比較基因組學(xué)原理及應(yīng)用教學(xué)課件

比較基因組學(xué)原理及應(yīng)用成員:韓柳閻永偉黃繼馬壽光朱琳姜南李春麗比較基因組學(xué)相關(guān)概念韓柳基因組學(xué)概念及范疇基因組(genome)泛指一個(gè)有生命體、病毒或細(xì)胞器的全部遺傳物質(zhì);在真核生物,基因組是指一套染色體(單倍體)DNA?；蚪M學(xué)genomics)就是發(fā)展和應(yīng)用DNA制圖、測(cè)序新技術(shù)以及計(jì)算機(jī)程序,分析生命體(包括人類)全部基因組結(jié)構(gòu)及功能?；蚪M學(xué)概念亞領(lǐng)域內(nèi)容結(jié)構(gòu)基因組學(xué)整個(gè)基因組的遺傳制圖、物理制圖及DNA測(cè)序。功能基因組學(xué)認(rèn)識(shí)、分析整個(gè)基因組所包含的基因、非基因序列及其功能比較基因組學(xué)比較不同物種的整個(gè)基因組,增強(qiáng)對(duì)各個(gè)基因組功能及發(fā)育相關(guān)性的認(rèn)識(shí)比較基因組學(xué)概定義:比較基因組學(xué)(Comparativegenomics)是基于基因組圖譜和測(cè)序基礎(chǔ)上,對(duì)已知的基因和基因組結(jié)構(gòu)進(jìn)行比較,來了解基因的功能、表達(dá)機(jī)理和物種進(jìn)化的學(xué)科·研究內(nèi)容:種間的比較基因組學(xué)和種內(nèi)的比較基因組學(xué)細(xì)菌基因組H能腸桿菌39個(gè)物種釀酒酵母其它基因組線蟲果蠅擬南芥遺傳圖微星SNPs小物理圖轉(zhuǎn)錄圖ESTS全長cDM序列圖預(yù)測(cè)序遺傳圖微星SNP物理圖全長cDNM轉(zhuǎn)錄圖預(yù)測(cè)序15%2工作草圖9O%,全長00序列圖第22號(hào)染色體第21號(hào)染色體概念工具:1、FASTA2、BLAST3、CLUSTALW基因組分類:1、通過比較確知其功能的。2、在數(shù)據(jù)庫中有相匹配的蛋白,但不知道其功能。3、在現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫中找不到任何相匹配的蛋白質(zhì)序列的新基因?；就瓿蒁NA序列分析的真核生物基因組比較物種完成總長度已完成總長占常染色質(zhì)基因數(shù)年份/M的百分?jǐn)?shù)/%百分?jǐn)?shù)/Mb/hb酵母20191293100483線蟲20199699100197果蠅200011697117擬南芥200011592100221人類第21染色體20003475100人類第22染色體20193470人類全基因組201926938412(PublicSequence)人類全基因組201926548399-9315(CeleraSequence部分真核、原核生物基因組成成份分析(A)人類v29TRYTRYmmnmttmnnnmmnh聞■■應(yīng)n,甲3)醉母50Ib■國D)大腸桿菌dnakcarBsokbKEY外顯子假基因■重復(fù)序列通過基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行比較基因組學(xué)研究例子尿殖道支原體帶有已知最小的基因組,可依此確定能自我復(fù)制的細(xì)胞必需的一套最少的核心基因流感嗜血桿菌的基因組為1.