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文檔簡(jiǎn)介
多重耐藥銅綠假單胞菌β-內(nèi)酰胺類相關(guān)耐藥基因研究【摘要】目的調(diào)查我院2005年臨床分離多重耐藥銅綠假單胞菌(PA)的耐藥性分析并探討其耐藥基因的存在狀況。方法對(duì)31株臨床分離的銅綠假單胞菌用紙片擴(kuò)散法檢測(cè)其藥敏表型,采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)法檢測(cè)β-內(nèi)酰胺酶編碼基因和外膜通道蛋白OprD2基因,并與相關(guān)藥敏表型比較。結(jié)果31株銅綠假單胞菌對(duì)16種抗菌藥物的耐藥率為48.4%~100%;β-內(nèi)酰胺酶編碼基因PER、VIM、CARB、IMP、TEM、OXA-10的檢出率分別為6.4%、3.2%、3.2%、3.2%、3.2%、3.2%,未檢出GES、SHV、VER基因,31株外膜通道蛋白OprD2基因缺失,檢出率為100%。結(jié)論本院多重耐藥銅綠假單胞菌對(duì)β-內(nèi)酰胺酶類抗生素的耐藥主要與外膜通道蛋白OprD2基因缺失有關(guān)。
【關(guān)鍵詞】銅綠假單胞菌;多重耐藥;β-內(nèi)酰胺酶;聚合酶鏈反應(yīng);基因型
【Abstract】ObjectiveTosurveythedistributionofaminoglycoside-modifyingenzymegenesinmultidrug-resistantpseudomonasaeruginosaisolatedinourhospitalin2005.MethodsTheantibioticsusceptibilityof31differentantibioticsofwastestedbyK-Bmethod,and31multi-drugresistantstrainswerescreened;β-lactamasegenesandtheoutermembraneproteinOprD2geneweredetectedbypolymerasechainreaction(PCR).ResultsResistantratesof31strainsofagainst16kindsofantibioticrangedfrom48.4%to100%;thedetectionrateofβ-lactamasegenePER,VIM,DHA,IMP,TEMandOXA-10was6.4%,3.2%,3.2%,3.2%,3.2%and3.2%respectively,andnoneofthe31strainspossessedgenesofGES,SHVandVER,31isolateofPAlosttheoutermembraneproteinOprD2Resistancetoβ-lactamcompoundsinofourhospitalisrelatedtolosttheoutermembraneprotein.
【Keywords】Pseudomonasaeruginosa;Multidrugresistance;β-Lactamases;Polymerasechainreaction;Genes
銅綠假單胞菌(pseudomonasaeruginosa,PA)是一種重要的條件致病菌,常常引起呼吸道感染、菌血癥、肺炎、泌尿系統(tǒng)感染、燒傷感染和囊性纖維化繼發(fā)感染等多種疾病。2002年全國(guó)細(xì)菌耐藥性監(jiān)測(cè)網(wǎng)調(diào)查顯示:PA的分離率為10.3%,僅次于大腸埃希菌而居第二位[1]。由于臨床上抗生素的大量使用,銅綠假單胞菌呈現(xiàn)出天然或獲得性多重耐藥性(multidrugresistance,MDR),給治療造成困難。近年來(lái),銅綠假單胞菌對(duì)3、4代頭孢和亞胺培南在內(nèi)的多種β內(nèi)酰胺類抗生素及氨基糖苷類抗生素耐藥率一直處于一個(gè)比較高的水平,并呈現(xiàn)逐年上升的趨勢(shì)[1-3]。為了解臨床分離多重耐藥的PA中耐藥情況,收集了本院2005年1~12月臨床分離的31株P(guān)A,對(duì)其進(jìn)行耐藥性的檢測(cè),并采用分子生物學(xué)技術(shù)檢測(cè)其耐藥相關(guān)基因,結(jié)果報(bào)告如下。
