關(guān)于超級(jí)計(jì)算環(huán)境ppt課件

1、關(guān)于超級(jí)計(jì)算環(huán)境 遲學(xué)斌中國科學(xué)院計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心超級(jí)計(jì)算中心 2002年7月20日 內(nèi)容動(dòng)機(jī) 硬件平臺(tái)建立系統(tǒng)運(yùn)用軟件根底并行軟件平臺(tái)科學(xué)計(jì)算平臺(tái)運(yùn)用領(lǐng)域網(wǎng)格實(shí)驗(yàn)平臺(tái)建立我們的目的 動(dòng)機(jī)“十五院信息化根底設(shè)備 改善科學(xué)研討所需的計(jì)算環(huán)境更好地為我院知識(shí)創(chuàng)新任務(wù)效力提高我院在超級(jí)計(jì)算領(lǐng)域的影響國際開展動(dòng)態(tài) 美國、歐洲和日本98%Earth Simulator，40萬億次眾多超級(jí)計(jì)算中心動(dòng)機(jī)國內(nèi)開展情況 曙光系列，神威系列，銀河系列 國家高性能計(jì)算中心CERNET高性能計(jì)算中心北京市高性能計(jì)算機(jī)運(yùn)用中心上海超級(jí)計(jì)算中心北京運(yùn)用物理與計(jì)算數(shù)學(xué)研討所高性能中心 中科院計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心動(dòng)機(jī)院內(nèi)需求

2、分析 區(qū)域氣候環(huán)境生態(tài)耦合方式需求2.53G的內(nèi)存，4050G的硬盤，主頻500M Hz的單CPU，大約需求運(yùn)轉(zhuǎn)8個(gè)月 第一原理資料設(shè)計(jì)處置幾百甚至上千個(gè)原子的體系；需求7G內(nèi)存，50G硬盤，64個(gè)Fe原子體系，1個(gè)k點(diǎn)(Gamma)，12500個(gè)平面波，384個(gè)能帶，基態(tài)，無構(gòu)造弛豫，SP3上128個(gè)節(jié)點(diǎn)并行時(shí)間為12分鐘硬件平臺(tái)建立超級(jí)計(jì)算機(jī)2TFLOPS集群計(jì)算機(jī)系統(tǒng)cluster大規(guī)模計(jì)算機(jī)系統(tǒng)MPP共享存儲(chǔ)計(jì)算機(jī)系統(tǒng)SMP海量存儲(chǔ)系統(tǒng)100TB磁盤陣列RAID磁帶庫RAIT系統(tǒng)運(yùn)用軟件用戶運(yùn)用環(huán)境網(wǎng)格技術(shù)Grid TechnologyGLOBUSGPDK異構(gòu)系統(tǒng)資源的一致管理網(wǎng)絡(luò)計(jì)算

3、效力根底并行軟件平臺(tái)數(shù)值代數(shù)軟件BLASLAPACKScaLAPACK偏微分方程數(shù)值求解軟件PETSc快速富氏變換FFTW科學(xué)計(jì)算平臺(tái)生物信息學(xué)利用 EST 數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)新基因 地質(zhì)與地球物文科學(xué) 三維地震成像數(shù)值模擬 資料科學(xué)第一原理資料設(shè)計(jì) 聚合物加工過程的根底研討 科學(xué)計(jì)算平臺(tái)計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)和藥物挑選 生態(tài)環(huán)境區(qū)域氣候、環(huán)境和生態(tài)數(shù)值模擬 根底科學(xué)和運(yùn)用科學(xué) 高精度差分方程與復(fù)雜流動(dòng)的數(shù)值模擬 大系統(tǒng)的穩(wěn)定性和分枝 網(wǎng)格并行自動(dòng)生成器 運(yùn)用領(lǐng)域生物信息學(xué)基因組序列拼接蛋白質(zhì)構(gòu)造預(yù)測資料科學(xué)高溫液態(tài)分子構(gòu)造分析生態(tài)環(huán)境環(huán)境監(jiān)控與預(yù)告數(shù)值模擬 網(wǎng)格實(shí)驗(yàn)平臺(tái)建立WANgrid.ncic.ac入口：grid.nhpc.ac155Mbps教育網(wǎng)1Gbps校園網(wǎng)東區(qū)、西區(qū)、安大10Mbps科研網(wǎng)100Mbps園區(qū)網(wǎng)曙光2000、曙光3000gridc.ac我們的目的 十六字：建立中心、完善環(huán)境、奠定根底、探求途徑 建立中心-建立具有世界水準(zhǔn)的、我院的超級(jí)計(jì)算中心萬億次計(jì)算才干、萬億字節(jié)存儲(chǔ)才干完善環(huán)境-完善我院科