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生物醫(yī)學(xué)信號處理
BiomedicalDigitalSignalProcessing生物醫(yī)學(xué)信號處理
BiomedicalDigit《生物醫(yī)學(xué)信號處理》課程第一章生物醫(yī)學(xué)信號概論《生物醫(yī)學(xué)信號處理》課程第一章生物醫(yī)學(xué)信號概論第一章生物醫(yī)學(xué)信號概論1.1課程背景課程相關(guān)的科學(xué)生物醫(yī)學(xué)處理課程定位與學(xué)習(xí)目的課程的特點課程內(nèi)容與學(xué)時安排課程學(xué)習(xí)方法考核辦法1.2信號及其類型1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介第一章生物醫(yī)學(xué)信號概論1.1課程背景1.1課程背景–相關(guān)學(xué)科
生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)科
是應(yīng)用工程技術(shù)的理論和方法,研究解決生物學(xué)和醫(yī)學(xué)中的問題,是一個涉及生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、理工等多個領(lǐng)域的交叉性學(xué)科,它對生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的發(fā)展起到了極大的推動作用。
工程科學(xué)與技術(shù)生命科學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程1.1課程背景–相關(guān)學(xué)科工程科學(xué)與技術(shù)生命科學(xué)生生物醫(yī)學(xué)工程發(fā)展歷程1895年:X射線之父-倫琴倫琴夫人的手指倫琴的實驗室生物醫(yī)學(xué)工程發(fā)展歷程1895年:X射線之父-倫琴倫琴夫人的生物醫(yī)學(xué)工程歷程BME創(chuàng)始人-黃家駟院士國內(nèi):1977年:協(xié)和醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)成立1980年:中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會正式成立1978年:生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)學(xué)科組成立生物醫(yī)學(xué)工程興起于20世紀50年代美國1958年在美國成立了國際醫(yī)學(xué)電子學(xué)聯(lián)合會1965年該組織改稱國際醫(yī)學(xué)和生物工程聯(lián)合會,后來成為國際生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會。生物醫(yī)學(xué)工程歷程BME創(chuàng)始人-黃家駟院士國內(nèi):1980年:中1.1課程背景–相關(guān)學(xué)科
生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)科方向交叉性學(xué)科,其學(xué)科方向很多,包括:生物醫(yī)學(xué)信號處理醫(yī)學(xué)圖像處理醫(yī)療儀器醫(yī)療信息系統(tǒng)神經(jīng)工程(含腦機接口)醫(yī)學(xué)成像生物信息學(xué)生物材料……1.1課程背景–相關(guān)學(xué)科1.1課程背景–學(xué)科方向
例如:腦電信號轉(zhuǎn)換成腦音樂消除心電信號的強干擾
生物醫(yī)學(xué)信號處理方向—1.1課程背景–學(xué)科方向生物醫(yī)學(xué)信號處理方向—1.1課程背景–學(xué)科方向視網(wǎng)膜血管提取基于胃鏡圖像分割疾病區(qū)與正常區(qū)醫(yī)學(xué)圖像處理方向—1.1課程背景–學(xué)科方向視網(wǎng)膜血管提取醫(yī)學(xué)圖像處理方向1.1課程背景–學(xué)科方向醫(yī)療儀器方向—1.1課程背景–學(xué)科方向醫(yī)療儀器方向—南極膝關(guān)節(jié)手術(shù)美國馬薩諸塞總醫(yī)院雙向聲像連接醫(yī)學(xué)信息系統(tǒng)方向—1.1課程背景–學(xué)科方向南極膝關(guān)節(jié)手術(shù)美國馬薩諸塞總醫(yī)院雙向聲像連接醫(yī)學(xué)信息系統(tǒng)方向1.1課程背景–學(xué)科方向
