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第八章外源DNA片段與載體DNA的重組主要有哪幾種方法?各自的優(yōu)缺點(diǎn)?(1)黏性末端連接法:.1同一限制酶切位點(diǎn)連接:?jiǎn)蚊盖袃?yōu)點(diǎn):黏性末端連接可抑制載體和目的DNA分子的自連,因而可大大提高連接的效率。更重要是不同限制性酶切位點(diǎn)的黏性末端連接可以控制目的DNA和載體DNA的連接方向。缺點(diǎn):載體易自身環(huán)化;不易定向克隆;產(chǎn)生串聯(lián)重組體;難以插入特定的基因;大片段DAN的重組率低,2.不同一限制酶切位點(diǎn)連接:雙酶切優(yōu)點(diǎn):①不必將原有的內(nèi)切酶失活,可以直接進(jìn)行重組連接;②有原有限制性內(nèi)切酶的重組,載體自連就不會(huì)發(fā)生,不必用堿性磷酸酶進(jìn)行處理,從而得到高效連接。缺點(diǎn):同尾酶的粘性末端互相結(jié)合后形成的新位點(diǎn)一般不能再被原來(lái)的酶識(shí)別(2)平頭末端連接法:常用①同聚物加尾連接②人工接頭連接等缺點(diǎn):1效率很低2平頭末端連接常常破壞原有的識(shí)別性序列3雙向插入,由于平頭末端沒有粘性末端的堿基互補(bǔ)限制,只要是平頭末端均能連接,造成插入方向良種可性。4造成多拷貝外源DNA片段插入載體可能性。優(yōu)點(diǎn)::1連上后就能用。2能把任何片段連接起來(lái)第九章1轉(zhuǎn)化子:接納載體或重組分子的轉(zhuǎn)化細(xì)胞。2重組子:含有重組DNA分子的轉(zhuǎn)化細(xì)胞。3酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定(ELISA原理:一抗(primaryantibody):與目標(biāo)分子的特異結(jié)合。二抗(secondaryantibody):與一抗的特異性結(jié)合。酶連(enzyme-linke):二抗上攜帶一種酶能催化一種反應(yīng)將無(wú)色的底物轉(zhuǎn)變?yōu)橛猩奈镔|(zhì)(或發(fā)光),再通過(guò)比色測(cè)定有色物質(zhì)的含量(或光強(qiáng)度),從而推測(cè)目標(biāo)分子的含量。酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定(ELISA)步驟:①抗體制備(普通抗體、酶標(biāo)記抗體[一抗、二抗])②抗體或抗原的包被(固定在固相載體上)③免疫反應(yīng)④特異性表達(dá)產(chǎn)物的檢測(cè)具體步驟:1)固定樣品:將待測(cè)樣品加入96孔微量滴定板(microtiterplate)的孔中,干燥后就被固定在孔底。2)一抗結(jié)合:加入一抗,反應(yīng)后沖洗掉未結(jié)合的抗體。3)二抗結(jié)合:加入二抗,與一抗結(jié)合后再將未結(jié)合的二抗沖洗掉。二抗只識(shí)別一抗。二抗上聯(lián)著一種酶(堿性磷酸酶、過(guò)氧化物酶、脲酶等)。4)顯色反應(yīng):加入無(wú)色的底物,被二抗上所帶的酶催化反應(yīng)轉(zhuǎn)變成有色物質(zhì)(或發(fā)光)。5)比色:在特殊的分光光度儀(酶標(biāo)儀)上比色,打印出結(jié)果。ELISA的局限性有效,但準(zhǔn)確性稍差(主要取決于一抗的特異性)。必須與其他方法一起綜合考慮第十章外源基因表達(dá)系統(tǒng):泛指目的基因與表達(dá)載體重組后,導(dǎo)入合適的受體細(xì)胞,并能在其中有效表達(dá),產(chǎn)生目的基因產(chǎn)物(目的蛋白)。包涵體蛋白:在一定條件下,外源基因的表達(dá)產(chǎn)物在大腸桿菌中積累并致密地集中在一起形成無(wú)膜的裸露結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)稱為包涵體。涵體存在部位:細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞周質(zhì)融合蛋白:將外源蛋白基因與受體菌自身蛋白基因重組在一起,但不改變兩個(gè)基因的閱讀框,以這種方式表達(dá)的蛋白稱為融合蛋白。①穩(wěn)定性好;②表達(dá)效率高;③較易于分離純化寡聚型外源蛋白:為提高外源蛋白表達(dá)量,在構(gòu)建外源蛋白表達(dá)載體時(shí),將多個(gè)外源目的蛋白基因串連在一起,克隆在質(zhì)粒載體上,以這種方式表達(dá)的外源蛋白稱為寡聚型外源蛋白.