劉春艷北京大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館信息咨詢部liucylibbjmueducn

1、PubMed生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫檢索方法與技巧1主要內(nèi)容PubMed概況 PubMed數(shù)據(jù)來源PubMed檢索機(jī)制PubMed檢索運(yùn)算符PubMed檢索方法結(jié)果的顯示、打印、保存其他輔助功能21. PubMed概況創(chuàng)建機(jī)構(gòu)：美國國家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國生物技術(shù)信息中心(NCBI)1997年6月開始向全球開放特色：具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點(diǎn)，部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接免費(fèi)獲得全文。32. PubMed數(shù)據(jù)來源MEDLINE： pubmed-indexed for medlineIn Process Citations：每天收錄，尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。pubmed-in proc

2、essPublisher-Supplied Citations：由出版商提供的電子文獻(xiàn)，每條記錄標(biāo)有PubMed-as supplied by Publisher。43. PubMed檢索機(jī)制自動轉(zhuǎn)換匹配功能(Automatic Term Mapping)短語檢索(Phrase Searching)5對于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對照匹配和轉(zhuǎn)換，再進(jìn)行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是：MeSH表 期刊刊名表 短語表 作者索引如果在以上4個(gè)表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復(fù)以上的過程，檢索時(shí)各個(gè)詞之間是AND邏輯關(guān)系。如果仍找不到相匹配的詞，則

3、用單個(gè)詞在所有字段查找，各個(gè)詞之間也是AND邏輯關(guān)系。3.1 自動轉(zhuǎn)換匹配功能6也可稱為強(qiáng)迫詞組檢索，即，如果要將短語作為一個(gè)詞組進(jìn)行檢索，可用雙引號“ ”將其引起來。如：“drug therapy”作為詞組進(jìn)行檢索的詞，系統(tǒng)不進(jìn)行自動轉(zhuǎn)換匹配，也不進(jìn)行MeSH詞的擴(kuò)檢。3.2 短語檢索74. PubMed檢索運(yùn)算符邏輯運(yùn)算符8邏輯運(yùn)算符邏輯“與”運(yùn)算AND： 檢索式寫成A and B，表示文獻(xiàn)中同時(shí)包含檢索詞A和檢索詞B的文獻(xiàn)才是命中文獻(xiàn)。 AIDS and therapy 邏輯“或”運(yùn)算OR： 檢索式寫成A or B，表示包含檢索詞A的文獻(xiàn)或者包含檢索詞B的文獻(xiàn)或者同時(shí)包含檢索詞A和B的文

4、獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。 AIDS or Acquired Immunodeficiency Syndrome邏輯“非”運(yùn)算NOT： 檢索式寫成A not B，表示包含檢索詞A同時(shí)不包含檢索詞B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。 Hepatitis not Animal9IP地址：PubMed 網(wǎng)址10高級檢索主題檢索限制檢索基本檢索臨床咨詢115. PubMed檢索方法5.1 基本檢索5.2 高級檢索5.3 限制檢索5.4 主題檢索5.5 臨床咨詢125.1 基本檢索默認(rèn)檢索字段為主題、作者、期刊13關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語： 輸入任意關(guān)鍵詞：liver cancer、Lung cancer； 帶有雙引號” ”作為短

5、語檢索：”cancer therapy”； 帶有連接號”-”作為一個(gè)詞組檢索：interleukin-6。限制檢索字段：如liver cancerti作者：Smith J 、 僅知道作者姓，則必須加上字段標(biāo)識，如： Smithau2002年以后的文獻(xiàn)若文中有作者全稱可用全稱檢索如：Joshua Lederberg5.1 基本檢索14期刊刊名： 可用期刊全稱：GENE THERAPYTA； 可用期刊簡稱：JAMATA；(The Journal of the American Medical Association) 復(fù)雜表達(dá)式：liver cancer AND therapy帶有摘要文獻(xiàn)的檢索

6、：liver cancer AND hasabstract5.1 基本檢索15分析該檢索課題，包含兩個(gè)方面： 肝癌：liver cancer；治療：therapy兩個(gè)主題之間的邏輯關(guān)系是AND，即liver cancer AND therapy 基本檢索舉例：肝癌的治療16基本檢索舉例：肝癌的治療輸入：liver cancer AND therapy17“肝癌的治療”的基本檢索結(jié)果185.2 高級檢索高級檢索195.2 高級檢索20分析該檢索課題，包含兩個(gè)方面： 作者為：馬大龍（ma dl）；作者單位為： 北京大學(xué)（peking university）。 高級檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授

