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文檔簡介
第四章
凝膠過濾層析第一節(jié)凝膠層析的基本原理第二節(jié)
凝膠介質(zhì)的分類和性質(zhì)第三節(jié)凝膠層析的基本操作第四節(jié)應(yīng)用第一節(jié)凝膠層析的基本原理葡聚糖凝膠顆粒示意圖
概念
凝膠層析又稱分子篩層析、排阻層析、立體排阻層析、體積排阻層析,是利用具有立體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)、且呈珠狀顆粒的凝膠作為固定相,對(duì)混合物中各組分按分子大小進(jìn)行分離的層析技術(shù)。1959年,Porath和Flodin首次用一種多孔聚合物交聯(lián)葡聚糖凝膠作為柱填料,分離水溶液中不同分子量的樣品,稱為凝膠過濾。1964年,Moore制備了具有不同孔徑的交聯(lián)聚苯乙烯凝膠,能夠進(jìn)行有機(jī)溶劑中的分離,稱為凝膠滲透層析(流動(dòng)相為有機(jī)溶劑的凝膠層析一般稱為凝膠滲透層析)。隨后這一技術(shù)得到不斷地完善和發(fā)展。凝膠層析是生物化學(xué)中一種常用的分離手段,它具有設(shè)備簡單、操作方便、樣品回收率高、實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好、特別是不改變樣品生物學(xué)活性等優(yōu)點(diǎn)。因此,廣泛用于蛋白質(zhì)(包括酶)、核酸、多糖等生物分子的分離純化,同時(shí)還應(yīng)用于蛋白質(zhì)分子量的測定、脫鹽、樣品濃縮等。原理1)相對(duì)分子質(zhì)量較大的物質(zhì)由于直徑大于凝膠網(wǎng)孔而只能沿著凝膠顆粒間的孔隙向前移動(dòng),速度快而首先流出層析柱,因此流程較短;2)相對(duì)分子質(zhì)量較小的物質(zhì)由于直徑小于凝膠網(wǎng)孔,可自由地進(jìn)出凝膠顆粒的網(wǎng)孔,在向下移動(dòng)過程中,從一個(gè)膠??紫哆M(jìn)入另一凝膠顆粒,移動(dòng)速率慢而最后流出層析柱;3)中等大小的分子,在凝膠顆粒內(nèi)外均有分布,部分進(jìn)入顆粒,從而在大分子物質(zhì)與小分子物質(zhì)之間被洗脫。凝膠過濾原理示意圖
凝膠層析的幾個(gè)概念外水體積(Vo):是指凝膠柱中凝膠顆粒周圍空間的體積,也就是凝膠顆粒間液體流動(dòng)相的體積。內(nèi)水體積(Vi):是指凝膠顆粒中孔穴的體積,凝膠層析中固定相體積就是指內(nèi)水體積。基質(zhì)體積(Vg):是指凝膠顆粒實(shí)際骨架體積。柱床體積(Vt):是指凝膠柱所能容納的總體積。洗脫體積(Ve):樣品中某組分洗脫下來所需洗脫液的總體積。Vt=V0+Vi+Vg
計(jì)算法:Vt=1/4D2h測量法:Vt=V0+Vi+Vg
由于Vg非常小,可忽略不計(jì),因此:Vt=V0+ViV0可用不被凝膠滯留的大分子物質(zhì)的溶液,如藍(lán)色葡聚糖-2000;Vi可用硫酸銨等無吸附力的小分子物質(zhì)。分配系數(shù)Kav
分配系數(shù)是指某個(gè)組分在固定相和流動(dòng)相中的濃度比。對(duì)于凝膠層析,分配系數(shù)實(shí)質(zhì)上表示某個(gè)組分在內(nèi)水體積和在外水體積中的濃度分配關(guān)系。Kav=(Ve-Vo)/(Vt-Vo)它只與被分離物質(zhì)分子的大小和凝膠顆??紫兜拇笮》植加嘘P(guān),而與柱的長短粗細(xì)無關(guān),也就是說它對(duì)每一物質(zhì)為常數(shù)與柱的物理?xiàng)l件無關(guān)。(1)Kav=0時(shí),Ve=Vo,意味著該分子完全被排阻于凝膠顆粒之外,全部分布于流動(dòng)相里,在固定相分布為0,而最先流出。(2)當(dāng)Kav=1時(shí),Ve=Vt,意味著該分子完全不被排阻,可以自由地?cái)U(kuò)散進(jìn)入凝膠顆粒內(nèi)部,它能均等地分布在流動(dòng)相和固定相里,在兩相分配的比值為1,而最后流出.(3)當(dāng)0<Kav<1,Ve<
Vt為處于兩種極端行為之間的分子。(4)Kav>1現(xiàn)象說明凝膠對(duì)組分有吸附作用,此時(shí)Ve>Vt,例如一些芳香族化合物的洗脫體積遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出理論計(jì)算的最大值.
