靜息態(tài)處理全過(guò)程PPTPPT

1、關(guān)于靜息態(tài)處理全過(guò)程PPT第一張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月2Outline 預(yù)處理 ALFF, ReHo, FC 計(jì)算 統(tǒng)計(jì) 結(jié)果呈現(xiàn) 文獻(xiàn)管理第二張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月3預(yù)處理 數(shù)據(jù)整理 DICOM - NIFTI 去前10個(gè)時(shí)間點(diǎn) Slice Timing Realign Normalize Smooth 去線性漂移 Filter: 0.01-0.08第三張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月4數(shù)據(jù)整理被試信息整理第四張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月5數(shù)據(jù)整理被試信息整理第五張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月6數(shù)據(jù)整理被試信息整理原始

2、數(shù)據(jù)整理靜息功能數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)DTI數(shù)據(jù)第六張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月7數(shù)據(jù)整理被試信息整理原始數(shù)據(jù)整理靜息功能數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)DTI數(shù)據(jù)第七張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月8預(yù)處理 數(shù)據(jù)整理 DICOM - NIFTI 去前10個(gè)時(shí)間點(diǎn) Slice Timing Realign Normalize Smooth 去線性漂移 Filter: 0.01-0.08第八張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月9DICOM-NIFTIMRIcroNs dcm2niiguiSPM5s DICOM Import第九張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月10預(yù)處理 數(shù)據(jù)整理 DIC

3、OM - NIFTI 去前10個(gè)時(shí)間點(diǎn) Slice Timing Realign Normalize Smooth 去線性漂移 Filter: 0.01-0.08第十張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月11預(yù)處理 數(shù)據(jù)整理 DICOM - NIFTI 去前10個(gè)時(shí)間點(diǎn) Slice Timing Realign Normalize Smooth 去線性漂移 Filter: 0.01-0.08第十一張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月12Slice TimingWhy?第十二張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月13Slice TimingWhy?Huettel et al., 2

4、004第十三張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月14Slice Timing1:2:33,2:2:323322-(2/33)33第十四張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月15Slice Timing第十五張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月16預(yù)處理 數(shù)據(jù)整理 DICOM - NIFTI 去前10個(gè)時(shí)間點(diǎn) Slice Timing Realign Normalize Smooth 去線性漂移 Filter: 0.01-0.08第十六張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月17RealignWhy?第十七張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月18Realign第十八張，P

5、PT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月19Realign檢查頭動(dòng)?b=load(rp_name.txt);c=max(abs(b);c(4:6)=c(4:6)*180/pi;第十九張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月20預(yù)處理 數(shù)據(jù)整理 DICOM - NIFTI 去前10個(gè)時(shí)間點(diǎn) Slice Timing Realign Normalize Smooth 去線性漂移 Filter: 0.01-0.08第二十張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月21NormalizeWhy?Huettel et al., 2004第二十一張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月22mean_name

6、.imgr*.imgEPI.nii-90 -126 -72; 90 90 1083 3 3第二十二張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月23Normalize第二十三張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月24預(yù)處理 數(shù)據(jù)整理 DICOM - NIFTI 去前10個(gè)時(shí)間點(diǎn) Slice Timing Realign Normalize Smooth 去線性漂移 Filter: 0.01-0.08第二十四張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月25SmoothWhy?減少被試間的空間結(jié)構(gòu)差異；有利統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的有效性;第二十五張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月26w*.img平滑核Sm

7、ooth第二十六張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月27預(yù)處理 數(shù)據(jù)整理 DICOM - NIFTI 去前10個(gè)時(shí)間點(diǎn) Slice Timing Realign Normalize Smooth 去線性漂移 Filter: 0.01-0.08第二十七張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月28去線性漂移第二十八張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月29預(yù)處理 數(shù)據(jù)整理 DICOM - NIFTI 去前10個(gè)時(shí)間點(diǎn) Slice Timing Realign Normalize Smooth 去線性漂移 Filter: 0.01-0.08第二十九張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6

8、月30濾波Why?關(guān)心低頻的活動(dòng)第三十張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月31濾波第三十一張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月32Outline 預(yù)處理 ALFF, ReHo, FC 計(jì)算 統(tǒng)計(jì) 結(jié)果呈現(xiàn) 文獻(xiàn)管理第三十二張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月33ALFFZang et al., 2007第三十三張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月34ALFF第三十四張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月35ReHo注意：預(yù)處理時(shí)不做平滑，計(jì)算完ReHo后再進(jìn)行平滑。Zang et al., 2004第三十五張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月36ReHo第三十

