立克次體分類研究進(jìn)展與新分類

立克次體分類研究進(jìn)展與新分類昆明醫(yī)科大學(xué)熱帶醫(yī)學(xué)研究所病原生物學(xué)與免疫學(xué)系

寶福凱教授電話：0871－5338884E-mail:baofukai@126.com，F(xiàn)ukai.bao@實(shí)驗(yàn)室網(wǎng)頁(yè)：/home整理ppt整理pptHowardTaylorRicketts(1871-1910)wasanAmerican

pathologistafterwhomtheRickettsiaceaefamilyandtheRickettsialesarenamed.Intheearlierpartofhiscareer,RickettsundertookresearchatNorthwesternUniversityonblastomycosisandlaterattheUniversityofChicagoonandRockyMountainspottedfever.RickettsandhisassistantdiscoveredthattheagentthatcarriedthebacillusforthelatterwastheRockyMountainwoodtick(theAmericandogtickisalsoacarrier).Rickettswasdevotedtohisresearchand,onseveraloccasions,injectedhimselfwithapathogeninordertomeasureitseffects.In1909,RickettsbecameinterestedintyphusduetoanoutbreakinMexicoCityandtheapparentsimilarityofthediseasetospottedfever.daysafterisolatingtheorganismthathebelievedcausedtyphus,hehimselfdiedofthedisease.整理ppt立克次體目（Rickettsiales）微生物是一類嚴(yán)格細(xì)胞內(nèi)寄生的原核細(xì)胞型微生物，其生物學(xué)性狀如形態(tài)結(jié)構(gòu)、化學(xué)組成及代謝方式等方面與細(xì)菌類似。立克次體是引起斑疹傷寒、恙蟲病、Q熱等傳染病的病原體，首先由美國(guó)青年醫(yī)師HowardTaylorRicketts發(fā)現(xiàn)，為紀(jì)念他在研究斑疹傷寒時(shí)不幸感染而獻(xiàn)身，故以他的姓名命名。立克次體與節(jié)肢動(dòng)物關(guān)系密切，寄生在吸血節(jié)肢動(dòng)物體內(nèi)，使其成為寄生宿主，或?yàn)閮?chǔ)存宿主，或同時(shí)為傳播媒介。立克次體大多是人獸共患病的病原體,引起的新現(xiàn)和再現(xiàn)傳染?。‥mergingandre-emerginginfectiousdiseases）呈世界性或地方性流行，日益受到醫(yī)學(xué)界重視。整理ppt2.Rickettsiology:PresentandFutureDirections

AnnalsNYAS,Volume990,Jun2003

ISBN1-57331-445-5770pages,46papers

Rickettsiology:CurrentIssuesandPerspectives

AnnalsNYAS，Volume590,Jun1990

整理ppt3.CenturyofRickettsiology:Emerging,ReemergingRickettsioses,MolecularDiagnostics,andEmergingVeterinaryRickettsiosesAnnalsNYAS,Volume1078,publishedOct2006EditedbyKarimE.Hechemy;JoséA.Oteo;DidierA.Raoult,etal.4.Rickettsioses:FromGenometoProteome,Pathobiology,andRickettsiaeasanInternationalThreatAnnalsNYAS,Volume1063,publishedFeb2006EditedbyKarimE.Hechemy;JoséA.Oteo;DidierA.Raoult,etal.整理ppt

