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文檔簡介
醫(yī)學微生物學
MedicalMicrobiology基礎醫(yī)學院微生物學系鄔國軍生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第1頁第四章細菌遺傳和變異生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第2頁★遺傳(heredity)子代與親代生物學性狀基本相同,且代代相傳?!镒儺悾╲ariation)子代與親代以及子代與子代之間生物學性狀出現(xiàn)差異。概述生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第3頁★遺傳性變異——基因型變異(genotypicvariation)★非遺傳性變異——表型變異(phenotypicvariation)變異生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第4頁一、形態(tài)與結構變異二、菌落變異三、毒力變異四、耐藥性變異……細菌變異實例生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第5頁
※Bacterialchromosome(細菌染色體)※Plasmid(質(zhì)粒)※Phage(噬菌體)細菌遺傳變異物質(zhì)基礎:細菌基因組生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第6頁一.細菌基因組主要組成第一節(jié)細菌基因組(BacterialGenome)包含細菌染色體、質(zhì)粒及噬菌體基因組生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第7頁環(huán)狀雙螺旋雙鏈DNA,無組蛋白,為裸露核酸分子。B.操縱子
[Op(e)ron]結構。C.無內(nèi)含子,轉錄后無需剪切修飾。D.結構基因無重合。E.大多數(shù)基因為單拷貝。細菌染色體特點:1.細菌染色體生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第8頁Thestructureofoperon生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第9頁A.環(huán)狀雙螺旋雙鏈DNA,無組蛋白,為裸露核酸分子。B.操縱子
[Op(e)ron]結構。C.無內(nèi)含子,轉錄后無需剪切修飾。D.結構基因無重合。E.大多數(shù)基因為單拷貝。1.細菌染色體特點:生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第10頁F.種內(nèi)或種間存在廣泛基因交換◎Pathogenicislands(致病島)[alsocalledtoxicislands(毒力島),fitnessislands(適應島),
ecologicalislands(生態(tài)島),symbiosisislands(共生島)]◎Resistantgene(耐藥基因)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第11頁致病島致病菌染色體上編碼與毒力相關基因外源性DNA片段(分子量較大基因群)。如adherencefactors,toxins,ironuptakesystems,invasionfactorsandsecretionsystems.★外源性DNA片段兩側含有重復序列或插入序列,且G+C百分比和密碼子使用偏向性與宿主菌染色體有顯著差異。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第12頁E.種內(nèi)或種間存在廣泛基因交換◎Pathogenicityislands(alsocalledToxicityIslands,fitnessislands,ecologicalislands,symbiosisislands)◎Resistantgene生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第13頁(1)概念:
細菌染色體外遺傳物質(zhì),為環(huán)狀閉合或線性雙鏈DNA分子,能于細菌DNA外獨立復制。2.
Plasmid(質(zhì)粒)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第14頁(2)特點:①
含有自我復制能力。②
編碼基因產(chǎn)物能賦予細菌一些特征
(非細菌生命活動不可缺乏)。③
質(zhì)??勺孕衼G失與消除。④
質(zhì)粒含有轉移性。⑤質(zhì)粒含有相容性與不相容性。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第15頁①Accordingtotransferproperties
◎Conjugativeplasmids(接合性質(zhì)粒):
Conjugativeplasmidscontainso-calledtra-genes,whichperformthecomplexprocessofconjugation,thesexualtransferofplasmidstoanotherbacterium
◎Nonconjugativeplasmids(非接合性質(zhì)粒):
Non-conjugativeplasmidsareincapableofinitiatingconjugation,buttheycanbetransferredtogetherwithconjugativeplasmids,duringconjugation.