面對海量的生物數(shù)據(jù),傳統(tǒng)的生物學(xué)研究方法已經(jīng)完全不能適應(yīng),因此,生物信息學(xué)應(yīng)運而生。生物信息學(xué)建立在分子生物學(xué)基礎(chǔ)上,一是對海量數(shù)據(jù)的收集、整理與服務(wù),也就是管好這些數(shù)據(jù);另一個是從中發(fā)現(xiàn)新的規(guī)律,例如,認識疾病發(fā)生機制。
預(yù)測基因及功能篩選復(fù)雜疾病的生物標(biāo)記物挖掘疾病的生物特征推斷基因調(diào)控機制預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
……
生物信息學(xué)方向—1.1課程背景–學(xué)科方向1.1課程背景–學(xué)科方向例如,基于傅里葉變換技術(shù)預(yù)測蛋白編碼區(qū)
生物信息學(xué)方向—1.1課程背景–學(xué)科方向例如,基于傅里葉變換技術(shù)預(yù)測1.1課程背景–學(xué)科方向相關(guān)研究工作包括:
挖掘生物信息的方法(算法)和工具的發(fā)展預(yù)測、分析和解釋生物規(guī)律生物信息學(xué)方向—1.1課程背景–學(xué)科方向相關(guān)研究工作包括:生物信息學(xué)1.1課程背景–學(xué)科方向與醫(yī)學(xué)圖像處理、醫(yī)療儀器、醫(yī)學(xué)信息系統(tǒng)、生物信息學(xué)等方向密切相關(guān)、相互滲透生物信號處理是生物醫(yī)學(xué)工程重要的學(xué)科方向之一生物信號處理方向與其他方向的關(guān)系1.1課程背景–學(xué)科方向與醫(yī)學(xué)圖像處理、醫(yī)療儀器、醫(yī)學(xué)1.1課程背景–課程定位生物醫(yī)學(xué)信號處理課程定位:
生物醫(yī)學(xué)工程一級學(xué)科專業(yè)課程體系中的一門專業(yè)核心基礎(chǔ)課程課程主要面向生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)類本科生
課程在生命科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)診斷以及臨床治療等方面均起著重要的作用1.1課程背景–課程定位1.1課程背景–前后關(guān)系生物醫(yī)學(xué)信號處理課程:
先修課程:微積分、線性代數(shù)、概率論與數(shù)理統(tǒng)計、信號與系統(tǒng)、數(shù)字信號處理等。作用:“承上啟下”1.1課程背景–前后關(guān)系1.1課程背景–學(xué)習(xí)目的
培養(yǎng)學(xué)生用定量分析方法解決生物醫(yī)學(xué)問題的能力,在生物醫(yī)學(xué)和信號處理之間構(gòu)建一座橋梁。主要培養(yǎng)學(xué)生的下列技能:(1)處理(即濾波)生物醫(yī)學(xué)信號,如分離信號中的有用成份和無用成份。(2)定量描述生物醫(yī)學(xué)信號,即揭示產(chǎn)生生物醫(yī)學(xué)信號的本質(zhì),根據(jù)得出的結(jié)果預(yù)測信號未來的行為。(3)探測產(chǎn)生生物醫(yī)學(xué)信號的源,描述一個生物醫(yī)學(xué)物理系
統(tǒng)的輸入與輸出信號之間的內(nèi)在聯(lián)系,如腦電反演問題。1.1課程背景–學(xué)習(xí)目的
培養(yǎng)學(xué)生用定量分析方法解決生1.1課程背景
課程的特點交叉性強內(nèi)容廣既注重理論,又強調(diào)應(yīng)用知識點涉及多個學(xué)科,如人體結(jié)構(gòu)、電生理信號、組織器官、基因、蛋白質(zhì)、自適應(yīng)濾波
等。1.1課程背景課程的特點交叉性強1.1課程背景
課程內(nèi)容與學(xué)時安排課程內(nèi)容選擇:1.1課程背景課程內(nèi)容與學(xué)時安排課程內(nèi)容選擇:1.1課程背景
課程內(nèi)容與學(xué)時安排總學(xué)時:48學(xué)時其中,理論講授:40學(xué)時
課外實驗:8學(xué)時1.1課程背景課程內(nèi)容與學(xué)時安排1.1課程背景-
課程內(nèi)容與學(xué)時安排教學(xué)內(nèi)容安排順序與對應(yīng)學(xué)時如下:1.1課程背景-課程內(nèi)容與學(xué)時安排教學(xué)內(nèi)容安排順序與對1.1課程背景
-課程學(xué)習(xí)方法預(yù)習(xí)并補充課程涉及的生物學(xué)和醫(yī)學(xué)知識;重視課堂教學(xué)環(huán)節(jié);建立正確的概念;只有在概念清楚的基礎(chǔ)上,才能對擬解決的生物醫(yī)學(xué)問題做出正確的、定性的分析,并利用簡化的方法做定量估算。認真做實驗;按時完成并上交作業(yè);關(guān)注生物醫(yī)學(xué)信號處理學(xué)科發(fā)展動態(tài)。1.1課程背景-課程學(xué)習(xí)方法預(yù)習(xí)并補充課程涉及的生物學(xué)過程性考核終結(jié)性考核期末考試鼓勵學(xué)生重視平時學(xué)習(xí)平時成績(作業(yè)、出勤等)期中考試科研小論文