近年來(lái)，隨著立克次體分子生物學(xué)研究的迅速發(fā)展（如16SrDNA序列分析、全DNA或基因片段分析等），原有的立克次體分類已不能準(zhǔn)確反映立克次體目、科和各種屬的面貌，代之而起的是根據(jù)特定基因（如16SrRNA基因、HSP60基因等）對(duì)立克次體進(jìn)行新的分類。目前細(xì)菌分類的權(quán)威資源是《伯杰手冊(cè)》不同版本，包括《伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》（Bergey＇sManualofDeterminativeBacteriology）第8版（1974）、《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》（Bergey＇sManualofSystematicBacteriology）第1版（1984，1986，1989）和第2版（2001，2005）。在線資源NCBITaxonomy（/Taxonomy/）的分類方法也被許多專業(yè)人員認(rèn)可。兩種資源內(nèi)容大同小異。本文以《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》第2版第2卷（2005）為主要參照，參考NCBITaxonomy資源和近期發(fā)表的重要立克次體分類文獻(xiàn)，對(duì)立克次體目分類學(xué)現(xiàn)狀進(jìn)行概括性介紹。整理ppt1．《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》（第1版）對(duì)立克次體目微生物的分類【1】本版《伯杰手冊(cè)》也對(duì)核酸分析和化學(xué)分類法加以重視，但由于當(dāng)時(shí)技術(shù)條件的限制，它仍然沿用以表型特征為主的傳統(tǒng)分類法，將立克次體目分為3個(gè)科，即立克次體科、巴通體科和無(wú)形體科，立克次體科下再分3個(gè)族，見表1。整理ppt整理ppt2．《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》（第2版）對(duì)立克次體目微生物的新分類【2】從1984年第一版開始發(fā)行以來(lái)，細(xì)菌分類已取得了巨大進(jìn)展，新命名的種成倍增加、新描述的屬也在170個(gè)以上，尤其是80年代末以來(lái)，rRNA、DNA、蛋白質(zhì)序列分析方法日趨實(shí)用，因而為細(xì)菌的系統(tǒng)發(fā)育積累了不少新的資料。因此急需對(duì)第一版進(jìn)行新的修訂。第2版預(yù)計(jì)分5卷出版，它更多地依靠分子水平上系統(tǒng)發(fā)育與進(jìn)化研究成果對(duì)細(xì)菌進(jìn)行分類，在總體安排上進(jìn)行了較大的調(diào)整，至今已出版兩卷?！恫苁舷到y(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》第2版第2卷（2005年出版）將立克次體目微生物分為3科，即立克次體科、無(wú)形體科和全孢菌科（Holosporaceae）。與第1版相比，取消了族（tribe）一級(jí)分類單元和羅莎利馬體屬（Rochalimaea）屬名，原羅莎利馬體屬微生物并入巴爾通體科，將巴通體科歸入根瘤菌目（Rhizobiales）；無(wú)形體科的血蟲體屬（附紅細(xì)胞體，Eperythrozoon）和血巴爾通體屬（Haemobartonella）歸入支原體目的支原體科，柯克斯體屬（Coxiella）和立克次小體屬（Rickettsiella）歸入軍團(tuán)菌目（Legionellanes）；新設(shè)東方體屬，將第一版列入立克次體科、無(wú)漿體科中的一些屬進(jìn)行了重新組合。詳見表2。整理ppt整理ppt3．無(wú)形體科一些重要病原體簡(jiǎn)介【3】經(jīng)過(guò)重新組合，無(wú)形體包括7個(gè)屬，其中無(wú)形體屬和埃立克體屬囊括了立克次體科中通過(guò)蜱類傳播、感染外周血細(xì)胞（粒細(xì)胞、單核細(xì)胞、紅細(xì)胞和血小板）的所有病原體。這些病原體引起的新現(xiàn)、再現(xiàn)傳染病近年受到高度重視?，F(xiàn)將與人和動(dòng)物疾病相關(guān)的重要病原體列表3：整理ppt整理ppt4．小結(jié)與展望隨著分子生物學(xué)分析技術(shù)和真核生物系統(tǒng)分類學(xué)的進(jìn)展，新的微生物不斷被發(fā)現(xiàn)和分類，許多舊有微生物也被重新分類。立克次體目微生物種類繁多，專性細(xì)胞內(nèi)寄生，既往分類存在許多問(wèn)題；新的立克次體類微生物不斷發(fā)現(xiàn)和鑒定。因此，需要應(yīng)用種系進(jìn)化與系統(tǒng)分類學(xué)手段對(duì)立克次體目微生物的分類進(jìn)行調(diào)整。以Dumler和Rikihisa為首的著名立克次體研究學(xué)者長(zhǎng)期致力與立克次體分類研究，取得一系列進(jìn)展【4】。這些進(jìn)展最近已收入國(guó)際權(quán)威細(xì)菌分類學(xué)巨著《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》第2版第2卷（2005年出版）【2】。整理ppt近年來(lái)，無(wú)形體和埃立克體引起的人類無(wú)形體病和埃立克體病的報(bào)道日益增多，成為新現(xiàn)傳染病的重要組成部分。目前世界上已新發(fā)現(xiàn)了2種人類埃立克體病，即查菲埃立克體（Ehrlichiachaffeensis）引起的人類單核細(xì)胞性埃立克體?。℉umanMonocyticEhlichiosis,HME）；由腺熱埃立克體（E.sennetsa）引起人類腺熱（亦稱傳染性單核細(xì)胞增多癥）。從前認(rèn)為無(wú)形體（Anaplasma）只引起動(dòng)物疾病，近年發(fā)現(xiàn)嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體（Anaplasmaphagocytophilum）可引起人類感染，并且常與萊姆病病原體伯氏螺旋體引起混合感染，從而受到廣泛重視【5】。整理ppt