9、六張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月37功能連接提取協(xié)變量 頭動(dòng)參數(shù): rp_name.txt 全腦信號(hào)、腦脊液、白質(zhì)信號(hào)第三十七張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月38提取協(xié)變量第三十八張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月39提取協(xié)變量第三十九張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月40提取協(xié)變量第四十張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月41提取協(xié)變量第四十一張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月42提取協(xié)變量第四十二張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月43提取協(xié)變量第四十三張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月44提取協(xié)變量第四十四張，PPT共八十

10、五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月45功能連接提取協(xié)變量 頭動(dòng)參數(shù): rp_name.txt 全腦信號(hào)、腦脊液、白質(zhì)信號(hào) 協(xié)變量組合：RPCov=load(rp_name.txt);BCWCov=load(ROI_FCMap_name.txt);Cov=RPCov,BCWCov;save(Cov.txt, Cov, -ASCII, -DOUBLE,-TABS);第四十五張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月46功能連接Voxel-wiseROI-wiser=0.36第四十六張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月47Voxel-wise第四十七張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月48Vox

11、el-wise第四十八張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月49Voxel-wise第四十九張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月50Voxel-wise第五十張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月51Voxel-wise第五十一張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月52Voxel-wise第五十二張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月53Voxel-wise1 by 1Cov.txt第五十三張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月54ROI-wise第五十四張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月55ROI-wise第五十五張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月5

12、6ROI-wise1 by 1Cov.txt第五十六張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月57Outline 預(yù)處理 ALFF, ReHo, FC 計(jì)算 統(tǒng)計(jì) 結(jié)果呈現(xiàn) 文獻(xiàn)管理第五十七張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月58統(tǒng)計(jì)單樣本T檢驗(yàn)雙樣本T檢驗(yàn)第五十八張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月59單樣本T檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)準(zhǔn)備 ALFF: mALFF ReHo: smReHo FC: zFC第五十九張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月60單樣本T檢驗(yàn)mALFF-1, smReHo-1m圖像1by 1i1-1第六十張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月61單樣本T檢驗(yàn)m*-1

13、圖像; zFC圖像存放SPM.mat的目錄第六十一張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月62單樣本T檢驗(yàn)上一步生成的spm.mat第六十二張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月63單樣本T檢驗(yàn)上一步生成的spm.mat1第六十三張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月64單樣本T檢驗(yàn)HeightthresholdT = 2.687659 p0PD_1T.imgCON_1T.imgMask_2T.imgi1+i20第六十六張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月67雙樣本T檢驗(yàn)兩組的m*圖像; zFC圖像存放SPM.mat的目錄Mask_2T.img第六十七張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作

14、于2022年6月68雙樣本T檢驗(yàn)上一步生成的spm.mat第六十八張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月69雙樣本T檢驗(yàn)上一步生成的spm.mat1 -1第六十九張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月70雙樣本T檢驗(yàn)HeightthresholdT = Inf p0.05(FDR)Extentthresholdk = 0 voxelsspmT_0001.img第七十張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月71Outline 預(yù)處理 ALFF, ReHo, FC 計(jì)算 統(tǒng)計(jì) 結(jié)果呈現(xiàn) 文獻(xiàn)管理第七十一張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月72結(jié)果呈現(xiàn) SPM5 xjview res

15、t_sliceviewer MRIcroN第七十二張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月73結(jié)果呈現(xiàn)SPM5第七十三張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月74結(jié)果呈現(xiàn)SPM5第七十四張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月75結(jié)果呈現(xiàn)xjview第七十五張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月76結(jié)果呈現(xiàn)xjview第七十六張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月77結(jié)果呈現(xiàn)rest_sliceviewer第七十七張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月78結(jié)果呈現(xiàn)MRIcroN第七十八張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月79結(jié)果呈現(xiàn)MRIcroN第七十九張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月80Outline 預(yù)處理 ALFF, ReHo, FC 計(jì)算 統(tǒng)計(jì) 結(jié)果呈現(xiàn) 文獻(xiàn)管理第八十張，PPT共八十五頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月81文獻(xiàn)管理第八十一張，PPT共八