(3)分類生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第16頁②Phenotypiceffects
◎Fertilityplasmid(Ffactor,致育質(zhì)粒)
——whichcontainonlytra-genes.Theonlyfunctionistoinitiateconjugation.生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第17頁◎Bacteriocinogenicplasmids(細菌素質(zhì)粒)——whichcontaingenesthatcodefor
bacteriocin,proteinsthatcankillotherbacteria.SuchasColplasmidcanencodecolicin
生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第18頁◎Resistanceplasmids(Rfactors,
耐藥性質(zhì)粒)
whichcontaingenesthatcanestablisharesistanceagainstantibioticsorpoisons.HistoricallyknownasR-factors,beforethenatureofplasmidswasunderstood.生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第19頁RTFRdeterminantRTF(ResistanceTransferFactor)■Conjugativeplasmid■TransfergenesRdeterminant■Resistancegenes■Transposons生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第20頁◎
Virulenceplasmids(毒力質(zhì)粒),whichturnthenon-pathogenicbacteriaintoapathogen.◎
Metabolism
plasmids(代謝質(zhì)粒),alsocalleddegrativeplasmids,whichenablethedigestionofunusualsubstances,e.g.,toluyl(甲苯酰)orsalicylicacid(水楊酸).生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第21頁③Accordingtothecopynumberofaplasmidinthehostcell,plasmidscanbeclassifiedintotwogroups,thatisstringentplasmid(嚴緊型質(zhì)粒)andrelaxedplasmid(松弛型質(zhì)粒)④Onthebasisofcompatibility,plasmidscanbeclassifiedintoincompatibility(不相容性)andcompatibility(相容性)plasmids.生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第22頁3.噬菌體基因組(genomeofphage)
生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第23頁轉位因子
(Transposableelements
),又稱為轉座元件。不依賴于同源重組即可在細菌或其它生物基因組(如染色體、質(zhì)粒及噬菌體基因組)中改變本身位置獨特DNA序列,又稱為跳躍基因(jumpinggenesormovablegenes).1.定義二.細菌基因組中主要特殊結構生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第24頁麥克琳托克(McClintockB.)(1902-1992)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第25頁2.特點:(1)非同源重組(2)兩側存在重復序列、插入序列或tRNA.(3)
轉座依賴于其編碼轉座酶。①Intra-chromosome(A—B)②Betweenchromosomeandplasmid③Amongdifferentplasmidsorchromosome生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第26頁3.意義插入突變、基因重排或插入位點附近基因轉錄表示改變。ISH1geneH2geneH1flagellaH2flagella生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第27頁4.分類☆插入序列(Insertionsequence,IS)
☆轉座子(Transposon,Tn)☆整合子(integron,In)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第28頁(1)插入序列(Insertionsequence,IS)①定義
僅含轉座酶及轉錄調(diào)整蛋白編碼基因轉座元件,是細菌(也包含其它生物)基因組(包含染色體、質(zhì)粒及噬菌體)正常組分。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第29頁②結構特點
Ⅰ.兩側帶長度不一定相等反向重復序列,其中有3~10個bp為轉座酶識別位點。Ⅱ.中心序列僅編碼轉座酶及與轉錄相關調(diào)整蛋白。Ⅲ.插入序列轉座能夠是雙向,即可經(jīng)過正向或反向整合到基因組上。Ⅳ.可獨立存在,也能夠是轉座子一部分。Ⅴ.長度普通在2kbp以下。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第30頁(2)轉座子(Transposon,Tn)①定義除了兩端IS和攜帶轉座酶編碼基因及轉錄調(diào)整蛋白以外還攜帶有一個或多個其它基因(如耐藥基因、重金屬抗性基因等)轉位因子。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第31頁②結構特點Ⅰ.兩側帶IS。Ⅱ.中心序列除編碼轉座酶及與轉錄相關調(diào)整蛋白外,尚帶有其它基因如耐藥基因等。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第32頁③分類依據(jù)結構特點,轉座子能夠分為三類:☆復合型轉座子(Complextransposon)ISnISnAntibioticresistantgeneISnISnAntibioticresistantgeneIRIRIRIR生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第33頁☆Tn3系轉座子(Tn3transposon)IRIRTnpATnpRβ-LacThecentralseparatedarea☆接合型轉座子(Conjugativetransposon)存在于革蘭陽性球菌中,可經(jīng)過接合而轉移。無末端重復序列(正向或反向)。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第34頁常見插入序列及轉座子生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第35頁(3)整合子(integron,In):①定義整合子是一個運動性DNA分子,含有獨特結構可捕捉和整合外源基因,使之轉變?yōu)楣π曰虮硎締挝?。它?jīng)過轉座子或接合性質(zhì)粒,使多重耐藥基因在細菌中進行水平傳輸。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第36頁★ageneencodingforasite-specificintegrase:intI,belongingtothetyrosineintegrasefamily★aproximalrecombinationsite:attI,whichisrecognizedbytheintegraseandatwhichgenecassettesmaybeinserted★apromoter:Pc,whichdirectstranscriptionofcassette-encodedgenes②結構整合子結構包含兩端高度保守片斷5′CS和3′CS以及中間可變區(qū)??勺儏^(qū)含有一個或多個可插入基因盒。整合酶(intI)是整合子中一個功效元件。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第37頁※定位于細菌染色體、質(zhì)?;蜣D座子上※基本結構:兩端為保守末端,中間為可變區(qū),含一個或多個基因盒※整合子含有3個功效元件:重組位點;整合酶基
