核酸、蛋白技術(shù)參數(shù)資料、分子量標(biāo)準(zhǔn)及常用試劑的配制_第1頁
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文檔簡介

核酸、白技術(shù)參數(shù)料、分量標(biāo)準(zhǔn)及常試劑的制一、核酸及蛋白質(zhì)常用數(shù)據(jù)1.苷三磷酸的物理常數(shù)化合物ATPCTPGTPUTPdATPdCTPdGTPdTTP

分子量507483523484494467507482

λmax(pH7.0)259271253262259271253267

1摩溶液()max的最大吸收值1540090001370010000152009300137009600

OD280/OD2600.150.970.660.380.150.980.660.71核酸λDNApBR32228SrRNA23SrRNA18SrRNA19SrRNA5SrRNA

2.常用核酸的長度與分子量核苷酸數(shù)48502(雙鏈環(huán)狀)4363(鏈)4800370019001700120

分子量3.0×1072.8×1061.6×1061.2×1066.1×1055.5×1053.6×104

tRNA(大腸桿菌)752.5×1043.用核酸蛋白換算數(shù)據(jù)()量換算1μg=10-6g1pg=10-12g1ng=10-9g1fg=10-15g()光光度算:1A260雙鏈DNA=50μg/ml1A260單DNA=30g/ml1A260單RNA=40μg/ml()DNA摩換算:1μg100bpDNA=1.52pmol=3.03pmol末端μgpBR322DNA=0.36pmol1pmol1000bpμg1pmolpBR322=2.8g1kb雙(鈉鹽道爾頓1kb單鏈DNA(鹽)=3.3×105道頓單鏈(鈉鹽)=3.4×105道頓()蛋白摩爾換算:100pmol分量100蛋白質(zhì)=10μg100pmol分量,000蛋白質(zhì)5μg100pmol分量,000蛋白=1μ

氨基酸的平均分子量126.7道爾頓()白質(zhì)換:1kbDNA=333個氨基酸編碼容量=04MW蛋白質(zhì)10,000MW蛋質(zhì)270bp30,000MW蛋白=810bpDNA50,000MW蛋白質(zhì)=1.35kb100,蛋白=2.7kbDNA4.常用蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)參照物()分子量標(biāo)準(zhǔn)參照

()分子量標(biāo)準(zhǔn)參照

()分子量標(biāo)準(zhǔn)參照肌球蛋白肌球蛋白β-半糖甘酶B磷酸化酶B牛血清白蛋白

分子量212,000116,00097,40066,200

磷酸化酶B牛血清白蛋白谷氨酶脫氫酶卵白蛋白醛縮酶

97,66,55,42,40,

碳酸酐酶大豆脻蛋白酶抑制劑馬心肌球蛋白溶菌酶

31,0021,16,14,過氧化氫酶醛縮酶

57,00040,000

碳酸酐酶大豆脻蛋白酶

31,21,

肌球蛋白(F1)8,100肌球蛋白(F2)6,200抑制劑

肌球蛋白(F3)2,500溶菌酶

14,5.用DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)參照物λDNA/HindⅢ

λDNA/EcoRⅠ

λ/HindⅢ+EcoRⅠpBR322/HaeⅢ

2313094166557436123222027564125

2122674215804564348433530

2122751484973426835302027190415841375974831

587405504458434267234213192184124

12310489806457512118117564125常用抗生素溶液貯存液

工作濃度抗生素氨芐青霉素羧芐青霉素氯霉素卡那霉素鏈霉素四環(huán)素b

濃度50mg/ml(溶于水)50mg/ml(溶于水)34mg/ml(溶于乙醇)10mg/ml(溶于水)10mg/ml(溶于水)5mg/ml(溶于乙)

保存條件-20℃-20℃-20℃-20℃-20℃-20℃

嚴(yán)緊型質(zhì)粒20μg/ml20μg/ml25μg/ml10μg/ml10μg/ml10μg/ml

松弛型質(zhì)粒60μg/ml60μg/ml170g/ml50μg/ml50μg/ml50μg/mla:以水為溶劑的抗生素貯存液通過0.22μm濾器過濾除菌。以乙醇為溶劑的抗生素溶液無須除菌處理。所有抗生素溶液均應(yīng)放于不透光的容器保存。b:鎂離子是四環(huán)素的拮抗劑,四環(huán)素抗性菌的篩選應(yīng)使用不含鎂鹽的培養(yǎng)基(如LB培基)。

