酶催化反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第1頁
酶催化反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第2頁
酶催化反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第3頁
酶催化反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第4頁
酶催化反應(yīng)動(dòng)力學(xué)_第5頁
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文檔簡介

關(guān)于酶催化反應(yīng)動(dòng)力學(xué)第1頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六(1)較高的催化效率(2)很強(qiáng)的專一性(3)具有溫和的反應(yīng)條件(4)易變性與失活7.1酶的催化特性

第2頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六絕對(duì)專一性

:一種酶只能催化一種化合物進(jìn)行一種反應(yīng)相對(duì)專一性:一種酶能夠催化一類具有相同化學(xué)鍵或基團(tuán)的物質(zhì)進(jìn)行某種類型的反應(yīng)反應(yīng)專一性:一種酶只能催化某化合物在熱力學(xué)上可能進(jìn)行的許多反應(yīng)中的一種反應(yīng)底物專一性:一種酶只能催化一種底物立體專一性:一種酶只能作用于所有立體異構(gòu)體中的一種

很強(qiáng)的專一性第3頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六具有溫和的反應(yīng)條件一般在生理溫度25~37℃的范圍,僅有少數(shù)酶反應(yīng)可在較高溫度下進(jìn)行。在接近中性的pH值條件下進(jìn)行第4頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六易變性與失活蛋白酶的化學(xué)本質(zhì)是蛋白質(zhì),因而具有蛋白質(zhì)的所有性質(zhì)。常因變性而使活力下降,甚至完全失活。酶的變性多數(shù)為不可逆。

第5頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六激活劑和抑制劑激活劑:能提高酶活性的物質(zhì)1)無機(jī)離子:酶的輔因子;橋梁作用2)中等大小的有機(jī)分子:還原劑;EDTA3)蛋白質(zhì)性質(zhì)的大分子:激活酶原抑制劑:降低酶的催化活性甚至完全失活的物質(zhì)(區(qū)別于變性劑)第6頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六7.2.1Michaelis-Menten方程:快速平衡學(xué)說

①與底物濃度[S]相比,酶的濃度[E]是很小的,因而可忽略由于生成中間復(fù)合物[ES]而消耗的底物。②不考慮這個(gè)逆反應(yīng)的存在(只適應(yīng)于反應(yīng)初期)③認(rèn)為基元反應(yīng)的反應(yīng)速率最慢,為該反應(yīng)速率的控制步驟,

k-1>>k2,也就是說ES分解生成P的速率不足以破壞E和ES之間的快速平衡k1k-1k2k-2第7頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六反應(yīng)快速建立平衡:反應(yīng)體系的總酶量為:(1)經(jīng)整理得:由于酶促反應(yīng)速度由[ES]決定,即,所以(2)將(2)代入(1)得:(3)當(dāng)[Et]=[ES]時(shí),(4)所以

將(4)代入(3),則:快速平衡學(xué)說:米氏方程第8頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六7.2.1Briggs-Haldane方程:擬穩(wěn)態(tài)學(xué)說

1、與底物濃度[S]相比,酶的濃度[E]是很小的,因而可忽略由于生成中間復(fù)合物[ES]而消耗的底物。

2、不考慮這個(gè)逆反應(yīng)的存在3、認(rèn)為基元反應(yīng)的反應(yīng)速率最慢,為該反應(yīng)速率的控制步驟。4、在一定時(shí)間內(nèi)雖然[S]和[P]在不斷變化,ES復(fù)合體也在不斷地生成和分解,但ES的生成速率與分解速率接近相等,[ES]基本保持不變k1k-1k2k-21925年BriggsG.E.和HaldaneJ.B.S.對(duì)該模型提出了修正第9頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六[ES]生成速度:,[ES]分解速度:當(dāng)酶反應(yīng)體系處于恒態(tài)時(shí):即:令:則:(1)經(jīng)整理得:由于酶促反應(yīng)速度由[ES]決定,即,所以(2)將(2)代入(1)得:(3)當(dāng)[Et]=[ES]時(shí),(4)所以

將(4)代入(3),則:穩(wěn)態(tài)學(xué)說:Brigges-Haldane方程第10頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六米氏常數(shù)的意義(1)物理意義:Km值等于酶反應(yīng)速度為最大速度一半時(shí)的底物濃度。(2)Km值愈大,酶與底物的親和力愈小;Km值愈小,酶與底物親和力愈大。酶與底物親和力大,表示不需要很高的底物濃度,便可容易地達(dá)到最大反應(yīng)速度。(3)Km值是酶的特征性常數(shù),只與酶的性質(zhì),酶所催化的底物和酶促反應(yīng)條件(如溫度、pH、有無抑制劑等)有關(guān),與酶的濃度無關(guān)。酶的種類不同,Km值不同,同一種酶與不同底物作用時(shí),Km值也不同。第11頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六7.3有抑制的酶催化反應(yīng)動(dòng)力學(xué)