因;開啟子※經(jīng)過轉座子或接合性質(zhì)粒,使各種耐藥基因在細
菌中進行水平傳輸③特點生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第38頁整合子介導取得耐藥基因盒機制Theintegronmechanismofantibiotic-resistancegenecassetteacquisitionattC,基因盒重組位點;attI,整合子重組位點;Pant,基因盒表示開啟子;qac,季銨鹽類化合物耐藥基因;sul,磺胺類耐藥基因。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第39頁5、轉座元件轉座類型GeneshiftorrearrangementismediatedbyISorTn.Therearetwokindsoftransposition,i.e.replicativetransposition(復制型轉座),conservativetransposition(保守型轉座)。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第40頁ReplicativetranspositionAfterthetransposableelementswerereplicated,onecopymovestoanewposition,whiletheotherisleftinitsnormalposition
Conservativetransposition
Transposableelementsmovefromthenormalpositiontoanewposition生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第41頁生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第42頁ReplicativetranspositionAfterthetransposableelementswerereplicated,onecopymovestoanewposition,whiletheotherisleftinitsnormalpositionConservativetransposition
Transposableelementsmovefromthenormalpositiontoanewposition生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第43頁生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第44頁第二節(jié)細菌基因突變生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第45頁一、定義二、類型:點突變、插入突變、缺失突變等。三、細菌基因突變規(guī)律1.突變頻率Themutationalfrequencyofspontaneousmutation(自發(fā)突變)
isabout10-10~10-6,whilesomemutagencanincreasethemutationalfrequencywith10-1000times,thatistosaythatthemutationalfrequencyofinducedmutation(誘發(fā)突變)canreachto10-6~10-4.生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第46頁2.突變與選擇
★Is
mutationinducedbyenvironmentalfactor?
★Isittakeplaceatrandom,nondirectional?生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第47頁In1943and1952,LuriaandLederbergdesignedveryfamousexperimentsnamedfluctuationtest(彷徨試驗)andreplicaplating(影印培養(yǎng)),respectively,andtheresultofthesetwoexperimentsansweredtheabovequestionperfectly。
生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第48頁Fluctuationtest(彷徨試驗)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第49頁Theprincipleofreplicaplating生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第50頁Conclusion
A.Mutationistakeplacespontaneouslyandatrandom.B.Environmentalfactorssuchasantibioticsisnotthemotivationofmutation,theonlyfunctionofthesefactorsisselection.生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第51頁wildstrain
(野生株)mutantstrain(突變株)forwardmutationreversemutationMechanism:
inhibitinggenemutationistakeplaceinmutantstrain.Reversemutationcantakeplacespontaneouslyorbyinduce.3.回復突變(Reversemutation)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第52頁
Suppressormutationtakesplaceindifferentgene.TypesofreversemutationReversemutationIntragenicsuppressor
(基因內(nèi)抑制)
Extragenicsuppressor
(基因間抑制)Suppressormutationtakesplaceindifferentsiteofthesamegene.生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第53頁genotypemechanismstrainphenotypeBeforemutatinwildstrainsensitivePost-mutationmutantstrainresistant
Intragenicreversalmutantsensitivesuppressor
strainIdeographofreversemutationgenotype
Intergenicreversalmutantsensitivesuppressor
strain生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第54頁4.突變型細菌及其分離
自學自學思索題細菌有哪幾個常見基因突變型,其各自主要性狀分離方法是什么?生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第55頁第三節(jié)基因轉移與重組1.Basicconcept(1)
Genetransfer(基因轉移)orgeneexchange(基因交換)
TheprocessthatDNAtransferfromdonortorecipient.(2)Generecombination(基因重組)
