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文檔簡(jiǎn)介
乙型肝炎病毒cccDNA檢測(cè)方法乙型肝炎病毒cccDNA檢測(cè)方法1一、幾個(gè)相關(guān)問(wèn)題簡(jiǎn)介一、幾個(gè)相關(guān)問(wèn)題簡(jiǎn)介2什么是HBVcccDNA?
即共價(jià)閉合環(huán)狀DNA(covalentlyclosedcircularDNA)。乙肝病毒感染宿主細(xì)胞后在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制并建立感染狀態(tài),病毒松弛環(huán)狀DNA(rcDNA)進(jìn)入細(xì)胞核,利用宿主DNA聚合酶和拓?fù)涿傅取靶迯?fù)”形成的、結(jié)構(gòu)完整的、超螺旋雙鏈DNA分子。什么是HBVcccDNA?即共價(jià)閉合環(huán)狀DNA3乙型肝炎病毒基因組結(jié)構(gòu)示意圖乙型肝炎病毒基因組結(jié)構(gòu)示意圖4乙型肝炎病毒的復(fù)制過(guò)程乙型肝炎病毒的復(fù)制過(guò)程5我們?yōu)槭裁匆P(guān)注HBVcccDNA?cccDNA存在于細(xì)胞核內(nèi),成為乙肝病毒的復(fù)制“池”目前尚沒(méi)有可以進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi),并能夠清除cccDNA
的藥物,這也是現(xiàn)有抗病毒藥物治療效果不佳和治療后容易復(fù)發(fā)的原因之一肝臟以外器官組織細(xì)胞可能存在cccDNA,成為肝臟移植術(shù)后乙肝復(fù)發(fā)的來(lái)源還沒(méi)有穩(wěn)定、可靠、敏感的cccDNA檢測(cè)試劑盒問(wèn)世我們?yōu)槭裁匆P(guān)注HBVcccDNA?cccDNA存在于6為什么沒(méi)有cccDNA檢測(cè)試劑盒問(wèn)世?·研究和開(kāi)發(fā)該檢測(cè)技術(shù)的時(shí)間不長(zhǎng)·檢測(cè)技術(shù)上的難度較大·前期研究主要集中于細(xì)胞模型和動(dòng)物肝臟模,不能滿足臨床檢驗(yàn)的需求·現(xiàn)有技術(shù)靈敏度不高,檢測(cè)低限104copy/ml左右·分研究機(jī)構(gòu)和學(xué)者對(duì)檢測(cè)技術(shù)的特異性認(rèn)識(shí)不足,存在缺陷為什么沒(méi)有cccDNA檢測(cè)試劑盒問(wèn)世?·研究和開(kāi)發(fā)該檢測(cè)技術(shù)7·多種同源的乙肝病毒DNA分子并存(cccDNA、
rcDNA、ssDNA、整合的HBVDNA),必須有效地分離cccDNA和其他類型的病毒DNA·如何進(jìn)一步解決特異性的問(wèn)題?·如何解決靈敏度不高的問(wèn)題(細(xì)胞內(nèi)cccDNA
含量的較低),血清中含量?·如何簡(jiǎn)化檢測(cè)步驟?建立cccDNA檢測(cè)技術(shù)必須克服的難點(diǎn)·多種同源的乙肝病毒DNA分子并存(cccDNA、建立ccc8cccDNArcDNA核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)完整的雙鏈兩條鏈均不完整核酸空間結(jié)構(gòu)閉合環(huán)狀,超螺旋松弛環(huán)狀,非超螺旋是否與蛋白質(zhì)結(jié)合不結(jié)合共價(jià)結(jié)合對(duì)某些核酸酶抗性強(qiáng),不容易被降解弱,容易被降解分離cccDNA和rcDNA的分子基礎(chǔ)分離cccDNA和rcDNA的任何手段均基于上述差異cccDNArcDNA核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)完整的雙鏈兩條鏈均不完整核9二、HBVcccDNA檢測(cè)技術(shù)二、HBVcccDNA檢測(cè)技術(shù)101.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)2.侵入者探針?lè)ǎ↖nvaderassaay)3.嵌合引物熒光PCR法現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介1.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)現(xiàn)有的11現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)2.