在酶催化反應(yīng)中,由于某些外源化合物的存在而使反應(yīng)速率下降,這種物質(zhì)稱為抑制劑??赡嬉种瓶捎弥T如透析等物理方法把抑制劑去掉而恢復(fù)酶的活性,酶與抑制劑的結(jié)合存在著解離平衡的關(guān)系。抑制劑與酶的基因成共價(jià)結(jié)合,不能用物理方法去掉抑制劑。此類抑制可使酶永久性地失活。例如重金屬離子Hg2+”、Pb2+”等對(duì)木瓜蛋白酶、菠蘿蛋白酶的抑制都是不可逆抑制。不可逆抑制第12頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六根據(jù)產(chǎn)生抑制的機(jī)理不同,可逆抑制分為:

競爭性抑制非競爭性抑制反競爭性抑制混合性抑制

第13頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六1.競爭性抑制(competitiveinhibition)(1)含義和反應(yīng)式抑制劑I和底物S結(jié)構(gòu)相似,抑制劑I和底物S對(duì)游離酶E的結(jié)合有競爭作用,互相排斥,已結(jié)合底物的ES復(fù)合體,不能再結(jié)合I。第14頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六(2)特點(diǎn):①抑制劑I與底物S在化學(xué)結(jié)構(gòu)上相似,能與底物S競爭酶E分子活性中心的結(jié)合基團(tuán).例如,丙二酸、蘋果酸及草酰乙酸皆和琥珀酸的結(jié)構(gòu)相似,是琥珀酸脫氫酶的競爭性抑制劑。第15頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六

②抑制程度取決于抑制劑與底物的濃度比、〔ES〕和〔EI〕的相對(duì)穩(wěn)定性;③加大底物濃度,可使抑制作用減弱甚至消除。第16頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六(3)競爭性抑制劑的動(dòng)力學(xué)方程

E+SESE+PE+IEIk1k2k3由米氏方程得:Km=①

Ki=②

〔E〕=〔E〕t-〔ES〕-〔EI〕③〔E〕〔S〕〔ES〕〔E〕〔I〕〔EI〕ki第17頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六解方程①②③得:〔ES〕=

〔E〕t

(1+)+1Km〔S〕〔I〕Ki又因vi=k3〔ES〕,代入上式得:Vi=

(1+)+〔S〕Km〔I〕KiVmax〔S〕第18頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六競爭性抑制劑雙倒數(shù)曲線,如下圖所示:有競爭性抑制劑存在的曲線與無抑制劑的曲線相交于縱坐標(biāo)1/Vmax處,但橫坐標(biāo)的截距,因競爭性抑制存在變小,說明該抑制作用,并不影響酶促反應(yīng)的最大速度Vmax,而使Km值變大。1vi=(1+)KmVmax〔S〕1+Vmax1〔I〕Ki第19頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六2.非競爭性抑制(non-competitiveinhibition)(1)含義和反應(yīng)式抑制劑I和底物S與酶E的結(jié)合完全互不相關(guān),既不排斥,也不促進(jìn)結(jié)合,抑制劑I可以和酶E結(jié)合生成EI,也可以和ES復(fù)合物結(jié)合生成ESI。底物S和酶E結(jié)合成ES后,仍可與I結(jié)合生成ESI,但一旦形成ESI復(fù)合物,再不能釋放形成產(chǎn)物P。第20頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六第21頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六(2)特點(diǎn):

①I和S在結(jié)構(gòu)上一般無相似之處,I常與酶分子上結(jié)合基團(tuán)以外的化學(xué)基團(tuán)結(jié)合,這種結(jié)合并不影響底物和酶的結(jié)合,增加底物濃度并不能減少I對(duì)酶的抑制。②非競爭性抑制劑的雙倒數(shù)曲線:有非競爭性抑制劑存在的曲線與無抑制劑的曲線相交于橫坐標(biāo)-1/Km處,但縱坐標(biāo)的截距,因競爭性抑制存在變大,說明該抑制作用,并不影響酶促反應(yīng)的Km值,而使Vmax值變小,如下圖所示:第22頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六非競爭性抑制Vi=Vmax〔S〕(1+)〔I〕KiKm+()〔S〕1Vi=(1+)〔I〕Ki×(+)1VmaxKmVmax1〔S〕第23頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六3.反競爭性抑制

(1)含義和反應(yīng)式反競爭性抑制劑必須在酶結(jié)合了底物之后才能與酶與底物的中間產(chǎn)物結(jié)合,該抑制劑與單獨(dú)的酶不結(jié)合。第24頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六

酶第25頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六(2)特點(diǎn):反競爭性抑制劑存在下,Km、Vmax都變小。1Vi=KmVmax1〔S〕+1Vmax〔I〕Ki(1+)Vi=Vmax〔S〕〔S〕〔I〕Ki(1+)Km+第26頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六復(fù)雜的酶促反應(yīng)——雙底物反應(yīng)A+BP+Q序列反應(yīng):在任何產(chǎn)物釋放前兩種底物必須先結(jié)合到酶上乒乓反應(yīng):在所有底物完全結(jié)合之前即有產(chǎn)物釋放k1k-1k2k-2k1k-1k2k-2第27頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六復(fù)雜的酶促反應(yīng)——雙底物反應(yīng)第28頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六第29頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六復(fù)雜的酶促動(dòng)力學(xué):雙底物反應(yīng)

第30頁,共35頁,2022年,5月20日,11點(diǎn)6分,星期六復(fù)雜的酶促動(dòng)力學(xué):乒乓反應(yīng)(無三元復(fù)合物,酶的過度態(tài)

第31頁,共3

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