豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)

豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)有關豬的育種常規(guī)育種，重在落實、持之以恒常規(guī)的育種方法主要利用表型值和系譜信息進行BLUP預測估計育種值，在豬的遺傳改良方面取得了很大進展育種新技術，迎頭趕上、奮起直追國家提倡，大眾創(chuàng)新、萬眾創(chuàng)業(yè)，“新”是其核心內(nèi)容，育種本身就是創(chuàng)新，育種新技術是新上加新育種新技術是抄近道追趕豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)育種新技術全基因組選擇育種目標的變化測定技術的變化豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)全基因組選擇什么叫全基因組選擇為了進一步提高育種的效率，T.H,Meuwissen等提出了一種新的標記輔助選擇方法，即全基因組選擇（Genomicselection,GS）。該方法假設覆蓋全基因組上的高密度SNPs標記中至少有１個SNP與QTL處于連鎖不平衡關系，利用SNP估計每個QTL的效應，從而獲得個體的全基因組估計育種值（Genomicestimatedbreedingvalue,GEBV）。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)它與標記輔助選擇的區(qū)別隨著分子遺傳學技術的發(fā)展，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了大量與豬經(jīng)濟性狀相關聯(lián)的基因或分子標記,例如,雌激素受體（ESR）基因、胰島素樣生長因子２（IGF2）基因和蘭尼定１型受體（RYR1）基因等。標記輔助選擇（MAS）方法可以準確、快速地對目的性狀進行選擇，在豬育種中得到了廣泛應用，但是其估計位點效應范圍有限且取得的遺傳進展較小。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)全基因組選擇的優(yōu)點不僅可以提高選擇的準確性，尤其是一些低遺傳力性狀、難以測量的性狀、限性性狀、生長后期測定的性狀、屠宰性狀和免疫力等，還可以在動物出生時或者胚胎期即可預測GEBV，從而縮短世代間隔，大大提高遺傳進展。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)全基因組選擇商業(yè)化應用在豬的全基因組測序完成后，等對商業(yè)品種杜洛克（34頭）、皮特蘭（23頭）、長白豬（29頭）、大白豬（36頭）和野豬（36頭）共5個品種的DNA分別混池，采用全基因組重測序方法鑒定出數(shù)十萬個SNPs，并從中選擇設計出PorcineSNP60Beadchip。該SNP芯片共有64232個SNPs，檢出率可達97.5%，SNP信息可靠。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)隨著豬60kSNP芯片的商業(yè)化和測序的成本不斷降低，全基因組選擇方法成為在豬育種領域的新熱點，并已經(jīng)從試驗階段逐步走向應用階段，成為未來長期最大化提高遺傳進展的育種新技術，將對中國豬種遺傳改良發(fā)揮巨大的推動作用。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)全基因組選擇的過程實施全基因組選擇需要具備一定數(shù)量、并記錄相關性狀的參考群體和適宜標記密度的SNP芯片，構建表型值與標記信息的預測方程，最終利用預測方程計算候選個體標記信息的GEBV，而候選個體無需其表型記錄，通常在其出生后便可以預測GEBV，計算GEBV的過程大致分為以下步驟：（1）利用SNP標記推導出每個個體在每個QTL上的基因型，（2）估計每個QTL基因型在性狀上的效應，（3）所有QTL效應值的總和便是候選個體的GEBV豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)HYBOR公司，保育豬進入測定舍時戴上專用耳標，采集其耳組織，然后提取DNA，每頭測定幾萬個SNP，由電腦進行系統(tǒng)分析，然后采用基因組育種值BLUP綜合指數(shù)（GBLUP）作為輔助選擇的依據(jù)豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)有效群體規(guī)模等建議對豬進行全基因組選擇時，參考群體至少要達到1000頭，每個家系建議測定40-50頭。有效群體的大小會直接影響全基因組育種值的準確性豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)全基因組選擇的應用研究豬60kSNP芯片商業(yè)化后，使得全基因組選擇在豬育種中的研究和應用具有可實施性和操作性。大量研究表明，利用該SNP芯片得到的GEBV具有較高的準確性。在肉質(zhì)方面等利用豬60kSNP芯片對長白和杜洛克豬的肌間脂肪進行全基因組選擇，GEBV的準確性（）明顯比傳統(tǒng)選育方法（）高。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)全基因組選擇的實際應用近年來，全基因組選擇已經(jīng)成為豬育種界的熱點，全球各個知名豬育種公司已經(jīng)將該技術作為新的育種手段實施應用，并且少數(shù)大型豬育種公司對豬的大量性狀和品系都實施了全基因組選擇。PIC作為全球最大的種豬改良公司，擁有全球最大的豬育種數(shù)據(jù)庫，包括了超過2000萬頭豬的系譜信息、大量的性能測定數(shù)據(jù)和基因型分型信息，有利于實現(xiàn)基因潛力的最大化。