侵入者探針?lè)ǎ↖nvaderassaay)3.嵌合引物熒光PCR法現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介選擇性PCR(普通PCR12設(shè)計(jì)一對(duì)特殊引物:跨雙缺口引物正義引物P1:與負(fù)鏈互補(bǔ)結(jié)合,位于正鏈缺口上游反義引物P2:與正鏈互補(bǔ)結(jié)合,位于負(fù)鏈缺口下游目的:rcDNA不被擴(kuò)增1.選擇性PCR設(shè)計(jì)一對(duì)特殊引物:跨雙缺口引物1.選擇性PCR13選擇性PCR:rcDNA不被擴(kuò)增選擇性PCR:rcDNA不被擴(kuò)增14選擇性PCR:cccDNA能被擴(kuò)增選擇性PCR:cccDNA能被擴(kuò)增15PCR產(chǎn)物自身退火(selfannealing)“選擇性”PCR:并非萬(wàn)無(wú)一失PCR產(chǎn)物自身退火(selfannealing)“選擇性16rcDNA被大量擴(kuò)增,陽(yáng)性結(jié)果不可靠,定量結(jié)果也不可靠
HepatologyResearch2003;15:234-243(PBMC)
WorldJGastroenterol2004;10(1):82-85(血清)Kock等:反應(yīng)管中rcDNA含量不能超過(guò)105copyHepatology
1996;23:405-413
血清HBVrcDNA超過(guò)108copy/ml,進(jìn)行熒光PCR可能會(huì)出現(xiàn)檢測(cè)結(jié)果假陽(yáng)性“選擇性”PCR:并非萬(wàn)無(wú)一失rcDNA被大量擴(kuò)增,陽(yáng)性結(jié)果不可靠,定量結(jié)果也不可17
與定性法比較增加了一個(gè)熒光探針,探針位于擴(kuò)增片段區(qū)(負(fù)鏈缺口下游),與cccDNA的負(fù)鏈互補(bǔ)。選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA與定性法比較增加了一個(gè)熒光探針,探針位于擴(kuò)增片段區(qū)(18rcDNA不能被擴(kuò)增無(wú)熒光信號(hào)EcoRI5‘+P1P23200(1)5‘3‘15903‘1820P118201590+3200(1)EcoRIP2cccDNA能被擴(kuò)增檢測(cè)到熒光信號(hào)選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNArcDNA不能被擴(kuò)增EcoRI5‘+P1P23219實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理20實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理21實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理22
標(biāo)準(zhǔn)曲線方程YCt=42.0827-3.5554logXcopy
相關(guān)指數(shù):R2=0.995
靈敏度至少可以達(dá)到103copy/ml結(jié)果:選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA標(biāo)準(zhǔn)曲線方程YCt=42.0827-3.5554logX23·同樣存在PCR產(chǎn)物自身退火引起的rcDNA
非特異性擴(kuò)增的問(wèn)題·由于靈敏度較普通PCR高,假陽(yáng)性率比普通PCR更高缺陷:選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA·同樣存在PCR產(chǎn)物自身退火引起的rcDNA缺陷:選擇性實(shí)時(shí)24質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品107copy/ml3.5×108copy/ml攜帶者血清質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品105copy/ml105~107copy/ml攜帶者血清選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品107copy/ml3.5×108copy/ml攜25解決方案
特異性抽提分離cccDNA與其它形式的病毒DNA
采用沉淀法或質(zhì)粒抽提試劑盒抽提法酶切純化cccDNA
