蛋白質二級結構

復旦大學生物化學系作用力

破壞因子氫鍵：

α-螺旋，β-折疊

尿素，鹽酸胍疏水作用：

形成球蛋白的核心

去垢劑，有機溶劑VanderWaals力：穩(wěn)定緊密堆積的集團和原子離子鍵：穩(wěn)定α-螺旋，三、四級結構酸、堿二硫鍵：穩(wěn)定三、四級結構還原劑配位鍵：與金屬離子的結合螯合劑EDTA維持蛋白質空間構象的作用力H2NC(:NH)NH2HCl維持空間構象的作用力復旦大學生物化學系蛋白質結構的層次

一級結構：氨基酸序列

二級結構：α螺旋，β折疊

超二級結構

Module

結構域（domain）

三級結構：所有原子空間位置

四級結構：蛋白質多聚體蛋白質的結構層次復旦大學生物化學系肽鍵的特征復旦大學生物化學系肽鍵平面肽鍵平面復旦大學生物化學系肽鏈中的肽平面肽鏈中的肽平面復旦大學生物化學系兩個肽平面以一個Cα為中心發(fā)生旋轉兩面角復旦大學生物化學系RamachandranPlotRamachandranPlot復旦大學生物化學系蛋白質二級結構類型α-helix

keratintriplehelices

collagentriplehelicesβ-sheetβ-turn復旦大學生物化學系LinusCarlPauling

(1901-1994)1926年，留學Sommerfeld實驗室（1年7個月）1928年，發(fā)明雜化軌道，創(chuàng)立量子化學1930年，去LaurenceBragg實驗室學X-ray衍射1936年，與Mirsky一起發(fā)表蛋白質變性的理論---氫鍵1937年，開始搭α-helix的模型，發(fā)現5.4A的周期，與Astbury的Keratin蛋白測定得到的5.1A不符。此后化了約10年的時間測定各種含肽鍵的小分子的結構，得出肽鍵的6個原子在同一平面上的結論1949年，人造絲X-ray數據發(fā)表，他看到了5.4A的周期1950年，α-helix模型發(fā)表，次年發(fā)表β-sheet模型1954年，Nobel化學獎1963年，Nobel和平獎70年代，提倡VitaminC治百病80年代，鹽湖城丑聞/biography/Pauling.htmlPauling的生涯復旦大學生物化學系肽平面的相疊形成α螺旋t肽平面的相疊形成α螺旋復旦大學生物化學系α-螺旋的特性氫鍵取向與主軸基本平行右旋，3.6個氨基酸一個周期，螺距0.54nm第n個AA(NH)與第n-4個AA(CO)形成氫鍵，環(huán)內原子數13。α螺旋的特性復旦大學生物化學系左旋和右旋的判斷左旋和右旋的判斷復旦大學生物化學系Pauling預測的三種螺旋結構3.010helixπ16

helixαhelixPauling預測的三種螺旋第X個氨基酸的氨基與（X－n）個氨基酸的羧基之間形成氫鍵環(huán)內原子數N＝3n+1復旦大學生物化學系角蛋白keratin的結構特征Keratin的結構特征復旦大學生物化學系膠原蛋白Collagen的特殊性Collagen的結構特征復旦大學生物化學系Collagen的結構特征2左旋的肽鏈截面圖復旦大學生物化學系結締組織中的膠原蛋白組織中的膠原蛋白復旦大學生物化學系反平行β折疊反平行β折疊復旦大學生物化學系平行β折疊平行β折疊復旦大學生物化學系β折疊