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)PIC公司對產(chǎn)仔總數(shù)、生長速度、采食量和眼肌面積性狀進行選擇，普通EBV分別為、、、，而采用全基因組選擇得到GEBV的準確性較高，分別為、、、。PIC還持續(xù)對pH24、大理石紋和肌內(nèi)脂肪含量等肉質(zhì)指標進行選育，使16系公豬的后代肌內(nèi)脂肪含量提高到3.5%，眼肌、后腿肌肉pH24為。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)自2010年，丹麥已經(jīng)在杜洛克、大白、長白上應用基因組選育。在2013年這一年，丹麥利用基因芯片測定的數(shù)量已達到24000頭。2013年丹麥的年平均斷奶數(shù)達30.3頭。在德國，皮特蘭良種登記協(xié)會采用豬60kSNP芯片進行父系育種，主要針對生長速度、屠宰率和肉質(zhì)性狀進行性能測定，并建立了最初的參考群。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)目前，國外只有荷蘭的Hybor公司、丹麥的丹育公司、加拿大的TOPIG公司等育種技術先進的大型國際化公司投入大量資金研發(fā)，掌握并應用全基因組選育技術進行種豬遺傳改良。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)在中國，廣東溫氏食品集團率先采用全基因組選擇技術對飼料利用率、日增重、肉質(zhì)等性狀進行選擇，2013年選育了1頭杜洛克特級種公豬，并開始配種應用。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)低密度芯片的應用隨著全基因組選擇方法在豬育種中進入應用階段，一些研究人員開始關注其經(jīng)濟效益，雖然全基因組選擇可以提高準確性，但是需要昂貴的費用進行基因型分型，約1000元/頭，并且豬的世代間隔較短，該技術應用受到了一定的阻礙。眾多研究表明，降低芯片密度是降低費用的主要方式。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)在低密度芯片中增加已知性狀關聯(lián)的SNP標記，設計開發(fā)高效的低密度SNP芯片和應用，為豬育種提供更高性價比的全基因組選擇技術。目前GeneSeek公司已經(jīng)開發(fā)出了豬9kSNP芯片，其中挑選的SNP位點與疾病和其他經(jīng)濟性狀直接關聯(lián)，如生長和肉質(zhì)等。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)國家重視農(nóng)業(yè)部關于推進農(nóng)業(yè)供給側結構性改革的實施意見（農(nóng)發(fā)〔2017〕1號）中強調(diào)，加快現(xiàn)代種業(yè)創(chuàng)新，“加快推進畜禽水產(chǎn)良種繁育體系建設，加強地方畜禽品種資源的保護與開發(fā)，推進聯(lián)合育種和全基因組選擇育種，推動主要畜禽品種國產(chǎn)化”豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)育種目標的變化二十一世紀選育目標在瘦肉率、飼料利用率和生長速度的基礎上增加了肉質(zhì)、抗病性、母豬使用年限等。丹麥在母系豬長白和大白的選育上，權重第一不是繁殖性能，而是料重比，30kg～100kg的料重比占42％，丹麥歷年來都在堅持選育屠宰率，因為其可以帶來巨大的經(jīng)濟效益。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)目前，丹麥在選育14P，原因是丹育豬產(chǎn)仔太多，現(xiàn)在強制每頭母豬只可帶14頭仔豬還有一個很有意思的性狀——合群性，現(xiàn)在丹麥認為從一欄中選育出最好的一個不一定是最好的，而是認為某一群生長最快、貢獻最大才是最好的。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)根據(jù)消費市場、生產(chǎn)現(xiàn)場結合起來考慮選育性狀，要有自己的分析判斷，而且要持之以恒，不能朝令夕改。國際上育種公司的目標越來越一致，選育將從現(xiàn)在的外形選育逐步過渡到由屠宰場決定種豬的優(yōu)質(zhì)與否中國呢？種豬場產(chǎn)品是種豬不是豬肉，買種豬看體型，所以要發(fā)展到由屠宰場決定育種目標有一段時間豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)要引領市場，特別是在肉質(zhì)的改善方面，要有前瞻性。屠宰場一旦覺醒，消費者一旦對肉質(zhì)提出要求，具體實現(xiàn)要3、5年以后，所以育種要先知先覺。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)測定技術的變化CT技術的應用CT測定種豬。目前這套先進的設備只有2家公司在用，挪威的Norsvin和美國CG公司，而且也將在中國設置CT研發(fā)中心，公司對育種方面非常重視。對豬體進行一系列掃描之后，可以精確預測胴體的組成成分。與傳統(tǒng)的超聲波技術相比，用這種技術預測胴體肌肉、脂肪和骨骼產(chǎn)量的準確率分別可提高％、％和％。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)對于屠宰商和零售商來說，CT還有一個更加突出的優(yōu)點，那就是可以測出不同大分切部位（背脊部、后腿部、腹脅部和肩胛部）當中的肌肉產(chǎn)量。