五、常用貯存液的配制1.30%丙烯酰胺液【制方法】

將29g丙酰胺和N’亞甲雙丙烯酰胺溶于總體積為60ml的水熱至37溶解之加水至終體積為100ml。

用Nalgene濾(0.45μm孔徑)過濾除菌,查證該溶液的pH值不大于7.0,置棕色瓶中保存于室溫。【注意】

丙烯酰胺具有很強(qiáng)的神經(jīng)毒性并可以通過皮膚吸收,其作用具累積性。稱量丙烯酰胺和亞甲雙丙烯酰胺時應(yīng)戴手套和面具。可認(rèn)為聚丙烯酰胺無毒,但也應(yīng)謹(jǐn)慎操作,因為它還可能會含有少量未聚合材料。

一些價格較低的丙烯酰胺和雙丙烯酰胺通常含有一些金屬離子,在丙烯酰胺貯存液中加入大約0.2體的單床混合樹脂MB-1Mallinckrodt)攪拌過夜,然后用Whatman1號紙過濾以純化之。

在貯存期間,丙烯酰胺和雙丙烯酰胺會緩慢轉(zhuǎn)化成丙烯酰和雙丙烯酸。2.40%丙烯酰胺【配制方法】

把380g丙烯酰胺(DNA測序)和20g,N亞甲雙丙烯酰胺溶于總體積為600ml的蒸餾水中繼按上述配制30%烯酰胺溶液的方法處理但加熱溶解后應(yīng)以蒸餾水補(bǔ)足至終體積為1L?!疽狻?/p>

見上述配制丙酰胺的說明40%烯酰胺溶液用于DNA序測定。3放線菌素D液【制方法】

把20mg放菌素D溶于4ml乙中110釋貯存液,用100%乙作空白對照讀取OD440值放線菌素D(分子量為1255)純在水溶液中的摩爾消化系數(shù)為21,900,而1mg/ml的放線菌素溶液440nm處吸值為0.182線菌素D的存液應(yīng)放在包有箔片的試管中,保存于20℃。【意

放線菌素D是畸和致癌劑,制該溶液時必須戴手套并在通風(fēng)櫥內(nèi)操作,而不能在開放在實驗桌面上進(jìn)行,謹(jǐn)防吸入藥粉或讓其接觸到眼睛或皮膚。

藥廠提供的作治療用途的放線菌素品常含有糖或鹽等添加劑。只要通過測量貯存液在440nm波長的吸收確定放線菌素D的濃度,這類制品便可用于抑制自身引導(dǎo)作用。4.0.1mol/L腺三磷酸ATP溶液【配制方法】

在0.8ml水中溶解60mgATP,用0.1mol/LNaOH至pH值至7.0用蒸餾水定容1ml,分裝成小份保存于70℃510mol/L乙酰液【配制方法】

把770g乙酸酰溶解于800ml水中,加水定容至1L后濾除菌6.10%硫酸銨溶液【制方法】

把1g過硫酸銨溶解于終量為10ml的水溶液中液可在4保存數(shù)周。7溶【制方法】

把的5-溴-4-氯3-吲哚磷二鈉鹽BCIP)溶解于10ml100%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃8緩沖鹽溶液【配制方法】

用總體積90ml的蒸餾水溶解1.07g鹽液BES[N,N-(2-羥乙基-2-基乙磺酸、1.6gNaCl和0.027gNa2HPO4,溫下用HCl調(diào)節(jié)該液的pH值至6.96、后加入蒸餾水定容至,0.22m器過濾除菌,分裝成小份,保存-20℃。.1mol/LCaCl2溶【配制方法】

在200ml蒸餾水中溶解54gCaCl2·6H2O用μm濾過濾除菌,分裝成10ml小貯存于20℃?!疽狻?/p>

制備感受態(tài)細(xì)胞時,取出一小份解凍并用蒸餾水稀釋至100mlNalgene濾0.45μm徑除菌驟至0℃。102.5mol/LCaCl2溶【制方法】

在20ml蒸水中溶解13.5g,用0.22μm濾器過濾除菌成1ml小貯存-20。硫蘇糖【制方法】

用20ml0.01mol/L乙鈉溶液pH5.2溶解3.09gDTT過濾除菌后分裝成1ml小貯存于20℃。【意】或含有DTT溶液不能進(jìn)行高壓處理。12氧核苷三磷酸(dNTP)溶液【制方法】