整合型外源蛋白:為防止外源基因隨質(zhì)粒丟失,將要表達(dá)的外源基因整合到染色體的非必需編碼區(qū)上,使之成為染色體結(jié)構(gòu)的一部分而穩(wěn)定地遺傳,以此種方式表達(dá)的外源蛋白即為整合型外源蛋白。分泌型外源蛋白:外源基因的表達(dá)產(chǎn)物,通過(guò)運(yùn)輸或分泌的方式穿過(guò)細(xì)胞的外膜進(jìn)入培養(yǎng)基中,即為分泌型外源蛋白.1基因表達(dá)在原核生物與真核生物中的差別和特點(diǎn):1)原核生物表達(dá)系統(tǒng)1基因表達(dá)是以操縱子的形式進(jìn)行的。2當(dāng)操縱子的調(diào)節(jié)基因與RNA聚合酶作用時(shí),結(jié)構(gòu)基因則開始轉(zhuǎn)錄成相應(yīng)的mRNA;3與此同時(shí),mRNA立即與核糖體結(jié)合轉(zhuǎn)譯出相應(yīng)的多肽或蛋白質(zhì),轉(zhuǎn)錄完畢時(shí)轉(zhuǎn)譯也完成,隨之mRNA也被水解掉。2)真核生物基因表達(dá)系統(tǒng)1轉(zhuǎn)錄是在核內(nèi)進(jìn)行的,先生成hnRNA,再加工去掉內(nèi)含子,外顯子相連接,并修飾5′和3′末端后才形成成熟的、有功能的mRNA。2mRNA只能在細(xì)胞質(zhì)中的核糖體上轉(zhuǎn)譯成多肽或蛋白質(zhì),再經(jīng)過(guò)加工、糖化,形成高級(jí)結(jié)構(gòu)2原核生物作為基因表達(dá)系統(tǒng)的受體細(xì)胞所具有的特點(diǎn):1原核生物多為單細(xì)胞異養(yǎng),生長(zhǎng)快,代謝易于控制,可通過(guò)發(fā)酵迅速獲得大量基因表達(dá)產(chǎn)物。2基因組結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,便于基因操作和分析。3多數(shù)原核生物細(xì)胞內(nèi)含有質(zhì)?;蚴删w,便于構(gòu)建相應(yīng)的表達(dá)載體。4生理代謝途徑及基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制比較清楚。5不具備真核生物的蛋白質(zhì)加工系統(tǒng),表達(dá)產(chǎn)物無(wú)特定的空間構(gòu)象。6內(nèi)源蛋白酶會(huì)降解表達(dá)的外源蛋白,造成表達(dá)產(chǎn)物的不穩(wěn)定。]3真核細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)外源基因的特點(diǎn):真核生物可識(shí)別并切除外源基因的內(nèi)含子,從而表達(dá)目的多肽,所以不必向原核細(xì)胞表達(dá)體系那樣從mRNA制備cDNA。2真核基因在真核細(xì)胞中表達(dá)是,其SD序列與細(xì)胞核糖體RNA16S亞基3‘末端的互補(bǔ)程度較高,對(duì)于翻譯水平的調(diào)節(jié)有利3在真核細(xì)胞內(nèi)由外源基因表達(dá)的蛋白可被糖基化,成為糖蛋白,有利于保持或提高免疫原性4外源基因?qū)胝婧思?xì)胞表達(dá)效率較低,其在染色體DNA上的整合是隨機(jī)的和自發(fā)的,還無(wú)法控制整合的位置和適當(dāng)?shù)目截悢?shù)5真核細(xì)胞的培養(yǎng)要求較高,大量生產(chǎn)比較困難,成本較高。2酵母基因表達(dá)載體1)自主復(fù)制型質(zhì)粒載體(yeastreplicatingplasmid,YRP)該載體含有酵母基因組的DNA復(fù)制起始區(qū)、選擇標(biāo)記和基因克隆位點(diǎn)等元件,能夠在酵母細(xì)胞中進(jìn)行自我復(fù)制。優(yōu)點(diǎn):在酵母細(xì)胞中的轉(zhuǎn)化效率較高,每個(gè)細(xì)胞中的拷貝數(shù)可達(dá)200個(gè)。缺點(diǎn):經(jīng)過(guò)多代培養(yǎng)后,子細(xì)胞中的拷貝數(shù)會(huì)迅速減少。(2著絲粒型質(zhì)粒載體該型質(zhì)粒載體是在自主復(fù)制型的基礎(chǔ)上,增加了酵母染色體有絲分裂穩(wěn)定序列元件。在細(xì)胞分裂時(shí),質(zhì)粒載體能平均分配到子細(xì)胞中,穩(wěn)定性較高,但拷貝數(shù)很低,通常只有1~2個(gè)拷貝。(3酵母人工染色體該載體在酵母細(xì)胞中以線性雙鏈DNA的形式存在,每個(gè)細(xì)胞內(nèi)只有單拷貝。在細(xì)胞分裂和遺傳過(guò)程中,能將染色體載體均勻分配到子細(xì)胞中,并保持相對(duì)獨(dú)立和穩(wěn)定。