DNA順式作用元件

會計學1DNA順式作用元件同一DNA分子中具有轉錄調節(jié)功能的特異DNA序列。定義化學本質存在于DNA分子中的較短的DNA序列順式作用元件概述順式作用元件在分子遺傳學領域，相對同一染色體或DNA分子而言為“順式”；對不同染色體或DNA分子而言為“反式”。第1頁/共11頁順式作用元件結構第2頁/共11頁順式作用元件結構（一）啟動子啟動子一般位于真核基因轉錄起始點上游200bp以內。包括至少一個轉錄起始點以及一個以上的機能組件。1.TATA盒

TATA盒共有序列是TATAAAA，通常位于轉錄起始點上游-25~-30bp，決定轉錄的方向和精確的轉錄起始點。TATA盒是基本轉錄因子TFIID結合位點。2.起始子在一些真核基因的上游沒有典型的TATA盒，但在某些無TATA盒的基因轉錄起始點附近發(fā)現(xiàn)了起始子元件INR，一般將位于轉錄起始點下游的調控序列稱為下游起始子。3.上游啟動子元件除TATA盒外，GC盒（GGGCGG）和CAAT盒（GCCAAT）也是很多基因常見的，它們通常位于轉錄起始點上游-30~-110bp區(qū)域。第3頁/共11頁順式作用元件結構（二）調節(jié)元件一般位于基因轉錄起始點上游-200bp以上區(qū)域的順式作用元件，包括增強子和沉寂子1.增強子起正調控作用的順式元件，位于真核基因中遠離轉錄起始點，能明顯增強啟動子轉錄效率的順式作用元件，它對方向和定位無依賴性。一般具有組織特異性和細胞特異性。序列長度一般在70~200bp之間，基本核心組件常為8～12bp，部分序列有回文結構特征，可以單拷貝或多拷貝串聯(lián)形式存在。2.沉寂子和起正調控作用的增強子相對應的是起負調控作用的沉寂子。它的功能不受定位和方向的限制。與相應的反式作用因子結合后，可降低或封閉某些基因的表達。增強子和沉寂子協(xié)調可決定基因表達的時空順序3.轉座元件一些DNA序列在染色體上的座位可以在一系列的靶位點之間插入或移出，此系列稱為轉座元件。第4頁/共11頁順式作用元件與反式作用因子關系反式作用因子：與順式作用元件結合的可擴散性蛋白，包括基礎因子，上游因子，誘導因子。真核生物的轉錄調控是調控的最重要的途經，大多是通過順式作用元件和反式作用因子復雜的相互作用而實現(xiàn)的。第5頁/共11頁順式作用元件與反式作用因子關系1.順式作用元件本身不編碼任何蛋白質，僅僅提供一個作用位點，只有與反式作用因子相互作用才起作用。2.反式作用因子通過不同的途經發(fā)揮調控作用，它們與特異的靶基因的順式元件相結合起作用。反式作用因子一般具有兩大類結構域：一類是識別和結合特異DNA順式作用元件所必需的，一類是調節(jié)轉錄基因效率所必需的。兩類結構域具有不同的特征，但同一類結構域具有一些共同的結構特點。第6頁/共11頁反式作用因子結構域類型1.螺旋-轉折-螺旋有2個螺旋，螺旋2是識別和DNA結合，一般結合于大溝；螺旋1和其它蛋白質結合。兩個螺旋由一個轉角鏈接2.鋅指鋅指這個名稱來源于它的結構，它由一小組保守的氨基酸和鋅離子結合，在蛋白質中形成了相對獨立的功能域，像一根根手指伸向DNA的大溝。3、亮氨酸拉鏈兩個蛋白質分子對應的螺旋區(qū)之間的兩行亮氨酸通過疏水性相互作用形成1個類似拉鏈的結構，稱為亮氨酸拉鏈。對形成穩(wěn)定的蛋白二聚體十分重要。4、螺旋一環(huán)一螺旋有2個螺旋，螺旋中有些疏水氨基酸，分布在螺旋一側。螺旋間被長短不同的肽斷分隔而形成的結構。第7頁/共11頁反式作用因子結構域類型第8頁/共11頁反式作用因子結構域類型反式作用因子通過不同的結構域與不同DNA順式作用元件互作用來實現(xiàn)真核基因的轉錄調控機制。第9頁/