把每一種溶于水至濃度為

100mmol/L左,用微量移液器取0.05mol/lTris堿別調(diào)節(jié)每一dNTP溶的pH值7.0(用pH試紙檢測),把中和的每種dNTP溶液各取一份作適當(dāng)稀釋,在下表中給出的波長下讀取光密度計算出每種dNTP的實濃度,然后用水稀釋成終濃度為50mmol/L的dNTP,裝成小份貯存于-70℃堿基AGCT

波長()259253271260

消化系數(shù)(ε[L/(mol·cm)]1.54×1041.37×1049.10×1037.40×103比色杯光徑為1cm時吸光度εM13.0.5mol/lEDTA(pH8.0)液【配制方法】

在水加入186.1g二水二胺四乙酸二鈉EDTA-Na·2H2O)在磁力攪拌器上劇烈攪拌,用NaOH調(diào)節(jié)溶液的pH值至(約需20gNaOH顆粒)然后定容至1L,分裝后高壓滅菌備用?!疽狻縀DTA鈉鹽需加入將液的pH值至接近8.0,才能完全溶解。14.化乙錠10mg/ml溶)【制方法】

在100ml水中加入1g溴化錠,磁力攪數(shù)小時以確保其完全溶解,然后用鋁箔包裹容器或轉(zhuǎn)移至棕色瓶中,保存于室溫。【意】

小心:溴化乙錠是強(qiáng)誘變劑并有中度毒性,使用含有這種染料的溶液時務(wù)必戴上手套,稱量染料時要戴面罩。15.2×HEPES緩鹽溶液【制方法】

用總量為的餾水溶解1.6g、KCl0.027gNa2PO4·2H2O、0.2g葡糖和1gHEPES,0.5mol/l調(diào)節(jié)pH值7.05,再用蒸餾水定容至100ml用0.22m濾器過濾除菌分裝成5ml小貯存于20℃。16IPTG溶液【制方法】為異丙基硫-β-D-半乳苷(分子量為238.3)在8ml蒸餾水中溶解2gIPTG后,用蒸水定容至,用0.22μ濾器過濾除菌,分裝成1ml小份貯存于20℃。.乙酸鎂溶液【配制方法】

在800ml水溶解214.46g四乙酸鎂,用水定容至過濾菌。18.1mol/LMgCl2溶【制方法】

在水溶解203.4gMgCl2·6H2O,用水定容至1L分裝成小份并高壓滅菌備用?!疽狻縈gCl2極易潮解,應(yīng)選購小瓶(如100g)試劑,啟用新瓶后勿長期存放。19.β-巰基乙醇BME溶液【配制方法】

一般得到的是14.4mol/L溶液應(yīng)在棕色瓶中保存于4。【注意】或含有BME的液不能高壓處理。20.NBT溶液【制方法】

把0.5g氯氮藍(lán)四唑溶解于10ml70%二甲基甲酰胺中,保存于4℃。21.酚/仿溶液【配制方法】

把酚和氯仿等體積混合后用0.1mol/LTris·HCl(pH7.6)抽幾次以平衡這一混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆蓋等體積的0.01mol/lTris·HCl(pH7.6)層,保存于℃。【意】

酚腐蝕性很強(qiáng),并可引起嚴(yán)重灼傷,操作時應(yīng)戴手套及防護(hù)鏡,穿防護(hù)服。所有操作均應(yīng)在化學(xué)通風(fēng)櫥中進(jìn)行。與酚接觸過的部位皮膚應(yīng)用大量的水清洗,并用肥皂和水洗滌,忌用乙醇。

22.10mmol/L苯基磺酰氟(PMSF溶液【配制方法】

用異丙醇溶解PMSF成1.74mg/ml(10mmol/L)分裝成小份貯存20℃。如有必要可配成濃度高達(dá)17.4mg/ml的貯存液100mmol/L?!疽狻縋MSF嚴(yán)損害呼吸道粘膜眼及皮膚,吸入、吞進(jìn)或通過皮膚吸收后有致命危險旦眼睛或皮膚接觸了PMSF應(yīng)立即用大量水沖洗之。凡被PMSF污的衣物應(yīng)予丟棄PMSF水溶液中不穩(wěn)定應(yīng)使用前從貯存液中現(xiàn)用現(xiàn)加于裂解緩沖液中PMSF在水液中的活性喪失速率隨pH值的高而加快,且25℃的失活速率高于4℃。值為8.0時20μmmol/lPMSF溶液的半壽期大約為85min,這表明將PMSF溶液調(diào)節(jié)為性pH>8.6)并在室溫放置數(shù)小時后,可安全地予以丟棄。23.酸鹽緩沖溶液(PBS)溶【制方法】

