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1、威尼德分子雜交儀:Western blot常見試驗問題歸納與總結(jié)威尼德生物科技(北京),研發(fā)生產(chǎn)的經(jīng)濟型分子雜交儀VH-1000、 多功能型分子雜交儀VH-4000、組合型分子雜交儀VH-2000,底部標(biāo)配培養(yǎng)皿圓 周運動托盤,選配250ML/500ML錐形瓶托盤,96孔酶標(biāo)板托盤,可適用于如 放置雜交袋等其他嚴格要求的孵育實驗一以及膜洗脫和凝膠脫色,同時可以做 恒溫微生物培養(yǎng)。分子雜交儀是現(xiàn)代實驗室采用雜交技術(shù)的理想設(shè)備,可替代塑 料雜交袋和水浴搖床,并防止破損帶來的污染危害。QI: PVDF膜和硝酸膜結(jié)合蛋白的原理是什么?A1:一般而言,硝酸纖維素膜是通過疏水作用來和蛋白質(zhì)相聯(lián),假設(shè)反復(fù)洗
2、幾次后, 蛋白容易掉下來,效果較差。尼龍膜主要通過它膜上的正電荷和蛋白接合(注: 常用的PVDF膜即帶正電荷的尼龍膜),同時也有疏水作用,但相對較弱。這樣 的話,PVDF膜和蛋白接合較牢,不易脫落,效果較好。Q2:做組織樣品的western blot的時候,處理樣品有什么訣竅?A2:必須進行研磨、勻漿、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會更好,離心要充分,膜蛋 白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心)。還有一 點就是組織中的蛋白酶活性更強,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF和蛋 白酶抑制劑),封閉劑一般5%脫脂奶粉。如果一抗為多克隆抗體,使用BSA也 是不錯的選擇Q3:免疫組化
3、和 Western blot可以用同一種抗體嗎?A3:免疫組化時抗體識別的是未經(jīng)變性處理的抗原決定簇(又稱表位),有些表 位是線性的,而有的屬于構(gòu)象型;線性表位不受蛋白變性的影響,天然蛋白和煮 后的蛋白都含有;構(gòu)象型表位由于受蛋白空間結(jié)構(gòu)限制,煮后變性會消失。如果 你所用的抗體識別的是蛋白上連續(xù)的幾個氨基酸,也就是線性表位,那么這種抗 體可同時用于免疫組化和Western blotting,而如果抗體識別構(gòu)象形表位,那么只能 用于免疫組化。一般抗體說明書上都有注明此種抗體識別的氨基酸區(qū)間。(限于 單抗)Q4:不能很好地將大分子量蛋白轉(zhuǎn)移到膜上,轉(zhuǎn)移效率低怎么樣解決? A4:可以考慮:轉(zhuǎn)移緩沖液
4、中加入20%甲醇(是指終濃度)(優(yōu)化的轉(zhuǎn)移緩沖液, 可以參考蛋白質(zhì)技術(shù)手冊),因為甲醇可降低蛋白質(zhì)洗脫效率,但可增加蛋 白質(zhì)和NC膜的結(jié)合能力,甲醇可以防止凝膠變形,甲醇對高分子量蛋白質(zhì)可延 長轉(zhuǎn)移時間;轉(zhuǎn)移緩沖液加入終濃度0.l%SDS,也是為了增加轉(zhuǎn)移效率;用優(yōu) 質(zhì)的轉(zhuǎn)移膜,或使用小孔徑的NC膜(0.2微米);使用戊二醛交聯(lián);低濃度膠, 如低至6%。太大時還可以考慮用瓊脂糖膠;提高轉(zhuǎn)移電壓/電流;增加轉(zhuǎn)移時 間。威尼德生物科技(北京),研發(fā)生產(chǎn)的經(jīng)濟型分子雜交儀VH-1000、 多功能型分子雜交儀VH-4000、組合型分子雜交儀VH-2000,底部標(biāo)配培養(yǎng)皿圓 周運動托盤,選配250ML/
5、500ML錐形瓶托盤,96孔酶標(biāo)板托盤,可適用于如 放置雜交袋等其他嚴格要求的孵育實驗一以及膜洗脫和凝膠脫色,同時可以做 恒溫微生物培養(yǎng)。分子雜交儀是現(xiàn)代實驗室采用雜交技術(shù)的理想設(shè)備,可替代塑 料雜交袋和水浴搖床,并防止破損帶來的污染危害。Q5:Western blot哪種染色好?A5:(l)陰離子染料是最常用的,特別是氨基黑,脫色快,背景低檢測極限可達 到1.5解,考馬斯亮藍雖然與氨基黑有相同的靈敏度,但脫色慢,背景高。麗春 紅S和快綠在檢測后容易從蛋白質(zhì)中除去,以便進行隨后的氨基酸分析。缺點是: 溶劑系統(tǒng)的甲醇會引起硝化纖維素膜的皺縮或破壞,不能用于帶正電荷的膜。靈 敏度低。(2)膠體金,