占20%占總成績的40%為激勵學(xué)生追求更好成績,作業(yè)和上機實驗成績實施動態(tài)評價。上機實驗占20%占總成績的60%1.1課程背景
考核辦法過程性考核終結(jié)性考核期末考試平時成績(作業(yè)、出勤等)期中考試參考教材饒妮妮,李凌.生物醫(yī)學(xué)信號處理.成都:電子科技大學(xué)出版社.楊福生,高上凱.生物醫(yī)學(xué)信號處理.北京:高等教育出版社.謝正祥,陳良遲,張世強等.醫(yī)學(xué)信號數(shù)字處理技術(shù)及應(yīng)用.北京:科學(xué)出版社.張賢達.現(xiàn)代信號處理.北京:清華大學(xué)出版社.ReddyD.C.,BiomedicalSignalProcessingPrinciplesandTechniques,McGraw–HillPublishingCompanyLimited,2005
參考教材饒妮妮,李凌.生物醫(yī)學(xué)信號處理.成都:電子科技1.2信號及其類型什么是信號?
傳統(tǒng)定義:傳感器測量的結(jié)果,稱為信號。例如:電路中的電流、大氣壓儀每小時的讀數(shù)、蚊子
嗡嗡的叫聲,
例外,DNA序列信號:
atcgattggccatcgcgcgtata
它是生物與生俱來的一種信號。1.2信號及其類型什么是信號?1.2信號及其類型來自于真實世界的信號各不相同,但大致可分為四種類型:(1)確定性信號(2)隨機信號(3)分形信號(4)混沌信號1.2信號及其類型來自于真實世界的信號各不相同,但大致可分1.2信號及其類型(1)確定信號:有確定的函數(shù)關(guān)系,能準(zhǔn)確預(yù)測未來;或者,已知其過去值,就能準(zhǔn)確預(yù)測其未來值,如正弦波。1.2信號及其類型(1)確定信號:1.2信號及其類型(2)隨機信號即使知道它過去的全部信息,也不能預(yù)測其未來值的一類信號,稱之。注意:隨機信號與噪聲的差別1.2信號及其類型(2)隨機信號1.2信號及其類型(2)隨機信號例如:實驗室用的信號發(fā)生器,會產(chǎn)生一定的噪聲;
自發(fā)腦電信號但有些目前認為是隨機性的事物,往往是因為現(xiàn)在還沒有掌握影響該事物的所有因素所遵循的規(guī)律,這在生物醫(yī)學(xué)信號中很普遍。1.2信號及其類型(2)隨機信號1.2信號及其類型(3)分形信號這類信號在各種尺度下看上去都很類似,具有所謂的“尺度不變性”。1.2信號及其類型(3)分形信號1.2信號及其類型(3)分形信號例如,心率信號和血管分支中的血流信號是分形信號的兩個典型例子。此外,在自然界中也廣泛存在分形特征:
1.2信號及其類型(3)分形信號1.2信號及其類型(3)分形信號一棵植物的枝杈表現(xiàn)出來的分形特征1.2信號及其類型(3)分形信號一棵植物的枝杈表現(xiàn)出來的分1.2信號及其類型(4)混沌信號
不能準(zhǔn)確預(yù)測其未來值的確定性信號。生物中存在大量混沌現(xiàn)象和混沌信號例如,一些免疫和生物化學(xué)的調(diào)控腦電活動呼吸
混沌信號特征:對初始條件十分敏感(初值敏感性)。
1.2信號及其類型(4)混沌信號1.2信號及其類型混沌現(xiàn)象發(fā)現(xiàn)者:美國麻省理工學(xué)院氣象學(xué)家羅倫茲(Lorenz),混沌理論之父,蝴蝶效應(yīng)的發(fā)現(xiàn)者。他在1963年的一次試驗中,為了更細致地觀察結(jié)果,他把一個中間解0.506取出,提高精度到0.506127再送回。當(dāng)他到咖啡館喝完咖啡回來再看時,竟大吃一驚。本來很小的差異,結(jié)果卻偏離了十萬八千里!再次驗算發(fā)現(xiàn)計算機并沒有毛病,他于是認定這為:“對初始值的極端不穩(wěn)定性”,即:“混沌”,又稱“蝴蝶效應(yīng)”。1.2信號及其類型混沌現(xiàn)象發(fā)現(xiàn)者:1.2信號及其類型(4)混沌信號
目前,證明信號的混沌性還是一個難題,常用的辦法是利用Lyapunov指數(shù)。注意區(qū)分混沌信號與隨機信號的差別。1.2信號及其類型(4)混沌信號1.2信號及其類型(4)混沌信號A.隨機信號不是混沌的,而混沌信號不是隨機的;B.理論上,混沌信號是確定的,有下列特征:
非漸近周期性無Lyapunov指數(shù)消失最大Lyapunov指數(shù)為正相同的初始值產(chǎn)生相同的軌跡1.2信號及其類型(4)混沌信號1.2信號及其類型(4)混沌信號
隨機信號是非確定的
即使初始狀態(tài)相同,一個隨機過程也會產(chǎn)生不同的信號。目前隨機信號的lyapunov指數(shù)沒有得到定義。