采用綠豆核酸酶或ATP依賴的plasmid-safeDNA酶選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA解決方案特異性抽提分離cccDNA與其它形式的病毒DNA選261.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)侵入者探針?lè)ǎ↖nvaderassaay)3.嵌合引物熒光PCR法現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介1.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)現(xiàn)有的272.侵入者探針?lè)?Invaderassay)兩個(gè)體系:兩種特殊的探針:invaderprobe和primaryprobe,后者含與待測(cè)模板無(wú)關(guān)的5’側(cè)翼的堿基片段。熒光共振能量轉(zhuǎn)移系統(tǒng):被核酸內(nèi)切酶Ⅰ(cleavase,裂解酶)特異地切割5’側(cè)翼堿基片段作為第二個(gè)invader,與熒光共振能量轉(zhuǎn)移盒(FRETC)結(jié)合,裂解酶切割FRETC上含有熒光基團(tuán)的短臂,發(fā)出熒光信號(hào)。特點(diǎn):一個(gè)模板可以重復(fù)使用,每“結(jié)合—裂解—結(jié)合—裂解”一次為一個(gè)循環(huán),每循環(huán)一次產(chǎn)生一個(gè)熒光信號(hào),呈線性信號(hào)放大2.侵入者探針?lè)?Invaderassay)兩個(gè)體系:28乙型肝炎病毒cccDNA檢測(cè)方法課件29乙型肝炎病毒cccDNA檢測(cè)方法課件30侵入者探針?lè)ǘ繖z測(cè)cccDNA的優(yōu)缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):線性信號(hào)放大,特異性比熒光
PCR法強(qiáng)缺點(diǎn):靈敏度低:104copy/ml侵入者探針?lè)ǘ繖z測(cè)cccDNA的優(yōu)缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):線性信號(hào)放大,311.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)2.侵入者分析法(Invaderassaay)嵌合引物熒光PCR法現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介1.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)現(xiàn)有的323.嵌合引物熒光PCR法Shao,etal.JVirolMethods2003;
112:45-52+PNN:與HBVDNA非同源片段5’N5’3’3’p+rcDNAcccDNA3.嵌合引物熒光PCR法Shao,etal.JVi33PNNP25’3’5’3’3.嵌合引物熒光PCR法PNNP25’3’5’3’3.嵌合引物熒光PCR法34
嵌合引物熒光PCR的優(yōu)缺點(diǎn)
優(yōu)點(diǎn):克服了熒光PCR法的部分缺陷,靈敏度比侵入法提高
缺點(diǎn):仍不能完全避免待測(cè)標(biāo)本中存在的
rcDNA被非特異性擴(kuò)增嵌合引物熒光PCR的優(yōu)缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):克服了熒光PCR法的部35
無(wú)論是選擇性熒光PCR,還是侵入者探針?lè)ɑ蚯逗弦餆晒釶CR,本身都不能解決在高rcDNA背景條件下的假陽(yáng)性問(wèn)題,必須結(jié)合抽提分離、酶切純化等步驟,以提高特異性。無(wú)論是選擇性熒光PCR,還是侵入者探針?lè)ɑ蚯逗弦餆?6三、影響cccDNA池的因素三、影響cccDNA池的因素371.cccDNA池的自身恒定cccDNA池:感染肝細(xì)胞核內(nèi)HBVcccDNA的含量在無(wú)外來(lái)干擾的情況下保持恒定(5-50copy/cell)病毒自身調(diào)節(jié):關(guān)于病毒的進(jìn)化關(guān)于病毒的“思維”病毒自身的調(diào)節(jié)外來(lái)壓力:打破病毒含量自身恒定的結(jié)果1.cccDNA池的自身恒定cccDNA池:感染肝細(xì)胞核382.