血清學(xué)研究證明我國(guó)云南地區(qū)軍犬和健康人中存在犬埃立克體立克體抗體，人廣東病犬、血紅扇頭蜱（Rhipicephalussanguineus）及廣西的微小牛蜱（Boophilusmicroplus）擴(kuò)增出犬埃立克體的基因片段。我國(guó)不少地區(qū)常有發(fā)熱待查，或類似埃立克體病臨床表現(xiàn)的病例的發(fā)生，提示可能存在有埃立克體?。辉谖覈?guó)部分地區(qū)蜱類還檢測(cè)出嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體的基因片段，顯示我國(guó)可能存在此類病原體，值得研究證實(shí)【6，7】。整理ppt

參考文獻(xiàn)[1]HOLTJG,Ed.Bergey'sManualofSystematicBacteriology,1stEd,Vol.1[M].Williams&Wilkins,Baltimore,USA,1984：687-720[2]BRENNERDJ,KRIEGNR,STALEYJTANDGARRITYGM,Ed.Bergey'sManualofSystematicBacteriology,2ndEd.,Vol.2[M].Springer,NewYork,USA,2005,110-145[3]RIKIHISA,Y.NewfindingsonmembersofthefamilyAnaplasmataceaeofveterinaryimportance[J].Ann.N.Y.Acad.Sci..2006,1078:438-445.

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Rickettsiales;UnificationofsomespeciesofEhrlichiawithAnaplasma,

CowdriawithEhrlichia,andEhrlichiawithNeorickettsia;Descriptionofsixnewspeciescombinations;andDesignationofEhrlichiaequiand"HGEagent"assubjectivesynonymsofEhrlichiaphagocytophila[J].Int.J.Syst.Evol.Microbiol.2001,51:2145-2165.

