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第一章蛋白質(zhì)化學(xué)§1.4蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.5蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)§1.6蛋白質(zhì)的分離、純化與測(cè)定§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系一、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系⒈一級(jí)結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)
RNase是由124氨基酸殘基組成的單肽鏈,分子中8個(gè)Cys的-SH構(gòu)成4對(duì)二硫鍵,形成具有一定空間構(gòu)象的蛋白質(zhì)分子。在蛋白質(zhì)變性劑(如8mol/L的尿素)和一些還原劑(如巰基乙醇)存在下,酶分子中的二硫鍵全部被還原,酶的空間結(jié)構(gòu)破壞,肽鏈完全伸展,酶的催化活性完全喪失。當(dāng)用透析的方法除去變性劑和巰基乙醇后,發(fā)現(xiàn)酶大部分活性恢復(fù),所有的二硫鍵準(zhǔn)確無(wú)誤地恢復(fù)原來(lái)狀態(tài)。若用其他的方法改變分子中二硫鍵的配對(duì)方式,酶完全喪失活性。這個(gè)實(shí)驗(yàn)表明,蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)決定它的空間結(jié)構(gòu),而特定的空間結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)具有生物活性的保證。如下圖:§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系2.前體與活性蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的關(guān)系
由108個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成的前胰島素原(pre-proinsulin),在合成的時(shí)候完全沒(méi)有活性,當(dāng)切去N-端的24個(gè)氨基酸信號(hào)肽,形成84個(gè)氨基酸的胰島素原(proinsulin),胰島素原也沒(méi)活性,在包裝分泌時(shí),A、B鏈之間的33個(gè)氨基酸殘基被切除,才形成具有活性的胰島素。如圖所示:§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系胰島素:AB兩條鏈構(gòu)成,A鏈含21個(gè)氨基酸殘基,B鏈含30個(gè)氨基酸殘基,鏈間有兩對(duì)二硫鍵,A鏈上有一對(duì)二硫鍵?!?.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系3.同源蛋白質(zhì)有順序同源性:
比較不同來(lái)源的細(xì)胞色素C發(fā)現(xiàn),與功能密切相關(guān)的氨基酸殘基是高度保守的,這說(shuō)明不同種屬具有同一功能的蛋白質(zhì),在進(jìn)化上來(lái)自相同的祖先,但存在種屬差異。不同種屬間的同源蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)上相對(duì)應(yīng)的氨基酸差別越大,其親緣關(guān)系愈遠(yuǎn),反之,其親緣關(guān)系愈近?!?.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系⒋蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)與分子病
現(xiàn)知幾乎所有遺傳病都與蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)改變有關(guān),都稱之為分子病。例如鐮刀型貧血癥,它是由于血紅蛋白的β-亞基上的第六位氨基酸由谷氨酸變成了纈氨酸,導(dǎo)致血紅蛋白的結(jié)構(gòu)和功能的改變,其運(yùn)輸氧氣的能力大大地降低,并且紅細(xì)胞呈鐮刀狀?!?.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
所以,蛋白質(zhì)一定的結(jié)構(gòu)執(zhí)行一定的功能。功能不同的蛋白質(zhì)總是有著不同的序列;比較種屬來(lái)源不同而功能相同的蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu),可能有某些差異,但與功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)也總是相同。若一級(jí)結(jié)構(gòu)變化,蛋白質(zhì)的功能可能發(fā)生很大的變化?!?.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系二、蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