1材料
1.1菌株來(lái)源于本院2005年1~12月臨床分離的多重耐藥銅綠假單胞菌(MDRP)31株。所有標(biāo)本均采用法國(guó)生物梅里埃公司細(xì)菌鑒定儀鑒定菌種。
1.2質(zhì)控菌株大腸埃希菌ATCC25922、銅綠假單胞菌ATCC27853均購(gòu)自衛(wèi)生部臨床檢驗(yàn)中心。
1.3MH培養(yǎng)基采用英國(guó)Oxoid公司產(chǎn)品。
1.4抗生素及藥敏紙片頭孢他啶(30μg/片,CAZ)、頭孢曲松(30μg/片,CRO)、亞胺培南(10μg/片,IMP)、克拉維酸(2mmol/L,CA)、氯唑西林(2mmol/L)、美羅培南(10μg/片,MER)、2-巰基丙酸紙片均購(gòu)自英國(guó)Oxoid公司。
1.5微生物鑒定系統(tǒng)VITEK-32法國(guó)生物梅里埃公司產(chǎn)品。
1.6儀器DNA擴(kuò)增儀為美國(guó)PE公司產(chǎn)品。
1.7PCR檢測(cè)試劑盒由無(wú)錫市克隆遺傳技術(shù)研究所提供。
2方法
2.1細(xì)菌培養(yǎng)、鑒定和保存細(xì)菌培養(yǎng)根據(jù)臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程按常規(guī)方法進(jìn)行,采用VITEK-32全自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)鑒定結(jié)果;將細(xì)菌接種于半固體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)24h后置-80℃冰箱保存,以備進(jìn)行分子學(xué)檢測(cè)。
2.2抗生素敏感試驗(yàn)采用紙片擴(kuò)散法(K-B法),結(jié)果根據(jù)美國(guó)臨床實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化委員會(huì)(NCCLS)2004年版標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行判斷。
2.3PCR擴(kuò)增模板制備挑取菌落置入含100μl生理鹽水的0.5ml離心管內(nèi),15000轉(zhuǎn)/min離心5min,去上清。加0.05%非離子去污劑NP4050μl、200ng/ml的蛋白酶K2μl混勻,55℃水浴1h,然后95℃水浴5min,最后10000轉(zhuǎn)/min離心30s,取上清做PCR擴(kuò)增的模板。
2.4基因檢測(cè)均為PCR法。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物500bp熱循環(huán)參數(shù)均為:93℃預(yù)變性2min,然后93℃60s→55℃60s→72℃60s,循環(huán)35個(gè)周期,最后一個(gè)72℃延長(zhǎng)至5min,其余均為:93℃預(yù)變性2min,然后93℃30s→55℃30s→72℃60s,循環(huán)35個(gè)周期,最后一個(gè)72℃延長(zhǎng)至5min。各種靶基因的目的產(chǎn)物長(zhǎng)度見表1。
2.5擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物在1.5%瓊脂糖凝膠(含0.5μg/ml溴化乙錠)120V電泳30~40min,全自動(dòng)凝膠圖像成像儀觀察,出現(xiàn)與陽(yáng)性模板分子量相同的條帶即為陽(yáng)性,PCR檢測(cè)陽(yáng)性對(duì)照DNA,由無(wú)錫市克隆遺傳技術(shù)研究所微生物DNA收集與保存室提供,擴(kuò)增條件同上。
3結(jié)果
3.1藥敏試驗(yàn)結(jié)果31株銅綠假單胞菌對(duì)16種抗菌藥物的藥敏率見表2。
