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圖位克?。哼z傳學的經典策略孔忠新2012.05.21圖位克?。哼z傳學的經典策略孔忠新圖位克隆的定義:圖位克隆(Map-basedcloning)又稱定位克隆(positionalcloning),用該方法分離基因是根據(jù)目的基因在染色體上的位置進行的,無需預先知道基因的DNA順序,無需預先知道其表達產物的有關信息。圖位克隆的定義:圖位克隆(Map-basedcloning用該方法分離基因是根據(jù)功能基因在基因組中都有相對穩(wěn)定的基因座,再利用分子標記技術對目的基因進行精確定位的基礎上,用與目的基因緊密連鎖的分子標記篩選DNA文庫,從而構建目的基因區(qū)域的物理圖譜,再利用此物理圖譜通過染色體步移逐步逼近目的基因或通過染色體登陸的方法,最終克隆目的基因并通過遺傳轉化實驗可以研究目的基因的功能。圖位克隆的原理:用該方法分離基因是根據(jù)功能基因在基因組中都有相對穩(wěn)定的基因座1.建立目的基因的遺傳分離群體2.找到與目的基因緊密連鎖的分子標記3.用遺傳圖或物理作圖將目的基因定位在染色體特定位置4.構建含有大插入片段的基因組文庫5.以與目的基因連鎖的分子標記為探針篩選基因組文庫6.用陽性克隆構建目的基因區(qū)域的重疊群7.通過染色體步移或登陸,獲得含有目標基因的大片段克隆8.通過亞克隆獲得目標的小片段克隆9.測序獲得候選基因堿基序列10.通過遺傳轉化和功能互補驗證,最終確定目標基因的功能。圖位克隆的一般流程:1.建立目的基因的遺傳分離群體圖位克隆的一般流程:標記1基因標記2標記1基因標記223456BAC重疊群
BAC重疊群
12345初步定位
精細定位6標記1基因標記2標記1基因標記223456BAC重疊群BA實驗七-基因的圖位克隆技術ppt課件親本1親本2XF1123456789100geneF2親本1親本2XF1123456標記1基因標記2標記1基因標記22345612初步定位
精細定位2cM1.2cM0.02cM0.01cM標記1基因標記2標記1基因標記22345612初步定位精細標記1基因標記22BAC重疊群
BACClone基因1基因2基因3基因4基因5基因6基因7標記1基因標記22BAC重疊群BACClone基因1基基因1基因2基因3基因4基因5基因6基因7轉基因突變體單倍型分析序列-功能基因1基因2基因3基因4基因5基因6基因7轉基因突變體單倍型1、需要有精確的遺傳圖譜;2、遺傳圖譜上離目的基因很近的分子標記在物理圖譜上還
相距甚遠;3、高等植物基因組極其復雜,存在大量重復序列,在實際操作中會遇到
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