因此分子的正常Kav值0~1之間,這種由小到大的順序決定了物質(zhì)流出的順序。排阻極限:是指不能進(jìn)入凝膠顆粒孔穴內(nèi)部的最小分子的分子量。
排阻極限代表一種凝膠能有效分離的最大分子量。第二節(jié)
凝膠介質(zhì)的分類和性質(zhì)1)葡聚糖凝膠
①
G類葡聚糖(Sephadex)
②
LH-親脂型葡聚糖
③
Sephacryl2)瓊脂糖凝膠3)聚丙烯酰胺凝膠(1)葡聚糖凝膠①
G類葡聚糖(Sephadex)
由葡聚糖(右旋糖酐)和交聯(lián)劑以醚鍵交聯(lián)而成理化性質(zhì)1)型號(hào)不同,交聯(lián)度不同,膨脹度和吸水量不同,篩孔大小和分級(jí)范圍也不同;2)商業(yè)用的型號(hào)又G10、G15、G25,G100等,數(shù)字代表每g干凝膠吸水量×10,如G50即表示每克干凝膠的吸水量為5.0毫升;3)數(shù)字越小,分級(jí)范圍窄,適合低分子量的蛋白質(zhì)的分離,數(shù)字越大,適合寬范圍分子量的分級(jí)4)穩(wěn)定性對(duì)堿比較穩(wěn)定,在強(qiáng)酸性環(huán)境中其糖苷鍵易水解5)吸附性對(duì)堿性蛋白有吸附作用,提高離子強(qiáng)度即可解決(含NaCl的緩沖液)
②LH-親脂型葡聚糖在有機(jī)溶劑中膨脹,可以分離脂肪酸、甘油脂、類固醇、維生素、激素類等親脂性分子的分離。洗脫劑可用單一有機(jī)溶劑如甲醇、氯仿等,也可用混合溶劑如氯仿與甲醇的混合液。
③Sephacryl
烯丙烷基葡聚糖和甲叉雙丙稀酰胺交聯(lián)而成。優(yōu)點(diǎn)1)分離范圍很大,排阻極限甚至可以達(dá)到108,遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于Sephadex的范圍。甚至可以分離較大的病毒顆粒。2)化學(xué)穩(wěn)定性更高:Sephacryl在各種溶劑中很少發(fā)生溶解或降解,可以用各種去污劑、胍、脲等作為洗脫液,耐高溫。3)機(jī)械性能較好,可以以較高的流速洗脫,比較耐壓,流速可以快些,分辨率也較高。
(2)瓊脂糖凝膠商品名Sepharose(瑞典)
1)2B,4B等型號(hào),數(shù)字代表顆粒中瓊脂糖的百分含量,數(shù)字越大,分離的范圍越小
2)與1,3-二溴異丙醇反應(yīng)生成交聯(lián)瓊脂糖,穩(wěn)定性提高;Bio-gelA(美國)
一般有A0.5,A1.5等型號(hào),數(shù)字×106代表分離的分子量極限;與葡聚糖凝膠和聚丙烯酰胺凝膠相比,瓊脂糖凝膠機(jī)械強(qiáng)度和篩孔穩(wěn)定性好,洗脫速度可以快些瓊脂糖凝膠的優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn)
瓊脂糖凝膠(agarosegel)比葡聚糖凝膠和生物膠的排阻范圍大,可達(dá)相對(duì)分子質(zhì)量108,使凝膠層析的分離區(qū)間擴(kuò)大到大分子和病毒顆粒;機(jī)械性能好。缺點(diǎn)穩(wěn)定性較葡聚糖凝膠和聚丙烯酰胺凝膠穩(wěn)定性差,不耐酸堿,最好將條件控制在pH4~9之間,溫度0~40℃,超出此范圍,可能被破壞。(3)聚丙烯酰胺凝膠商品名Bio-gel