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附：《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》（Bergey‘sManualofSystemaicBacteriology）60年代以前，國(guó)際上不少細(xì)菌分類學(xué)家都曾對(duì)細(xì)菌進(jìn)行過(guò)全面的分類，提出過(guò)一些在當(dāng)代有影響的細(xì)菌分類系統(tǒng)。但70年代以后，對(duì)細(xì)菌進(jìn)行全面分類的、影響最大的是"伯杰氏手冊(cè)"。所以該書目前已成為對(duì)細(xì)菌進(jìn)行分類鑒定的主要參考書?！安苁鲜謨?cè)”最初是由美國(guó)賓夕法尼亞大學(xué)的細(xì)菌學(xué)教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937)及其同事為細(xì)菌的鑒定而編寫的，名為《伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》(Bergey‘sManualofDeterminativeBacteriology)。該書自1923年問(wèn)世以來(lái)，已進(jìn)行過(guò)八次修訂，現(xiàn)已發(fā)行第九版。整理ppt1957年第七版后，由于越來(lái)越廣泛地吸收了國(guó)際上細(xì)菌分類學(xué)家參加編寫(如1974年第八版，撰稿人多達(dá)130多位，涉及15個(gè)國(guó)家；現(xiàn)行版本撰稿人多達(dá)300多人，涉及近20個(gè)國(guó)家)，所以它的近代版本反映了出版年代細(xì)菌分類學(xué)的最新成果，因而逐漸確立了在國(guó)際上對(duì)細(xì)菌進(jìn)行全面分類的權(quán)威地位。70年代以來(lái)該書所提出的分類系統(tǒng)已被各國(guó)普遍采用。盡管該書編輯們一再堅(jiān)決否認(rèn)，還是被人稱之為“細(xì)菌分類金標(biāo)準(zhǔn)"整理ppt伯杰氏手冊(cè)現(xiàn)行版本從1984年開始至1989年分四卷出版，并改名為《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》(Bergey'sManualofSystematicBacteriology)(第一版)(以下簡(jiǎn)稱'系統(tǒng)手冊(cè)"第一版)，1994年又將"系統(tǒng)手冊(cè)"1-4卷中有關(guān)屬以上分類單元的分類鑒定資料進(jìn)行少量的修改補(bǔ)充后匯集成一冊(cè)仍用原來(lái)書名出版，故稱之為《伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》第九版。據(jù)報(bào)導(dǎo)，"系統(tǒng)手冊(cè)"第二版修訂工作已在進(jìn)行之中，預(yù)計(jì)在年內(nèi)開始分5卷出版發(fā)行，現(xiàn)已有資料介紹了第二版大致的分類結(jié)構(gòu)。下面即簡(jiǎn)要介紹"系統(tǒng)手冊(cè)"第一、二版對(duì)原核生物的大致分類。整理ppt第9版（1984，1986）中實(shí)質(zhì)性的變化，象征著細(xì)菌分類學(xué)的發(fā)展進(jìn)入新的階段。第一，手冊(cè)更名，原書名為《伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》（Bergey＇sManualofDeterminativeBacteriology），第9版由于內(nèi)容增加，范圍擴(kuò)大，提高了手冊(cè)的實(shí)用性，同時(shí)指出各類細(xì)菌間的關(guān)系，所以改名為《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》；第二，由1卷分成4卷，這是考慮到能及時(shí)反映新進(jìn)展和使用者的方便；第三，細(xì)菌在生物界的地位，8、9版間無(wú)變動(dòng)，但它們的高級(jí)分類單位有很大變化，尤其嗜鹽細(xì)菌和產(chǎn)甲烷細(xì)菌，根據(jù)胞壁分析和DNA序列分折，另列疵壁菌門，古細(xì)菌綱；第四，趨近自然體系，在各級(jí)分類單位中全面應(yīng)用核酸研究；在表型特征的基礎(chǔ)上，以DNA資料給予決定性的判斷。使人為的分類體系過(guò)渡到自然體系的理想進(jìn)一步付諸實(shí)現(xiàn)。整理pptBergey'sManualofSystematicBacteriology

1stEditionJohnG.Holt,Editor-in-Chief

Williams&Wilkins,Baltimore,MD

Publishedin4volumes:Volume1(1984)Gram-negativeBacteriaofgeneral,medical,orindustrialimportanceVolume2(1986)Gram-positiveBacteriaotherthanActinomycetes

Volume3(1989)Archaeobacteria,Cyanobacteria,andremainingGram-negativeBacteria

Volume4(1989)Actinomycetes整理ppt

從1984年第一版開始發(fā)行以來(lái)，細(xì)菌分類又取得了巨大進(jìn)展，新命名的種成倍增加、新描述的屬也在170個(gè)以上，尤其是90年代末以來(lái)，rRNA、DNA、蛋白質(zhì)序列分析方法日趨實(shí)用，因而為細(xì)菌的系統(tǒng)發(fā)育積累了不少新的資料。因此已經(jīng)有可能對(duì)其第一版進(jìn)行新的修訂。第二版預(yù)計(jì)分5卷出版，從已報(bào)導(dǎo)的資料看，它更多地依靠系統(tǒng)發(fā)育資料對(duì)細(xì)菌分類群的總體安排進(jìn)行了較大的調(diào)整。第二版將原核生物分為30組，5卷大致的內(nèi)容安排如下：

第一卷：1～14組。包括古生菌、藍(lán)細(xì)菌、光合細(xì)菌和最早分支的屬第二卷：15～