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MEGA軟件系統(tǒng)發(fā)育樹構建方法（圖文講解）2012年12月02日 Evolution 字號 小 中 大 評論 3 條 閱讀 3,872 次 點擊加入在線收藏夾 一、序列文本的準備構樹之前先將目標基因序列都分別保存為txt文本文件中（或者把所有序列保存在同一個txt文本中,可以用“>基因名稱”作為第一行，然后重起一行 編輯基因序列），序列只包含序列字母（ATCG或氨基酸簡寫字母）。文件名名稱可以已經(jīng)您的想法隨意編輯。二、序列導入到Mega 5軟件（1）打開Mega 5軟件，界面如下（2）導入需要構建系統(tǒng)發(fā)育樹的目的序列OK選擇分析序列類型（如果是DNA序列，點擊DNA，如果是蛋白序列，點擊Protein）出現(xiàn)新的對話框，創(chuàng)建新的數(shù)據(jù)文件選擇序列類型導入序列導入序列成功。（3）序列比對分析點擊工具欄中“W”工具，進行比對分析，比對結束后刪除兩端不能夠完全對齊堿基（4）系統(tǒng)發(fā)育分析關閉窗口，選擇保存文件路徑，自定義文件名稱三、系統(tǒng)發(fā)育樹構建根據(jù)不同分析目的，選擇相應的分析算法，本例子以NJ算法為例Bootstrap 選擇1000，點擊Compute，開始計算計算完畢后，生成系統(tǒng)發(fā)育樹。根據(jù)不同目的，導出分析結果，進行簡單的修飾，保存本方法來自網(wǎng)絡，經(jīng)小編mi

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