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)稱重豬個體專用籠秤是種豬稱量的必需設備，不可簡單采用磅秤等代替，最好使用帶有保定功能的籠秤，可以在完成稱量的同時一次性完成測膘等工作，有效節(jié)約時間籠秤的精度和具備動物稱重模式，能最大限度地減少傳統(tǒng)電子籠秤的人為誤差目前主要使用的有電子籠秤和機械電子籠秤2種推薦使用的籠秤精度為0.1kg，靜態(tài)模式允許偏差0.05kg，動物模式允許偏差0.1kg豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)科學使用籠秤，尤其是電子籠秤清洗和使用中避免對電子部分的污染碰撞等，如傳感器、轉換器和儀表。同時還要注意設備的預熱、放置平穩(wěn)和保護等使用要點。從流程上講，還得注意空腹12h的規(guī)定，否則因采食差異容易造成1~2kg的體重誤差。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)測定背膘第一點，必須保持豬的背腰平直和安靜。比較溫順的豬在自然站立狀態(tài)下，背部是相對平直的，肌肉和背膘不易變形，測量的準確性自然較高，對于運動劇烈的豬則應使用保定器使之安靜.豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)第二點則是找準測定部位，獲取清晰影像.按照我國標準和遺傳評估方案的要求，測定部位為豬左側倒數(shù)第3~4肋骨之間距背中線5cm處，最好的方法是使用超聲波儀的探頭由背腰結合處向頭部緩慢推進找出倒數(shù)第3~4肋骨（圖1，2），圖2所示的從右向左的方向依次為倒數(shù)第1、2、3、4肋骨。其操作要點為參數(shù)設置合適、探頭耦合密實（涂抹超聲膠或植物油），按壓力度適中，探頭方向垂直于皮膚，平行于背中線，保持5cm的距離，對B超參數(shù)的設置也十分重要，同時做到以上幾點才能有效獲取較為清晰的超聲影像。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)第三點，找準測量起止點。由于設備差異、指導差異、人員水平差異等各因素，常常導致測量背膘的起止點千差萬別，這也是導致測量不準確的主因。起點為影像的最上端，止點為眼肌筋膜與結締組織層的中間部，起止點之間的垂直距離即為背膘厚（圖3）。一般需要經(jīng)過3層膘的影像、如果使用探頭保護套，請一定注意起點在保護套與皮膚接觸的亮白線的上緣。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)產(chǎn)仔數(shù)是采用記錄的方式進行而不需要設備，但作為母系性狀的選擇這是最重要的指標之一，部分歐美發(fā)達國家考慮使用第5天的活仔數(shù)來代替總產(chǎn)仔數(shù)的選擇，完全靠母豬的母性來保障其存活。（大家可以討論）豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)已發(fā)現(xiàn)的QTL根據(jù)Rothschild的總結，利用標記-QTL連鎖分析的方法，已發(fā)現(xiàn)的QTL有：在染色體4、7和13上有與生長速度和背膘厚效應關聯(lián)的QTL存在，對于肉質(zhì)性狀，PSE肉受位于第6染色體上的氟烷基因（蘭尼定受體基因）的控制，染色體4和7上也有影響肉質(zhì)性狀的QTL存在，對于繁殖性狀，多項研究證實在第8染色體上有影響排卵率和產(chǎn)仔數(shù)的QTL存在等。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)利用候選基因法證明雌激素受體基因（ESR）對產(chǎn)仔數(shù)有顯著影響，催乳素受體基因（PRLR）對產(chǎn)仔數(shù)也有顯著影響豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)國家生豬核心育種場育種要求及變化1.參與遺傳評估的數(shù)據(jù)范圍（1）豬只個體本身有生長性能測定成績，即同時滿足結測體重85-130kg，結測背膘5-30mm，結測日齡100-300天，校正日齡120-210天。（2）上述有生長性能測定成績的個體，根據(jù)系譜，向上追溯4代的所有親屬個體。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)采用多性狀動物模型最佳線性無偏預測（MTBLUP）方法估計達100kg體重日齡、100kg體重活體背膘厚和總產(chǎn)仔數(shù)。3個性狀的育種值。其模型具體如下：（1）達100kg體重日齡、100kg體重活體背膘厚達100kg體重日齡、100kg體重活體背膘厚觀察值=總平均數(shù)+場年季性別固定效應+窩隨機效應+個體隨機遺傳效應+隨機剩余效應（2）總產(chǎn)仔數(shù)觀察值=總平均數(shù)+場年季固定效應+個體隨機遺傳效應+母豬永久環(huán)境效應+隨機剩余效應豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)父系指數(shù)和母系指數(shù)為杜洛克計算父系指數(shù)，為長白和大白計算母系指數(shù)；各個豬場還要自己計算杜洛克的母系指數(shù)和長白大白的父系指數(shù)在父系指數(shù)中，將日齡和背膘厚的相對重要性調(diào)整為70%和30%（原指數(shù)中為52%和48%）；在母系指數(shù)中，將日齡、背膘厚和產(chǎn)仔數(shù)的相對重要性調(diào)整為30%、10%和60%（原指數(shù)中為26%、24%和50%）。豬育種新技術中國種豬信息網(wǎng)其中：EBVday為達100kg體重日齡EBV；EBVbf為100kg體重活體背膘厚EBV；

σday為該場參與此次遺傳評估所有個體達100kg體重日齡EBV的標準差；

σbf為該場參與此次遺傳評估所有個體1