在蒸水中溶解8gNaCl、0.2gKCl、1.44gNa2HPO4和0.24gKH2PO4,用HCl節(jié)溶液的pH值至加定容至1L,15lbf/in2(1034×105Pa)壓下蒸氣滅菌20min保存于室溫。.乙酸鉀(pH7.5)液【制法】

將9.82g乙鉀溶解于90ml純中,用2mol/L乙酸調(diào)節(jié)pH值7.5后入純水定容到1L,保存-20。.酸鉀溶液(用于堿裂解)【配制方法】

在60ml5mol/L乙鉀溶液中加11.5ml冰乙酸和28.5ml水,即成鉀濃度為3mol/L而酸根濃度為5mol/L的溶液。263mol/L乙酸鈉(pH5.2和pH7.0)液【制方法

在80ml水溶解408.1g三乙鈉,用冰乙酸調(diào)節(jié)pH值至5.2或用稀乙酸調(diào)節(jié)pH值至7.0定到1L后高壓滅菌。27NaCl溶【制方法】

在800ml水溶解NaCl水定容至1L分裝后高壓滅菌。28.10%十二烷基酸鈉(SDS)液【制方法】

在900ml水溶解100g電泳級SDS,加熱至68助溶,加入幾滴濃鹽酸調(diào)節(jié)溶的pH值7.2,加水定容至1L,分裝備用?!疽獾奈⒓?xì)晶粒易擴(kuò)散,因此稱量時要戴面罩,稱量完畢后要清除殘留在稱量工作區(qū)和天平上的SDS10%SDS溶無須滅菌。29溶液【制方法】

在800ml水溶解175.3gNaCl和88.2g檬酸鈉,加入數(shù)滴10mol/l溶調(diào)節(jié)pH值至加水定容至1L分裝后高壓滅菌。.20×SSPE溶液【制方法】

在800ml水溶解17.5gNaClNaH2PO4·H2O7.4gEDTA,用NaOH溶液調(diào)節(jié)pH值7.4(需6.5ml10ml/LNaOH,加水定容至1L,分裝后高壓滅菌。31100%三乙酸溶【制方法】

在裝有TCA的瓶中加入227ml水,形成的溶液含有100%()TCA321mol/LTris溶液【制方法】

在800ml水溶解121.91g堿,加入濃HCl調(diào)pH值至需值。pHHCl7.470ml7.660ml8.042ml

應(yīng)使溶液冷至室溫后方可最后調(diào)定值,水定容至1L,分裝后高壓滅菌?!咀⒁狻?/p>

如溶呈現(xiàn)黃色,應(yīng)予丟棄并置備質(zhì)量更好的Tris

盡管多種類型的電極均不能準(zhǔn)確測量Tris液的pH值,但仍可向大多數(shù)廠商購合適的電極。Tris溶的pH值溫度而異,溫度每升高1℃,值大約降低個單位。例如0.05mol/L的液在5℃、25℃、和37℃的值分為9.5和。33緩沖鹽溶TBSTris)【配制方法】

在800ml蒸餾中溶解8gNaCl0.2gKCl和3g堿,加入0.015g酚

用HCl調(diào)至pH值7.4,用蒸水定容至,分裝后在151bf/in2(1.034×105Pa)高下蒸汽滅菌20min,室溫保存。34X-gal溶【配制方法】X-gal為5-溴4-氯3-吲哚β-D半糖苷。用二基甲酰胺溶解X-gal配成的20mg/ml的存液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中,裝有溶液的試管須用鋁箔封裹以防因受光照而被破壞,并應(yīng)貯存于-20℃。X-gal溶液無過濾除菌。試劑Denhardt試劑

雜交試驗中用于降低背景的封閉劑用途Northern雜使用RNA探的雜交單拷貝序列的Southern雜交將DNA固于尼龍膜上的雜交Denhardt試通常配制50×貯液,過濾后保存20℃??蓪⒃撡A存液10倍稀于預(yù)雜交液(常為含有0.5%SDS和100μ經(jīng)變性被打斷的鮭精DNA的6×SSC6×SSPE)中。50×Denhardt液含5g聚蔗Ficoll,400型Pharmacia)5g聚烯吡咯烷酮和5g牛清白蛋白(組分V”Sigmal),加水至終體積為500

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