抗病毒藥物對(duì)cccDNA的影響現(xiàn)有抗病毒藥物,包括干擾素和各種核苷類似物,可以一過(guò)性地減少cccDNA,但均不能清除cccDNA細(xì)胞核內(nèi)cccDNA含量的相對(duì)穩(wěn)定性,決定了長(zhǎng)療程抗病毒治療的必要性2.抗病毒藥物對(duì)cccDNA的影響現(xiàn)有抗病毒藥物,包括干擾素393.肝外組織也是cccDNA的儲(chǔ)存池?·肝外組織細(xì)胞中HBV標(biāo)志的存在情況:腎、胰腺、肺、心肌、心包膜、胃腸黏膜、皮膚、睪丸、前列腺、唾液腺等組織或細(xì)胞中均檢測(cè)到HBV的標(biāo)志物·HBV吸附?暫居?建立感染狀態(tài)?依據(jù):從上述組織細(xì)胞中檢測(cè)到cccDNA,但必須解決檢測(cè)技術(shù)問(wèn)題3.肝外組織也是cccDNA的儲(chǔ)存池?·肝外組織細(xì)胞中HBV40(2)關(guān)于血清中是否存在cccDNA的問(wèn)題·“血清中rcDNA含量越高,cccDNA陽(yáng)性率越高和含量越高”的現(xiàn)象,使我們對(duì)方法學(xué)提出質(zhì)疑·肝衰竭的病人在一定病期有可能大量釋放
cccDNA入血·細(xì)胞壞死后,cccDNA釋放入血是必然的,但是,裸露的核酸分子在血清中存在多少時(shí)間?(2)關(guān)于血清中是否存在cccDNA的問(wèn)題·“血清中rcD41乙型肝炎病毒cccDNA檢測(cè)方法乙型肝炎病毒cccDNA檢測(cè)方法42一、幾個(gè)相關(guān)問(wèn)題簡(jiǎn)介一、幾個(gè)相關(guān)問(wèn)題簡(jiǎn)介43什么是HBVcccDNA?
即共價(jià)閉合環(huán)狀DNA(covalentlyclosedcircularDNA)。乙肝病毒感染宿主細(xì)胞后在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制并建立感染狀態(tài),病毒松弛環(huán)狀DNA(rcDNA)進(jìn)入細(xì)胞核,利用宿主DNA聚合酶和拓?fù)涿傅取靶迯?fù)”形成的、結(jié)構(gòu)完整的、超螺旋雙鏈DNA分子。什么是HBVcccDNA?即共價(jià)閉合環(huán)狀DNA44乙型肝炎病毒基因組結(jié)構(gòu)示意圖乙型肝炎病毒基因組結(jié)構(gòu)示意圖45乙型肝炎病毒的復(fù)制過(guò)程乙型肝炎病毒的復(fù)制過(guò)程46我們?yōu)槭裁匆P(guān)注HBVcccDNA?cccDNA存在于細(xì)胞核內(nèi),成為乙肝病毒的復(fù)制“池”目前尚沒(méi)有可以進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi),并能夠清除cccDNA
的藥物,這也是現(xiàn)有抗病毒藥物治療效果不佳和治療后容易復(fù)發(fā)的原因之一肝臟以外器官組織細(xì)胞可能存在cccDNA,成為肝臟移植術(shù)后乙肝復(fù)發(fā)的來(lái)源還沒(méi)有穩(wěn)定、可靠、敏感的cccDNA檢測(cè)試劑盒問(wèn)世我們?yōu)槭裁匆P(guān)注HBVcccDNA?cccDNA存在于47為什么沒(méi)有cccDNA檢測(cè)試劑盒問(wèn)世?·研究和開(kāi)發(fā)該檢測(cè)技術(shù)的時(shí)間不長(zhǎng)·檢測(cè)技術(shù)上的難度較大·前期研究主要集中于細(xì)胞模型和動(dòng)物肝臟模,不能滿足臨床檢驗(yàn)的需求·現(xiàn)有技術(shù)靈敏度不高,檢測(cè)低限104copy/ml左右·分研究機(jī)構(gòu)和學(xué)者對(duì)檢測(cè)技術(shù)的特異性認(rèn)識(shí)不足,存在缺陷為什么沒(méi)有cccDNA檢測(cè)試劑盒問(wèn)世?·研究和開(kāi)發(fā)該檢測(cè)技術(shù)48·多種同源的乙肝病毒DNA分子并存(cccDNA、
rcDNA、ssDNA、整合的HBVDNA),必須有效地分離cccDNA和其他類型的病毒DNA·如何進(jìn)一步解決特異性的問(wèn)題?·如何解決靈敏度不高的問(wèn)題(細(xì)胞內(nèi)cccDNA