與甲叉雙丙稀酰胺交聯(lián),過硫酸銨為催化劑,TEMED加速劑。改變交聯(lián)劑的濃度,可以改變孔隙,交聯(lián)劑越多,孔隙越??;常用型號(hào)P-2和P-300,數(shù)字×103為分離的分子量極限聚丙烯酰胺凝膠的分離范圍、吸水率等性能基本近似于Sephadex。排阻極限最大的Bio-GelP-300為4×105
性質(zhì)
耐酸,pH1-10穩(wěn)定,耐受變性劑(尿素、胍鹽等)種類(商品名)商品型號(hào)型號(hào)中數(shù)字意義排阻限度穩(wěn)定性葡聚糖凝膠(Sephadex)G15,G25,G100…每g的吸水量(ml)×10數(shù)字越大,篩孔越大
6×105水、鹽、堿、弱酸中穩(wěn)定;對(duì)強(qiáng)酸敏感瓊脂糖凝膠(Sepharose)2B,4B,6B…顆粒中瓊脂糖的含量(%);數(shù)字越大,篩孔越小
1×108
機(jī)械強(qiáng)度好,物理穩(wěn)定性高于葡聚糖和聚丙烯酰胺凝膠,但不耐酸堿(僅在ph4-9穩(wěn)定)瓊脂糖凝膠(Bio-gel)A0.5m,A5M…排阻極限*的10-6,數(shù)字越大,篩孔越大聚丙烯酰胺凝膠(Bio-gel)P-2,P-4,P-300…排阻極限*的10-3數(shù)字越大,篩孔越大
4×105耐受鹽、尿素、胍鹽,pH1-10穩(wěn)定,短時(shí)超過此范圍也可
幾種凝膠的比較第三節(jié)凝膠層析基本操作一、凝膠的選擇凝膠型號(hào)的選擇凝膠粒度的選擇不同凝膠類型的選擇凝膠用量的計(jì)算
組別分離,將樣品中的大分子物質(zhì)與小分子物質(zhì)分開。脫鹽就是一種組別分離。
其分離策略是使高分子物質(zhì)完全被排阻,小分子物質(zhì)完全滲入凝膠內(nèi)。
分級(jí)分離,將樣品中一些分子量比較接近的物質(zhì)分開。
策略是使在層析過程中,樣品中各組份均能不同程度地深入到凝膠內(nèi)部,但由于深入凝膠空隙程度上的差異,最后得到分離。1)凝膠型號(hào)的選擇(根據(jù)分離的目的)
組別分離一般選用SephadexG-25或G-50(3*104Da),脫鹽一般選用G25(1000-5000Da)。
分級(jí)分離一般選用排阻極限略大于樣品中最高分子量物質(zhì)的凝膠。
2)粒度的選擇
目數(shù)(反映凝膠顆粒直徑的大小)。目數(shù)越大,直徑越小。每種型號(hào)凝膠都有有粗粒和細(xì)粒之分。細(xì)粒均一性好,分離效果好,但是流速慢,適合小型實(shí)驗(yàn)。層析柱選用大直徑的;粗粒的優(yōu)勢是流速快,適合樣品量大的實(shí)驗(yàn),選用小直徑的柱子提高分辨率。
凝膠粒度與洗脫效果的關(guān)系圖3)不同凝膠類型的選擇瓊脂糖凝膠、Sephacryl