酵母菌選擇標(biāo)記基因赭石突變抑制基因SUP4表達(dá)時(shí)菌落呈白色,不表達(dá)時(shí)呈紅色。外源基因的插入可滅活SUP4基因,獲得紅色的重組轉(zhuǎn)化子。YAC載體可插入200~800kb的外源基因片段,因而特別適合高等真核生物基因組的克隆與表達(dá)研究。第十一章1原核細(xì)胞表達(dá)真核基因的障礙和措施:障礙:1細(xì)菌RNA聚合酶不能識(shí)別真和基因的啟動(dòng)子2從真和基因轉(zhuǎn)錄的mRNA缺乏SD序列,不能結(jié)合到核糖核蛋白體上3真核基因中一般含有內(nèi)含子,而原核基因缺乏真核細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄后加工系統(tǒng),不能切除內(nèi)含子,不能形成成熟的mRNA,不能表達(dá)真核蛋白。4表達(dá)的真核蛋白在原核細(xì)胞中不穩(wěn)定,容易被細(xì)菌蛋白酶破壞。措施:(1)可以通過(guò)人工合成的方法或者從cDNA庫(kù)中獲取.(2)(2)需要在真核生物基因的上游加入SD序列.(3)使用原核生物的強(qiáng)啟動(dòng)子.(4)如果人工合成某一蛋白質(zhì)的基因,需要考慮原核生物對(duì)密碼子的偏愛性.(5)為了防止原核生物分解目的蛋白可以考慮分泌表達(dá)和融合表達(dá)等方法.(6)需要較復(fù)雜翻譯后加工的蛋白質(zhì)最好不用原核細(xì)胞表達(dá).信號(hào)肽:(signalpeptide)是引導(dǎo)新合成肽鏈轉(zhuǎn)移到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的一段多肽,一般位于新合成肽鏈的N端,含有6~15個(gè)帶正電荷的非極性氨基酸,由于信號(hào)肽又是引導(dǎo)肽鏈進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔的一段序列,又稱開始轉(zhuǎn)移序列(starttransfersequence)。2um質(zhì)粒::一個(gè)閉合環(huán)狀超螺旋DNA分子,長(zhǎng)約2um。在釀酒酵母中發(fā)現(xiàn)的一種模擬微生物??捎糜谘芯炕蛘{(diào)控、染色體復(fù)制的理想系統(tǒng),也可作為酵母菌轉(zhuǎn)化的有效載體,并組建基因工程菌YEP質(zhì)粒:含有釀酒酵母2um質(zhì)粒和DNA復(fù)制有關(guān)的部分或全部序列,是一種酵母附加體型質(zhì)粒。2基因工程疫苗種類主要包括基因工程亞單位疫苗,核酸疫苗,基因缺失活疫苗,及蛋白工程疫苗等四種1、基因工程亞單位疫苗(geneengineeringsubunitvaccine)基因工程亞單位疫苗,主要是指將基因工程表達(dá)的蛋白抗原純化后制成的疫苗。優(yōu)點(diǎn):①產(chǎn)量高;②純度高;③安全性高;④用于病原體難于培養(yǎng)或有潛在致癌性,或有免疫病理作用的疫苗研究。缺點(diǎn):與傳統(tǒng)亞單位疫苗相比,免疫效果較差。增強(qiáng)其免疫原性的方法:①調(diào)整基因組合使之表達(dá)成顆粒性結(jié)構(gòu)②是在體外加以聚團(tuán)化,包入脂質(zhì)體或膠囊微球③加入有免疫增強(qiáng)作用的化合物作為佐劑(adjuvant)。2、核酸疫苗(nucleicacidvaccine)核酸疫苗或稱基因疫苗(genevaccine),指使用能夠表達(dá)抗原的基因本身,即核酸制成的疫苗。優(yōu)點(diǎn):①易于制備;②便于保存;③可多次免疫并且容易制成多聯(lián)多價(jià)疫苗。缺點(diǎn):①外源核酸是否會(huì)整合到染色體中引起癌變;②能否引起免疫病理作用,如自身抗核酸抗體的產(chǎn)生,免疫耐受等。3、基因缺失活疫苗(genedeletedlivevaccine)基因缺失活疫苗使用分子生物學(xué)技術(shù)去除與毒力有關(guān)的基因獲得的缺失突變毒株制成的疫苗。優(yōu)點(diǎn):①有突變性狀明確、穩(wěn)定;②不易返祖、毒力恢復(fù);③是研究安全有效的新型疫苗的重要途徑。缺點(diǎn):免疫效率、低用量大。5、蛋白工程疫苗(proteinengineeringvaccine)蛋白工程疫苗是指將抗原基因加以改造,使之發(fā)生點(diǎn)突變、插入、缺失、構(gòu)型改變,甚至進(jìn)行不同基因或部分結(jié)構(gòu)域的人工組合,以期達(dá)到增強(qiáng)其產(chǎn)物的免疫原性,擴(kuò)大反應(yīng)譜,去除有害作
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