三代基因測(cè)序儀加耗材參數(shù)

—PAGE8—三代基因測(cè)序儀加耗材參數(shù)采購(gòu)編號(hào)貨物名稱(chēng)采購(gòu)數(shù)量計(jì)量單位設(shè)備最高限價(jià)（萬(wàn)元）國(guó)別備注2023-JKMXJY-W3004三代基因測(cè)序儀2套40R國(guó)產(chǎn)□進(jìn)口配套耗材耗材參數(shù)★所投試劑生產(chǎn)廠家的試劑檢測(cè)內(nèi)容需包含DNA病毒、RNA病毒、細(xì)菌，真菌，寄生蟲(chóng)，耐藥基因、疑似背景微生物。耗材年用量15.3萬(wàn)元/年/臺(tái)序號(hào)耗材名稱(chēng)耗材年預(yù)估量耗材最高限價(jià)（單價(jià)）耗材最高限價(jià)（總價(jià)）1病原微生物宏基因組檢測(cè)試劑2400測(cè)試45元/測(cè)試1080002靶向多重病原體檢測(cè)試劑1600測(cè)試28.125元/測(cè)試45000合計(jì)153000采購(gòu)項(xiàng)目技術(shù)要求設(shè)備功能要求三代測(cè)序技術(shù)，區(qū)別于傳統(tǒng)的用聚合酶擴(kuò)增引入帶有熒光標(biāo)記的核苷酸，捕獲其光信號(hào)，再轉(zhuǎn)化成數(shù)字信號(hào)的方式，三代測(cè)序技術(shù)是核酸序列（DNA/RNA）通過(guò)有離子的納米孔，從而產(chǎn)生電流波動(dòng)，獲取電流波動(dòng)的信息進(jìn)而計(jì)算出對(duì)應(yīng)的核酸序列，是不使用聚合酶直接讀取電信號(hào)模式。實(shí)現(xiàn)了Real-Time讀取核酸序列，通量較高，單張芯片理論最高單鏈產(chǎn)量50Gb。讀長(zhǎng)沒(méi)有限制，取決于樣品提取時(shí)核酸序列的長(zhǎng)度，目前最長(zhǎng)的讀長(zhǎng)記錄是4.2Mb，可以直接讀取DNA甲基化，無(wú)需像二代測(cè)序那樣做bisulfite處理，在DNA單堿基修飾相關(guān)方面研究有極大幫助。三代測(cè)序儀是目前市面上唯一一個(gè)可以直接測(cè)RNA的技術(shù)，可讀取RNA序列上單堿基修飾（6mA/5mC）。三代測(cè)序平臺(tái)非常便攜，不僅操作簡(jiǎn)單，無(wú)需像傳統(tǒng)測(cè)序平臺(tái)那樣有比較多的配套設(shè)施與人員，可輕松的實(shí)現(xiàn)測(cè)序?qū)嶒?yàn)，同時(shí)儀器對(duì)實(shí)驗(yàn)環(huán)境無(wú)限制，室內(nèi)、野外、太空都可以進(jìn)行測(cè)序。軟硬件配置清單序號(hào)描述數(shù)量1主機(jī)2臺(tái)2服務(wù)器2臺(tái)技術(shù)參數(shù)要求序號(hào)指標(biāo)名稱(chēng)技術(shù)參數(shù)1測(cè)序類(lèi)型三代測(cè)序儀，直接測(cè)序DNA/RNA，無(wú)需PCR擴(kuò)增，無(wú)需熒光標(biāo)記。避免由于PCR擴(kuò)增和熒光標(biāo)記產(chǎn)生的偏離和原始樣本的失真。2＃測(cè)序讀長(zhǎng)最長(zhǎng)讀長(zhǎng)高達(dá)4.2Mb，具體讀長(zhǎng)長(zhǎng)度取決于DNA或RNA片段的長(zhǎng)度和質(zhì)量3CONTIGSN50目前超長(zhǎng)讀長(zhǎng)contigN50=1Mb(具體取決于樣品類(lèi)型、質(zhì)量等)4★準(zhǔn)確性1X準(zhǔn)確度99%，30X準(zhǔn)確度99.6%，100X準(zhǔn)確度99.999%5＃數(shù)據(jù)量單張芯片理論最高單鏈產(chǎn)量50Gb（內(nèi)測(cè)數(shù)據(jù)）6運(yùn)行時(shí)間1分鐘至64小時(shí)；按需測(cè)序，無(wú)固定運(yùn)行時(shí)間7便攜性一個(gè)人可輕松搬運(yùn)，測(cè)序?qū)嶒?yàn)不受環(huán)境限制8混樣建庫(kù)測(cè)序12，24，48，96個(gè)樣本試劑盒可選9＃測(cè)序模式實(shí)時(shí)堿基讀取，用戶(hù)可以實(shí)時(shí)讀取堿基序列信息，無(wú)需通過(guò)熒光信號(hào)轉(zhuǎn)換。直接，迅速給出測(cè)序結(jié)果。10★服務(wù)器配置1.單次可并行分析6個(gè)樣本以上，分析時(shí)間最快可達(dá)5min/樣本；2.高性能CPU、GPU配置；GPUCUDA核心數(shù)不少于2400，運(yùn)行速度快；3.內(nèi)存至少128Gb；固態(tài)硬盤(pán)不低于1T，機(jī)械硬盤(pán)不低于4T；11服務(wù)器性能可直接完成原始電信號(hào)堿基讀取（FAST5ToFASTQ）、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制（QC）、可實(shí)現(xiàn)barcode拆分（Demultiplexing）、序列比對(duì)（Alignment）、基因組組裝（Assembly）、宏基因組分析（Metagenomics）、擴(kuò)增子分析（Amplicon）、測(cè)序錯(cuò)誤校正（Errorcorrection）、變異分析（Variantcalling）、堿基修飾（Basemodification）等功能12#產(chǎn)地進(jìn)口設(shè)備售后服務(wù)要求（每一項(xiàng)都是“★”）1質(zhì)保期1年2備件庫(kù)國(guó)內(nèi)有備件庫(kù)3維修站國(guó)內(nèi)有維修站4收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)保期外只收取維修配件成本費(fèi)5培訓(xùn)支持現(xiàn)場(chǎng)培訓(xùn)6維修響應(yīng)2小時(shí)內(nèi)回應(yīng)，48小時(shí)內(nèi)到達(dá)現(xiàn)場(chǎng)7到貨時(shí)間