LH-葡聚糖凝膠瓊脂糖凝和Sephacryl大分子分離親脂分子規(guī)模大,流速快其他因素如洗脫液的酸堿度根據(jù)各種凝膠的性質(zhì)選擇4)凝膠用量的計(jì)算二、凝膠的處理將所用的干凝膠慢慢傾入5、10倍的蒸餾水中,參照凝膠說明書溶脹所需的時(shí)間進(jìn)行充分浸泡,并除去懸浮的小顆粒。再用0.5mol/LNaoH—0.5mol/LNaCl溶液在室溫下浸泡0.5h,抽濾除去堿液.用蒸餾水洗至中性。為了除去凝膠顆??障吨械臍馀?,可把處理過的凝膠浸泡于蒸餾水或平衡液中用抽氣方法實(shí)現(xiàn)。三、凝膠柱的制備1)柱的選擇
長層析柱分辨效率高于短柱。理想的直徑和長度之比是1:25-1:100根據(jù)經(jīng)驗(yàn),組別分離時(shí),大多采用2-30cm長的層析柱,分級(jí)分離時(shí),一般需要100cm左右長的層析柱,其直徑在1-5cm范圍內(nèi)。2)裝柱
干裝法容易產(chǎn)生氣泡濕裝法先將適量溶劑加到柱中,將浸泡好的凝膠緩慢倒入,一直浸泡在溶劑中,沉降至柱高1/4-1/3時(shí)打開下端出口,溶劑流出。3)鑒定柱的質(zhì)量
用帶色的物質(zhì)或蛋白質(zhì)過柱均勻下降即可。細(xì)胞色素c、血紅蛋白等物質(zhì)配成2mg/ml的溶液過柱。四、加樣加樣體積越小,分辨率越高。
兩種蛋白洗脫體積為VeA、VeB,兩種蛋白分離體積Vs(洗脫體積之差),Vs=VeA-VeB,理論上,Vp(加入樣品體積)=Vs時(shí)就能分離兩種蛋白質(zhì)Vp<Vs時(shí)效果好。樣品粘度的影響五、洗脫洗脫液:能溶解被洗脫物質(zhì)、不使其變性或失活為原則。一般都以單一緩沖液(如磷酸緩沖液、Tris-HCl緩沖液等)或者鹽溶液作為洗脫液。有時(shí)甚至也可以用蒸餾水作洗脫液。影響流速的因素洗脫液加在柱上的壓力凝膠交聯(lián)度凝膠顆粒大小
流速過低樣品橫向擴(kuò)散增大,峰變寬,分辨率降低,洗脫時(shí)間長流速過高洗脫峰重疊,柱壓增大,分離效果變差線性流速控制在2~10cm/h六、凝膠柱的再生和保存用低濃度的酸或堿按其預(yù)處理方法進(jìn)行,處理后重新裝柱即可再使用。第四節(jié)應(yīng)用脫鹽高分子(如蛋白質(zhì)、核酸、多糖等)溶液中含有的低分子量雜質(zhì),可以用凝膠層析法除去,這一操作稱為脫鹽。脫鹽時(shí),選擇排阻極限小的凝膠適用的凝膠為SephadexG-10、15、25或Bio-Gel-p-2、4、6。柱長與直徑之比為5-15分離大分子物質(zhì)測定分子量用一系列已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)品放入同一凝膠柱內(nèi),在同一條件下層析記錄每一種成分的洗脫體積,并以洗脫體積對(duì)分子量的對(duì)數(shù)作圖,在一定分子量范圍內(nèi)可得一直線,即分子量的標(biāo)準(zhǔn)曲線。測定未知物質(zhì)的分子量時(shí),可將此樣品加在測定了標(biāo)準(zhǔn)曲線的凝膠柱內(nèi)洗脫后,根據(jù)物質(zhì)的洗脫體積,在標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出它的分子量。LgMWVeve但是不適于以下情況
1)極端pH洗脫液
2)纖維狀蛋白
3)一些酶類如淀粉酶分子量不
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