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文檔簡介
htpp://杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://EASYspinPlus細菌RNA快速提取試劑盒目錄號:RN43眨編號包裝單位RN430250次?:?適用范圍:適用于快速提取細菌總RNA,使用獨有基因組DNA清除柱技術(shù)確保有效清除gDNA殘留,不需要使用DNase消化,RNA可直接用于反轉(zhuǎn)錄PCR,熒光定量PCR.。?試劑盒組成、儲存、穩(wěn)定性:試劑盒組成保存50次TE(PH8.0)室溫6ml溶菌酶4c20mg裂解液RLTPlus室溫25ml去蛋白液RW1室溫40ml漂洗液RW室溫10ml一第一次使用前按說明加指定量乙醇70%乙醇室溫9mlRNase-freeHO2第一次使用前按說明加指定量乙醇RNase-freeHO室溫10ml基因組DNA清除柱和收集管RNase-free吸附柱RA和收集管室溫50套室溫50套本試劑盒在室溫儲存6個月不影響使用效果。
杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://儲存事項:.所有的溶液應(yīng)該是澄清的,如果環(huán)境溫度低時溶液可能形成沉淀,此時不應(yīng)該直接使用,可在37。。水浴加熱幾分鐘,即可恢復(fù)澄清。.不合適的儲存于低溫(4。?;蛘咭?0℃)會造成溶液沉淀,影響使用效果,因此運輸和儲存均在室溫下(15℃—25℃)進行。.避免試劑長時間暴露于空氣中產(chǎn)生揮發(fā)、氧化、PH值變化,各溶液使用后應(yīng)及時蓋緊蓋子。注意事項所有的離心步驟均在室溫完成,使用轉(zhuǎn)速可以達到13,000rpm的傳統(tǒng)臺式離心機,MEppendorf5415C或者類似離心機。樣品處理量絕對不要超過基因組吸附柱DA和和RNA吸附柱RA處理能力,否則造成DNA殘留或產(chǎn)量降低。開始摸索實驗條件時,如果不清楚樣品DNA/RNA含量時寧可使用較少的樣品處理量,將來根據(jù)樣品試驗情況增加或者減少處理量。裂解液RLTPlus和去蛋白液RW1中含有刺激性化合物,操作時戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時,要用大量清水或者生理鹽水沖洗。關(guān)于DNA的微量殘留:一般說來任何總RNA提取試劑在提取過程中無法完全避免DNA的微量殘留(DNase消化也無法做到100%無殘留),本公司的EASYspinPlusRNA提取產(chǎn)品,由于采取了本公司獨特的緩沖體系和基因組DNA清除柱技術(shù),絕大多數(shù)DNA已經(jīng)被清除,不需要DNase消化,可直接用于反轉(zhuǎn)錄PCR和熒光定量PCR。個別特殊情況如DNA含量過于豐富造成殘留或者要進行嚴格的mRNA表達量分析熒光定量PCR,我們建議在進行模板和引物的選擇時:選用跨內(nèi)含子的引物,以穿過mRNA中的連接區(qū),這樣DNA就不能作為模板參與擴
杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://增反應(yīng)。選擇基因組DNA和cDNA上擴增的產(chǎn)物大小不一樣的引物對。將RNA提取物用RNase-free的DNaseI處理。本試劑盒還可以用于DNaseI處理后的RNA清潔(cleanup),請聯(lián)系我們索取具體操作說明書。在步驟去蛋白液RW1漂洗前,直接在吸附柱RA上進行DNaseI處理。請聯(lián)系我們索取具體操作說明書。RNA純度及濃度檢測:完整性:RNA可用普通瓊脂糖凝膠電泳(電泳條件:膠濃度1.2%;0.5XTBE電泳緩沖液;150v,15分鐘)檢測完整性。由于細胞中70%-80%的RNA為rRNA,電泳后UV下應(yīng)能看到非常明顯的rRNA條帶。動物rRNA大小分別約為5kb和2kb,分別相當(dāng)于28S和18SrRNA。動物RNA樣品中最大rRNA亮度應(yīng)為次大rRNA亮度的1.5-2.0倍,否則表示RNA樣品的降解。出現(xiàn)彌散片狀或條帶消失表明樣品嚴重降解。純度:OD260/OD280比值是衡量蛋白質(zhì)污染程度的參考指標(biāo)。