第二章數(shù)量遺傳學基礎-重復力

第二章數(shù)量遺傳學基礎第三節(jié)數(shù)量性狀遺傳參數(shù)分析數(shù)量性狀遺傳研究的基本統(tǒng)計方法*總體(poputlation)和樣本(sample)*總體參數(shù)(parameter)與樣本統(tǒng)計量(statistic)資料均值資料變異程度*資料相關程度資料變異程度用以衡量群體數(shù)量資料的變異程度(也稱離中性/分散程度)的參數(shù)主要有：方差/均方(variance,V/S2)；標準差(standarddeviation,S)?？傮w資料的參數(shù)由樣本的統(tǒng)計量估計：方差的計算公式；標準差的計算公式。當樣本容量大于30時，可用n代替n-1計算方差與標準差。*資料相關程度用以衡量同一遺傳群體不同數(shù)量性狀間相互關聯(lián)程度的參數(shù)主要是：協(xié)方差(covariance,C)；相關系數(shù)(correlationcoefficient,r)?？傮w協(xié)方差與相關系數(shù)也由樣本統(tǒng)計量估計：樣本協(xié)方差的估計；樣本相關系數(shù)的估計。遺傳參數(shù)參數(shù)（parameter）反映總體特征的數(shù)遺傳參數(shù)(geneticparameter)反映總體遺傳特征的參數(shù),即指為了進行基因型選擇而估計育種值時所必須參考的一些常數(shù)。數(shù)量性狀的三個最重要的遺傳參數(shù)：重復力，遺傳力，遺傳相關不可觀測，只能用統(tǒng)計學方法進行估計一、重復力重復力（repeatability）的定義：同一個體某一性狀各次度量之間的相關（可重復的程度）,用統(tǒng)計學語言表達，是指同一個體不同次生產記錄的組內相關系數(shù)（intraclasscorrelation）。在時間上的重復：產奶量、產仔數(shù)在空間上的重復：羊毛品質影響同一個體同一性狀各次度量之間相關性的因素：遺傳：各次度量值受相同的遺傳因素（基因型）影響環(huán)境：持久性環(huán)境效應 組間方差=遺傳方差+持久環(huán)境方差一、重復力重復力的估計模型：個體（組）效應（隨機）隨機誤差一、重復力方差分析一、重復力重復力的估計一、重復力重復力的估計重復力的主要用途一、重復力確定n次度量的相對精確性：一次度量：n次度量平均數(shù)：重復力的主要用途n次度量的相對精確性：作為遺傳力估計值的上限用于育種值估計重復力的主要用途不同度量次數(shù)的相對精確性re=0.5re=0.75re=0.25re=0.1重復力的主要用途估計個體終生平均生產能力

根據(jù)個體的前n次記錄的平均數(shù)估計其終生平均生產能力

n次度量平均數(shù)的重復力個體終生平均生產能力估計值群體平均數(shù)二、遺傳力（一）遺傳力（heritability）的定義遺傳變異占總變異(表型變異)的比率，用以度量遺傳因素與環(huán)境因素對性狀形成的影響程度，是對雜種后代性狀進行選擇的重要指標。P=G+E=A+D+I+Es+Er=A+R （一）遺傳力（heritability）的定義廣義遺傳力(heritabilityinthebroadsense):遺傳方差占總方差(表型方差)的比率PrGEGEH狹義遺傳力（heritabilityinthenarrowsense）:加性方差占總方差的比率。PrGEARh二、遺傳力遺傳力=0.25（一）遺傳力（heritability）的定義期望的后代平均性能親本的性能（與群體均數(shù)的離差）h2=0.5h2=0.25h2=0.10（一）遺傳力（heritability）的定義（二）遺傳力的估計基本原理根據(jù)親屬之間的相關性估計

P1A1R1hP2A2R2hrA假定：親屬間不存在非加性效應相關和環(huán)境相關在非近交群體中（二）遺傳力的估計估計方法利用親子資料：A.子親回歸

親代觀測值：單親觀測值或雙親平均值（中親值）子代觀測值：一個后代觀測值或多個后代平均值（二）遺傳力的估計子親回歸系數(shù):遺傳力估計值:單個親本：中親：注意：

-不同親本之間不能有親緣關系不同親子對之間不能有系統(tǒng)環(huán)境差異

-當性別對性狀表達有影響時，應采用同一性別的 子親回歸，常用女母回歸（二）遺傳力的估計

B.公畜內子母回歸:

適用于在不同公畜家系間存在系統(tǒng)環(huán)境差異的情形父親 母親 后代數(shù)據(jù)資料S1D11D12O11

O12O1nS2D21D22D2nO21O22O2n

D1n

（二）遺傳力的估計計算公畜內平方和及乘積和母親平方和：后代平方和：子母乘積和：（二）遺傳力的估計公畜內子母回歸系數(shù)遺傳力估計值（二）遺傳力的估計女母回歸或相關法式中，N為親子對數(shù)；O為女兒性狀表型值；P為母親性狀表型值；VP為母親性狀表型方差；COVOP為女兒與母親同一性狀的表型協(xié)方差。

該方法僅限于母畜（禽）表現(xiàn)的限性性狀，性狀遺傳率為女兒產量對母親產量回歸系數(shù)的2倍，即：利用同胞資料-同胞分析（sibanalysis）（父系）半同胞資料S1D11D12O11

O12O1nS2D21D22D2nO21O22O2n

D1n

（二）遺傳力的估計同胞相關法動物的同胞有全同胞和半同胞之分，因此估測遺傳率的方法可分為半同胞相關法和全同胞相關法。根據(jù)半同胞相關估測遺傳率的公式為:同理，用全同胞相關估測遺傳率的公式為：原理rHS=半同胞組內相關（二）遺傳力的估計1）數(shù)據(jù)結構:2）模型:（二）遺傳力的估計3）方差分析（二）遺傳力的估計4）半同胞組內相關系數(shù)5）注意：

-所有親本間不能有親緣關系

-

不同家系間不能有系統(tǒng)環(huán)境差異（二）遺傳力的估計子親回歸:6）遺傳力估計值的標準誤公畜內女母回歸:單親:中親:（二）遺傳力的估計6）遺傳力估計值的標準誤同胞分析-半同胞資料（二）遺傳力的估計(三)遺傳力的用途如前所述，遺傳率可作為雜種后代性狀選擇指標的指標，其高低反映：性狀傳遞給子代的能力、選擇結果的可靠性、育種選擇的效率；通常認為遺傳率：

>50%高； =20%~50%中； <20%低.1.制定育種方案:對遺傳率高的性狀宜采用本品種選育，對遺傳率低的性狀則宜采用雜交育種。2.確定選擇方法:根據(jù)h2高低，確定是采用個體表型選擇（h2高者）呢還是采用家系選擇（植物叫群內選擇）（h2低者）?；蚨呒骖?。3.育種值估計4.預測選擇反應:子代群體均值與親代群體均值之差稱為遺傳進展或選擇反應，用△R表示：△R=Sh2

其中：S——留種群均值與供選群體均值之差，稱為選擇差。(三)遺傳力的用途親屬間的遺傳相關：指有