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文檔簡介
白血病分子診療第1頁/共26頁分子生物學
在白血病中的應用第2頁/共26頁
一、白血病相關基因改變的常見類型融合基因基因突變基因表達異常第3頁/共26頁1.融合基因:
所謂融合基因,是指將兩個或多個基因的編碼區(qū)首尾相連.置于同一套調控序列(包括啟動子、增
強子、核糖體結合序列、終止子等)控制之下,構成的嵌合基因。
概念Chr9Chr22ABLBCRBCR-ABL融合基因第4頁/共26頁2.基因突變:
錯義突變(點突變)插入突變缺失突變移碼突變第5頁/共26頁錯義突變(點突變):
DNA分子中一個堿基對被另一個不同的堿基對取代所引起的突變。
如:JAK2V617FJAK2基因
mRNA水平(cDNA水平):第1849位點G突變?yōu)門
蛋白水平:第617位氨基酸位點由纈氨酸(V)突變?yōu)楸勘彼幔‵)第6頁/共26頁插入突變:
較長片段的DNA的插入而發(fā)生突變,但不改變閱讀框
如:NOTCH1H1590-L1592insFGPNOTCH1基因
mRNA水平(cDNA水平):c.47754776ins(TGGGCC)
蛋白水平:H1590-L1592insFGP第7頁/共26頁缺失突變:
較長片段的DNA的缺失而發(fā)生突變,但不改變閱讀框
如:JAK2N542-E543del
JAK2基因
mRNA水平(cDNA水平):c.1624-1629del6bp
蛋白水平:N542-E543缺失N、E氨基酸
第8頁/共26頁移碼突變:DNA片段中某一位點插入或丟失一個或幾個(非3或3的倍數堿基對時,造成插入或丟失位點以后的一系列編碼順序發(fā)生錯位的一種突變。
如:CALRL367fs(46)突變
CALR基因
mRNA水平(cDNA水平):c.1179_1230del52bp
蛋白水平:第367位氨基酸(亮氨酸)位點發(fā)生移碼,在
367位點起后的46位氨基酸終止。第9頁/共26頁
癌基因或抑癌基因表達異常如:WT1定量3、基因表達異常第10頁/共26頁二、白血病基因檢測的臨床意義1、輔助診斷2、指導治療3、評估預后4、微小病變殘留檢測第11頁/共26頁三、白血病相關基因分類BCR-ABLFLT3-ITDJAK2V617FC-KIT……PML-RARaNPM1RUNX1AML1-ETO……DNMT3ATET2ASXL1/ASXL2IDH1/IDH2……SF3B1SRSF2U2AF1……
Class1
增殖Class2分化Class3
表觀遺傳Class4
剪切因子第12頁/共26頁四、白血病相關常見基因AMLCMLMPNALLCLLMDS第13頁/共26頁AML相關基因異常融合基因:1、
PML-RARa:95%AML-M3分為三型L型、S型、V型
PLZF-RARaNPM1-RARa2、
AML1-ETO:40%AML-M2(主要為M2b)3、
CBFβ-MYH11:90%AML-M4Eo4、
MLL-AF17
MLL-AF6AML-M4/M5
MLL-AF9第14頁/共26頁AML相關基因異常基因突變:FLT3-ITDNPM1(A/B/D型)c-KitIDH1IDH2ASXL2NRASKRASP53DNMT3A基因定量分析:WT1定量FLT3-ITD:AML-M3中發(fā)生頻率較高c-Kit:50%AML1-ETO陽性AML
CBFβ-MYH11陽性AMLASXL2:AML1-ETO陽性AML第15頁/共26頁CML相關基因異常BCR-ABL:95%CMLCML特異marker
亞型:
cDNAProtein
b3a2、b2a2型P210e19a2型P230e1a2型P190第16頁/共26頁MPN相關基因異常PV、ET、PMF的診斷BCR-ABL排除早期慢粒PV:JAK2V617FJKA2exon12ET:JAK2V617FMPLCALRPMF:JAK2V617FMPLCALRBCR-ABLJAK2V617FMPLCALRJAK2exon12第17頁/共26頁MDS相關基因異常WT1定量DNMT3ATET2ASXL1SF3B1SRSF2RUNX1SF3B1:主要見于50-70%環(huán)形鐵粒幼增多性貧血SRSF2
:主要見于CMML第18頁/共26頁ALL相關基因異常BCR-ABL:35%成人ALLTEL-AML1:兒童ALL預后好E2A-PBX1:預后不好MLL-AF4:嬰幼兒多見NOTCH1:預后好FBXW7:預后不好PTENNRASKRASB-ALLT-ALL第19頁/共26頁CLL相關基因異常P53NOTCH1NOTCH1:見于B系或T系CLL在CLL中為預后不好指標第20頁/共26頁五、檢測
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