(一)肌紅蛋白(Mb)與血紅蛋白的結(jié)構(gòu)與功能:§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系肌紅蛋白的結(jié)構(gòu)§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系肌紅蛋白的亞基鐵卟啉§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系肌紅蛋白的氧合曲線§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
Hb由4條肽鏈組成:2α、2β,功能是運(yùn)載O2。在去氧Hb亞基中有下列幾對(duì)離子鍵:§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系血紅蛋白的變構(gòu)效應(yīng)使其有利于氧的運(yùn)輸§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系二磷酸甘油酸(BPG)結(jié)合于四個(gè)亞基的中央空穴處§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系二磷酸甘油酸(BPG)降低血紅蛋白對(duì)氧的親和力§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系波爾(Bohr)效應(yīng)有利于血紅蛋白對(duì)氧的運(yùn)輸§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系由于基因水平的突變導(dǎo)致的血紅蛋白的分子病§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系(二)免疫系統(tǒng)與免疫球蛋白的結(jié)構(gòu)與功能§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系免疫球蛋白的結(jié)構(gòu)§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系§1.4蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
總之,各種蛋白質(zhì)都有特定的空間構(gòu)象,而特定的空間構(gòu)象又與它們特定的生物學(xué)功能相適應(yīng),蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能是高度統(tǒng)一的?!?.5蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)一、蛋白質(zhì)的兩性電離和等電點(diǎn)蛋白質(zhì)與氨基酸相似,也具有兩性電離的性質(zhì)。蛋白質(zhì)的多肽鏈含有末端氨基和羧基,一些側(cè)鏈上含有可解離的基團(tuán),有的可以接受氫離子,有的可以電離出氫離子,因此蛋白質(zhì)具有酸堿兩性電離的性質(zhì)。它的兩性電離比氨基酸復(fù)雜。對(duì)某一蛋白質(zhì)而言,在某一pH下,當(dāng)它所帶正負(fù)電荷相等的時(shí)候,該溶液的pH就稱為該蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)的大小與蛋白質(zhì)的氨基酸組成有關(guān)?!?.5蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及分離純化二、蛋白質(zhì)的高分子性質(zhì)
蛋白質(zhì)溶液有許多高分子溶液的性質(zhì),如:擴(kuò)散慢、易沉降、
粘度大、不能透過(guò)半透膜,在水溶液中可形成親水的膠體。
蛋白質(zhì)膠體溶液的穩(wěn)定因素:水化膜、帶電荷。當(dāng)破壞這兩個(gè)因素時(shí),蛋白質(zhì)中從溶液中析出而產(chǎn)生沉淀?!?.5蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及分離純化三、蛋白質(zhì)的沉淀作用
使蛋白質(zhì)從溶液中析出的現(xiàn)象稱為沉淀,方法有:1.鹽析:在蛋白質(zhì)的水溶液中,加入大量高濃度的強(qiáng)電解質(zhì)鹽如硫酸胺、氯化鈉、硫酸鈉等,使蛋白質(zhì)從溶液中析出,稱為蛋白質(zhì)的鹽析。而低濃度的鹽溶液加入蛋白質(zhì)溶液中,會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)的溶解度增加,該現(xiàn)象稱為鹽溶。鹽析的機(jī)理:破壞蛋白質(zhì)的水化膜,中和表面的凈電荷。鹽析法是最常用的蛋白質(zhì)沉淀方法,該方法不會(huì)使蛋白質(zhì)產(chǎn)生變性。§1.5蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及分離純化2.有機(jī)溶劑沉淀法:在蛋白質(zhì)溶液中,加入能與水互溶的有機(jī)溶劑如乙醇、丙酮等,蛋白質(zhì)產(chǎn)生沉淀。有機(jī)溶劑沉淀法的機(jī)理:破壞蛋白質(zhì)的水化膜。