6、靈敏度高,檢測范圍可到pg級,但染色比擬穩(wěn)定。(3)生物素化靈敏度位于1、2之間,可用于任何一種膜。6:用Western檢測基因轉(zhuǎn)染后細胞培養(yǎng)上清中表達的目的蛋白(定性), 分子量為20KD,濃度約為幾百iiRml。蛋白樣品是否需濃縮、純化?如何濃縮、 純化上清液中的目的蛋白?對小分子蛋白Western blot時需特別注意哪些條件?A6:按照提供的濃度,如果做Western blot,是不用濃縮樣品的.對于20kd的小 分子的蛋白,Western Blot中要注意的是:轉(zhuǎn)移時的時間,轉(zhuǎn)移時的電流或電壓.transfer buffer 中加 20%的甲醇.可以用13-15%的別離膠.Q7:半干
7、法轉(zhuǎn)移與膠的面積和蛋白分子兩大小有一定關(guān)系、那么濕法轉(zhuǎn)移 是不是所有的轉(zhuǎn)移條件都一樣呢? 一般的條件是怎樣的?A7:半干轉(zhuǎn)的電流大小是按照面積來算的,時間是根據(jù)蛋白分子大小定的;而 濕轉(zhuǎn)的話電流是恒定的,時間也是根據(jù)分子量而定。Q8:采用生物素標(biāo)記的二抗.SABCDAB檢測系統(tǒng)做western,非特異性的條帶和背景很高,總蛋白考染的時候發(fā)現(xiàn)接近積層膠的條帶比擬清楚,條帶也 很窄,可是越靠下面的條帶越來越寬,有的跑得都連在一起,這是什么原因, 如何解決? SDSPAGE的時候恒壓和恒流哪個好?A8:非特異性的條帶和背景高:可能性很多,如一抗,二抗,封閉的原因都可 能??偟鞍卓既镜臅r候發(fā)現(xiàn)接近積層
8、膠的條帶比擬清楚,條帶也很窄,可是越靠 下面的條帶越來越寬,有的跑得都連在一起,這種現(xiàn)象是正常的。另外,也可能 積層膠有問題。SDSPAGE的時候,恒壓和恒流都可以用。威尼德生物科技(北京),研發(fā)生產(chǎn)的經(jīng)濟型分子雜交儀VH-1000、 多功能型分子雜交儀VH-4000、組合型分子雜交儀VH-2000,底部標(biāo)配培養(yǎng)皿圓 周運動托盤,選配250ML/500ML錐形瓶托盤,96孔酶標(biāo)板托盤,可適用于如 放置雜交袋等其他嚴格要求的孵育實驗一以及膜洗脫和凝膠脫色,同時可以做 恒溫微生物培養(yǎng)。分子雜交儀是現(xiàn)代實驗室采用雜交技術(shù)的理想設(shè)備,可替代塑 料雜交袋和水浴搖床,并防止破損帶來的污染危害。VH-200
9、0 -、g 。9:血清樣品進行 Western blot分析,目的蛋白21kD,結(jié)果顯色出來后, 目的條帶很淡,而白蛋白和及G條帶很濃,為什么?A9:可能是因為白蛋白為67kD和目的蛋白相差較大,且其濃度較低,可以底物二氨基聯(lián)苯胺和0.01%過氧化氫溶液顯色的時間延長為30分鐘,再用去離子水 漂洗以終止反響;也可能是抗體的特異性不好。把封閉的時間延長,同時提高封 閉液的濃度,可以減少以下背景噪音。同時洗的時候要徹底,而目的條帶弱,說 明濃度缺乏,如果不考慮后續(xù)功能的話,可過G-50 (細)柱子,純化靶蛋白, 接著真空冷凍濃縮,可以得到很好的結(jié)果。Western轉(zhuǎn)膜已經(jīng)成功了,但是Marker泳道未見蛋白條帶,其余各泳道均有清晰的蛋白條帶,經(jīng)考馬斯亮藍染膠,結(jié)果相同。經(jīng)5%的脫脂牛奶封閉1小時45分鐘后,進行一抗孵育(1: 200,建議起始濃度)過夜,二抗孵育5個半小時(1:2000),均在室溫下,DAB顯色,雖出現(xiàn)蛋白條帶,但較弱,且出 現(xiàn)非特異性條帶。所用 Marker可別離14U16KD的蛋白,是否因為 marker有問題? 一抗(多克隆抗體)、二抗的濃度及孵育的時間是否合適?封閉的時間是 否太短?A10: 1
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