含量的較低),血清中含量?·如何簡(jiǎn)化檢測(cè)步驟?建立cccDNA檢測(cè)技術(shù)必須克服的難點(diǎn)·多種同源的乙肝病毒DNA分子并存(cccDNA、建立ccc49cccDNArcDNA核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)完整的雙鏈兩條鏈均不完整核酸空間結(jié)構(gòu)閉合環(huán)狀,超螺旋松弛環(huán)狀,非超螺旋是否與蛋白質(zhì)結(jié)合不結(jié)合共價(jià)結(jié)合對(duì)某些核酸酶抗性強(qiáng),不容易被降解弱,容易被降解分離cccDNA和rcDNA的分子基礎(chǔ)分離cccDNA和rcDNA的任何手段均基于上述差異cccDNArcDNA核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)完整的雙鏈兩條鏈均不完整核50二、HBVcccDNA檢測(cè)技術(shù)二、HBVcccDNA檢測(cè)技術(shù)511.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)2.侵入者探針?lè)ǎ↖nvaderassaay)3.嵌合引物熒光PCR法現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介1.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)現(xiàn)有的52現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)2.侵入者探針?lè)ǎ↖nvaderassaay)3.嵌合引物熒光PCR法現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介選擇性PCR(普通PCR53設(shè)計(jì)一對(duì)特殊引物:跨雙缺口引物正義引物P1:與負(fù)鏈互補(bǔ)結(jié)合,位于正鏈缺口上游反義引物P2:與正鏈互補(bǔ)結(jié)合,位于負(fù)鏈缺口下游目的:rcDNA不被擴(kuò)增1.選擇性PCR設(shè)計(jì)一對(duì)特殊引物:跨雙缺口引物1.選擇性PCR54選擇性PCR:rcDNA不被擴(kuò)增選擇性PCR:rcDNA不被擴(kuò)增55選擇性PCR:cccDNA能被擴(kuò)增選擇性PCR:cccDNA能被擴(kuò)增56PCR產(chǎn)物自身退火(selfannealing)“選擇性”PCR:并非萬(wàn)無(wú)一失PCR產(chǎn)物自身退火(selfannealing)“選擇性57rcDNA被大量擴(kuò)增,陽(yáng)性結(jié)果不可靠,定量結(jié)果也不可靠
HepatologyResearch2003;15:234-243(PBMC)
WorldJGastroenterol2004;10(1):82-85(血清)Kock等:反應(yīng)管中rcDNA含量不能超過(guò)105copyHepatology
1996;23:405-413
血清HBVrcDNA超過(guò)108copy/ml,進(jìn)行熒光PCR可能會(huì)出現(xiàn)檢測(cè)結(jié)果假陽(yáng)性“選擇性”PCR:并非萬(wàn)無(wú)一失rcDNA被大量擴(kuò)增,陽(yáng)性結(jié)果不可靠,定量結(jié)果也不可58
與定性法比較增加了一個(gè)熒光探針,探針位于擴(kuò)增片段區(qū)(負(fù)鏈缺口下游),與cccDNA的負(fù)鏈互補(bǔ)。選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA與定性法比較增加了一個(gè)熒光探針,探針位于擴(kuò)增片段區(qū)(59rcDNA不能被擴(kuò)增無(wú)熒光信號(hào)EcoRI5‘+P1P23200(1)5‘3‘15903‘1820P118201590+3200(1)EcoRIP2cccDNA能被擴(kuò)增檢測(cè)到熒光信號(hào)選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNArcDNA不能被擴(kuò)增EcoRI5‘+P1P23260實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理61實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理62實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理63
標(biāo)準(zhǔn)曲線方程YCt=42.0827-3.5554logXcopy
相關(guān)指數(shù):R2=0.995