TheprocessthatexogenousDNAintegratewiththechromosomeofplasmidoftherecipientcell,resultinthechangeofthegenotypeandbecomearecombinantbacteria.生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第56頁2.Themainwaysofgenetransferandrecombination:
※轉化(Transformation)※轉導(transduction)※接合(conjugation)※溶原性轉換(lysogenicconversion)※原生質(zhì)體融合(protoplastfusion)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第57頁(1)轉化
(Transformation)
①定義
受體菌直接攝取供體菌DNA片段而取得新遺傳性狀過程。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第58頁②肺炎鏈球菌轉化試驗1928,Griffith1944Avery生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第59頁生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第60頁③轉化機制生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第61頁④影響轉化原因Ⅰ.DNA大小DoublestrandedDNAofatleast5×105
daltonsworksbest.Inaddition,theconcentration,purityandconfigurationoftargetDNAcanalsoaffecttheprocessoftransformation.Ⅱ.供體菌與受體菌親緣關系生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第62頁Ⅲ.受體菌生理狀態(tài)SomebacteriaareabletotakeupDNAnaturally.However,thesebacteriaonlytakeupDNAataparticulartimeintheirgrowthcyclewhentheyproduceaspecificproteincalledacompetencefactor.Thebacteriaatthisstagearecalledcompetent.MostbacteriaarenotabletotakeupDNAnaturally.However,inthesebacteriacompetencecanbeinducedinvitrobytreatmentwithchemicals(e.g.CaCl2).生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第63頁Ⅳ.環(huán)境原因:Ca++,Mg++,cAMP等由于有利于維持DNA穩(wěn)定性,故含有促進轉化作用。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第64頁(2)接合(Conjugation)①定義
經(jīng)過性菌毛連接溝通,將遺傳物質(zhì)由供體菌轉給受體菌方式。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第65頁②F質(zhì)粒接合Ⅰ.F因子基本知識※功能——編碼性菌毛產(chǎn)生※復制方式——滾環(huán)復制或與宿主菌染色體整合而隨著宿主菌染色體復制而復制。※存在形式:
F+
菌——包含游離F質(zhì)粒細菌
Hfr菌——高頻重組菌
(highfrequencyrecombinant)F質(zhì)粒整合到宿主菌基因組中.
F’
菌——含有游離F’質(zhì)粒(F質(zhì)粒上整合了部分宿主基因組片段)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第66頁F-F+HfrF’ConjugatewithF+CuringIntegrateexcisionDeviationalexcisionCuringIntegrateConjugatewithF’Ⅲ.TransformofE.coliFplasmid生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第67頁Ⅳ.F質(zhì)粒接合類型☆F+×F-
接合生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第68頁☆
Hfr×F-接合生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第69頁☆
F’×F-接合生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第70頁(3)轉導(Transduction)①定義
由噬菌體介導,將供體菌DNA片段轉入受體菌,使受體菌取得供體菌部分遺傳性狀。生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第71頁②轉導類型Generalizedtransduction(普遍性轉導)TransductioninwhichpotentiallyanydornorbacterialgenecanbetransferredRestrictedtransduction
(不足轉導)
Transductioninwhichonlycertaindonorgenescanbetransferred生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第72頁Ⅰ.普遍性轉導(GeneralizedTransduction)Potentiallyanydonorgenecanbetransferred生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第73頁ThefateofexogenousDNAinGeneralizedTransductioni)Completetransduction(完全轉導)ii)Abortivetransduction(流產(chǎn)轉導):生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第74頁Ⅱ.不足轉導(Restrictedtransduction)
(LysogenicPhage)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第75頁Ⅲ.DifferencebetweengeneralizedtransductionandRestrictedtransduction(discuss)生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第76頁
GeneralizedRestrictedVectorTargetgeneTimeCausePseudophageDefectivephageAnydornorgeneCertaindonorgeneBacteriolysisphaseLysogenicphaseErrorassembleErrorexcision生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第77頁(4)溶原性轉換(LysogenicConversion)①定義溶原性轉換是指侵入細菌噬菌體在溶原期,以前噬菌體形式與細菌染色體發(fā)生重組,造成細菌基因發(fā)生改變。溶原性細菌可因之而取得新特征,如白喉桿菌、產(chǎn)氣莢膜桿菌和肉毒桿菌分別可因溶原性轉換而分別成為可產(chǎn)生白喉毒素、α毒素和肉毒素有毒株。
生物專業(yè)細菌的遺傳和變異第78頁②ExampleCorynebacteriumdiphtheriae
(Doesnotproducediphtheratoxin)β-corynebacteriapha
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