高質(zhì)量的RNA,OD260/OD280讀數(shù)(10mMTris,pH7.5)在2.1-2.2之間(100%純的RNA比值一般是2.2左右,很多公司無法達到這個標(biāo)準(zhǔn),所以1.9-2.0就湊合用了,但是我們的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)一般可以達到2.1-2.2)。OD260/OD280讀數(shù)受測定所用溶液的pH值影響。同一個RNA樣品,假定在10mMTris,pH7.5溶液中測出的OD260/OD280讀數(shù)1.8-2.1之間,在水溶液中所測讀數(shù)則可能在1.5-1.9之間,但這并不表示RNA不純。濃度:取一定量的RNA提取物,用RNase-free水稀釋n倍,用RNase-free水將分光光度計調(diào)零,取稀釋液進行OD260,OD280測定,按照以下公式進行RNA濃度的計算:終濃度(ng/〃)l=(OD260)x(稀釋倍數(shù)n)x40杭州昊鑫生物科技股份有限公司 htpp://?:? 操作步驟:(實驗前請先閱讀注意事項)提示:“第一次使用前請先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入指定量無水乙醇!“提取細菌RNA需先配制加了溶菌酶的TE(10mMTris-HCl,1mMEDTAPH8.0),TE中溶菌酶的終濃度為1mg/ml。離心收集1-2ml菌液(約108-109細胞)到一個1.5ml離心管,盡可能去除上清,注意殘留的上清不能超過20回。根據(jù)細胞的種類和數(shù)量,充分重懸細胞在100m(<5x108細胞)/200m(5x108-7.5x108細胞)TE中(TE中需先加入溶菌酶,終濃度濃度為1mg/ml)或者直接用TE重懸后,用干凈槍頭挑取少許溶菌酶加入。室溫(15-25℃)溫育5分鐘/溶菌酶,破解細胞壁。每2分鐘渦旋振蕩10秒幫助破壁。注意各種細菌破壁的難易程度不一樣,一般革蘭氏陰性菌E.coli使用上面的條件就足夠了,甚至可能省略該步驟,但是某些革蘭氏陽性菌如B.subtilis難破壁需要提高溶菌酶濃度到15mg/ml和溫育時間到10分鐘。如果金黃色葡萄球菌需要加入lysostaphin到1mg/ml,37c溫育15分鐘??傊煌毦愋推票陔y易程度不同,有的難破壁的種類需要根據(jù)用戶自己的具體情況調(diào)節(jié)酶的種類、工作濃度和溫育溫度、時間,此外還可以聯(lián)合使用玻璃珠擊打,機械破壁,蛋白酶K消化等方法幫助破壁。短暫離心收集細胞到管底,吸棄上清。渦旋振蕩重懸分散細胞。加入500m裂解液RLTPlus,吹打混勻后用手劇烈振蕩20秒,充分裂解。一般加入裂解液后充分渦旋吹打后應(yīng)該見不到明顯團塊或者不溶物,極少數(shù)情況下如果有明顯團塊或者不溶物可以將裂解物13,000rpm離心3分鐘,沉淀不能裂解的碎片或者不溶物,取裂解物上清進行下一步。
杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://立刻將裂解物加入一個DNA清除柱上(清除柱放在收集管內(nèi))13,000rpm離心60秒,保留濾過液(RNA在濾過液中)。確保離心后液體全部濾過去,膜上沒有殘留,如有必要,可以加大離心力和離心時間。用微量移液器較精確估計濾過液體積(通常為500回,濾過時候損失體積應(yīng)該減去),加入等體積的70%乙醇(請先檢查是否已加入無水乙醇!),此時可能出現(xiàn)沉淀,但是不影響提取過程,立即吹打混勻,不要離心。立刻將混合物(每次小于700或多可以分兩次加入)加入一個吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm離心60秒,棄掉廢液。加700m去蛋白液RW1,12,000rpm離心30秒,棄掉廢液。加入500m漂洗液RW(請先檢查是否已加入無水乙醇!),12,000rpm離心30秒,棄掉廢液。加入500m漂洗液RW重復(fù)一遍。將吸附柱RA放回空收集管中,13,000rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液,以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng)。取出吸附柱區(qū)八,放入一個RNasefree離心管中,根據(jù)預(yù)期RNA產(chǎn)量在吸附膜的中間部位加30-50可RNasefreewater(事先在70-90℃水浴中加熱可提高產(chǎn)量),室溫放置1分鐘,12,000rpm離心
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