水解。Protien-Based蛋白酶抑制劑一般比人工合成的蛋白酶抑制劑便宜而且高效 *感染條件:推薦在細(xì)胞處于中對(duì)數(shù)期時(shí)(密度為細(xì)胞l)感染細(xì)胞。確
54、定在感染時(shí)培養(yǎng)不受營(yíng)養(yǎng)或環(huán)境限制 *MOI:理想的MOI因細(xì)胞系間,相關(guān)感染動(dòng)力學(xué)毒株或使用的克隆不同而不同。對(duì)于蛋白表達(dá)試驗(yàn),應(yīng)該為每個(gè)毒株,介質(zhì),反映和細(xì)胞系建立一個(gè)劑量反映,來(lái)證明感染參量的最優(yōu)。最為試驗(yàn)的起始,感染細(xì)胞使用的MOI為1-5 *時(shí)間進(jìn)程:推薦實(shí)施一個(gè)時(shí)間進(jìn)程決定表達(dá)蛋白的表達(dá)動(dòng)力學(xué),因?yàn)樵S多蛋白可能會(huì)在培養(yǎng)之中被細(xì)胞蛋白酶降解。注意:分泌蛋白的最大表達(dá)一般在感染30-72小時(shí)看到,非分泌表達(dá)蛋白48-96小時(shí)。最優(yōu)的表達(dá):大量因素影響著最優(yōu)表達(dá),包括細(xì)胞系,MOI,你的目的,基因種類等。你可以使用下列優(yōu)化的條件表達(dá)你的重組蛋白 *細(xì)胞系:一定量MOI的感染的Sf9,Sf21,HighFive或MimicTMSf9。重組蛋白表達(dá)的試驗(yàn)在不同的感染后時(shí)間(24,48,72,96小時(shí))。選擇細(xì)胞系提供重組蛋白的最好表達(dá)條件 *MOI:不同的MOIs的感染的細(xì)胞量和蛋白試驗(yàn)。使用重組蛋白的最優(yōu)水平提供的MOI *時(shí)間進(jìn)程:固定的MOI感染的細(xì)胞和試驗(yàn)在感染后不同時(shí)間表達(dá)重組蛋白(24,48,96)選擇最優(yōu)條件分析重組蛋白表達(dá):是用下列過(guò)程分析你的重組蛋白。下列過(guò)程使用與24孔形式的感染后24-96小時(shí)收獲的細(xì)胞進(jìn)行分析。其它程序也可以參考 1、24孔板接種Sf96X105/孔.細(xì)胞接觸至少30分鐘 2、棄去培養(yǎng)基用新鮮的培養(yǎng)基清洗一次。換上300ul新鮮培養(yǎng)基
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