3.2基因檢測(cè)結(jié)果β內(nèi)酰胺酶編碼基因PER、VIM、CARB、IMP、TEM、OXA-10的檢出率分別為6.4%、3.2%、3.2%、3.2%、3.2%、3.2%,未檢出GES、SHV、VER基因,31株外膜通道蛋白OprD2基因缺失,檢出率為100%。
4討論
研究發(fā)現(xiàn),PA對(duì)β內(nèi)酰胺類抗生素存在多種耐藥機(jī)制,如外膜滲透性降低、泵出機(jī)制、由染色體編碼持續(xù)高產(chǎn)AmpC酶、產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰胺酶以及能水解卡巴培能碳?xì)涿赶┑慕饘倜傅?。IMP是目前用于治療革蘭陰性桿菌感染具有最強(qiáng)抑菌效能的抗生素,對(duì)產(chǎn)ESBLs及AmpC酶的革蘭陰性桿菌均有效。IMP耐藥的PA在臨床上具有更大的危險(xiǎn)性。
近年來(lái)隨著研究的深入,國(guó)內(nèi)外學(xué)者在PA菌臨床分離株中發(fā)現(xiàn)了多種β內(nèi)酰胺酶和碳青霉烯酶基因如TEM、SHV[6,7]、OXA、VEB-1、PER[8,9]、GES、持續(xù)高產(chǎn)AmpC酶、IMP[10]、VIM[11]、SPM[12]等。在我國(guó)上海、杭州、石家莊、溫州相繼發(fā)現(xiàn)了VEB-1、OXA-10、IMP、PER-1、TEM-1、SHV基因[6,8,10]。這些基因所表達(dá)的產(chǎn)物可以水解青霉素類、頭孢菌素類、單酰胺類和碳青霉烯類抗生素。
本組菌株中,表型耐亞胺培南的共31株(占100%),其中外膜通道蛋白OprD2基因缺失為100%;VIM、IPM基因各發(fā)現(xiàn)1株,各占3.2%。PA對(duì)亞胺培南耐藥的主要原因?yàn)楫a(chǎn)IMP、VIM、SPM、GIM型金屬β-內(nèi)酰胺酶、GES-2型β-內(nèi)酰胺酶和外膜蛋白OprD2缺失等。β內(nèi)酰胺類抗生素對(duì)PA的作用靶位是細(xì)菌內(nèi)膜上的PBP2,該類藥物要達(dá)到其作用靶位必須首先經(jīng)過(guò)外膜通道進(jìn)入周漿間隙。如果菌株外膜蛋白通道減少或缺失,藥物難以到達(dá)其作用靶位,細(xì)菌將產(chǎn)生耐藥。因此,OprD2被認(rèn)為是亞胺培南擴(kuò)散的通道[11]。VIM、IMP是金屬β-內(nèi)酰胺酶,可快速水解青霉素類、頭孢菌素類和碳青酶烯類抗菌藥物。通過(guò)本組實(shí)驗(yàn)研究可以表明PA對(duì)亞胺培南耐藥的主要原因是特異性通道OprD2缺失引起外膜通透性降低,從而阻礙抗菌藥物進(jìn)入菌體內(nèi)到達(dá)細(xì)菌作用靶位。
OXA、TEM、SHV、PER、GES陽(yáng)性均可引起PA對(duì)β內(nèi)酰胺酶類抗菌藥物的廣泛耐藥。本組菌株中PER的陽(yáng)性率為6.4%,TEM、OXA-10的陽(yáng)性率為3.2%,而GES、SHV基因未檢出,這些基因的陽(yáng)性率與國(guó)內(nèi)其他地區(qū)的檢測(cè)結(jié)果有差別[6,8,10]。導(dǎo)致此種結(jié)果出現(xiàn)的原因應(yīng)與本地區(qū)抗菌藥物的使用情況有密切關(guān)系。
總之,PA的耐藥機(jī)制極為復(fù)雜,它對(duì)某一類抗菌藥物的耐藥往往不是由單一因素造成,而常是幾種機(jī)制協(xié)同作用的結(jié)果;它對(duì)不同抗菌藥物的耐藥機(jī)制也不完全相同,并不斷有新的耐藥機(jī)制出現(xiàn)。即使是同一種菌不同地區(qū)、不同時(shí)期其耐藥性和耐藥基因狀況也不相同。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明聊城地區(qū)的PA對(duì)各類抗菌藥物均有不同程度的耐藥性,且耐藥基因陽(yáng)性率較有報(bào)道的國(guó)內(nèi)其他地區(qū)高。OprD2基因缺失應(yīng)該是本組菌株耐藥的主要原因,此情況應(yīng)引起臨床醫(yī)生和院內(nèi)感染科的高度重視,但也不排除同時(shí)存在其他耐藥機(jī)制的可能,有待進(jìn)一步研究。
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