7、發(fā)表的文獻(xiàn)21高級檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)第一步：輸入作者姓名輸入：ma dl22高級檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)第二步：輸入作者單位輸入：peking university23高級檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)245.3 限制檢索限制檢索255.3 限制檢索限制檢索或條件檢索：Limit (1)文獻(xiàn)類型：日期： (2)語種： (3)動物/人類： (4)性別： (5)數(shù)據(jù)庫子集的限定： (6)年齡組： (7)是否帶有摘要或全文： (8)字段：26限制日期限制語種限制是否帶有全文、摘要限制字段限制研究對象限制性別限制子集限制年齡限制文獻(xiàn)類型27分

8、析該課題，可知：主題為肝癌治療，即liver cancer and therapy限制條件有兩個(gè)：語種為英文（English）；文獻(xiàn)類型為綜述（Review）限制檢索舉例：原文為英文的肝癌治療方面的綜述文獻(xiàn)28限制檢索舉例：原文為英文的肝癌治療方面的綜述文獻(xiàn)第1步：輸入 liver cancer and therapy第2步：限制語種為英文（English）第3步：限制文獻(xiàn)類型為綜述（Review）29限制檢索舉例：原文為英文的肝癌治療方面的綜述文獻(xiàn)主題為： liver cancer and therapy限制條件：英文；綜述305.3 主題檢索根據(jù)medline數(shù)據(jù)主題標(biāo)引的規(guī)范性，利用主題

9、詞進(jìn)行的研究，對提高查全率、查準(zhǔn)率會有相當(dāng)?shù)膸椭?。點(diǎn)擊MeSH Database打開主題檢索界面31高級檢索主題檢索限制檢索基本檢索臨床咨詢325.3 主題檢索33主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)分析該檢索課題，有兩個(gè)概念：長春新堿（Vincristine ） 、白血病（leukemia）：對長春新堿來說是利用其治療疾病，故其應(yīng)組配副主題詞“治療應(yīng)用（therapeutic use）”；對白血病來說是利用藥物來治療，故其應(yīng)組配副主題詞“藥物療法（drug therapy）”。同時(shí)這兩個(gè)概念之間是AND的關(guān)系。34主題檢索舉例：長春新堿（Vi

10、ncristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用35主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用36主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用副主題詞37主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用38主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用39主題檢索舉例：長春新

11、堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用40主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法41主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法42主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法43主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法44主題檢索舉例：長春新堿（Vi

12、ncristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法45主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法46我們通過兩個(gè)主題檢索分別得到了：“長春新堿/治療應(yīng)用” 的檢索結(jié)果“白血病/藥物療法” 的檢索結(jié)果下面我們要把這兩個(gè)檢索結(jié)果用AND組合起來，就需要用到檢索史主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)47主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)48主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療

13、白血病（leukemia）的文獻(xiàn)49主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)505.5 臨床咨詢和系統(tǒng)評價(jià)可以使用戶方便快捷地檢索到有關(guān)臨床方面的文獻(xiàn)，如臨床疾病的診斷、治療、病因和預(yù)后等；也可以用它來檢索臨床實(shí)踐過程中遇到的一些具體問題，如系統(tǒng)性綜述、元分析、臨床試驗(yàn)、循證醫(yī)學(xué)、實(shí)踐指導(dǎo)以及有關(guān)遺傳學(xué)方面的問題等。 515.5 臨床咨詢和系統(tǒng)評價(jià)臨床咨詢525.5 臨床咨詢和系統(tǒng)評價(jià)系統(tǒng)評價(jià)535.5 臨床咨詢和系統(tǒng)評價(jià)檢索醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究方面的文獻(xiàn)546. 結(jié)果的顯示、打印、保存顯示保存、打印556.1 結(jié)果的顯示顯示格式：系統(tǒng)提供的顯示格式很多

14、，一般較常用的有以下4種：（1）Summary：為默認(rèn)顯示格式。顯示的信息包括文獻(xiàn)的標(biāo)題、著者、出處、PMID、綜述出版類型、非英文文獻(xiàn)的原文語種等。（2）Abstract：顯示信息除了文獻(xiàn)標(biāo)題、著者、出處等基本信息外，還包括摘要信息，以便用戶了解文獻(xiàn)詳細(xì)內(nèi)容。56（3）MEDLINE：以MEDLINE數(shù)據(jù)庫的記錄格式來顯示檢索結(jié)果。字段內(nèi)容主要包括PMID、題目、摘要、作者、作者地址、語種、出版類型、出處、MeSH、文獻(xiàn)ID、出版狀態(tài)等。6.1 結(jié)果的顯示576.1 結(jié)果的顯示58保存記錄在“send to”下拉菜單中選擇“File”，可完成將記錄保存為文件。選擇“E-mail”，則可將結(jié)果發(fā)送至郵箱。在檢索結(jié)果顯示頁面可將某一次檢索的全部記錄或標(biāo)記記錄保存；而“Clipboard”頁面