1.2信號及其類型(4)混沌信號1.2信號及其類型(5)噪聲信號中不需要(unwantedorundesired)的成分例如,母親心電和胎兒心電信號自發(fā)腦電和腦誘發(fā)電位
1.2信號及其類型(5)噪聲1.2信號及其類型生物醫(yī)學(xué)信號及其類型
大多數(shù)生物醫(yī)學(xué)信號具有隨機性,難以準(zhǔn)確劃分其類型。
一些表現(xiàn)出周期性,如心電信號、呼吸信號。一些具有隨機性,如腦電信號。采集的生物醫(yī)學(xué)信號伴隨復(fù)雜的干擾和噪聲,淹沒有用信號。
生物醫(yī)學(xué)信號中攜帶大量有用的生物或臨床醫(yī)學(xué)信息,需要通過處理提取有用信息。
1.2信號及其類型生物醫(yī)學(xué)信號及其類型信號處理信號與系統(tǒng)處理:濾波、放大、變換、相關(guān)、
信號處理信號與系統(tǒng)處理生物醫(yī)學(xué)信號
的目的:
去除干擾,例如工頻干擾。提取特征,例如在大量的腦電數(shù)據(jù)中找到感興趣的生理醫(yī)學(xué)解釋。預(yù)測醫(yī)學(xué)信號的未來,例如用采集的電生理信號數(shù)據(jù)預(yù)測可能的病變,實現(xiàn)疾病的早期檢測?!幚砩镝t(yī)學(xué)信號
的目的:
本講總結(jié)第1章生物醫(yī)學(xué)信號概述課件課后作業(yè):
學(xué)習(xí)生物醫(yī)學(xué)信號處理的目的是什么?列舉4種不同類型的生物醫(yī)學(xué)信號。課后作業(yè):學(xué)習(xí)生物醫(yī)學(xué)信號處理的目的是什么?1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
來自人體的醫(yī)學(xué)信號分類:A.由生理過程自發(fā)產(chǎn)生的主動信號例如,心電(ECG)、腦電(EEG)、肌電(EMG)、眼電(EOG)、胃電(EGG)等電生理信號,體溫、血壓、脈搏、呼吸等非電生理信號。1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
來自人體的醫(yī)學(xué)信號分類1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介人體作為通道,用外界信號作用于人體后產(chǎn)生的被動信號例如,超聲波、同位素、X射線、CT圖像等1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(1)ECG–
Electrocardiogram
1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(1)ECG–Ele1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(1)ECG在實際應(yīng)用中,進一步分:A.標(biāo)準(zhǔn)臨床ECG,12導(dǎo)聯(lián)采集;B.矢量心電圖VCG,3導(dǎo)聯(lián)采集;
C.監(jiān)護ECG,1or2導(dǎo)聯(lián)采集.1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(1)ECG1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介ECG信號特征
(1)帶寬:0.05–100Hz
(2)峰值幅度:mV量級處理ECG的主要目的:采用準(zhǔn)確、快速和可靠的信號處理方法估計ECG的重要參數(shù)
QRS復(fù)合波、R–R間期、P波和T波等1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介ECG信號特征1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(1)ECG–
ElectrocardiogramP波P-R間期QRS波群S-T段T波Q-T間期u波構(gòu)成
1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(1)ECG–Ele1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(1)ECG–Electrocardiogram瞬時心率信號:1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(1)ECG–Ele1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(2)EEG-Electroencephalogram
EEG是通過電極記錄下來的腦細胞群的自發(fā)性、節(jié)律性電活動。