有機(jī)溶液沉淀蛋白質(zhì)通常在低溫條件下進(jìn)行,否則有機(jī)溶劑與水互溶產(chǎn)生的溶解熱會(huì)使蛋白質(zhì)產(chǎn)生變性。3.重金屬鹽沉淀(條件:pH稍大于pI為宜):在蛋白質(zhì)溶液中加入重金屬鹽溶液,會(huì)使蛋白質(zhì)沉淀。重金屬沉淀法的機(jī)理:重金屬鹽加入之后,與帶負(fù)電的羧基結(jié)合。重金屬沉淀蛋白質(zhì)會(huì)使蛋白質(zhì)產(chǎn)生變性,長(zhǎng)期從事重金屬作業(yè)的人應(yīng)多吃高蛋白食品,以防止重金屬離子被機(jī)體吸收后造成對(duì)機(jī)體的損害。§1.5蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及分離純化4.生物堿試劑沉淀法(條件:pH稍小于pI)生物堿是植物組織中具有顯著生理作用的一類含氮的堿性物質(zhì)。能夠沉淀生物堿的試劑稱為生物堿試劑。生物堿試劑一般為弱酸性物質(zhì),如單寧酸、苦味酸、三氯乙酸等。生物堿試劑沉淀蛋白質(zhì)的機(jī)理:在酸性條件下,蛋白質(zhì)帶正電,可以與生物堿試劑的酸根離子結(jié)合而產(chǎn)生沉淀。
“柿石癥”的產(chǎn)生就是由于空腹吃了大量的柿子,柿子中含有大量的單寧酸,使腸胃中的蛋白質(zhì)凝固變性而成為不能被消化的“柿石”。5.弱酸或弱堿沉淀法:用弱酸或弱堿調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)溶液的pH處于等電點(diǎn)處,使蛋白質(zhì)沉淀。弱酸或弱堿沉淀法機(jī)理:破壞蛋白質(zhì)表面凈電荷?!?.5蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及分離純化
四、蛋白質(zhì)的變性作用、結(jié)絮和凝固1.蛋白質(zhì)變性的概念:天然蛋白質(zhì)受物理或化學(xué)因素的影響后,使其失去原有的生物活性,并伴隨著物理化學(xué)性質(zhì)的改變,這種作用稱為蛋白質(zhì)的變性。2.使蛋白質(zhì)變性的因素1)物理因素:高溫、高壓、射線等
2)化學(xué)因素:強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、重金屬鹽等3.變性的本質(zhì):分子中各種次級(jí)鍵斷裂,使其空間構(gòu)象從緊密有序的狀態(tài)變成松散無(wú)序的狀態(tài),一級(jí)結(jié)構(gòu)不破壞?!?.5蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及分離純化4.蛋白質(zhì)變性后的表現(xiàn):1)生物學(xué)活性消失
2)理化性質(zhì)改變:溶解度下降,粘度增加,紫外吸收增加,側(cè)鏈反應(yīng)增強(qiáng),對(duì)酶的作用敏感,易被水解。五、蛋白質(zhì)的顏色反應(yīng)
蛋白質(zhì)的顏色反應(yīng)主要與其定性、定量測(cè)定有關(guān):1.茚三酮反應(yīng):多肽與蛋白質(zhì)都能與之反應(yīng)生成藍(lán)色化合物。2.雙縮脲反應(yīng):多肽與蛋白質(zhì)都能和雙縮脲試劑反應(yīng),隨著肽鍵的數(shù)目越多,顏色依次為粉紅、紫紅、紫、藍(lán)。3.酚試劑反應(yīng):多肽與蛋白質(zhì)與酚試劑生成藍(lán)色的化合物。另外,前面提到的氨基酸顏色反應(yīng)蛋白質(zhì)都具有。
六、蛋白質(zhì)的紫外吸收特征蛋白質(zhì)溶液能在近紫外區(qū)(280nm處)有光吸收,主要是由帶芳香環(huán)的氨基酸決定的。其對(duì)紫外光吸收能力的強(qiáng)弱順序?yàn)椋?/p>
色(Trp)>酪(Tyr)>苯丙(Phe)。
§1.6蛋白質(zhì)的分離、純化與測(cè)定一、分離純化蛋白質(zhì)的意義
研究蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能:要求純度高,不變性;提取活性的酶或蛋白質(zhì):必須保持天然活性狀態(tài);作為藥物或食品添加劑:純度要求一般。二、蛋白質(zhì)分離純化的一般步驟
材料的選擇→原料的預(yù)處理→蛋白質(zhì)的抽提→從抽提液中沉淀蛋白質(zhì)→純化→蛋白質(zhì)的結(jié)晶§1.6蛋白質(zhì)的分離、純化與測(cè)定1.原料的選擇:要求含待分離的蛋白質(zhì)豐富,廉價(jià),易得,容易收集,新鮮無(wú)腐敗。2.原料的預(yù)處理:如果待分離蛋白質(zhì)為胞外蛋白質(zhì),材料破碎后,用適當(dāng)?shù)娜軇┲苯映樘?;若待分離蛋白質(zhì)為胞內(nèi)蛋白質(zhì),則需要破碎細(xì)胞膜,再用適當(dāng)?shù)娜軇┏樘帷?.從抽提液中沉淀蛋白質(zhì):常用鹽析法、低溫乙醇沉淀法、等電點(diǎn)沉淀法?!?.6蛋白質(zhì)的分離、純化與測(cè)定4.純化:將沉淀的蛋白質(zhì)溶解,再選擇適當(dāng)?shù)募兓椒?,得到純度比較高的蛋白質(zhì)溶液。純化方法:透析或超濾、電泳法、凝膠過(guò)濾法、離子交換層析、
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