靈敏度至少可以達(dá)到103copy/ml結(jié)果:選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA標(biāo)準(zhǔn)曲線方程YCt=42.0827-3.5554logX64·同樣存在PCR產(chǎn)物自身退火引起的rcDNA
非特異性擴(kuò)增的問(wèn)題·由于靈敏度較普通PCR高,假陽(yáng)性率比普通PCR更高缺陷:選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA·同樣存在PCR產(chǎn)物自身退火引起的rcDNA缺陷:選擇性實(shí)時(shí)65質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品107copy/ml3.5×108copy/ml攜帶者血清質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品105copy/ml105~107copy/ml攜帶者血清選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品107copy/ml3.5×108copy/ml攜66解決方案
特異性抽提分離cccDNA與其它形式的病毒DNA
采用沉淀法或質(zhì)粒抽提試劑盒抽提法酶切純化cccDNA
采用綠豆核酸酶或ATP依賴的plasmid-safeDNA酶選擇性實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)cccDNA解決方案特異性抽提分離cccDNA與其它形式的病毒DNA選671.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)侵入者探針?lè)ǎ↖nvaderassaay)3.嵌合引物熒光PCR法現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介1.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)現(xiàn)有的682.侵入者探針?lè)?Invaderassay)兩個(gè)體系:兩種特殊的探針:invaderprobe和primaryprobe,后者含與待測(cè)模板無(wú)關(guān)的5’側(cè)翼的堿基片段。熒光共振能量轉(zhuǎn)移系統(tǒng):被核酸內(nèi)切酶Ⅰ(cleavase,裂解酶)特異地切割5’側(cè)翼堿基片段作為第二個(gè)invader,與熒光共振能量轉(zhuǎn)移盒(FRETC)結(jié)合,裂解酶切割FRETC上含有熒光基團(tuán)的短臂,發(fā)出熒光信號(hào)。特點(diǎn):一個(gè)模板可以重復(fù)使用,每“結(jié)合—裂解—結(jié)合—裂解”一次為一個(gè)循環(huán),每循環(huán)一次產(chǎn)生一個(gè)熒光信號(hào),呈線性信號(hào)放大2.侵入者探針?lè)?Invaderassay)兩個(gè)體系:69乙型肝炎病毒cccDNA檢測(cè)方法課件70乙型肝炎病毒cccDNA檢測(cè)方法課件71侵入者探針?lè)ǘ繖z測(cè)cccDNA的優(yōu)缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):線性信號(hào)放大,特異性比熒光
PCR法強(qiáng)缺點(diǎn):靈敏度低:104copy/ml侵入者探針?lè)ǘ繖z測(cè)cccDNA的優(yōu)缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):線性信號(hào)放大,721.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)2.侵入者分析法(Invaderassaay)嵌合引物熒光PCR法現(xiàn)有的幾種cccDNA檢測(cè)技術(shù)簡(jiǎn)介1.選擇性PCR(普通PCR、套式PCR、熒光PCR)現(xiàn)有的733.嵌合引物熒光PCR法Shao,etal.JVirolMethods2003;
112:45-52+PNN:與HBVDNA非同源片段5’N5’3’3’p+rcDNAcccDNA3.嵌合引物熒光PCR法Shao,etal.JVi74PNNP25’3’5’3’3.嵌合引物熒光PCR法PNNP25’3’5’3’3.嵌合引物熒光PCR法75
嵌合引物熒光PCR的優(yōu)缺點(diǎn)
優(yōu)點(diǎn):克服了熒光PCR法的部分缺陷,靈敏
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