1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介(2)EEG-El1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(2)EEG
Caton于1875年首先以電流計從兔子及猴的大腦皮層觀測到了“腦電波”。
自發(fā)腦電
誘發(fā)電位(EP)-施加一個刺激(聲、光或體感刺激)所引起的人腦的微弱電變化。又稱誘發(fā)反應(yīng)、事件相關(guān)電位。
1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(2)EEG1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(2)EEG不同狀態(tài)下的EEG1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(2)EEG1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(2)EEG信號特征:A.振幅:10-100V;
B.頻率:0.5–40Hz;
波:0.5-3.5Hz,表示睡眠狀態(tài)(有夢或無夢);(ii)波:3.5–7.5Hz,表示昏昏欲睡狀態(tài);
(iii)波:7.5–12.5Hz,表示清醒、放松等狀態(tài);(iv)波:>12.5Hz,表示機警或工作狀態(tài)。1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(2)EEG信號1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(3)EMG/肌電信號1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(3)EMG/肌電信1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(4)其他醫(yī)學(xué)信號眼電(EOG)、胃電(EGG)血細胞信號:1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
(4)其他醫(yī)學(xué)信號1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
常見人體生理信號的幅值和帶寬1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
常見人體生理信1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介生物醫(yī)學(xué)信號的特點:(1)非常微弱(
V,mV,PA量級);(2)頻率很低,如:0.05Hz–1Hz(胃電);(3)干擾與有用信號之間頻帶重復(fù);(4)復(fù)雜性;(5)隨機、非平穩(wěn)性;(6)噪聲背景強。1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介生物醫(yī)學(xué)信號的特點:1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介生物醫(yī)學(xué)系統(tǒng)的特點:(1)生物體,
例如,人體系統(tǒng)(四大系統(tǒng)?)(2)開放性;(3)時變性;(4)非線性;(5)變異性??偨Y(jié)起來,生物醫(yī)學(xué)系統(tǒng)是十分復(fù)雜的系統(tǒng)。1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介生物醫(yī)學(xué)系統(tǒng)的特點:1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介常用信號處理技術(shù):(1)相關(guān)技術(shù);(2)傅里葉變換;(3)功率譜估計;(4)維納濾波;(5)卡爾曼濾波;(6)參數(shù)模型法;(7)自適應(yīng)濾波;(8)時頻分析;(9)主成分分析(PCA)、獨立成分分析(ICA)
1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介常用信號處理技術(shù):ECG處理:心臟中大約200多種疾病可以用ECG來診斷,如房顫(P波消失,代之以f波),心律失常等,因此處理ECG信號在臨床上十分重要。1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
1.3一些典型的生物醫(yī)學(xué)信號簡介
基本ECG處理:帶通濾波(0.5-40Hz
)滑動平均濾波器去除基線漂移當(dāng)前國內(nèi)外針對房顫信號處理內(nèi)容有:
房顫信號(f波)提取
房顫信號(f波)抑制
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